2021年9月4日
我们提供了一种利用广泛可用的成像序列和开源软件进行磁共振成像(MRI)视神经评估与定量分析的标准化方法的详细方案。遵循该标准化方案可获得有意义的数据,用于不同患者之间以及不同研究之间的比较。
本方案旨在介绍利用磁共振成像(MRI)评估视神经横截面积的标准化方法。我们将描述使用广泛可用的成像序列进行图像采集的过程,并介绍使用开源功能软件进行图像分析的方法。
该方案的重要用途之一是青光眼患者的评估,可为视神经完整性提供宝贵的数据。图像采集方案开始时,需向患者充分解释检查过程,并说明需要遵循以下指示:您需要更换成专用的成像检查服。
您需要确保不要携带或穿戴任何金属物品,这可能包括某些类型的口罩。某些植入式设备可能与磁共振成像不兼容,例如起搏器和胰岛素泵。您必须向医生告知体内留有任何金属物体的情况。
由于MRI设备空间狭小,患有幽闭恐惧症的患者可能不适合进行此项检查。检查预计需要15分钟,期间患者必须保持静止不动。患者需签署适当的知情同意书。
成像前,医生将向患者解释检查步骤,并指导其在磁共振成像(MRI)设备内注视一个正前方的目标,以获得方位正确的图像。医生会进一步说明注意事项,并为患者提供耳机和紧急呼叫按钮等安全装置,以确保检查过程顺利且舒适。视神经的冠状切面将进行垂直正交采集,即
垂直于眼球后方三毫米处的视神经。将使用转移锯和斜矢状面的定位图像,以确保视神经走向及视神经-眼球连接部位的位置最佳。可通过视神经周围脑脊液的分布情况来评估凝视固定的质控,脑脊液应均匀分布在视神经周围,各侧厚度几乎相等。
输入以下参数以进行图像采集。在T2加权脂肪抑制序列中,TR为3000毫秒,TE为90毫秒。
视野范围,16 厘米 × 16 厘米。矩阵,296 × 384。层厚,3 mm。
切片间隙为0.3毫米。最终分析的图像为眼球后方3毫米处的斜冠状面图像。在图像分析流程中,我们将首先从imagej.net下载Fiji图像处理软件包。
首先访问其网站,选择“下载”、“Fiji”,然后根据您的设备选择合适的版本。安装完成后,启动 Fiji 程序。通过选择“文件”、“打开”,然后选择您需要的视神经冠状图像,将其上传至程序中。
请注意,转移过程中需保持图像质量,否则将导致图像分析结果不可靠。通过指定单位长度所对应的像素数量来标准化比例尺,可通过在地图比例尺上绘制一条直线来实现。
然后从“分析”菜单栏中选择“设置比例尺”。根据地图比例尺上显示的线段长度,输入正确的长度单位。使用“图像”菜单将图像转换为灰度图像,然后选择“类型”,再选择“8位”。
通过量化白质像素的强度范围,依次点击插件菜单、分割、套索选择,选择套索选择工具,然后选取足够大的白质区域。如需扩大区域,按住 Shift 键并扩展白质区域。注意在操作过程中不要覆盖任何灰质区域。
总共选择 1000 像素的区域已足够。您可以通过选择“分析”菜单中的“测量”功能来确认所选区域是否为 1000 像素,以量化所选区域的大小。从“分析”菜单中打开“直方图”工具,该工具将显示所选白质区域内像素强度的分布情况。
单击“实时”框,以确保直方图评估所选区域。直方图上的曲线应显示强度的正态分布。按以下方法计算白质强度范围:下限为平均强度减去三倍标准差。
对于本例,下限为 94.372 减去 3 倍的 7.085。上限为平均强度加上 3 倍标准差,即 94.372 加上 3 倍的 7.085。
打开阈值工具,依次点击图像菜单中的“图像”→“调整”→“阈值”。通过点击“设定”并输入上下限值,指定上一步计算得到的范围。在本例中,上下限分别为 73 和 115。
仅勾选“深色背景”功能,并指定黑白标注,B&W从下拉列表中选择,然后点击应用。视盘内白质的掩膜将显示出来。使用套索选择工具(可通过上述方法从插件菜单或快速选择菜单中选择),选中代表视盘的黑色区域。
使用分析菜单栏中的测量功能,计算以厘米为单位的视盘面积。在本例中,测量结果为 0.069。一位30岁男性患者在眼科体检中测得杯盘比为0.8,此结果具有可疑性,可能提示青光眼。
进行视网膜神经纤维层厚度的光学相干断层扫描后,我们发现该患者的神经纤维层厚度在年龄正常范围内。计划为该患者进行头部MRI检查,并按照前述方案要求获取用于视神经评估的冠状面图像。我们获取了位于视盘后方3毫米处的冠状面MRI切面。
白质平均强度为94.372,标准差为7.085,由此得出白质强度范围:下限为94.372减去21.255,等于73.117;上限为94.372加上21.255,等于115.627。图2A显示了冠状面图像。
图2B显示了使用计算出的上下限对白质进行阈值处理后的冠状面图像。图2C则显示了用于定量分析的视神经白质。左侧视神经白质的横截面积为6.9平方毫米,处于该年龄正常范围内。
我们提供了一种使用磁共振成像(MRI)设备对视神经进行评估和定量的标准化方法的详细操作流程,非专科医生也可高可靠性地实施该流程。我们建议在视神经评估相关研究中采用此方案,以便于不同研究结果之间的比较。此外,当需要通过MRI影像排除视神经病变和青光眼的继发性病因时,我们也推荐使用该方案。
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本方案描述了使用磁共振成像(MRI)评估视神经横截面积的标准化方法。旨在为青光眼患者的评估提供有价值的数据,并确保各研究之间的一致性。
通过MRI对视神经横截面积进行标准化定量,有助于客观评估与青光眼及其他视神经病变相关的神经退行性过程。本方案可实现可重复的定量生物标志物测量,能够整合到临床前和临床研究工作流程中,降低靶点验证和治疗效果评估的风险。通过提供按年龄标准化的参考范围并尽量减少个体间测量偏差,本方案可提高在涉及神经保护或神经修复候选药物的转化研究中的预测可信度。
该方法适用于从发现到临床前研究的连续过程,支持在早期发现阶段进行假设验证、在筛选过程中实现检测准备就绪,以及在转化研究中开展定量生物标志物的应用。