2018年6月14日
在此,我们介绍一种利用基因修饰技术改造原代或扩增的人自然杀伤(NK)细胞的实验方案 Cas9 核糖核蛋白复合物 (Cas9/RNPs)。通过使用本方案,我们获得了人类自然杀伤细胞中特定基因缺陷的 转化生长因子-β受体2 (TGFBR2)和 次黄嘌呤磷酸核糖转移酶1 (HPRT1)
该方法有助于解答自然杀伤细胞(NK细胞)生物学领域中的关键问题,即调控效应细胞功能的特定基因和信号通路的作用与功能。该技术的主要优势在于,与依赖DNA的方法相比,其成功率更高,能够高效敲除NK细胞治疗中最具临床相关性的基因之一。该技术的应用前景涵盖表达TGF-β作为免疫逃逸机制的实体瘤和脑瘤的免疫治疗。
对于原代NK细胞的转导,将每毫升RPMI培养基中含5×10⁵个 freshly isolated NK细胞的悬液,按每T75培养瓶加入适量体积,在含100 IU/mL IL2的条件下培养4天,每隔一天更换培养基,并在转导前一天换液。对于扩增后的NK细胞转导,在第0天以1:1的比例用经辐射处理的表达膜结合型IL21的K562饲养细胞刺激原代NK细胞,每隔一天更换培养基,并在转导前一天换液。在电穿孔当天,为每个实验组的细胞条件准备一个T25培养瓶,加入8 mL新鲜培养基(每毫升含100 IU IL2),并将培养瓶置于37°C、5% CO₂、湿度充足的培养箱中。
在培养基平衡的同时,将每种条件下的三至四乘以十的六次方个细胞加入26微升转导混合液中,置于锥形管内,通过离心形成细胞沉淀。随后,每次用12毫升无菌PBS洗涤细胞三次,每次洗涤均需去除细胞悬液中的全部FBS。在洗涤细胞的同时,将每种CRISPR RNA和tracrRNA重悬至200微摩尔的终浓度。
将每个样本的2.2 µL CRISPR RNA与一剂200 µmol的tracrRNA混合,于95 °C加热5分钟。随后让样本冷却至室温,并将CRISPR RNA/tracrRNA复合物保存在-20 °C,直至使用。为形成核糖核蛋白复合物,将Cas9核酸内切酶加入相应的CRISPR RNA/tracrRNA复合物中,轻柔涡旋混匀30至60秒,然后在室温下孵育生成的Cas9核糖核蛋白复合物15至20分钟。
最后一次洗涤后,加入P3核转染试剂盒中的全部电穿孔补充液体积,将每个细胞沉淀重悬于20微升P3原代4D-核转染溶液中,注意避免产生气泡。立即向每种细胞悬液中加入5微升相应的核糖核蛋白复合物,并向Cas9核糖核蛋白复合物细胞混合液中加入1微升100微摩尔的Cas9电穿孔增强剂。将26微升Cas9核糖核蛋白细胞溶液转移至Nucleocuvette电转杯条的各个孔中,并轻轻敲击电转杯条,确保样品覆盖每个孔的底部。
然后启动 4D-Nucleofector 系统的 EN138 程序。转导结束后,让细胞静置三分钟。随后向每个比色皿中加入 80 µL 预先平衡的培养基,并将样品轻柔地转移至各自条件对应的培养瓶中,在 37 °C 条件下孵育。
培养48小时后,根据标准操作流程,从5 × 10⁵个转导细胞中提取基因组DNA,用于基因敲除筛选。随后,以1:1的比例,用新鲜的表达膜结合型IL21的饲养细胞刺激其余转导细胞,并在共培养5天后,根据标准操作流程提取RNA,用于通过定量PCR进行基因表达分析。流式细胞术分析显示,在现有的Nucleofector系统程序中,EN138程序可获得最高的细胞活力百分比和转导效率。
例如,使用商业化提供的向导RNA,可在扩增的人自然杀伤细胞中成功敲除人HPRT1基因。此外,包含向导RNA2、向导RNA1加向导RNA2以及向导RNA3的Cas9核糖核蛋白均能成功敲除TGF-β受体II的胞外域基因,而单独使用向导RNA1则未诱导出任何T7E1可检测的插入缺失突变。事实上,使用EN138程序进行Cas9核糖核蛋白电穿孔,可使经该程序转导的细胞中TGF-β受体II mRNA表达水平降低60%。
此外,将转导细胞与TGF-β及一种人原代髓母细胞瘤细胞系共培养后,NK细胞的细胞毒性与未经TGF-β处理的对照转导细胞相比无显著差异,这表明Cas9核糖核蛋白修饰细胞在蛋白水平上TGF-β受体II功能相应缺失。一旦掌握,若操作得当,该技术可在五小时内完成。在进行该实验时,需注意设计多种不同的向导RNA,以获得最佳的基因编辑效果。
完成此操作后,可进一步采用DNA测序或T7E1突变检测等方法,以回答有关基因编辑效率的问题,或确定潜在的脱靶遗传突变。该技术自建立以来,为癌症免疫治疗领域的研究人员探索利用基因编辑的NK细胞进行癌症治疗的潜力铺平了道路。观看本视频后,您应能够充分掌握如何对原代人源NK细胞进行基因编辑。
有关此过程后自然杀伤细胞扩增的更多信息,请参见我们早前在 JoVE 上发表的文章。请注意,处理人血具有极高的危险性,在进行本操作时应始终采取通用的健康与安全防护措施。
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本文介绍了一种利用Cas9核糖核蛋白(Cas9/RNPs)对人类自然杀伤(NK)细胞进行基因修饰的实验方案。该方法可用于生成TGFBR2和HPRT1基因缺陷的NK细胞,有助于推动NK细胞生物学及免疫治疗领域的研究。
高效编辑人原代自然杀伤(NK)细胞基因组解决了免疫治疗开发中的一个关键瓶颈,使得能够深入研究免疫逃逸通路(如TGF-β信号通路)的作用机制。这种无DNA的Cas9/核糖核蛋白(RNP)方法通过减少操作相关性细胞凋亡并提高基因敲除效率,增强了靶点验证的可靠性,有助于降低基于NK细胞的治疗策略的风险。该方法通过生成功能修饰后仍保持扩增能力和细胞毒性潜能的NK细胞,显著提升了从发现到临床前评估的转化连续性。
该方法适用于从发现到临床前研究的连续过程,通过基因敲除支持靶点验证,能够制备适用于筛选的细胞产品,并为免疫调节耐药性的临床前评估提供依据。