$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
أجريت جميع التجارب على الحيوانات في منشأة خالية من مسببات الأمراض (SPF) محددة وتمت الموافقة عليها من قبل لجنة أخلاقيات واستخدام الحيوانات في المستشفى الثالث التابع لجامعة القوات الجوية الطبية (رقم الموافقة: IACUC-2024kq-065).
تم شراء فئران ذكور C57BL/6 (عمرها 6-8 أسابيع، وزنها 18-20 جرام) من مركز الحيوانات المختبرية في جامعة القوات الجوية الطبية (رخصة الإنتاج: SCXK (شنشي) 2024-002). تم وضع الفئران في أقفاص مهواة بشكل فردي تحت ضغط إيجابي وظروف نظيفة، بدرجة حرارة تتراوح بين 20-26 درجة مئوية، ورطوبة نسبية بين 40٪-70٪، ودورة ضوء وظلام مدتها 12 ساعة، وعلى الأقل 15 تغييرات هواء في الساعة. تم توفير نظام غذائي معقم، ومياه شرب، وإثراء بيئي.
الكواشف والمواد الكيميائية والأدوات التجريبية المستخدمة في البروتوكول مدرجة في جدول المواد.
1. التضحية بالحيوانات وجمع الأنسجة
- ضع الفأر في غرفة قتل رحيم محكمة الإغلاق وقم بالقتل الرحيم عبر استنشاق ثاني أكسيد الكربون تدريجيا (CO₂)، بحجم حجرة 30٪-70٪ في الدقيقة.
- تأكيد الوفاة عن طريق توقف التنفس التلقائي وضربات القلب، فقدان ردود فعل الحدقة، وعدم الاستجابة للتحفيز الميكانيكي.
- اغمر الفئران المزيفة C57BL/6 في إيثانول 75٪ لمدة 5 دقائق للتعقيم.
ملاحظة: لتجنب تثبيت الأنسجة الناتج عن الكحول وتلف الخلية، حدد وقت الغمر إلى 10 دقائق. استخدم الأنسجة الطازجة طوال البروتوكول لأن التجميد يضر بصلاحية الميتوكوندريا وسلامة وظيفتها.
- ضع الفأر في طبق بتري معقم داخل غطاء تدفق طبقي بحيث يكون البطن مواجها للأعلى لكشف مناطق البطن والطرف الخلفي بالكامل.
- ارفع جلد أسفل البطن بالقرب من المنطقة التناسلية باستخدام الملقط وقم بعمل شق صغير. قم بإجراء تشريح غير حاد لفصل الجلد عن الأنسجة الأساسية. قم بتمديد الشق للأعلى على طول الخط الأوسط إلى الكاحل وجانبيا نحو كلا الأطراف الخلفية لكشف مجموعات عضلات الطرف الخلفي بالكامل.
- حدد عضلة الفخذ الرباعية في الجانب الأمامي من الفخذ وفصل العضلة بعناية على طول اتجاه ألياف العضلة باستخدام تشريح غير حاد. اقطع الرباط البعيد للرضفة والوتر القريب لعزل نسيج العضلة تماما.
ملاحظة: اغسل النسيج ثلاث مرات في محلول ملحي مبرد مسبقا بالفوسفات (PBS) مع إضافة 2٪ من البنسلين-ستريبتوميسين باستخدام طبق بتري جديد لكل غسول لتقليل التلوث.
- ضع نسيج العضلات المعزول فورا في PBS المبرد مسبقا وشطفها جيدا لإزالة الشعر والدم من سطح النسيج.
- قم بمسح الرطوبة الزائدة من الأنسجة بلطف باستخدام شاش معقم. قسم النسيج إلى أنابيب طرد مركزي دقيق بحجم 1.5 مل ووزن العينات. استخدم حوالي 100 ملغ من النسيج لكل عينة للحفاظ على التناسق بين التحضيرات.
2. تقطيع الأنسجة وتجانسها
- ضع أنبوب الطرد المركزي الدقيق الذي يحتوي على الأنسجة من الخطوة 1.8 على الثلج. قم بتقطيع الأنسجة إلى شظايا صغيرة بحجم حوالي 1-2 مم3 باستخدام مقص معقم.
- أضف 8 مجلدات من التربسين المبرد مسبقا بنسبة 0.25٪ واهضم شظايا الأنسجة على الثلج لمدة 15 دقيقة.
ملاحظة: احسب حجم التريبسين المطلوب حسب كتلة الأنسجة (1 ملغ ≈ 1 ميكرولتر). على سبيل المثال، أضف 640 ميكرولتر من 0.25٪ تريبسين إلى 80 ملغ من الأنسجة.
- قم بطرد المركزي بالخليط عند 1000 × جرام لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية. تخلص من المادة الفائقة واحتفظ بحبيبات الأنسجة. أعد تعليق الحبيبات في محلول عزل ميتوكوندريا مبرد مسبقا بحجم 1 مل يحتوي على D-مانيتول (215 ملم)، السكروز (75 ملم)، HEPES (20 ملم)، EGTA (1 ملم)، وألبومين مصل البقري الخالي من الأحماض الدهنية (0.5٪ مع الضرب/الولت).
- انقل التعليق إلى جهاز تجانس زجاجي مثبت على الثلج. قم بتجانس النسيج باستخدام 10-12 حركة لطيفة صعود وهبوط حتى يصبح التعليق عكرا.
ملاحظة: تجنب تدوير المدقة الزجاجية جانبيا في أسفل المدمج لأن القوة الميكانيكية الزائدة قد تضر أغشية الميتوكوندريا وتؤثر سلبا على وظيفة الميتوكوندريا.
3. الطرد المركزي التفاضلي
- انقل التجانس إلى أنبوب طرد مركزي دقيق بسعة 1.5 مل وجهاز طرد مركزي بحرارة 1000 × جرام لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية.
- انقل المادة الفائقة إلى أنبوب طرد مركزي دقيق جديد بسعة 1.5 مل وجهاز طرد مركزي عند 12,000 × جرام لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية للحصول على الحبيبات الميتوكوندرية الخام.
ملاحظة: اجمع المادة الفائقة بعناية باستخدام حقنة بسعة 1 مل مع تجنب اضطراب الحبيبات وبقايا الأنسجة.
4. تنقية وتخزين الميتوكوندريا
- أعد تعليق الحبيبات الميتوكوندرية الخام بلطف في محلول غسيل مبرد مسبقا يحتوي على السكروز (250 ملليم)، HEPES (10 ملميول، الرقم الهيدروجيني 7.4)، EGTA (1 ملم)، وألبومين مصل البقري (0.15٪ w/v). قم بعمل جهاز التعليق المركزي عند 1000 × جرام لمدة 5 دقائق عند 4 درجات مئوية.
- انقل المادة الفائقة إلى أنبوب طرد مركزي جديد وجهاز طرد مركزي بقوة 12,000 × جرام لمدة 10 دقائق عند 4 درجات مئوية للحصول على الحبيبات الميتوكوندرية المنقية.
ملاحظة: استخدم الميتوكوندريا المعزولة حديثا فورا كلما أمكن. التخزين قصير الأمد عند 4 درجات مئوية أو التخزين طويل الأمد عند −80 درجة مئوية في مخزن الميتوكوندريا الذي يحتوي على السكروز (0.25 م)، تريس-MOPS (10 مللي مو، رقم الهيدروجيني 7.4)، وEGTA (0.1 ميليم) ممكن. ومع ذلك، قد يؤثر التجمد على النشاط الإنزيمي للميتوكوندريا ووظائف الجهاز التنفسي. استخدم العينات المجمدة بشكل أساسي لتحليل البروتين.
5. استخراج البروتينات الميتوكوندرية والسيتوسولية وقياس كمية BCA
- استخراج البروتين الميتوكوندري
- أعد تعليق الحبيبات الميتوكوندرية المنقاة في 50 ميكرولتر من محلول تحلل RIPA لكل 100 ملغ من الأنسجة الابتدائية وحضن التعليق على الجليد لمدة 15 دقيقة.
- قم بعمل الطرد المركزي للليزات عند حوالي 14,000 × جرام لمدة 15 دقيقة عند 4 درجات مئوية. انقل المادة الفائقة إلى أنبوب طرد مركزي دقيق جديد بسعة 1.5 مل للحصول على نسبة البروتين الميتوكوندري.
- استخراج البروتين السيتوسولي
- الطرد المركزي هو الفائق السيتوصولي الذي تم الحصول عليه في الخطوة 4.2 عند 12,000 × جرام لمدة 15 دقيقة عند 4 درجات مئوية. تخلص من المادة الفائقة واحتفظ بالحبيبة كجزء سيتوصولي مخصي.
- أعد تعليق الحبيبة السيتوسولية في 50 ميكرولتر من مخزن تحلل RIPA ومعالجة العينة كما هو موضح في الخطوات 5.1.1-5.1.2.
ملاحظة: جهز محلول التحلل طازجا باستخدام مثبطات البروتياز، وقم بجميع الإجراءات على الثلج لتقليل تحلل البروتين. الميتوكوندريا المستخدمة في هذه الخطوة يمكن أن تكون طازجة أو مجمدة.
- قياس كمية بروتين BCA
- تحضير محلول BCA العامل عن طريق خلط الكاشف A والكاشف B بنسبة 50:1 (v/v). أضف 200 ميكرولتر من محلول العمل إلى كل بئر من صفيحة تحتوي على 96 بئرا.
ملاحظة: جهز محلول BCA العامل مباشرة قبل الاستخدام واستخدمه خلال ساعة واحدة في درجة حرارة الغرفة.
- قم بتخفيف محلول ألبومين مصل البقري (BSA) (2 ملغ/مل) إلى 0.5 ملغ/مل واحتفظ بالمحلول على التجميد حتى الاستخدام.
- جهز المنحنى القياسي بإضافة 20، 19، 18، 16، 12، 8، 4، أو 0 ميكرولتر من محلول BSA إلى آبار منفصلة. اضبط الحجم النهائي إلى 20 ميكرولتر باستخدام محلول NaCl.
- أضف 4 ميكرولتر من بروتين الميتوكوندريا و16 ميكرولتر من محلول NaCl إلى مجموعة واحدة من الآبار. أضف 4 ميكرولتر من بروتين السيتوسوليك و16 ميكرولتر من محلول NaCl إلى مجموعة أخرى من الآبار.
- أضف 200 ميكرولتر من محلول BCA العامل إلى كل بئر وحضن اللوحة عند 37 درجة مئوية في الظلام لمدة 30 دقيقة. قس الامتصاص عند 562 نانومتر باستخدام قارئ ميكروبلايت.
- قم بإنشاء منحنى بروتين معياري بمعامل ارتباط (R2) ≥ 0.999. حساب تركيزات البروتينات (ميكروغرام/ميكرولتر) عن طريق استيفاء قيم الامتصاص من المنحنى القياسي.
6. تقييم نقاء الميتوكوندريا المشتقة من العضلات العظمية
- قم بتخفيف عينات البروتين الميتوكوندري والبروتيني السيتوسولي إلى تركيز نهائي 1.5 ميكروغرام/ميكرولتر. تحضير 20 ميكرولتر من خلطات تفاعلية تحتوي على 30 ميكروغرام من البروتين و4 × من محلول التحميل. اضبط الحجم المتبقي باستخدام محلول NaCl. اغلي العينات لمدة 10 دقائق واحتزنها عند −80 درجة مئوية حتى الاستخدام.
- افصل عينات البروتين باستخدام جل مسبقا التدرج 4٪-20٪. قم بالرحلان الكهربائي عند 140-150 فولت لمدة 50 دقيقة.
- فعل غشاء PVDF (0.22 ميكرومتر) في الميثانول لمدة دقيقة واحدة. البروتينات المنتقلة باستخدام مخزن النقل السريع عند 400 مللي أمبير لمدة 30 دقيقة.
- أزل غشاء PVDF من شطيرة النقل واغسله في TBST لمدة 5 دقائق. قم بسد الغشاء بحليب خالي الدسم بنسبة 5٪ في درجة حرارة الغرفة لمدة ساعة مع هز لطيف.
- تخفيف الأجسام المضادة الأولية (COX IV، السيتوكروم c، β-الأكتين) بنسبة 1:1,000 في مخزن تخفيف الأجسام المضادة. حضن الغشاء بالأجسام المضادة الأولية طوال الليل عند درجة حرارة 4 درجات مئوية.
- اغسل الغشاء ثلاث مرات باستخدام TBST لمدة 10 دقائق في كل غسل.
- حضن الغشاء بالأجسام المضادة الثانوية المخففة بمقدار 1:10,000 في درجة حرارة الغرفة لمدة ساعة واحدة.
- اغسل الغشاء ثلاث مرات باستخدام TBST لمدة 10 دقائق لكل مرة. طور البقعة والتقط الصور.
7. صبغ MitoTracker للميتوكوندريا المشتقة من العضلات العظمية
- قم بتخفيف محلول التلوين إلى تركيز نهائي 200 نانومتر في وسط مسخن مسبقا قبل الاستخدام مباشرة.
- أعد تعليق الحبيبات الميتوكوندرية في 100 ميكرولتر من محلول العمل وحضن الحبيبات عند 37 درجة مئوية في الظلام لمدة 20 دقيقة.
- أضف خمسة مجلدات من مخزن التخزين المبرد مسبقا بعد الحضانة. قم بطرد المركزي بنظام التعليق عند 12,000 × جرام لمدة 10 دقائق عند 4 درجات مئوية وتخلص من المادة الفائقة التي تحتوي على صبغة غير مرتبطة.
- انقل قطعة من تعليق الميتوكوندريا الملون إلى شريحة زجاجية وغط العينة بغطاء داخلي.
- التقاط صور الفلورة باستخدام مجهر كونفوكلي ليزر مع إعدادات مناسبة للإثارة والانبعاث لاكتشاف صبغة الميتوكوندريا الفلورية الحمراء.
8. تقييم جهد غشاء الميتوكوندريا باستخدام تلوين JC-1
- مجموعة معالجة CCCP (سيانيد الكربونيل m-كلوروفينيل هيدرازون)
- عالج التعليق الميتوكوندري ب CCCP بتركيز نهائي 10 ميكرومولار واحتضن لمدة 20 دقيقة لتبدد جهد غشاء الميتوكوندريا.
- حضن تعليق الميتوكوندريا المعالج ب CCCP مع محلول تلوين JC-1 بسعة 250 ميكرولتر عند 37 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة مع تحريك لطيف.
- مجموعة علاج JC-1
- أعد تعليق الحبيبات الميتوكوندرية في محلول JC-1 العامل بسعة 100 ميكرولتر وحضن على حرارة 37 درجة مئوية لمدة 20 دقيقة محمية من الضوضاء.
- جهز محلول تلوين 1× JC-1 عن طريق تخفيف محلول المخزون 5× بالماء المقطر بنسبة 2:8 (v/v) والحفاظ على المخزن على الثلج.
- أزل محلول التلوين واغسل الحبيبات الميتوكوندرية مرتين باستخدام محلول تلوين مبرد مسبقا 1× JC-1.
- أعد تعليق الميتوكوندريا الملونة في PBS وصورها باستخدام مجهر كونفوكالي بالليزر الماسح. استخدم إعدادات الإثارة والانبعاث المناسبة للكشف عن مونومرات JC-1 الفلورية الخضراء ومجموعات JC-1 الفلورية الحمراء.
9. التحليل فوق البنيوي للميتوكوندريا العضلية المعزولة في الهيكل العظمي باستخدام المجهر الإلكتروني الناقل
- تثبيت الميتوكوندريا المعزولة حديثا في غلوتارالديهيد 2.5٪ محضر في محلول فوسفات بعمق 0.2 متر (درجة حموضة 7.4) وحضن العينات طوال الليل عند 4 درجات مئوية.
- غسل العينات بمحلول ملحي مخزن بالفوسفات بسعة 0.1 مليون (PBS، pH 7.4) ثم ثبتها لاحقا في رباعي أكسيد الأوزميوم 1٪ لمدة ساعة في درجة حرارة الغرفة.
- قم بتجفيف العينات عبر سلسلة إيثانول متدرجة تليها التسرب، والغرس، والبلمرة في راتنج الإيبوكسي.
- قم بتقسيم العينات المدمجة بسماكة 50-70 نانومتر باستخدام ميكروتوم فائق الميكرو.
- صبغ الأقسام مرتين بأسيتات اليورانيل وسيترات الرصاص. راقب وصور العينات باستخدام مجهر إلكتروني ناقل.
10. امتصاص الخلايا للميتوكوندريا المشتقة من العضلات الهيكلية
- الثقافة NCTC نسخة 929 (L929؛ RRID: CVCL_0462) الخلايا التي تم الحصول عليها من مورد تجاري في وسط كامل يحتوي على MEM ألفا مع 10٪ مصل أبقار جنيني و1٪ بنسلين-ستريبتومايسين.
- عندما تصل الخلايا إلى التقاء بنسبة 80٪-90٪، استنشق الوسط واغسل الخلايا مرتين باستخدام PBS المسخن مسبقا. أضف تريبسين-إيدتا وقم بالحضانة حتى تنفصل الخلايا.
- أضف وسط كامل لإنهاء الهضم وتوليد تعليق خلية واحدة عن طريق التوصيل اللطيف بالماصات. قم بعمل جهاز تعليق مركزي على 1000 × جرام لمدة 5 دقائق ثم تخلص من السوبرناتان.
- أعد تعليق حبيبات الخلية في وسط كامل طازج وازرع الخلايا في أطباق زراعة جديدة بكثافة مناسبة. حضن الخلايا عند 37 درجة مئوية في جو رطب يحتوي على 5٪ CO₂.
- تمر الخلايا 5 (P5) بداخل أطباق زجاجية بحجم 35 مم وتزرع الخلايا طوال الليل.
- قم بوضع علامة على الميتوكوندريا المعزولة بصبغة فلورية حمراء خاصة بالميتوكوندريا عند درجة حرارة 37 درجة مئوية في الظلام لمدة 20 دقيقة وغسل الميتوكوندريا ب PBS لإزالة الصبغة غير المرتبطة.
- أضف الميتوكوندريا الموسومة بالصبغة الفلورية الحمراء (20 ميكروغرام بروتين ميتوكوندريا لكل طبق) إلى الخلايا وحضن الخلايا لمدة 24 ساعة عند درجة حرارة 37 درجة مئوية في جو رطب يحتوي على 5٪ CO₂.
- صبغ الخلايا بمسبار أكتين فلوري لمدة 30 دقيقة لرؤية هيكل خلوي الأكتين وصبغ النوى بصبغة نووية فلورية.
ملاحظة: تحكم في تركيز المصل بعناية أثناء الحضانة المشتركة لأن الإفراط في المصل قد يقلل من كفاءة امتصاص الميتوكوندريا. الميتوكوندريا المستخدمة في هذه الخطوة طازجة.
11. قياس وظيفة الجهاز التنفسي الميتوكوندريا باستخدام قياس التنفس عالي الدقة
- تحضير الآلات
- نظف غرف التنفس، وحجرات الأقطاب الكهربائية، والسدادات.
- ضع قضيب تحريك مغناطيسي في كل غرفة وتحقق من سلامة غشاء قطب الأكسجين.
- معايرة الأجهزة
- أضف 2.1 مل من حاجز التنفس الميتوكوندري (MiR05، pH 7.10) في كل غرفة تنفسية وتأكد من عدم وجود فقاعات هواء.
- توازن نظام قياس التنفس عالي الدقة عند 37 درجة مئوية لمدة 30 دقيقة وإجراء معايرة هوائية يومية بعد تثبيت خط الأكسجين الأساسي.
ملاحظة: تجنب إدخال فقاعات الهواء إلى غرفة التنفس، لأنها تتداخل مع إشارات أقطاب الأكسجين وتؤثر على جودة البيانات. الميتوكوندريا المستخدمة في هذه الخطوة طازجة.
- تحميل العينات والتوازن
- أضف الميتوكوندريا المعزولة حديثا التي تحتوي على حوالي 30 ميكروغرام من البروتين إلى حجرة التنفس وأغلق الحجرة.
- اضبط الحجرة لمدة 5-8 دقائق وسجل استهلاك الأكسجين القاعدي.
ملاحظة: حافظ على الميتوكوندريا على الجليد وقم بقياسات التنفس فور العزل للحفاظ على النشاط.
- بروتوكول SUIT
- أضف 5 ميكرولتر بيروفات (2 م)، و10 ميكرولتر جلوتامات (2 م)، و10 ميكرولتر مالات (400 م) بالتتابع. ثبت التفاعل لمدة 5 دقائق وسجل تسرب التنفس في الحقل.
- أضف 10 ميكرولتر ADP (500 ملليمتر) لتحفيز الفسفرة التأكسدية وتسجيل تنفس CI OXPHOS. أضف 10 ميكرولتر من كلوريد المغنيسيوم (0.3 م).
- أضف 20 ميكرولتر سوكسينات (1 م) وسجل تنفس أكسفوس CI+CII بعد التثبيت.
- أضف 2 ميكرولتر من مثبط ATP سينثاز (0.01 ملليمتر) وسجل تنفس تسرب البروتون.
- أضف CCCP (1 ميليمول) تدريجيا في ثلاث إضافات بحجم 2 ميكرولتر بفواصل زمنية كل دقيقتين حتى يصل استهلاك الأكسجين إلى هبوطة. سجل أقصى سعة لنظام نقل الإلكترون.
- أضف 1 ميكرولتر روتينون (1 مللي مول) لتثبيط نشاط العقدة I.
- أضف 1 ميكرولتر مضاد ميسين A (5 ملليمو) لتثبيط نشاط السائل الثالث المركب وتسجيل استهلاك الأكسجين المتبقي.
- أضف 5 ميكرولتر الأسكوربات (800 ملم مول) و5 ميكرولتر من نترا ميثيل-ب فينيل إلينيديامين (200 ملميول). سجل أقصى نشاط تنفسي مركب في الوريد بعد الاستقرار.
ملاحظة: قم بإزالة جميع الكواشف قبل التجميد لتجنب تكرار دورات التجمد والذوبان. أضف CCCP تدريجيا، حيث أن الانفصال المفرط يثبط التنفس الميتوكوندري.
- تحليل البيانات
- احصل على معلمات التنفس الميتوكوندري، بما في ذلك تسريب CI، CI OXPHOS، CI+CII OXPHOS، CI+CII Leak، CI+CII et، CII et وCIV، باستخدام برنامج تحليل البيانات.
- حساب نسبة التحكم في التنفس (RCR؛ تنفس الحالة 3/التنفس في الحالة 4) وقدرة إنتاج ATP. احتفظ بجميع القيم حتى ثلاثة أرقام ذات دلالة للتحليل الإحصائي. كان البرنامج المستخدم لتحليل البيانات هو أوروبوروس داتلاب 8 (أجهزة أوروبوروس).