2017年6月14日
The protein composition of the human mitral valve is still partially unknown, because its analysis is complicated by low cellularity and therefore by low protein biosynthesis. This work provides a protocol to efficiently extract protein for the analysis of the mitral valve proteome.
该程序的总体目标是有效地从人心脏二尖瓣中提取蛋白质,适用于蛋白质组学分析。这种方法可能有助于揭示心脏瓣膜病领域的致病机制,从而可以识别新的诊断和预后疾病标志物,并有望识别治疗靶点。该方案的主要优点是它提供了与许多分析应用兼容的高效提取工作流程。
结果是对心脏二尖瓣蛋白质的更详尽的描述。此外,该协议还可以应用于其他系统,例如猪二尖瓣,它与人类瓣膜非常相似,用于瓣膜功能评估的实验模型。演示实验程序的是我实验室的技术人员 Stefania Ghilardi。
要准备人类二尖瓣,首先要使心脏外植,该心脏已经处于冷缺血状态 4 到 12 小时。在洁净室中,从运输袋中取出心脏,然后将其放入消毒桶中。接下来,将心脏转移到生物安全柜中。
在那里,使用一次性手术刀,在左心室和右心室水平上垂直于长轴切割,距心尖约 4 厘米。然后将心脏放在无菌窗帘上。然后,将升主动脉和肺动脉移到一边,进入左心房顶部。
在左心房顶部,使用镊子和镐子在左耳廓周围切开,露出二尖瓣。二尖瓣完全包含在左心室中。因此,暴露二尖瓣大叶和小二尖瓣叶。
前外侧和后内侧连合定义了前区和后区的边界。现在,用剪刀和非创伤镊子解剖左心房和围绕二尖瓣的脑室壁厚度。在解剖过程中,确定二尖瓣主动脉瓣的连续性。
接下来,通过沿着后瓣叶周围的连合切开,将二尖瓣前瓣叶与二尖瓣后瓣叶分开。程序完成后,用 70% 异丙醇溶液和 6% 过氧化氢溶液对柜子的桌子进行消毒。现在,用盐水清洗二尖瓣的后叶。
然后,将阀门切成小块,每块小于一平方厘米。用铝箔单独包裹这些碎片,然后用液氮快速冷冻。要开始蛋白质提取,请使用镊子从液氮中取出样品,并立即将其放在干冰上。
不要让样品解冻。接下来,将研钵、相关研杵和样品放入装满液氮的杜瓦瓶中。使用液氮冷冻样品和冷却研磨系统至关重要。
此步骤可防止生物降解并允许高效粉末化,但需要技术培训才能安全处理。速冻后,将研钵和研杵放入装有干冰的聚苯乙烯盒中。另外,将抹刀放在干冰上。
接下来,从箔纸中取出样品并将其装入砂浆中。并将较大的杵放在其上方。使用螺丝刀旋转杵,研磨样品 15 至 20 次。
研磨时,用冰镇的刮刀尖端混合样品。使用大杵后,用较小的杵重复研磨过程。获得细粉对于高效蛋白质提取至关重要。
现在,将粉末状样品倒入已知质量的 15 毫利特离心管中。然后用冷刮刀将任何剩余的材料刷入砂浆中。将装有样品的试管放在干冰上,并快速确定样品的质量。
接下来,将样品倒入玻璃均质管中。然后,每 10 毫克样品加入 200 微升尿素缓冲液。在此过程中,通过用尿素缓冲液等分试样冲洗来回收管中残留的残留物。
现在使用以 1, 500 rpm 运行的电动 PFTE 杵对样品进行均质化。以扭转动作将杵慢慢压在样品上 10 次。接下来,使用玻璃移液管将粘稠的黄色上清液转移到干净的 1.7 ml 离心管中。
现在使用一半的尿素对剩余的样品重复均质化。回收上清液并将其与先前的集合混合。接下来,将试管放在试管旋转器上 30 分钟。
30 分钟后,将试管装入冷离心机中,并以 13, 000 G 的离心速度将样品离心半小时。然后,回收上清液。并使用 Bradford 蛋白测定法测量蛋白质浓度。
在执行规定的方案后,经过一些额外的处理后,使用多种方法研究蛋白质提取物。通过二维电泳、液相等电聚焦、液相色谱-质谱和 2D 液相色谱-质谱在二尖瓣组织中共鉴定出 422 种蛋白质。使用 Gene Ontology 分析对 422 个蛋白质进行分类。
细胞外区域包含几种预期的蛋白质和其他细胞内和细胞表面蛋白。其中许多是首次在二尖瓣中发现的。在三个独特样本中用抗体证实了二尖瓣中先前未发现的四种此类蛋白质的存在。
这些蛋白质是 Septin-11、四个半 LIM 结构域、蛋白质 1、皮细胞红蛋白和 α 结晶 B.看完这个视频,您应该对如何从心脏二尖瓣中提取蛋白质进行鉴定和定量有很好的了解。一旦掌握,如果执行得当,这个协议可以在近两个小时内完成。在尝试此程序时,为了获得具有高蛋白质完整性的最大蛋白质产量,样品在任何转移过程中都不要解冻,这一点至关重要。
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本方案旨在高效提取人类心脏二尖瓣中的蛋白质,用于蛋白质组学分析。该方法有助于发现心脏瓣膜疾病中的新型诊断和预后标志物。
本方案通过实现从低细胞密度、富含基质的组织(如人类二尖瓣)中高效提取蛋白质,解决了心血管靶点验证中的一个关键瓶颈问题。该方法支持全面的蛋白质组学分析,有助于在心脏瓣膜疾病中对治疗靶点进行机制层面的风险评估。通过将分子表型与致病机制相联系,该方法在早期发现阶段提高了预测的可信度。
该方法通过从病变组织中提供可靠的分子检测结果,契合从靶点鉴定到临床前验证的整个发现流程。