تُقيم هذه الدراسة تعبير YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا باستخدام المعلوماتية الحيوية وتقنية qRT-PCR. وبينما تشير تحليلات قواعد البيانات إلى انخفاض في التعبير وعلاقة إنذارية، فإن التحقق السريري لم يظهر أي فرق معنوي. وتسلط النتائج الضوء على وجود تضاربات، مما يشير إلى دقة تشخيصية محدودة وضرورة إجراء مزيد من التحقق قبل التطبيق السريري.
مقالة بحثية
تعبير بروتين m6A القارئ YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا ضمن مجموعة سريرية صينية
يفتح في علامة تبويب جديدة
في هذه المقالة
ملخص
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
الملخص
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
لا يزال سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) سببًا رئيسيًا للوفيات المرتبطة بالسرطان في جميع أنحاء العالم، مع توفر عدد محدود من المؤشرات الحيوية للتشخيص المبكر والإنذار. وتلعب تعديلات الحمض النووي الريبي m6A (N6-methyladenosine) وبروتيناته القارئة، مثل YTHDC2، أدوارًا حاسمة في تنظيم الجينات وتكوين الأورام. تهدف هذه الدراسة إلى تقييم ملف تعبير YTHDC2 في أنسجة سرطان الرئة غير صغير الخلايا باستخدام المعلوماتية الحيوية وتفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (qRT-PCR)، وتقييم العلاقة بين YTHDC2 والخصائص المرضية السريرية، واستكشاف أهميته السريرية والبيولوجية المحتملة للأبحاث المستقبلية. تم تحليل بيانات التعبير الجيني والبقاء على قيد الحياة من قواعد البيانات لتقييم دقة الإنذار. كما تم قياس تعبير YTHDC2 في أنسجة سرطان الرئة غير صغير الخلايا ضمن مجموعة سريرية صينية، وتحليل الخصائص المرضية السريرية. وأظهرت تحليلات قواعد البيانات العامة أن YTHDC2 كان منخفض التعبير في أنسجة سرطان الرئة غير صغير الخلايا (p < 0.05) وكان مرتبطًا ببقاء المرضى على قيد الحياة، على الرغم من أن أداءه الإنذاري كان ضعيفًا (AUC ≈ 0.5). وأظهر تحليل qRT-PCR لـ 19 زوجًا من الأنسجة الورمية والأنسجة الطبيعية المجاورة عدم وجود فرق ذو دلالة إحصائية (p = 0.537) في تعبير YTHDC2 بين الأنسجة السرطانية والأنسجة المجاورة. وبشكل جماعي، تشير تحليلات قواعد البيانات العامة إلى أن YTHDC2 قد يكون منخفض التعبير وله صلة إنذارية محتملة في سرطان الرئة غير صغير الخلايا، ولكن التحقق السريري المستقل في مجموعتنا لم يؤكد وجود تعبير تفاضلي معتد به. تسلط هذه النتائج الضوء على التباين الكبير بين مجموعات البيانات واسعة النطاق والمجموعات السريرية الواقعية، مما يشير إلى أنه من غير المرجح أن يعمل YTHDC2 كمؤشر حيوي تشخيصي أو إنذاري موثوق بمفرده، وقد يتطلب دمجه مع مؤشرات جزيئية إضافية لتحقيق القابلية للتطبيق السريري.
المقدمة
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
يعد سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)، والذي يشمل سرطان الخلايا الحرشفية والسرطان الغدي، أكثر أنواع سرطان الرئة تشخيصاً وسبباً رئيسياً لوفيات السرطان على مستوى العالم1. وتظهر إحصائيات السرطان العالمية أن سرطان الرئة هو أحد الأسباب الرئيسية لوفيات السرطان2. ولم تؤدِ التطورات الأخيرة في التشخيص والجراحة والعلاج الإشعاعي والعلاج الموجه جزيئياً إلى تحسين مآل مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا بشكل ملحوظ، وذلك لأن التشخيص الأولي يحدث في مرحلة متأخرة، وغالباً ما يكون المرض بدون أعراض في المراحل المبكرة3. وهذا يؤكد الحاجة إلى مؤشرات حيوية جديدة لتحديد المرض والتنبؤ بمآله وتقييم فعالية العلاج لدى مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا.
يُعد m6A أول تعديل تم تحديده وأكثر تعديلات RNA وفرة في حقيقيات النوى، وقد ارتبط باستقرار RNA وترجمته ونسخه4. وتتميز تعديلات m6A بأنها ديناميكية وقابلة للعكس، وتتم بتسهيل من إنزيمات ميثيل ترانسفيراز (الكُتّاب)، وإنزيمات إزالة الميثيل (الممحاة)، وبروتينات ربط محددة (القراء)5. ومن بين هذه البروتينات، يقوم YTHDC2، وهو بروتين قارئ رئيسي لـ m6A، بتنظيم استقرار RNA ومعدل الترجمة6. وتشير الدراسات الحديثة إلى أن YTHDC2 يشارك في تنظيم أنواع متعددة من السرطانات، إما عن طريق تثبيط نمو الخلايا وغزوها أو عن طريق تحفيز موت الخلايا7. كما سلطت الدراسات الضوء على الأهمية السريرية لبروتينات قارئة أخرى لـ m6A، بما في ذلك YTHDF1 و YTHDF2 و YTHDC1، في تطور سرطان الرئة والتنظيم المناعي والإنذار المرضي، مما يؤكد أهمية التقييم المنهجي للقراء الفرديين لـ m6A في مجموعات مستقلة من المرضى8,9,10. وفي سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)، توجد مستويات منخفضة بشكل ملحوظ من YTHDC2، وهو ما ارتبط بمراحل الورم المتقدمة، وانتشار العقد اللمفاوية، وسوء الإنذار المرضي للمرضى، مما يشير إلى أنه قد يكون عاملاً مضاداً للأورام11. كما كشفت التجارب المختبرية والحيوية أن التعبير العالي لـ YTHDC2 يثبط تكاثر الخلايا والانتشار في سرطان الرئة7.
في هذه الدراسة، تم استقصاء تنظيم YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) من خلال تحليلات حاسوبية متكاملة وتحقق تجريبي عبر تقنية qRT-PCR. كما تم بحث العلاقة بين تعبير YTHDC2 والخصائص المرضية السريرية وإنذار المرضى. وعلى الرغم من تزايد الأدلة المستمدة من قواعد البيانات العامة التي تشير إلى خلل في تنظيم YTHDC2 في NSCLC، فقد أفادت الدراسات المنشورة بنتائج غير متسقة فيما يتعلق بحجم وأهمية هذا الخلل السريرية، ولا يزال التحقق المستقل في مجموعات سريرية واقعية محددة الخصائص، خاصة في المجموعات السكانية الآسيوية، محدوداً. علاوة على ذلك، اعتمدت معظم الدراسات السابقة بشكل أساسي على مجموعات بيانات ترانسكريبتومية عامة أو نماذج تجريبية، مع وجود عدد قليل نسبياً من الدراسات التي تدمج نتائج المعلوماتية الحيوية مع تحقق سريري مستقل. ومن خلال الجمع بين تحليلات ترانسكريبتومية عامة واسعة النطاق وتحقق مستقل بواسطة qRT-PCR في مجموعة سريرية صينية، هدفت هذه الدراسة إلى تقييم مدى تكرار النتائج السابقة ومعالجة الفجوة الانتقالية بين تحليلات قواعد البيانات العامة والعينات السريرية الواقعية. وبناءً على ذلك، هدفت هذه الدراسة إلى تقييم تعبير YTHDC2 بشكل منهجي باستخدام مناهج متكاملة من المعلوماتية الحيوية والتحقق السريري، وتقدير أهميته البيولوجية والسريرية المحتملة في NSCLC. وقد افترضت الدراسة أن تعبير YTHDC2 مختل في NSCLC، وأن دمج تحليلات المعلوماتية الحيوية مع التحقق السريري المستقل سيوفر تقييماً أكثر موثوقية لأهميته التشخيصية والإنذارية مقارنة باستخدام أي من النهجين بمفرده.
البروتوكول
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تمت الموافقة على هذه الدراسة من قبل اللجنة الأخلاقية في جامعة هاينان الطبية (رقم الموافقة HMC1984.24)، وكانت متوافقة مع إعلان هلسنكي (بصيغته المنقحة في عام 2013).
أشخاص الدراسة
أُجريت دراسة شملت 50 مريضاً بسرطان الرئة تم تشخيصهم بين عامي 2017 و2024 في مستشفى سانيا المركزي بمقاطعة هاينان، وذلك وفقاً للإرشادات السريرية للجمعية الطبية الصينية لتشخيص وعلاج سرطان الرئة (طبعة 2024). وقد تم اعتماد تصنيف CSCO (2024) ليتوافق مع الإصدار الثامن من تصنيف AJCC لضمان القابلية للمقارنة بين الدراسات، كما تم التحقق من ذلك في المجموعات الصينية12، مع مراجعة مريضين من قبل طبيبين أورام مستقلين لضمان الاتساق. وتلخص الشكل 1 عملية اختيار المرضى، وتوفر الأنسجة، وتقييم جودة الـ RNA، والعينات النهائية المدرجة لتحليل qRT-PCR.
بيانات الدراسة
استخدمت هذه الدراسة المعلوماتية الحيوية لتحليل مستويات تعبير YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) وعلاقتها بالسمات السريرية المرضية، مما يوفر رؤى حول الآليات المحتملة. أُجريت تحليلات المعلوماتية الحيوية حصرياً باستخدام بيانات تسلسل RNA المتاحة علناً من أطلس جينوم السرطان (TCGA)، بما في ذلك سرطان الرئة الغدي (LUAD)، وسرطان الرئة الحرشف الخلايا (LUSC)، وعينات أنسجة الرئة الطبيعية المقابلة التي تم تنزيلها عبر بوابة بيانات GDC (https://portal.gdc.cancer.gov/). تضمنت مجموعة البيانات التي تم تنزيلها بيانات تعبير تسلسل RNA إلى جانب المتغيرات السريرية المتاحة (معرف المريض، ومعرف العينة، والعمر، والجنس، والمرحلة المرضية، وحالة البقاء على قيد الحياة، ووقت البقاء الإجمالي) للحالات المؤهلة من TCGA-LUAD وTCGA-LUSC. تم استبعاد العينات التي تفتقر إلى معلومات التعبير الجيني أو معلومات البقاء على قيد الحياة من تحليلات البقاء وتحليلات ROC اللاحقة. تتوفر مجموعة البيانات المستخدمة في هذه الدراسة في الملف التكميلي 1. لم تُستخدم أي عينات سريرية جُمعت من مستشفى سانيا المركزي في تحليلات المعلوماتية الحيوية. تتوفر الإجراءات التفصيلية لتحليلات GEPIA وKaplan–Meier Plotter وsurvivalROC في قسم تحليل المعلوماتية الحيوية أدناه. تم تلخيص سير عمل المعلوماتية الحيوية الكامل، بما في ذلك الحصول على البيانات، والمعالجة المسبقة، وتحليل التعبير الجيني، وتحليل البقاء، وتحليل ROC، في الشكل 2.
معايير الاشتمال والاستبعاد
تظهر معايير الإدراج والاستبعاد للمرضى في الجدول 1. وقد حدد تحليل القوة باستخدام برنامج تحليل القوة الإحصائية أن توفير 26 حالة على الأقل لكل مجموعة سيعطي قوة بنسبة 80% للكشف عن حجم تأثير متوسط (d = 0.8, α = 0.05، ثنائي الذيل). وبينما كان الهدف من التسجيل الأولي هو 50 زوجاً في مجموعة سرطان الرئة، شمل تحليل qRT-PCR النهائي 30 عينة ورمية و19 عينة من الأنسجة الطبيعية المجاورة بعد استبعاد العينات بسبب جودة الأنسجة أو الحمض النووي الريبي RNA. ويعكس هذا الانخفاض في حجم العينة القيود السريرية الواقعية ويسلط الضوء على أهمية سلامة RNA وتوفر الأنسجة في الدراسات الانتقالية. وعندما يكون n = 19 للمقارنات، فإن الحد الأدنى لحجم التأثير القابل للكشف هو d = 1.0 (قوة 80%، α = 0.05). وبالتالي، كانت التجربة ذات قوة كافية للكشف عن الاختلافات الكبيرة، ولكن ليس الاختلافات الصغيرة إلى المتوسطة، في تعبير YTHDC2.
عينات الأنسجة وتفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (qRT-PCR)
تم تحديد التشخيصات الباثولوجية بطريقة مزدوجة التعمية بواسطة اثنين من أطباء الباثولوجيا المختلفين. وقام أطباء الباثولوجيا بتقدير نقاء الورم (>70% من الخلايا الخبيثة) وتم تأكيده عبر ESTIMATE (TCGA). كما تم إجراء تشريح عياني للأنسجة الطبيعية المجاورة لتقليل التلوث السدوي. شملت الأنواع النسيجية لسرطان الرئة سرطان الرئة الغدي وسرطان الخلايا الحرشفية، بواقع 26 حالة من سرطان الرئة الغدي و4 حالات من سرطان الخلايا الحرشفية. أُجري التصنيف السريري لـ 50 مريضاً مصاباً بسرطان الرئة وفقاً لمعايير التصنيف الموضحة في "الإرشادات السريرية لجمعية medical association الصينية لسرطان الرئة (طبعة 2024)". ومثلت عينات NSCLC المؤكدة باثولوجياً (n = 50) التوزيعات السريرية النموذجية (انظر الجدول 2). ومن بين 50 مريضاً تم إدراجهم في البداية، استوفت 30 عينة من أنسجة الورم و19 عينة مطابقة من الأنسجة الطبيعية المجاورة معايير جودة RNA. ونظراً لأن التحليل الإحصائي المزدوج يتطلب عينات مطابقة من المريض نفسه، فقد أُجريت مقارنة التعبير الجيني في الورم مقابل الأنسجة الطبيعية المجاورة باستخدام الأزواج الـ 19 المطابقة المتاحة. استُخدمت هذه العينات السريرية حصرياً للتحقق التجريبي بواسطة qRT-PCR وتم تحليلها بشكل مستقل عن مجموعات بيانات TCGA العامة المستخدمة في تحليل المعلوماتية الحيوية. تمت معالجة هذه العينات المختارة فور التأكيد الباثولوجي والتعامل معها في ظروف خالية من RNase قبل استخلاص RNA. تعكس هذه المجموعة الفرعية الحالات التي أمكن فيها الحصول على كمية كافية من الأنسجة وRNA كلي عالي الجودة (رقم سلامة RNA، RIN >7.0). وتم قياس تركيز ونقاء RNA الكلي قبل النسخ العكسي، وأُدرجت فقط العينات ذات جودة RNA الكافية (RIN >7.0) في التحليلات اللاحقة. تم تحويل كميات متساوية من RNA الكلي إلى DNA مكمل (cDNA) عن طريق النسخ العكسي وفقاً لبروتوكول الشركة المصنعة قبل إجراء PCR الكمي. وضمنت هذه العملية صحة بيانات التعبير الجيني التي تم تحليلها. أُجريت تجارب qRT-PCR على جهاز thermocycler لـ PCR في الوقت الحقيقي باستخدام مقايسة PCR كمية تعتمد على المسبار. نُفذت جميع التفاعلات في ثلاث نسخ مكررة، جنباً إلى جنب مع ضوابط خالية من القالب لضمان قابلية التكرار التحليلي. أُجري تضخيم PCR في ظل ظروف الدورات التالية: خطوة تنشيط الإنزيم/المسخ الأولية عند 95°C لمدة 10 min، تلتها 40 دورة من المسخ عند 95°C لمدة 15 s والارتباط/التمديد عند 60°C لمدة 60 s. وتم الحصول على إشارات الفلورة في نهاية كل دورة تضخيم. تم الحصول على جميع الكواشف والمواد الاستهلاكية من موردين تجاريين (انظر جدول المواد). وتتوفر تسلسلات البادئات والمسبارات المستخدمة في qRT-PCR في الجدول 3.
التحليل المعلوماتي الحيوي
تحليل قاعدة بيانات GEPIA للتعبير الجيني لـ YTHDC2
تم استخدام قاعدة بيانات GEPIA لتحليل تعبير YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). تم الدخول إلى خادم GEPIA الإلكتروني (http://gepia.cancer-pku.cn/) عبر متصفح الويب، واختيار وحدة Expression DIY، ثم إدخال رمز الجين "YTHDC2"، واختيار مجموعات بيانات LUAD وLUSC، مع الإبقاء على معلمات التعيير الافتراضية، ومن ثم توليد مخططات الصندوق للتعبير التفاضلي مباشرة عبر واجهة GEPIA. وقد حُددت الدلالة الإحصائية بأن تكون p < 0.05.
قاعدة بيانات Kaplan-Meier plotter لتحليل البقاء على قيد الحياة لمرضى سرطان الرئة
حللت الدراسة العلاقة بين تعبير YTHDC2 والإنذار لدى مرضى سرطان الرئة باستخدام قاعدة بيانات Kaplan-Meier Plotter. تم اختيار مجموعة بيانات سرطان الرئة، وإدخال رمز الجين "YTHDC2"، وتطبيق خيار نقطة القطع المثلى المختارة تلقائياً، ثم تم إنشاء منحنيات Kaplan–Meier للبقاء على قيد الحياة الإجمالي والبقاء على قيد الحياة بعد تطور المرض باستخدام إعدادات التحليل الافتراضية. تم تقسيم المرضى تلقائياً إلى مجموعات ذات تعبير عالٍ ومنخفض بناءً على نقطة القطع المثلى التي حددتها منصة Kaplan–Meier Plotter، كما تم استخراج نسب المخاطر مع فواصل الثقة 95% المقابلة باستخدام الإعدادات الافتراضية للمنصة.
تشغيل حزم R في برنامج R لرسم منحنى ROC
تم تنزيل بيانات تعبير تسلسل الـ RNA والبيانات السريرية الوصفية المقابلة لها للحالات المؤهلة من TCGA-LUAD وTCGA-LUSC من بوابة بيانات GDC. تم دمج مجموعات البيانات التي تم تنزيلها بواسطة معرف المريض واستيرادها إلى برنامج R لإجراء التحليلات اللاحقة. استُخدمت حزمة survivalROC لإنشاء منحنيات ROC المعتمدة على الوقت عند نقاط زمنية تنبؤية تبلغ 1 و3 و5 سنوات، وحُسبت قيم المساحة تحت المنحنى (AUC) المقابلة لتقييم الأداء الإنذاري لتعبير YTHDC2. شمل تحليل survival ROC فقط مرضى TCGA-LUAD وTCGA-LUSC الذين تتوفر لديهم معلومات تعبير RNA-seq ومعلومات البقاء على قيد الحياة. ولم تُستخدم المجموعة السريرية المحلية للتنبؤ بالبقاء على قيد الحياة نظراً لعدم توفر بيانات المتابعة طويلة الأمد.
تعبير YTHDC2 في الأنسجة بواسطة qRT-PCR
لتحليل مستويات التعبير الجيني، تم إجراء تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (qRT-PCR). أضيفت أحجام متساوية من cDNA إلى كل تفاعل وفقاً لظروف التفاعل الموصى بها من قبل الشركة المصنعة. تم إجراء التضخيم باستخدام مقايسة PCR كمية تعتمد على المسبار، وجُمعت بيانات الفلورة تلقائياً في نهاية كل دورة تضخيم. باختصار، تضمنت عملية استخلاص RNA عدة خطوات، شملت تحضير العينة، وإزالة البارافين، وإزالة السوائل المتبقية، والهضم باستخدام البروتيناز K، والحضن، والطرد المركزي، والمعالجة بإنزيم DNase، وإضافة DNase I، والترسيب بالإيثانول. ثم رُبطت العينة بعمود تنقية RNA يعتمد على السيليكا وجرى طردها مركزياً عند 8,000 × g لمدة 30 s. غُسل العمود بعد ذلك بمحلول الغسيل 1، ومحلول الغسيل 2، ومحلول الغسيل 2 المخفف بالإيثانول، ثم جُفف عند 13,000 × g لمدة 2 min. استُخلص RNA بعد ذلك بإضافة 70 µL من الماء الخالي من RNase إلى مركز غشاء العمود، متبوعاً بالطرد المركزي عند 13,000 × g لمدة 1 min. أظهر كل زوج من البادئات منتج تضخيم واحداً، وهو ما تم تأكيده بواسطة تحليل منحنى الانصهار قبل حساب التعبير الجيني النسبي. تم التحقق من كفاءة البادئات (90–110%) باستخدام منحنيات قياسية قبل تحليل العينات. وأكدت تحليلات منحنى الانصهار وجود مضخمات فردية وغياب ثنائيات البادئات. حُسب التعبير النسبي لـ YTHDC2 باستخدام طريقة 2-ΔCt، حيث تم تطبيع قيم Ct بالنسبة للجين المرجعي الداخلي GAPDH. وبما أن قيم التعبير قُدمت كمستويات تعبير مطبعة بدلاً من تغيرات طيّة بالنسبة لعينة معايرة، فقد تم الإبلاغ عن النتائج كقيم 2−ΔCt. تم اختيار GAPDH كجين تدبير منزلي لأن تعبيره أظهر تبايناً أدنى (CV < 5%) مقارنة بالبدائل المختبرة (ACTB، CV = 12%؛ 18S rRNA، CV = 18%)، وهو ما يتفق مع معايير اختيار الجينات المرجعية في دراسات m6A.
التحليل الإحصائي
أجريت التحليلات الإحصائية باستخدام برامج إحصائية، بما في ذلك إنشاء الرسوم البيانية والمخططات. ولتحليل البيانات الكمية والفئوية الخاصة بالتعبير الجيني لـ YTHDC2 في مرضى NSCLC، استُخدم برنامج R لإجراء تحليلات المعلوماتية الحيوية وإنشاء منحنيات ROC. كما استُخدمت منحنيات ROC والمساحة تحت المنحنى (AUC) لتقييم الأداء التشخيصي للتعبير عن YTHDC2 في التنبؤ بالبقاء على قيد الحياة. وبالنسبة للتحليلات القائمة على الانحدار، تم تسجيل تقديرات التأثير (نسب الأرجحية) مع فواصل الثقة المقابلة بنسبة 95% حيثما كان ذلك مناسباً. استُخدم اختبار ويلكوكسون للرتب الموقعة (Wilcoxon signed-rank test) لمقارنة التعبير عن YTHDC2 بين عينات الورم والأنسجة الطبيعية المجاورة المقترنة، بينما استُخدم تحليل ارتباط بيرسون لتقييم العلاقة بين التعبير عن YTHDC2 والسمات المرضية السريرية. وتم تسجيل معاملات الارتباط (r) وقيم p المقابلة لها. ونظراً لأن بيانات qRT-PCR تضمنت عينات مقترنة من الورم والأنسجة الطبيعية المجاورة من نفس المرضى، ولأن بيانات التعبير الجيني لم تكن موزعة توزيعاً طبيعياً، فقد استُخدم اختبار ويلكوكسون للرتب الموقعة لمقارنة مستويات التعبير عن YTHDC2 بين الأنسجة المقترنة؛ حيث لا يفترض هذا الاختبار طبيعية توزيع البيانات ويُستخدم عادةً للبيانات البيولوجية ذات التوزيع الملتوي. كانت جميع الاختبارات الإحصائية ثنائية الذيل، واعتُبرت قيمة p <0.05 دالة إحصائياً. كما تم تقييم المتغيرات المستمرة للتأكد من طبيعية توزيعها قبل التحليل، وعُرضت المتغيرات المستمرة كمتوسط ± انحراف معياري أو وسيط (المدى الربيعي)، حسبما هو مناسب.
النتائج
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تعبير جين YTHDC2 في الأورام استناداً إلى قاعدة بيانات TCGA
الشكل 3 يوضح الارتباط بين سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) وبروتين YTHDC2 من خلال فحص مستويات تعبير YTHDC2 عبر أنواع مختلفة من السرطانات باستخدام أداة GDC في قاعدة بيانات TCGA.
تعبير جين YTHDC2 في سرطان الخلايا غير الصغيرة الرئوي (NSCLC) في قاعدة بيانات GEPIA
تم الحصول على 483 عينة نسيجية من سرطان الرئة الغدي، و347 عينة نسيجية من الرئة الطبيعية، و486 عينة نسيجية من سرطان الرئة الخلايا الحرشفية، و338 عينة نسيجية من الرئة الطبيعية، وذلك من خلال فحص إضافي لمستويات تعبير YTHDC2 في سرطان الرئة الغدي (LUAD) وسرطان الرئة الخلايا الحرشفية (LUSC) ضمن قاعدة بيانات GEPIA. ومن خلال التحليلات الإحصائية، وُجد أن أنسجة كل من سرطان الرئة الغدي وسرطان الرئة الخلايا الحرشفية تظهر مستويات تعبير لـ YTHDC2 أقل بكثير مقارنة بأنسجة الرئة الطبيعية (p < 0.05)، كما هو موضح في الشكل 4.
تحليل GEPIA للتعبير عن YTHDC2 عبر المراحل المرضية
استُخدمت قاعدة بيانات GEPIA (التحليل التفاعلي لتوصيف التعبير الجيني) لإنشاء مخطط مراحل لتقييم التعبير التفاضلي لـ YTHDC2 عبر مراحل سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). وكما هو موضح في الشكل 5، لم تُلاحظ أي فروق ذات دلالة إحصائية في تعبير YTHDC2 عبر المراحل المرضية لـ NSCLC (p = 0.644).
تحليل كابلان-ماير لبقاء مرضى سرطان الرئة وعلاقته ببروتين YTHDC2
استُخدمت قاعدة بيانات Kaplan-Meier Plotter لإجراء تحليل بقاء كابلان-ماير لجين YTHDC2. ووفقاً للنتائج، أظهر المرضى الذين لديهم تعبير مرتفع عن YTHDC2 بقاءً إجمالياً (OS) أعلى بشكل ملحوظ مقارنة بأولئك الذين لديهم تعبير منخفض (p < 0.05). وكما هو موضح في الشكل 6A (OS)، كان مآل المرضى المصابين بسرطان الرئة الذين أظهروا مستويات أعلى من YTHDC2 أفضل، وكان هذا الفرق ذا دلالة إحصائية (p < 0.05). ووفقاً لـ الشكل 6B (PPS)، أظهرت المجموعة ذات التعبير المرتفع عن YTHDC2 مآلاً أفضل من المجموعة ذات التعبير المنخفض في مجموعة بيانات البقاء بعد تطور المرض (PPS)؛ وكان الفرق ذا دلالة إحصائية (p < 0.05).
نموذج التنبؤ بمعدل البقاء على قيد الحياة لـ YTHDC2
كشف تحليل منحنى خصائص التشغيل للمستقبل (ROC) المعتمد على الوقت، والمستند إلى بيانات التعبير عن RNA-seq وبيانات البقاء من أطلس جينوم السرطان (TCGA)، عن قدرة تنبؤية محدودة للتعبير عن YTHDC2 بمفرده فيما يتعلق بالبقاء على قيد الحياة لمرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)، حيث بلغت قيم المساحة تحت المنحنى (AUC) 0.50 (95% CI: 0.38-0.62)، و0.51 (95% CI: 0.39-0.63)، و0.52 (95% CI: 0.40-0.64)، و0.52 (95% CI: 0.39–0.65) عند سنة و3 سنوات و5 سنوات و8 سنوات على التوالي (الشكل 7). وقد شملت جميع فترات الثقة لقيم AUC القيمة 0.5، مما يشير إلى أداء يعادل الصدفة العشوائية. وتشير هذه النتائج إلى أن التعبير عن YTHDC2 بمفرده يفتقر إلى القوة التمييزية للتنبؤ بالبقاء على قيد الحياة، ولا ينبغي اعتباره مؤشراً حيوياً إنذارياً مستقلاً. وقد يؤدي الدمج مع المتغيرات السريرية المرضية أو التواقيع الجينية المتعددة إلى تحسين الأداء التنبؤي.
تعبير YTHDC2 في الأنسجة السرطانية مقابل الأنسجة الطبيعية بواسطة qRT-PCR
تم استقصاء تعبير جين YTHDC2 في كل من الأنسجة الخبيثة والأنسجة الطبيعية المجاورة لدى مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) باستخدام تقنية qRT-PCR. وكان تعبير YTHDC2 المُقنن (2−ΔCt) هو 3.24 ± 2.34 في الأنسجة الخبيثة و3.60 ± 1.70 في الأنسجة الطبيعية المجاورة. لم يكن هناك فرق معنوي في تعبير YTHDC2 بين 19 زوجاً من أنسجة أورام NSCLC والأنسجة الطبيعية المجاورة المطابقة لها (p = 0.537)، كما هو موضح في الشكل 8. وبينما أشار تحليل المعلوماتية الحيوية لمجموعات البيانات الكبيرة إلى انخفاض معنوي في تعبير YTHDC2 في حالات NSCLC، إلا أن نتائج qRT-PCR في مجموعتنا لم تظهر فرقاً معنوياً، مما يسلط الضوء على التناقضات المحتملة الناتجة عن حجم المجموعة، وعدم تجانس العينات، والتباين التقني. بالإضافة إلى ذلك، تشير قيمة AUC المنخفضة (0.5) إلى أن YTHDC2 وحده يفتقر إلى الدقة التشخيصية أو التنبؤية.
تعبير YTHDC2 والسمات المرضية السريرية في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)
شملت هذه الدراسة 50 شخصاً مصاباً بسرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). كان هناك 32 مريضاً من الذكور (64.00%) و18 مريضة من الإناث (36.00%)، بمتوسط عمر بلغ 63.10 ± 9.85 سنة. وتراوحت أعمارهم بين 37 و86 سنة. ومن بين المرضى، كان 25 منهم قد دخنوا في الماضي، و25 لم يدخنوا قط. تضمنت الأنواع المرضية تسع حالات من سرطان الخلايا الحرشفية (18.00%) وإحدى وأربعين حالة من سرطان الرئة الغدي (82.0%). وكان 22 مريضاً في المرحلتين III–IV (44.00%) و28 مريضاً في المرحلتين I–II (56.00%) وفقاً للتصنيف السريري لـ CSCO. لم يعانِ أربعة وعشرون مريضاً من نقائل في العقد اللمفاوية، بينما عانى من ذلك ستة وعشرون شخصاً (54.00%). وكان لدى تسعة مرضى سرطانات ضعيفة التمايز (18.00%)، بينما كان لدى 41 مريضاً أورام جيدة إلى متوسطة التمايز (82.00%).
تم فحص الارتباط بين الخصائص المرضية السريرية ومستويات تعبير YTHDC2 في أنسجة سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). لوحظت اختلافات في تعبير YTHDC2 بين الأنواع الفرعية المرضية ووفقاً لحالة النقائل في العقد اللمفاوية (p < 0.05). ومع ذلك، ونظراً لتوفر أربع عينات فقط من سرطان الخلايا الحرشفية، يجب تفسير مقارنة الأنواع الفرعية المرضية بحذر واعتبارها استكشافية. وكما هو موضح في الشكلين 9A وB، كان تعبير YTHDC2 أعلى بشكل ملحوظ في سرطان الخلايا الحرشفية مقارنة بسرطان الرئة الغدي، وكان أعلى بشكل ملحوظ في أنسجة NSCLC التي تعاني من نقائل في العقد اللمفاوية مقارنة بتلك التي لا تعاني من نقائل (5.70 ± 2.53 مقابل 3.83 ± 0.91, p = 0.027). ومع ذلك، وبسبب إدراج أربع عينات فقط من سرطان الخلايا الحرشفية، يجب تفسير المقارنة بين الأنواع الفرعية المرضية بحذر واعتبارها استكشافية في انتظار التحقق من صحتها في مجموعات أكبر. قد يشير ارتفاع تعبير YTHDC2 لدى المرضى الذين يعانون من نقائل في العقد اللمفاوية إلى وجود ارتباط محتمل بين YTHDC2 وحالة النقائل في العقد اللمفاوية؛ غير أن هذه النتيجة يجب أن تُفسر بحذر نظراً لصغر حجم العينة وتتطلب التحقق في مجموعات مستقلة أكبر. ومن ناحية أخرى، لم يؤثر العمر، وتاريخ التدخين، والمرحلة السريرية وفقاً لـ CSCO، والتمايز النسيجي بشكل ملحوظ على تعبير YTHDC2 (p > 0.05). تتوفر معلومات إضافية في الجدول 4، والجدول 5، والشكل 9.
الانحدار اللوجستي الثنائي لانتشار العقد اللمفاوية في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC)
بما يتفق مع تحليل الارتباط، ارتبط تعبير YTHDC2 بشكل معنوي بنقائل العقد اللمفاوية (p < 0.05). وباعتبار نقائل العقد اللمفاوية هي المتغير التابع، وكل من العمر، والجنس، وتاريخ التدخين، ومرحلة الورم، والنوع المرضي، ومستوى تعبير YTHDC2، ودرجة التمايز هي المتغيرات المستقلة، أُجري تحليل انحدار لوجستي ثنائي على مرضى NSCLC. وأظهرت النتائج أن تعبير YTHDC2 لدى مرضى NSCLC ارتبط بشكل معنوي بنقائل العقد اللمفاوية (p = 0.027, OR = 2.286, 95% CI: 1.101–4.748).
في البيانات السريرية العامة، ارتبطت مرحلة الورم لدى مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) ارتباطاً وثيقاً من الناحية الإحصائية بنقائل العقد اللمفاوية (p = 0.007, OR = 27, 95% CI: 2.504-291.186). ومع ذلك، لم يظهر العمر، والجنس، وتاريخ التدخين، والنوع الباثولوجي، ودرجة التمايز ارتباطاً معنوياً بنقائل العقد اللمفاوية في حالات NSCLC (p > 0.05)، كما هو موضح في الجدول 6.
توافر البيانات: تتوفر مجموعات البيانات التي تدعم نتائج هذه الدراسة في مستودع Zenodo (DOI: 10.5281/zenodo.21409961). ويتضمن المستودع البيانات الوصفية السريرية لـ TCGA، وتوضيحات العينات، ومواصفات استرجاع البيانات، وبيان التحليل المستخدم في تحليلات المعلوماتية الحيوية. كما تتوفر بيانات إضافية من المؤلف المسؤول عند تقديم طلب معقول.
الشكل 1: مخطط تدفقي لاختيار المرضى وإدراج الأنسجة لتحليل qRT-PCR. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 2. سير عمل تحليلات المعلوماتية الحيوية التي أجريت لتقييم تعبير YTHDC2 والأهمية الإنذارية في NSCLC يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 3: تعبير جين YTHDC2 في قاعدة بيانات TCGA. تمت مقارنة مستويات تعبير YTHDC2 في سرطان الرئة الغدي (LUAD) وسرطان الرئة حرشفي الخلايا (LUSC) مع مستوياتها في أنسجة الرئة الطبيعية باستخدام بيانات تسلسل RNA التي تم الحصول عليها من أطلس جينوم السرطان (TCGA) عبر بوابة بيانات Genomic Data Commons (GDC)، وتم تحليلها باستخدام منصة GEPIA الإلكترونية. حُللت البيانات من خلال منصة GEPIA. تم تحديد الدلالة الإحصائية بقيمة p-value < 0.05. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 4: التعبير التفاضلي لـ YTHDC2 في NSCLC بناءً على تحليل قاعدة بيانات GEPIA. تمت مقارنة مستويات تعبير YTHDC2 في سرطان الرئة الغدي (LUAD) وسرطان الرئة الخلايا الحرشفية (LUSC) مع تلك الموجودة في أنسجة الرئة الطبيعية باستخدام بيانات من مشروعي The Cancer Genome Atlas (TCGA) وGenotype-Tissue Expression (GTEx) عبر منصة GEPIA. تمثل المخططات الصندوقية مستويات التعبير الجيني المُطبعة. تم تحديد الدلالة الإحصائية بقيمة p-value < 0.05. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 5: تحليل تعبير YTHDC2 حسب المرحلة في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) باستخدام قاعدة بيانات GEPIA. تم تحليل مستويات تعبير YTHDC2 عبر المراحل المرضية المختلفة (I–IV) لسرطان الرئة غير صغير الخلايا باستخدام منصة GEPIA. يوضح مخطط المراحل التباين في التعبير الجيني عبر مراحل الورم. لم تُلاحظ فروق ذات دلالة إحصائية في تعبير YTHDC2 بين المراحل (p = 0.644). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 6: تحليل البقاء على قيد الحياة بطريقة كابلان-ماير لتعبير YTHDC2 في مرضى NSCLC (أداة Kaplan–Meier Plotter). (A) البقاء الإجمالي (OS): منحنيات البقاء بطريقة كابلان-ماير لمقارنة البقاء الإجمالي في مرضى NSCLC المصنفين إلى مجموعات تعبير YTHDC2 مرتفع (n = 140) ومنخفض (n = 364)، باستخدام إعداد نقطة القطع المثلى ("الاختيار التلقائي لأفضل نقطة قطع") المقدمة بواسطة أداة Kaplan–Meier Plotter. استُخدم اختبار log-rank لتقييم الدلالة الإحصائية (p = 0.0093)؛ نسبة الخطر (HR) = 0.61؛ فاصل ثقة 95% (CI): 0.42–0.89. يرتبط ارتفاع تعبير YTHDC2 ببقاء إجمالي أفضل بشكل ملحوظ. (B) البقاء بعد تطور المرض (PPS): منحنيات البقاء بطريقة كابلان-ماير لمقارنة البقاء بعد تطور المرض في مرضى NSCLC المصنفين إلى مجموعات تعبير YTHDC2 مرتفع (n = 181) ومنخفض (n = 296)، باستخدام إعداد نقطة القطع المثلى ("الاختيار التلقائي لأفضل نقطة قطع") المقدمة بواسطة أداة Kaplan–Meier Plotter. استُخدم اختبار log-rank للمقارنة الإحصائية (p = 4.2 × 10⁻5)؛ نسبة الخطر (HR) = 0.63 (فاصل ثقة 95%: 0.51–0.79). يرتبط التعبير المرتفع لـ YTHDC2 ببقاء أطول بشكل ملحوظ بعد تطور المرض. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 7: نموذج التنبؤ بمعدل البقاء على قيد الحياة لـ YTHDC2. منحنيات خصائص التشغيل للمستقبل (ROC) لتقييم دقة التنبؤ لـ YTHDC2 للبقاء الإجمالي على قيد الحياة في مرضى TCGA-LUAD و TCGA-LUSC الذين تتوفر لديهم بيانات تعبير RNA-seq وبيانات البقاء على قيد الحياة عند النقاط الزمنية 1 و 3 و 5 و 8 سنوات. قيم AUC: سنة واحدة = 0.50، 3 سنوات = 0.51، 5 سنوات = 0.52، و 8 سنوات = 0.52. يشير الخط القطري المقطع إلى الصدفة العشوائية (AUC = 0.5). أجري التحليل باستخدام حزمة survival ROC في برنامج R. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 8: تعبير YTHDC2 في أنسجة أورام NSCLC والأنسجة الطبيعية المجاورة المزدوجة المقاس بواسطة qRT-PCR. تم حساب التعبير النسبي لـ YTHDC2 باستخدام طريقة 2–ΔCt وعُيّر بالنسبة لـ GAPDH. تمثل قيم التعبير مستويات التعبير المُعيّرة بدلاً من التغيرات المضاعفة بالنسبة لعينة معايرة. أُجري التحليل الإحصائي باستخدام 19 زوجاً متطابقاً من أنسجة الورم والأنسجة الطبيعية المجاورة المتاحة للمقارنة المزدوجة. تُعرض البيانات كملاحظات مزدوجة فردية مع المتوسط ± الانحراف المعياري. حُللت الفروق بين العينات المزدوجة باستخدام اختبار ويلكوكسون للرتب الموقعة (p = 0.537). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 9: الارتباط بين تعبير YTHDC2 والخصائص المرضية السريرية لدى مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). (أ) تعبير YTHDC2 في الأنواع المرضية المختلفة، حيث يظهر تعبير أعلى في سرطان الخلايا الحرشفية مقارنة بسرطان الغدد (p < 0.05). (ب) تعبير YTHDC2 وفقاً لحالة نقائل العقد اللمفاوية، مما يظهر تعبيراً أعلى لدى المرضى الذين يعانون من نقائل في العقد اللمفاوية مقارنة بأولئك الذين لا يعانون من النقائل (p < 0.05). (ج) تعبير YTHDC2 عبر درجات التمايز النسيجي المختلفة، دون وجود فرق ذو دلالة إحصائية (p = 0.181). (د) تعبير YTHDC2 عبر المراحل السريرية لـ CSCO، دون وجود فرق ذو دلالة إحصائية (p = 0.08). تم قياس مستويات تعبير YTHDC2 بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الحقيقي (qRT-PCR) وحُسبت باستخدام طريقة 2–ΔCt، مع المعايرة بناءً على GAPDH. البيانات معروضة كمتوسط ± الانحراف المعياري (SD). أُجريت المقارنات الإحصائية باستخدام اختبار ويلكوكسون لمجموع الرتب (Wilcoxon rank-sum test). اعتُبرت القيمة *p < 0.05 ذات دلالة إحصائية. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
| الرقم التسلسلي | معايير الاشتمال | معايير الاستبعاد |
| 1 | العمر ≥18 عاماً، بغض النظر عن الجنس. | تشخيص الأورام الخبيثة الأخرى. |
| 2 | تشخيص مؤكد لسرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) وفقاً للإرشادات السريرية لسرطان الرئة الصادرة عن الجمعية الطبية الصينية (طبعة 2024). | وجود أمراض تنفسية أو قلبية وعائية مزمنة (على سبيل المثال: مرض الانسداد الرئوي المزمن، وأمراض القلب الرئوية، وفشل القلب). |
| 3 | توافر البيانات السريرية الكاملة، بما في ذلك التفاصيل الديموغرافية، ووسوم الأورام المصلية، وتصوير الصدر المقطع المحوسب المعزز، مع موافقة مستنيرة موقعة. | خلل وظيفي عضوي شديد، بما في ذلك القصور الكلوي (معدل الترشيح الكبيبي التقديري (eGFR <(30 مل/دقيقة/1.73 متر مربع) أو تليف الكبد. |
| 4 | المرضى الذين لم يتلقوا علاجاً سابقاً ولم يخضعوا لعلاجات سابقة موجهة ضد الورم. | الفئات الخاصة، بما في ذلك النساء الحوامل أو المرضعات (يتم التأكد من ذلك عن طريق اختبار β-hCG حيثما ينطبق). |
| 5 | توفر عينات كافية من الورم و/أو الأنسجة المجاورة تكون مناسبة للتحليل الجزيئي. | رداءة جودة العينة، بما في ذلك عدم كفاية الأنسجة أو تحلل الحمض النووي الريبي RNA (والذي يتم تأكيده من خلال مراجعة أخصائي علم الأمراض). |
الجدول 1: معايير الاشتمال والاستبعاد لمرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) في الدراسة
| نوع النسيج | العينات المزدوجة التي تم تحليلها (n) | التعبير النسبي (المتوسط ± الانحراف المعياري) |
| نسيج الورم | 19 | 3.24 ± 2.34 |
| النسيج الطبيعي المجاور المطابق | 19 | 3.60 ± 1.70 |
الجدول 2: تعبير YTHDC2 في أنسجة الأورام المقترنة وسرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) والأنسجة الطبيعية المجاورة. تم قياس التعبير النسبي لـ YTHDC2 باستخدام طريقة 2–ΔCt والمعايرة بالنسبة لـ GAPDH. تُمثَّل البيانات في صورة المتوسط ± الانحراف المعياري (SD). أُجريت المقارنة الإحصائية لـ 19 زوجاً متطابقاً من أنسجة الأورام والأنسجة الطبيعية المجاورة باستخدام اختبار ويلكوكسون للرتب الموقعة (p = 0.537).
| الجين المستهدف | البادئ/المسبار | التسلسل (5′→3′) |
| YTHDC2 | أمامي (F) | CCTGTCACCAATAAAGAGCG |
| عكسي (R) | CACTGGAATCTGAGGTATGCC | |
| المسبار (P) | AGCAAGACAAGTGGGCGACTCAA | |
| GAPDH | أمامي (F) | AATCCCATCACCATCTTCCAG |
| عكسي (R) | ATGACCCTTTTGGCTCCC | |
| مسبار (P) | CCAGCATCGCCCCACTTGATTTT |
الجدول 3: تسلسلات البادئات والمجسات المستخدمة في تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي في الوقت الفعلي (qRT-PCR). تم قياس تعبير YTHDC2 باستخدام كيمياء TaqMan، مع استخدام GAPDH كضابط داخلي.
| الخاصية | الفئة | n | % |
| النوع المرضي | سرطان غدي | 41 | 82 |
| سرطان الخلايا الحرشفية | 9 | 18 | |
| تصنيف CSCO | I–II | 28 | 56 |
| III–IV | 22 | 44 | |
| نقيلة العقد اللمفاوية | لا | 24 | 48 |
| نعم | 26 | 52 | |
| درجة التمايز | تمايز منخفض | 9 | 18 |
| تمايز متوسط إلى عالٍ | 41 | 82 | |
| العمر | ≥60 عاماً | 36 | 72 |
| <60 عاماً | 14 | 28 | |
| الجنس | ذكر | 32 | 64 |
| أنثى | 18 | 36 | |
| تاريخ التدخين | نعم | 25 | 50 |
| لا | 25 | 50 |
الجدول 4: الخصائص السريرية والمرضية لمرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). يتم عرض البيانات كأرقام (n) ونسب مئوية (%) بناءً على إجمالي عدد السكان في الدراسة (n = 50).
| السمات المرضية السريرية | مجموعة | نـ | تعبير YTHDC2 (المتوسط ± الانحراف المعياري) | بما أنك لم تقدم نصاً محدداً لترجمته، يرجى تزويدي بالمحتوى العلمي أو التعليمي من JoVE الذي ترغب في ترجمته، وسأقوم بتحويله إلى اللغة العربية بدقة أكاديمية وعلمية وفقاً للمعايير التي حددتها.القيمة الاحتمالية (p-value) |
| نوع النسيج | ورم | 30 | 3.24 ± 2.34 | 0.537 |
| طبيعي مجاور | 19 | 3.60 ± 1.70 | ||
| النمط الباثولوجي | سرطان غدي | 26 | 4.13 ± 1.29 | 0.022* |
| سرطان الخلايا الحرشفية | 4 | 7.50 ± 3.41 | ||
| تحديد المرحلة وفقاً لتصنيف CSCO | ١-٢ | 22 | 4.29 ± 1.94 | 0.08 |
| ٣-٤ | 8 | 5.05 ± 1.51 | ||
| النقائل العقدية اللمفاوية | لا | 19 | 3.83 ± 0.91 | 0.027* |
| نعم | 11 | 5.70 ± 2.53 | ||
| التمايز النسيجي | متمايز بدرجة متوسطة إلى جيدة | 25 | 4.33 ± 1.90 | 0.181 |
| ضعيف التمايز | 5 | 5.18 ± 1.60 | ||
| العمر | ≥60 سنة | 20 | 4.62 ± 2.10 | 0.835 |
| <60 عاماً | 10 | 4.16 ± 1.12 | ||
| التاريخ التدخيني | نعم | 12 | 4.62 ± 2.40 | 0.845 |
| لا | 18 | 4.38 ± 1.40 |
الجدول 5: الارتباط بين تعبير YTHDC2 والسمات المرضية السريرية لدى مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). تم قياس تعبير YTHDC2 بواسطة qRT-PCR وحُسب باستخدام طريقة 2–ΔCt، مع المعايرة وفقاً لـ GAPDH. البيانات معروضة في شكل المتوسط ± الانحراف المعياري (SD). تمثل أحجام المجموعات (n) عدد العينات الصالحة التي تم تحليلها. أجريت المقارنات الإحصائية بين المجموعات باستخدام اختبار ويلكوكسون لمجموع الرتب. اعتبرت قيمة p < 0.05 ذات دلالة إحصائية.
| المتغير | β | اختبار والد (Wald) | القيمة الاحتمالية (p-value) | نسبة الأرجحية (OR) | فاصل ثقة 95% CI |
| العمر (≥60 مقابل <60) | 0.07 | 0.01 | 0.93 | 1.08 | 0.20–5.68 |
| الجنس (أنثى مقابل ذكر) | 0.53 | 0.4 | 0.525 | 1.7 | 0.33–8.67 |
| تاريخ التدخين (نعم مقابل لا) | 0.54 | 0.46 | 0.496 | 1.71 | 0.36–8.09 |
| مرحلة الورم (III–IV مقابل I–II) | 3.3 | 7.38 | 0.007* | 27 | 2.50–291.18 |
| درجة التمايز (ضعيف مقابل متوسط-جيد) | –1.29 | 1.62 | 0.204 | 0.28 | 0.04–2.02 |
| تعبير YTHDC2 | 0.83 | 4.91 | 0.027* | 2.29 | 1.10–4.75 |
الجدول 6: تحليل الانحدار اللوجستي متعدد المتغيرات للعوامل المرتبطة بانتقال الورم إلى العقد الليمفاوية في مرضى سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC). تم إجراء الانحدار اللوجستي الثنائي باستخدام انتقال الورم إلى العقد الليمفاوية كمتغير تابع. تم تسجيل نسب الأرجحية (ORs) مع فواصل ثقة (CI) بنسبة 95%. فئات المرجعية: العمر (<60 عاماً)، والجنس (ذكر)، وتاريخ التدخين (لا)، ومرحلة الورم (I–II)، والتمايز (متوسط-جيد). تشير قيمة p < 0.05 إلى وجود دلالة إحصائية.*
المناقشة
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
يعد YTHDC2، وهو أكبر بروتين رابط لـ N6-methyladenosine (m6A) في عائلة YTH، فريداً بنشاطه كإنزيم RNA helicase المعتمد على ATP، مما يجعله منظماً رئيسياً لاستقلاب RNA13. وبخلاف الأعضاء الآخرين في عائلة YTH، يتواجد YTHDC2 في كل من النواة والسيتوبلازم، حيث يعمل على تنظيم ترجمة mRNA واستقرار RNA14. وقد أظهرت الدراسات التجريبية السابقة أن YTHDC2 يثبط تطور سرطان الرئة الغدي (LUAD) من خلال تثبيط تعبير mRNA لكل من ADIRF و MRPL12، وتعزيز الموت الخلوي المبرمج، وتقليل تكاثر الخلايا والانتشار الورمي15,16. كما أشارت الدراسات التجريبية السابقة أيضاً إلى أن YTHDC2 يعمل على تثبيت lncRNAs مثل ZNRD1-AS1 لتثبيط تكاثر LUAD، وينظم mRNAs المعدلة بـ m6A مثل CYLD و SLC7A11، مما يؤدي إلى تثبيط مسار إشارات NF-κB، وامتصاص السيستين، والعمليات المضادة للأكسدة، بينما يحفز الموت الخلوي الحديدي (ferroptosis) والنشاط المضاد للسرطان17,18.
في هذه الدراسة، تم تقصي تعبير والأهمية السريرية لبروتين قارئ m6A وهو YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) باستخدام نهج تكاملي يجمع بين التحليلات المعلوماتية الحيوية والتحقق التجريبي. وكشف هذا التحليل المعلوماتي الحيوي لقواعد بيانات TCGA وGEPIA عن انخفاض ملحوظ في تعبير YTHDC2 في أنسجة أورام NSCLC مقارنة بأنسجة الرئة الطبيعية، كما ارتبط ارتفاع تعبير YTHDC2 بتحسن معدلات البقاء الإجمالية والبقاء بعد تطور المرض، مما يشير إلى دور إنذاري محتمل. ومن المثير للاهتمام أن تجارب qRT-PCR التي أجريناها باستخدام 19 عينة مزدوجة متاحة من الورم والأنسجة الطبيعية المجاورة في المجموعة الحالية لم تظهر فرقاً ذا دلالة إحصائية في تعبير YTHDC2 بين الأنسجة الورمية والأنسجة الطبيعية المجاورة. ويسلط هذا التضارب الضوء على تحديات نقل النتائج من مجموعات البيانات العامة واسعة النطاق إلى مجموعات سريرية مستقلة، ويؤكد الحاجة إلى تفسير حذر للتحليلات التي تتم عبر الحاسوب (in silico). إن فهم الأسباب الكامنة وراء هذه الاختلافات أمر بالغ الأهمية لتقييم فائدة YTHDC2 كعلامة بيولوجية وهدف علاجي في NSCLC بدقة. ويتماشى تركيز الدراسة الحالية على YTHDC2 مع نشاط الهليكاز الفريد الذي يتميز به من بين قارئات YTH19، إلا أن التحليلات الحديثة الشاملة للسرطانات كشفت عن أدوار تعتمد على السياق لأفراد آخرين من هذه العائلة. فعلى سبيل المثال، أثبت Li وزملاؤه أن YTHDF1/2 يرتفع تعبيرهما في معظم أنواع السرطانات (مثل LIHC وLUAD) ويرتبطان بإنذار سيء، بينما يظهر YTHDC1/2 تأثيرات مثبطة للأورام في KIRC وBRCA20. ومن الجدير بالذكر أن الدور المسبب للأورام لـ YTHDF1 عبر تنشيط Wnt/β-catenin يتناقض مع الوظيفة المضادة للانتشار الورمي لـ YTHDC2 في NSCLC، مما يبرز الحاجة إلى استراتيجيات للعلامات البيولوجية خاصة بكل نوع فرعي. ومقارنة بالعلامات الإنذارية الراسخة (مثل PD-L1 للاستجابة للعلاج المناعي)، قد يتم تعزيز القدرة التنبؤية لـ YTHDC2 من خلال دمجه مع منظمات m6A أخرى (مثل METTL3 وYTHDF1) أو جينات نقاط التفتيش المناعية، كما اقترحت تحليلات الارتشاح المناعي الشاملة للسرطانات. وعلى الرغم من أن الدراسات السابقة تشير إلى أن YTHDC2 ينظم مسار NF-κB/CYLD12، فقد اقتصرت الدراسة الحالية على غياب التحقق على مستوى البروتين باستخدام الكيمياء النسيجية المناعية أو لطخة ويسترن، وكذلك غياب التحقق الوظيفي. ويجب أن تجمع الأعمال المستقبلية بين فحوصات إسكات الجينات وتسلسل m6A لتحديد الأهداف المباشرة.
كشفت التحليلات السابقة أن تعبير YTHDC2 ينخفض في أنسجة سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) ويرتبط بسوء الإنذار21. وأشار تحليل كابلان-ماير إلى بقاء المرضى الذين لديهم تعبير أعلى لـ YTHDC2 على قيد الحياة لفترة أطول، إلا أن تحليل منحنى ROC أشار إلى قدرة تنبؤية محدودة للبقاء على قيد الحياة20. وقد أُجري تحليل ROC للبقاء في الدراسة الحالية باستخدام بيانات تعبير RNA-seq وبيانات البقاء من أطلس جينوم السرطان (TCGA)، نظراً لعدم توفر معلومات المتابعة طويلة المدى لمجموعتنا السريرية المحلية. ومن المهم الإشارة إلى أن قيم AUC المنخفضة (~0.5) الملحوظة في هذه الدراسة تشير إلى أن تعبير YTHDC2 يفتقر إلى الحساسية والنوعية الكافيتين للاستخدام السريري كعلامة بيولوجية مستقلة22. ويتماشى هذا القصور مع الأدلة الناشئة التي تشير إلى أن العلامات البيولوجية المعتمدة على جين واحد غالباً ما تكون غير كافية للأمراض المعقدة مثل NSCLC، حيث تزداد الحاجة إلى نهج الأوميكس المتعددة ولوحات العلامات البيولوجية المتكاملة لتحقيق أداء تنبؤي ذو مغزى سريري. وقد لوحظ تعبير أعلى لـ YTHDC2 في أنسجة NSCLC التي تعاني من نقائل في العقد الليمفاوية، مما يشير إلى وجود ارتباط محتمل بين تعبير YTHDC2 وحالة النقائل في العقد الليمفاوية في المجموعة الحالية. وعلى الرغم من ملاحظة اختلافات في تعبير YTHDC2 بين السرطانات الغدية وسرطان الخلايا الحرشفية، إلا أنه يجب تفسير هذه المقارنة بحذر، حيث توفرت 4 عينات فقط من سرطان الخلايا الحرشفية للتحليل، مما حد بشكل كبير من القوة الإحصائية لهذه المقارنة بين المجموعات الفرعية. ولم تُلاحظ فروق ذات دلالة إحصائية في المرحلة السريرية، أو التمايز، أو العمر، أو تاريخ التدخين، ويرجع ذلك على الأرجح إلى قيود الدراسة، بما في ذلك حجم العينة وتصميم الدراسة في مركز واحد. وبالرغم من أن الارتباط الملحوظ بين انخفاض تعبير YTHDC2 ونقائل العقد الليمفاوية يشير إلى دور بيولوجي محتمل في NSCLC، فإن قدرته التمييزية الضعيفة (AUC ~0.5) والكشف غير المتسق بواسطة qRT-PCR يمنعان استخدامه كعلامة سريرية مستقلة. وينبغي أن تستكشف الدراسات المستقبلية ما إذا كان دمج YTHDC2 مع بروتينات أخرى مرتبطة بـ m6A يحسن من القيمة التنبؤية.
أشارت تحليلات المعلوماتية الحيوية إلى أن تعبير YTHDC2 ينخفض في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) وقد يكون مرتبطاً بتحسن نتائج المرضى. وعلى الرغم من ملاحظة انخفاض التعبير أيضاً لدى المرضى الذين يعانون من نقائل في العقد اللمفاوية ورصد اختلافات بين الأنواع الفرعية المرضية، إلا أنه يجب تفسير نتائج هذه المجموعات الفرعية بحذر بسبب صغر حجم العينة، لا سيما بالنسبة لسرطان الخلايا الحرشفية. ومع ذلك، لم يتم تأكيد هذه النتائج من خلال تحليل qRT-PCR في مجموعتنا السريرية، وهو ما قد يعكس اختلافات في خصائص المجموعة، أو حجم العينة، أو التباين التقني، أو التنظيم ما بعد النسخي، أو غياب التحقق على مستوى البروتين. وينبغي أن تستكشف الأبحاث المستقبلية آليات YTHDC2 في الأنواع الفرعية الأخرى من سرطان الرئة من خلال تجارب مخبرية (in vitro) وحيوية (in vivo). وقد تساهم هذه الدراسات في توضيح الدور البيولوجي لـ YTHDC2 وتحديد ما إذا كان له أي فائدة سريرية كجزء من نهج متعدد العلامات بدلاً من اعتماده كعلامة بيولوجية مستقلة.
القيود
هناك عدة قيود لهذه الدراسة؛ فقد كانت دراسة استرجاعية أجريت في مركز واحد وبحجم عينة صغير نسبيًا، مما قد يحد من إمكانية تعميم النتائج. كما أن استخدام الأنسجة المثبتة بالفورمالين والمطمورة في البارافين (FFPE) قد يكون قد أثر على جودة RNA وحساسية تقنية qRT-PCR. بالإضافة إلى ذلك، تم تقييم تعبير mRNA لـ YTHDC2 فقط، ولم يتم إجراء التحقق من مستوى البروتين باستخدام الكيمياء النسيجية المناعية (IHC) أو لطخة ويسترن (Western blotting). وبما أن تعبير mRNA لا يرتبط بالضرورة بوفرة البروتين بسبب التنظيم ما بعد النسخي، فقد يفسر هذا جزئيًا التناقض بين نتائجنا السريرية وتحليلات قواعد البيانات العامة. كما افتقرت الدراسة إلى بيانات المتابعة طويلة المدى، وكانت تحليلات المجموعات الفرعية (مثل سرطان الخلايا الحرشفية) غير كافية إحصائيًا.
التوجهات المستقبلية
يجب أن تستكشف الأبحاث المستقبلية آليات YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) من خلال تجارب في المختبر (in vitro) وفي الكائن الحي (in vivo) لفهم دوره الوظيفي بشكل أفضل. كما ثمة حاجة إلى دراسات متعددة المراكز بأحجام عينات أكبر للتحقق من النتائج وتحسين إمكانية تعميمها. بالإضافة إلى ذلك، قد يؤدي دمج YTHDC2 مع المنظمات الأخرى المرتبطة بـ m6A والمتغيرات المرضية والسريرية إلى تعزيز فائدته التنبؤية والإنذارية. ومن الضروري إجراء المزيد من الدراسات التي تدمج مناهج الأوميكس المتعددة (multi-omics)، بما في ذلك الترانسكريبتوميكس والبروتيوميكس والإبيجينوميكس، لتوضيح الآليات البيولوجية الكامنة وراء خلل تنظيم YTHDC2. كما يجب إجراء التحقق من مستوى البروتين عن طريق الكيمياء النسيجية المناعية (IHC) أو لطخة ويسترن (Western blotting) لتقييم التوافق بين تعبير mRNA وتعبير البروتين. وسيكون توحيد معايير معالجة العينات وتقنيات التحقق أمراً بالغ الأهمية لضمان القابلية للتكرار والتطبيق السريري.
الخلاصة
تقدم هذه الدراسة تقييماً استكشافياً للتعبير عن YTHDC2 في سرطان الرئة غير صغير الخلايا (NSCLC) من خلال دمج تحليلات المعلوماتية الحيوية مع التحقق السريري باستخدام qRT-PCR. ومع ذلك، فإن عدم اتساق اكتشافه عبر المنصات التحليلية ودقته التشخيصية المحدودة (AUC ≈0.5) يمنعان حالياً استخدامه كعلامة بيولوجية سريرية مستقلة. وبينما تشير تحليلات المعلوماتية الحيوية إلى أهمية إنذارية محتملة، فإن التحقق السريري المستقل لا يدعم موثوقيته للتطبيقات التشخيصية أو الإنذارية. يجب تفسير هذه النتائج بحذر، وهي تتطلب التحقق في مجموعات أكبر متعددة المراكز مع إجراء دراسات على مستوى البروتين ودراسات وظيفية قبل النظر في أي تطبيق سريري.
الإفصاحات
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
لا يوجد لدى المؤلفين أي مصالح مالية أو غير مالية ذات صلة للإفصاح عنها.
شكر وتقدير
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
تم دعم هذه الدراسة من قبل مؤسسة هاينان الإقليمية للعلوم الطبيعية (رقم 821RC735).
المواد
| الاسم | الشركة | رقم فهرسي | التعليقات |
|---|---|---|---|
| بادئات ومجسات مخصصة | Sangon Biotech Co., Ltd., Shanghai, China | تخليق مخصص | تسلسلات البادئات والمجسات مدرجة في الجدول 6 |
| DNase I | Magen Biotechnology Co., Ltd., Guangzhou, China | DNase I (HiPure FFPE RNA Kit) | إزالة تلوث DNA الجينومي |
| خوارزمية ESTIMATE | Yoshihara et al. | حزمة R (الإصدار 1.0.13) | تقدير نقاء الورم |
| طقم استخلاص RNA من أنسجة FFPE | Magen Biotechnology Co., Ltd., Guangzhou, China | HiPure FFPE RNA Kit (R4130-02) | استخلاص RNA من أنسجة FFPE |
| بوابة بيانات GDC | National Cancer Institute (NCI), NIH, USA | https://portal.gdc.cancer.gov | تنزيل مجموعات بيانات TCGA |
| خادم GEPIA الويب | Peking University, China | http://gepia.cancer-pku.cn | تحليل التعبير الجيني |
| مخطط Kaplan–Meier Plotter | Semmelweis University, Hungary | https://kmplot.com | تحليل البقاء على قيد الحياة |
| جهاز طرد مركزي دقيق | Eppendorf AG, Hamburg, Germany | 5424 R | إجراءات تنقية RNA |
| جهاز قياس الطيف الضوئي NanoDrop | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA | NanoDrop 2000/2000c | تقدير كمية RNA |
| مزيج qPCR الرئيسي القائم على المجسات | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA | TaqMan Universal PCR Master Mix II (4440040) | تضخيم PCR الكمي |
| برنامج R الإحصائي | R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria | الإصدار 4.4.1 | التحليلات الإحصائية وتحليل ROC |
| نظام PCR في الوقت الحقيقي | Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA, USA | CFX Opus 96 | PCR الكمي في الوقت الحقيقي |
| طقم النسخ العكسي | Thermo Fisher Scientific, Waltham, MA, USA | RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit (K1622) | تخليق cDNA |
| عمود تنقية RNA | Magen Biotechnology Co., Ltd., Guangzhou, China | HiPure Mini Column I | عمود تنقية RNA بغشاء السيليكا |
| ماء خالٍ من RNase | Magen Biotechnology Co., Ltd., Guangzhou, China | RNase-Free Water | شطف RNA |
| إحصائيات SPSS | IBM Corp., Armonk, NY, USA | IBM SPSS Statistics Version 27.0 | التحليلات الإحصائية |
| حزمة survivalROC | CRAN (R Foundation for Statistical Computing) | الإصدار 1.0.3.1 | تحليل ROC المعتمد على الوقت |
| قاعدة بيانات TCGA | National Cancer Institute (NCI), NIH, USA | https://portal.gdc.cancer.gov | قاعدة بيانات عامة لعلم الجينوم السرطاني |
| محلول غسيل RW1 | Magen Biotechnology Co., Ltd., Guangzhou, China | Buffer RW1 | محلول غسيل لتنقية RNA |
| محلول غسيل RW2 | Magen Biotechnology Co., Ltd., Guangzhou, China | Buffer RW2 | محلول غسيل لتنقية RNA |
المراجع
Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
- Shen, Y., Chen, J. Q., Li, X. P. Differences between lung adenocarcinoma and lung squamous cell carcinoma: Driver genes, therapeutic targets, and clinical efficacy. Genes Dis. 12 (1), 101374 (2025).
- Cao, W., Qin, K., Li, F., Chen, W. Comparative study of cancer profiles between 2020 and 2022 using global cancer statistics (GLOBOCAN). J. Natl. Cancer Cent. 4 (2), 128-134 (2024).
- Alduais, Y., Zhang, H., Fan, F., Chen, J., Chen, B. Non-small cell lung cancer (NSCLC): A review of risk factors, diagnosis, and treatment. Medicine (Baltimore). 102 (13), e32899 (2023).
- Sun, H., Li, K., Liu, C., Yi, C. Regulation and functions of non-m6A mRNA modifications. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 24 (11), 714-731 (2023).
- Zhang, W., Qian, Y., Jia, G. The detection and functions of RNA modification m6A based on m6A writers and erasers. J. Biol. Chem. 297 (2), 100973 (2021).
- Li, Y. et al. Autophagy activation is required for N6-methyladenosine modification to regulate ferroptosis in hepatocellular carcinoma. Redox Biol. 69, 102971 (2024).
- Wang, J. et al. Downregulation of m6A reader YTHDC2 promotes the proliferation and migration of malignant lung cells via the CYLD/NF-κB pathway. Int. J. Biol. Sci. 17 (10), 2633-2651 (2021).
- Koh, Y. W., Han, J. H., Haam, S., Lee, H. W. Prognostic and predictive value of YTHDF1 and YTHDF2 and their correlation with tumor-infiltrating immune cells in non-small cell carcinoma. Front. Oncol. 12, 996634 (2022).
- Tsuchiya, K. et al. YTHDF1 and YTHDF2 are associated with better patient survival and an inflamed tumor-immune microenvironment in non-small-cell lung cancer. Oncoimmunology. 10 (1), 1962656 (2021).
- Diao, H. et al. The m6A reader YTHDF1 promotes lung carcinoma progression via regulating ferritin-mediated ferroptosis in an m6A-dependent manner. Pharmaceuticals (Basel). 16 (2), 185 (2023).
- Sun, S. et al. Downregulation of m6A reader YTHDC2 promotes tumor progression and predicts poor prognosis in non-small cell lung cancer. Thorac. Cancer. 11 (11), 3269-3279 (2020).
- Chen, S., Wang, Z., Sun, B. Chinese Society of Clinical Oncology Non-small Cell Lung Cancer (CSCO NSCLC) guidelines in 2024: Key update on the management of early and locally advanced NSCLC. Cancer Biol. Med. In Press (2025). doi:10.20892/j.issn.2095-3941.2024.0592. (2025).
- Fan, S., Xu, X., Chen, J., Yin, Y., Zhao, Y. Genome-wide identification, characterization, and expression analysis of m6A readers-YTH domain-containing genes in alfalfa. BMC Genomics. 25, 18 (2024).
- Shi, R. et al. Linking the YTH domain to cancer: The importance of YTH family proteins in epigenetics. Cell Death Dis. 12 (4), 346 (2021).
- Wu, X. et al. The biological function of the N6-methyladenosine reader YTHDC2 and its role in diseases. J. Transl. Med. 22, 490 (2024).
- Teng, Y., Zhao, X., Xi, Y., Fu, N. N6-methyladenosine-regulated ADIRF impairs lung adenocarcinoma metastasis and serves as a potential prognostic biomarker. Cancer Biol. Ther. 24 (1), 2249173 (2023).
- Ma, L. et al. The m6A reader YTHDC2 inhibits lung adenocarcinoma tumorigenesis by suppressing SLC7A11-dependent antioxidant function. Redox Biol. 38, 101801 (2021).
- Ma, L. et al. Targeting SLC3A2 subunit of system XC− is essential for m6A reader YTHDC2 to be an endogenous ferroptosis inducer in lung adenocarcinoma. Free Radic. Biol. Med. 168, 25-43 (2021).
- Lin, Y. et al. Pan-cancer analysis reveals m6A variation and cell-specific regulatory network in different cancer types. Genomics Proteomics Bioinformatics. 22 (4), qzae052 (2024).
- Li, L. et al. Bioinformatic analysis of m6A "reader" YTH family in pan-cancer as a clinical prognosis biomarker. Sci. Rep. 13, 17350 (2023).
- Sun, Y., Liu, Y., Wang, P., Chang, L., Huang, J. The m6A reader YTHDC2 suppresses lung adenocarcinoma tumorigenesis by destabilizing MRPL12. Mol. Biotechnol. 66 (8), 1051-1061 (2024).
- Hajian-Tilaki, K. Receiver operating characteristic (ROC) curve analysis for medical diagnostic test evaluation. Caspian J. Intern. Med. 4 (2), 627-635 (2013).
إعادة الطباعة والأذونات
طلب إذن لإعادة استخدام النص أو الأشكال في مقالة JoVE هذه
طلب إذن