2022年9月16日
液体活检已彻底改变了我们进行肿瘤学转化研究的方式,其中样本采集、质量和储存是其成功应用于临床的关键步骤。本文介绍了一种标准化且经过验证的下游游离DNA检测应用方案,可适用于大多数转化医学研究实验室。
本方案是基于循环游离DNA的下游液体活检应用中血液样本处理与保存的标准操作流程。尽管该技术已应用数年,但这是首个公开发表的标准操作流程。本方案易于实施,仅需大多数转化医学或科研实验室常见的标准设备即可完成。
所有实验室工作人员均可执行该方案。该方案有助于标准化样本的采集和储存流程,最终将影响临床应用,并减少不同中心在执行相同或类似下游分析时的变异性,而精确性在这些分析中至关重要。该方法在肿瘤学研究以及临床应用中尤为有用。
然而,该方法也可应用于其他使用液体活检的非癌症疾病。在血液样本离心后,确定应移除多少血浆或血清可能较为困难,但遵循本具体指南将有助于解决这一问题。其余实验步骤非常简单,即使在实验室经验有限的情况下也易于操作。
演示该操作的将是本实验室的技术员 Jorge。首先,在室温下将含有新鲜血液的离心管以1600 × g离心10分钟,并启用最大刹车。小心地从离心机中取出离心管。
血清上清液的上层将呈现清澈的淡黄色。检查样本是否出现溶血迹象,并在适当时记录溶血的存在情况。在II级生物安全柜中,将血清以250 µL的等分试样转移至收集管中。
分装样品必须正确标记。立即将血清在储存盒中直立放置于零下80摄氏度条件下冷冻,并记录样本储存时间。确认样本已在规定的4小时内完成处理。
将EDTA管在室温下以1600 × g离心10分钟,并应用最大刹车。离心后,血浆上清液应呈现清澈的淡黄色。检查样本是否出现溶血迹象,并使用一次性移液管将血浆转移至15毫升离心管中,注意不要扰动细胞层。
在细胞层上方保留约五毫米的少量血浆残留体积。若观察到溶血现象,应弃去该样本,不再用于后续分析。将血浆与15毫升离心管一同离心,以去除在初次离心步骤中可能残留的完整血细胞。
小心地将离心管从离心机中取出,注意不要扰动管底的细胞沉淀,使用一次性移液管将1至4毫升血浆转移至1至4毫升的聚丙烯冻存管或Eppendorf管中。管底需保留一定残余血浆体积,以避免血细胞污染血浆。立即将血浆在储存盒中直立放置于-80摄氏度条件下冷冻,并记录样本储存时间。
确认样本已正确标记,并在规定的四小时内完成处理。使用 P1000 加样器和带滤芯吸头收集细胞层,并转移至一个 2 毫升离心管中。立即在 -80 摄氏度下冷冻保存。
此处展示了一个高质量cfDNA提取的示例,可用于下游应用;而该图像则代表了一个不合适的样本示例,其基因组污染程度较高。血浆或血清组分必须呈黄色,颜色深浅可能因个体样本而异。
出现溶血的样本应予以弃用。在移除血浆组分时,注意不要去除任何细胞沉淀物。本方案也可用于其他基于核酸和蛋白质的应用,例如利用免疫检测技术检测血清和血浆样本中的非编码 RNA 或蛋白质。
这是一种在许多实验室中广泛使用的技术。本方案有助于研究人员标准化分析操作流程,因为这是未来临床应用所必需的关键环节。
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本文介绍了一种用于液体活检应用中循环游离DNA的血液样本处理与保存的标准化方案。该方案设计简洁,易于操作,可适用于大多数转化医学研究实验室。
液体活检的标准化分析前方案对于确保转化医学和临床研究流程中可重复的高质量游离循环DNA(cfDNA)样本至关重要。本方案直接解决了样本处理过程中的变异问题,有助于提高预测可信度,并支持可靠的下游分子分析。该方案的应用对肿瘤学及其他利用cfDNA的疾病领域的早期发现、检测方法开发以及转化研究的连续性具有重要影响。
本方案将分析前样本处理视为从早期发现到先导物鉴定及转化研究全过程中的基础步骤。其标准化有助于产生可靠的数据,并实现不同研究间的可比性。