2023年11月17日
该文章描述了进行杂交链式反应RNA整体荧光染色所需的方法与试剂 原位 通过杂交链式反应RNA全组织荧光原位杂交(HCR RNA WM-FISH)揭示蚊子触角和下颚须中化学感受器基因的空间与细胞分辨率特征。
我们课题组致力于研究蚊子的化学感受系统。我们希望通过对蚊子的味觉和嗅觉进行靶向干预,阻止其寻找并叮咬人类。杂交链式反应荧光原位杂交技术是一项近期发展起来的方法。
该技术具有高灵敏度、高稳定性,并能够对多个基因靶标进行多重检测,从而可以在其天然环境中同时可视化这些基因的表达和定位。空间转录组学是空间生物学领域中使用的一种前沿方法。该技术能够对数千个基因进行多重检测,并可同时可视化这些基因的表达情况。
本实验方案使我们能够直接观察天线中哪些神经元表达了50种左右可能的离子型受体中的任意一种。这为我们提供了基础图谱,以指导我们理解这类因子受体如何介导行为。昆虫嗅觉器官(如天线)内的嗅觉神经元通常埋藏在一层保护性的几丁质外壳内部。
这使得在这些神经元中可视化嗅觉受体的表达变得非常困难。我们的方案结合了甲壳素酶处理和先进的荧光原位杂交技术,以克服这些挑战。首先,将解剖得到的按蚊头部置于预热的CCD缓冲液中,在37摄氏度的加热块上孵育5分钟。
将装有蚊虫头部的离心管转移至杂交炉中,在37摄氏度下旋转孵育。随后,将离心管中的全部内容物转移至解剖用表面皿中。使用镊子夹取头部或任何脱落的触角,并将其固定于1毫升预固定液中。
在振荡器中,将头部样本在预固定液中于 4 摄氏度条件下旋转孵育 24 小时。进行组织解剖时,首先在冰上用 1 毫升 0.1% PBS 吐温溶液冲洗头部样本,然后将头部转移至解剖用表面皿中。
在解剖显微镜下,用尖头镊子从头部去除目标组织。用镊子夹住头部的前部,并用另一把镊子从基部夹住一根触角。以同样方法去除须部,将触角和须部转移到置于冰上的空的无RNase的DNRNase-free管中。
在室温下用 400 微升脱水试剂对组织进行脱水处理,持续一小时。然后将脱水试剂替换为 400 微升无水甲醇,并在 -20 摄氏度条件下过夜脱水。固定完成后,在冰上用梯度复水溶液分四个步骤进行复水,每步 10 分钟。
然后在400 µL PBST中于室温下洗涤组织10分钟。将组织在400 µL蛋白酶K溶液中于室温下孵育30分钟。用400 µL PBST洗涤组织两次,以终止酶消化反应。
加入后固定液后,在探针杂交前用PBST再次洗涤组织。将组织浸入400微升探针杂交缓冲液中,孵育5分钟。接着,吸去缓冲液,并将组织在400微升预热的探针杂交缓冲液中于37摄氏度预杂交30分钟。
将预热的探针杂交缓冲液替换为400微升加热的探针溶液。将试管置于37摄氏度的摇床上孵育两晚。然后将摇床放入一个盒子里的培养箱中。
接下来,将组织在 400 µL 探针洗涤缓冲液中于 37 °C 摇床上孵育。在 SSCT 缓冲液中洗涤组织五次后,于室温下在 400 µL 扩增缓冲液中孵育 10 分钟。用移液器将扩增缓冲液从离心管中吸出。
然后加入加热后的发夹探针 H1 和 H2 的混合物。接着,用移液器加入 100 µL 扩增缓冲液。将组织在室温避光条件下旋转孵育过夜。进行组织封片时,首先在玻璃载片上滴加五滴封片液。
接下来,用镊子夹住已清洗的组织样本的基部,轻轻浸入一系列封片液液滴中进行冲洗。然后用封片液封片,并在组织上覆盖盖玻片。
成像前用指甲油封固盖玻片。对雌性按蚊嗅觉组织进行 HCR-FISH 分析发现,IR41t.1、IR75d 和 IR7t 在触角中的丰度较低。
IR64a 的丰度是其他候选基因的三倍。在蚊子的触角以及下颚须中均观察到 Orco 与 IR25a 受体家族的共定位。共定位模式表明,IR76b 阳性细胞表达 IR25a,而 IR8a 阳性细胞则与 IR76b 和 IR25a 部分共定位。
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本文介绍了一种杂交链式反应RNA整体荧光原位杂交(HCR RNA WM-FISH)的详细实验方案,旨在阐明蚊虫触角和下颚须中化学感受受体基因的空间分布与细胞表达模式。通过采用先进的荧光技术,该研究揭示了蚊虫化学感受系统的特征及其在蚊虫行为与环境互作中的潜在意义。
对蚊虫嗅觉附器中化学感受基因表达进行空间定位,可为媒介控制策略提供高分辨率的靶点验证。HCR RNA WM-FISH 方案可实现稳定、多重的基因表达检测,有助于在早期发现阶段提升预测可信度,并降低机制研究中的风险。该技术能力对于致力于解析感知识别通路并筛选疾病传播媒介昆虫分子靶点的生物制药团队具有直接应用价值。
本方案贯穿了从早期靶点验证到检测方法开发以及媒介生物学转化研究的整个发现过程。