أبريل 6, 2017
هنا، نقدم والتحلل كفاءة وحماية FMOC اللاحقة من الأحماض الأمينية معزولة عن مجمع ني شيف قاعدة. شروط التحلل المقدمة هنا هي مناسبة للاستخدام عند الحاجة الاحتفاظ مجموعات حماية حمض عطوب جنبا إلى سلسلة. قد تكون هذه التقنية قابلة للتكيف مع مجموعة متنوعة من ركائز الأحماض الأمينية غير طبيعية.
الهدف العام من هذا الإجراء هو عزل الأحماض الأمينية غير الطبيعية بشكل ملائم من مركب قاعدة تحول النيكل ، وبالتالي حماية Fmoc لهذه الأحماض الأمينية. يمكن أن تساعد هذه الطريقة في الإجابة على الأسئلة الرئيسية في مجال الكيمياء العضوية ، مثل كيفية تصنيع الأحماض الأمينية غير الطبيعية بسهولة أكبر. الميزة الرئيسية لهذه التقنية هي أنها تسمح بعزل الأحماض الأمينية ذات السلسلة الجانبية الحمضية المتقابلة التي تحمي المجموعات من مركب قاعدة تحول النيكل.
سيكافح الأفراد الجدد في هذه الطريقة بسبب وجود قابلية محدودة للذوبان لمركب النيكل في المذيبات العضوية. DMF هو المذيب الأنسب لأنه يمكن أن يحل المعقد وقابل للامتزاج بالماء. خطرت لنا فكرة هذه الطريقة لأول مرة عندما تلقينا نظرة ثاقبة من أستاذنا غير العضوي ، الدكتور بورون حول عوامل مخلب النيكل والمعادن.
لبدء هذا الإجراء ، أضف 40 مل من DMF إلى قارورة سفلية مستديرة سعة 250 ملليلترا. قم بإذابة مليمول واحد من مركب قاعدة إزاحة PBB من النيكل و DMF مع التحريك في درجة حرارة الغرفة. بعد ذلك ، أضف 60 مل من محلول EDTA المائي 0.2 مولار عند الرقم الهيدروجيني 4.5.
باستخدام شريط تحريك مغناطيسي وطبق تحريك ، قلب المحلول طوال الليل. بعد اكتمال التفاعل ، انقل المحلول إلى قمع فصل سعة 250 ملليلتر. أضف 50 مل من DCM.
ثم قم بتغطية القمع الفاصل واخلطه. صفي الغسيل العضوي في دورق نفايات. كرر عملية إضافة خلط DCM وإزالة الغسيل العضوي ثلاث مرات.
بعد ذلك ، اجمع الطبقة المائية المتبقية في قارورة سفلية مستديرة سعة 250 مل. استخدم أولا بيكربونات الصوديوم الصلبة لضبط الرقم الهيدروجيني على الطبقة المائية المعزولة إلى الرقم الهيدروجيني السبعة. بعد ذلك أضف 168 ملليغرام بيكربونات الصوديوم.
حرك المحلول باستخدام قضيب التحريك المغناطيسي ولوحة التقليب. من الأهمية بمكان ضبط الأس الهيدروجيني إلى سبعة لإضافة مكافئين من بيكربونات الصوديوم. هذا مهم لأن الحل يجب أن يكون أساسيا قليلا لتسهيل حماية Fmoc.
في قارورة 10 ملليلتر تذوب 337 ملليغرام من Fmoc و إستر هيدروكسي سوكسينيميد وخمسة ملليلتر من الديوكسان. انقلي هذا الخليط إلى المحلول المائي وقلبي طوال الليل. في اليوم التالي ، استخدم حمض الهيدروكلوريك المولي لتحمض المحلول إلى درجة الحموضة الثانية.
بعد هذا نقل رد الفعل إلى قمع فصل 250 ملليلتر. أضف 50 مل من أسيتات FO. من المهم ألا ينخفض الرقم الهيدروجيني إلى أقل من اثنين وأن تكتمل الخطوة بسرعة.
قد يؤدي عدم القيام بذلك إلى فقدان مجموعات حماية السلسلة الجانبية. قم بتغطية القمع الفاصل واخلطه جيدا. ثم اجمع الطبقة العضوية في قارورة Erlenmeyer سعة 250 مل.
كرر عملية إضافة أسيتات الإيثيل ، وخلط الطبقة العضوية وجمعها مرتين إضافيتين ، مع الجمع بين المستخلصات العضوية. بعد ذلك ، جفف المستخلصات العضوية المدمجة بحوالي ثلاثة جرامات من كبريتات المغنيسيوم. باستخدام مبخر دوار ، قم بتركيز المستخلصات العضوية المدمجة لتحمل تكاليف الأحماض الأمينية المحمية من Fmoc الخام.
في هذه الدراسة ، يتم عزل عظم الظهر من الأحماض الأمينية من مركب قاعدة تحول النيكل في ظل ظروف الأس الهيدروجيني المعتدلة ثم يخضع لاحقا لحماية Fmoc من خلال خطوتين حاسمتين. في خطوة اليد ، يتم تقليب محلول مائي DMF يحتوي على EDTA لتسهيل إطلاق الأحماض الأمينية من المجمع. بعد عزل الأحماض الأمينية التي تم إطلاقها واستخراجه، يخضع لظروف حماية Fmoc مما يوفر حمض أميني محمي من FmoC.
يتم تتبع تقدم تفاعل التحلل المائي من خلال مراقبة تغير لون المحلول من الأحمر إلى الأبيض. تظهر التفاعلات التي تنطوي على أقل من ثمانية مكافئات ل EDTA بعض الانتقال اللوني ولكنها دائما ما تكون غير مكتملة. بينما لا تظهر ردود الفعل بدون EDTA أي تغيير في اللون على الإطلاق.
لذلك ، هناك حاجة إلى ما لا يقل عن ثمانية مكافئات من EDTA لإكمال التفاعل. ثم يتم تقييم الأس الهيدروجيني الفعال على تفاعل التحلل المائي. يظهر التحلل المائي الناجح في ظل ظروف الأس الهيدروجيني التي تتراوح من 4.5 إلى 7.5 في درجة حرارة الغرفة مع التحريك طوال الليل.
مما يدل على مرونة التحلل المائي EDTA. ثم يتم اختبار جدوى ظروف التحلل المائي هذه باستخدام مجموعة من الأحماض الأمينية ذات مجموعات حماية السلسلة الجانبية المختلفة. في كل حالة ، يتم الاحتفاظ بالمجموعات التي تحمي السلسلة الجانبية بالكامل كدليل بواسطة الرنين النووي للبروتون.
بمجرد إتقان هذه التقنية ، يمكن القيام بها في غضون 48 ساعة إذا تم إجراؤها بشكل صحيح. أثناء محاولة هذا الإجراء ، من المهم أن تتذكر الالتزام بمستوى الأس الهيدروجيني المحدد الموصوف طوال الوقت. بعد هذا الإجراء ، يمكن إجراء طرق أخرى مثل التحلل المائي للأحماض الأمينية الأخرى مع مجموعات حماية السلسلة الجانبية الحمضية من أجل الإجابة على أسئلة إضافية مثل مدى فائدة هذه التقنية عبر مجموعة متنوعة من الركائز.
بعد تطويرها ، ستمهد هذه التقنية الطريق للباحثين في مجال التخليق العضوي لاستكشاف تخليق الأحماض الأمينية غير الطبيعية مع مجموعات حماية السلسلة الجانبية الحمضية القابلة للطي. بعد مشاهدة هذا الفيديو ، يجب أن يكون لديك فهم جيد لكيفية عزل الأحماض الأمينية من مركب قاعدة تحول النيكل PPB باستخدام ظروف التفاعل مع نطاقات الأس الهيدروجيني المعتدلة. لا تنس أن العمل مع المذيبات العضوية على وجه التحديد DMF ، يمكن أن يكون خطيرا للغاية ويجب دائما اتخاذ الاحتياطات مثل استخدام معدات الحماية الشخصية أثناء تنفيذ هذا الإجراء.
اعرض النص الكامل واحصل على الوصول إلى آلاف الفيديوهات العلمية
تقدم هذه المقالة طريقة فعالة لعزل الأحماض الأمينية غير الطبيعية من معقد قاعدة شيف للنيكل، ومن ثم حمايتها باستخدام مجموعة Fmoc. وقد صُمم هذا البروتوكول خصيصاً للحفاظ على مجموعات حماية السلسلة الجانبية الحساسة للأحماض، مما يجعل الأحماض الأمينية الناتجة مناسبة للاستخدام في تخليق الببتيد على الطور الصلب. تعتمد هذه الطريقة على ظروف تحلل مائي معتدلة، وهي قابلة للتطبيق على مجموعة متنوعة من ركائز الأحماض الأمينية غير الطبيعية.
يعد الحفاظ على مجموعات الحماية القابلة للتحلل الحمضي أثناء عزل الأحماض الأمينية أمراً بالغ الأهمية لتمكين سير عمل تصنيع الببتيدات اللاحقة في مجال البحث والتطوير الصيدلاني. يتيح بروتوكول التحلل المائي هذا تحضير أحماض أمينية غير طبيعية متوافقة مع تصنيع الببتيد على الطور الصلب، مما يدعم التنويع السريع للمركبات الرائدة واستكشاف العلاقة بين البنية والنشاط. تعالج هذه الطريقة عنق زجاجة رئيسياً في تصنيع لبنات بناء الببتيد المعقدة لبرامج مرحلة الاكتشاف.
يتناسب بروتوكول التحلل المائي والحماية هذا مع نقطة الالتقاء بين الاصطناع الكيميائي وتوليد الببتيدات الرائدة، مما يربط بين مرحلة الاكتشاف المبكر والأبحاث قبل السريرية.