ديسمبر 1, 2023
غالبا ما يكون الفحص متعدد الشبكات للمجهر الإلكتروني بالتبريد (cryoEM) عملية شاقة تتطلب ساعات من الاهتمام. يوضح هذا البروتوكول كيفية إعداد مجموعة Leginon قياسية وشاشة Leginon تلقائية ذكية لأتمتة هذه العملية. يمكن تطبيق هذا البروتوكول على غالبية شبكات رقائق هولي cryoEM.
في مركز سيمونز للمجهر الإلكتروني ، نهدف إلى توفير خدمات مجهر إلكتروني رائعة وخبرة وتدريب للباحثين المحليين والوطنيين ، وتطوير طرق مبتكرة لتحسين سير العمل. يغطي نطاقنا الخدمة والتطوير والتعلم الآلي والبحوث الطبية الحيوية. نحن نحاول الإجابة ، كيف يمكننا تحسين خدماتنا بشكل أفضل؟
التعلم الآلي يغير مجال المجهر الإلكتروني. أصبح جمع البيانات آليا. أصبحت أدوات تحليل البيانات أكثر كفاءة بسرعة.
يتضمن ذلك تقليل التشويش على الصور ، وانتقاء الجسيمات ، وتحليل مرونة 3G ، وبناء النماذج. نقوم بتحديث البرامج بانتظام لمراعاة المواقف المختلفة ، مثل ثقوب الشبكة المختلفة أو المجموعة المائلة أو الأخطاء التي تم تحديدها من خلال برنامج الاختبار التجريبي في بيئة الإنتاج الخاصة بنا. نقوم أيضا بدمج التعليقات الواردة من مستخدمينا ، لذلك نقدم باستمرار ميزات مفيدة لهم.
يعالج Smart Leginon المهام كثيفة العمالة والمستهلكة للوقت لفحص شبكة واحدة أو أكثر على cryoTEM. إنه يمكن المشغلين والباحثين من فحص الشبكات وتحليلها بسرعة أكبر ، مع توفير الوقت لتحسين ظروف الشبكة والعينات بالتوازي. هذا يقلل أيضا من وقت المجهر والتكلفة.
توفر الشاشة التلقائية Smart Leginon فحصا متعدد الشبكات غير مراقب بالكامل ، والذي يستغرق حوالي 10 دقائق لإعداد الفحص ل 12 شبكة. مقارنة بالفحص اليدوي ، يوفر بروتوكولنا عدة ساعات يوميا. منذ تقديم Smart Leginon ، تم تطوير برامج مجانية وتجارية أخرى لأتمتة مماثلة.
يحدد هذا البروتوكول آلية أتمتة فحص الشبكات المتعددة في المجهر الإلكتروني المبرد (cryoEM) باستخدام نظام Smart Leginon Autoscreen. ومن خلال تبسيط عملية الإعداد، يمكن للباحثين تقليل الوقت المستغرق في فحص الشبكات بشكل كبير، مما يتيح تحليلاً أكثر كفاءة وتحسيناً لظروف العينات.
يعالج الفحص الآلي لشبكات المجهر الإلكتروني المبرد (cryoEM) باستخدام نظام Smart Leginon عنق زجاجة حرج في سير عمل البيولوجيا البنيوية وعمليات اكتشاف الأدوية البيولوجية. ومن خلال تقليل الوقت الذي يقضيه المشغل وزيادة الإنتاجية، يعزز هذا النظام الآلي من كفاءة المراحل المبكرة من اكتشاف الأدوية القائمة على البنية والتحقق من الأهداف. يتيح هذا النهج إجراء فحص قابل للتوسع وإعادة الإنتاج عبر شبكات متعددة، مما يدعم اتخاذ قرارات قوية عند نقاط التحول الرئيسية في مسار عملية الاكتشاف.
يتكامل نظام Smart Leginon Autoscreen ضمن سلسلة عمليات الاكتشاف، بدءًا من التحسين المبكر للعينات وصولاً إلى تحديد المركبات الرائدة والتحقق الهيكلي في المرحلة ما قبل السريرية.