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Engineering Adherent Bacteria by Creating a Single Synthetic Curli Operon

The  method described here consists in redesigning E. coli adherence properties by assembling the minimum number of  curli genes under the control of a ...

All replication-competent retroviruses contain three main reading frames, gag, pol and env, which are used for the synthesis of structural proteins, enzymes and envelope proteins respectively. Complex retroviruses, such as lentiviruses, also code for regulatory and accessory proteins that have essential roles in viral replication. The concerted expression of these genes ensures the efficient polypeptide production required for the assembly and release of new infectious progeny virions. Retroviral protein synthesis takes place in the cytoplasm and depends exclusively on the translational machinery of the host infected cell. Therefore, not surprisingly, retroviruses have developed RNA structures and strategies to promote robust and efficient expression of viral proteins in a competitive cellular environment.

Translational control of retroviruses.

Alle Replikations-zust&auml;ndige Retroviren enthalten drei wichtigsten Lesung Frames, Gag, Pol und Env, die f&uuml;r die Synthese von Strukturproteinen, Enzymen und Proteinen Umschlag bzw. verwendet werden. Komplexe Retroviren, wie Lentiviruses, code auch f&uuml;r Regelungs- und Zubeh&ouml;r-Proteine, die wesentliche Rollen in Virusreplikation haben. Der aufeinander abgestimmten Ausdruck dieser Gene gew&auml;hrleistet die effiziente Polypeptid-Produktion f&uuml;r die Versammlung und Freigabe von neuen infekti&ouml;ser Nachkommen Virionen erforderlich. Retroviren Proteinsynthese findet im Zytoplasma und richtet sich ausschlie&szlig;lich auf die translatorischen Maschinerie der Wirtszelle infiziert. Daher nicht &uuml;berraschend, dass entwickelten Retroviren RNA-Strukturen und Strategien zur F&ouml;rderung der robuste und effiziente Ausdruck der viralen Proteine in einem Wettbewerbsumfeld zellul&auml;re.

Translational Steuerung der Retroviren.

The characterization of internal ribosome entry sites (IRESs) in virtually all lentiviruses prompted us to investigate the mechanism used by the feline immunodeficiency virus (FIV) to produce viral proteins. Various in vitro translation assays with mono- and bicistronic constructs revealed that translation of the FIV genomic RNA occurred both by a cap-dependent mechanism and by weak internal entry of the ribosomes. This weak IRES activity was confirmed in feline cells expressing bicistronic RNAs containing the FIV 5' untranslated region (UTR). Surprisingly, infection of feline cells with FIV, but not human immunodeficiency virus type 1, resulted in a great increase in FIV translation. Moreover, a change in the cellular physiological condition provoked by heat stress resulted in the specific stimulation of expression driven by the FIV 5' UTR while cap-dependent initiation was severely repressed. These results reveal the presence of a "dormant" IRES that becomes activated by viral infection and cellular stress.

A dormant internal ribosome entry site controls translation of feline immunodeficiency virus.

Die Charakterisierung der internen Ribosom Eintrag Websites (IRESs) in praktisch allen Lentiviruses aufgefordert wir untersuchen den Mechanismus verwendet durch das feline Immundefizienz-Virus (FIV), um virale Proteine zu produzieren. Verschiedene in-vitro-&Uuml;bersetzung-Proben mit Mono - und Bicistronic-Konstrukte ergab, dass &Uuml;bersetzung der FIV genomische RNA sowohl von GAP-abh&auml;ngige Mechanismus schwache interne Eintrag von den Ribosomen aufgetreten ist. Diese schwache IRES-Aktivit&auml;t best&auml;tigte Katzenartige Zellen Bicistronic RNAs, enth&auml;lt den FIV 5&#39; Untranslatierter Bereich (UTR) zum Ausdruck zu bringen. &Uuml;berraschend, Infektion der katzenartigen Zellen mit FIV, aber nicht humanen Immundefizienz-Virustyp 1, f&uuml;hrte zu eine gro&szlig;e Zunahme der FIV-&Uuml;bersetzung. Dar&uuml;ber hinaus f&uuml;hrte eine &Auml;nderung in der zellul&auml;ren physiologischen W&auml;rmebelastung verursachten die spezifische Stimulation des Ausdrucks durch die FIV 5&#39; UTR angetrieben, w&auml;hrend GAP-abh&auml;ngige Einleitung stark unterdr&uuml;ckt wurde. Diese Ergebnisse zeigen das Vorhandensein von einem &quot;ruhenden&quot; IRES, das durch virale Infektion und zellul&auml;ren Stress aktiviert wird.

Eine ruhende interne Ribosom Eintrag Website steuert die &Uuml;bersetzung von feline Immunodeficiency Virus.

Some 20 years ago, the study of picornaviral RNA translation led to the characterization of an alternative mechanism of initiation by direct ribosome binding to the 5' UTR. By using a bicistronic vector, it was shown that the 5' UTR of the poliovirus (PV) or the Encephalomyelitis virus (EMCV) had the ability to bind the 43S preinitiation complex in a 5' and cap-independent manner. This is rendered possible by an RNA domain called IRES for Internal Ribosome Entry Site which enables efficient translation of an mRNA lacking a 5' cap structure. IRES elements have now been found in many different viral families where they often confer a selective advantage to allow ribosome recruitment under conditions where cap-dependent protein synthesis is severely repressed. In this review, we compare and contrast the structure and function of IRESes that are found within 4 distinct family of RNA positive stranded viruses which are the (i) Picornaviruses; (ii) Flaviviruses; (iii) Dicistroviruses; and (iv) Lentiviruses.

Structural and functional diversity of viral IRESes.

Vor 20 Jahren f&uuml;hrte die Studie der picornaviral RNA-&Uuml;bersetzung auf die Charakterisierung eines alternativen Mechanismus zur Einleitung von direkten Ribosom binden an den 5&#39; UTR. Mit einen Bicistronic-Vektor, es wurde gezeigt, dass 5&#39; UTR des Poliovirus (PV) oder das Enzephalomyelitis-Virus (EMCV) hatte die 43S Preinitiation Komplex in 5&#39; und GAP-unabh&auml;ngige binden Weise. Dies ist m&ouml;glich durch gerendert einer RNA-Dom&auml;ne namens IRES f&uuml;r interne Ribosom-Eintrag-Site erm&ouml;glicht effiziente &Uuml;bersetzung einer mRNA fehlt eine 5&#39;-Cap-Struktur. IRES Elemente nun in viele verschiedene virale Familien gefunden wo sie oft einen selektiven Vorteil verleihen um Ribosom Rekrutierung unter Bedingungen zu erm&ouml;glichen, wo ist GAP-abh&auml;ngige Proteinsynthese stark unterdr&uuml;ckt. In diesem Bericht wir vergleichen und die Struktur und Funktion des IRESes, die in 4 verschiedene Familie der RNA positiven angeschwemmte Viren gefunden werden, sind die (i) Picornaviren; (Ii) Flaviviren; (Iii) Dicistroviruses; und (iv) Lentiviruses.

Article	Year
Translational control of retroviruses. Nature reviews. Microbiology\| PubMed ID: 17224922	2007
A dormant internal ribosome entry site controls translation of feline immunodeficiency virus. Journal of virology\| PubMed ID: 18234788	2008
Structural and functional diversity of viral IRESes. Biochimica et biophysica acta\| PubMed ID: 19632368	2009

Laurent Balvay

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