פרוטוקול האימונולוקליזציה הזה במיוציטים זכריים של תירס שומר על שלמות תלת-ממדית של התאים במהלך המיוזה. הוא מאפשר מעקב דינמי אחר המיקום התוך-תאי של עד שלושה נוגדנים עצמאיים בחומר משומר עם פאראפורמלדהיד, בנוסף ל-DAPI, שמצבע DNA.
מאמר שיטה
פרוטוקול האימונולוקליזציה הזה במיוציטים זכריים של תירס שומר על שלמות תלת-ממדית של התאים במהלך המיוזה. הוא מאפשר מעקב דינמי אחר המיקום התוך-תאי של עד שלושה נוגדנים עצמאיים בחומר משומר עם פאראפורמלדהיד, בנוסף ל-DAPI, שמצבע DNA.
במהלך פרופאזה מיוטית I, הקונפיגורציה הפיזית של הכרומוזומים משתנה מאוד בין שלבי ההתפתחות, ולמזלנו, תצורות ספציפיות אלו מאפשרות זיהוי נכון של כל אחד מהשלבים המיוטיים הקלאסיים הללו, הידועים בהתאמה כלפטוטן (למשל 'חוטים דקים'), זיגוטן (למשל 'חוטים מחוברים'), פאכיטן (למשל 'חוטים עבים'), דיפלוטן (למשל 'החוטים הכפולים') ודיאקינזיס (למשל 'תנועת הדחייה'). ניתוח חזותי של מספר תופעות ציטוגנטיות המתרחשות במהלך פרופאזה I, כגון רקומבינציה, זיווג וסינפסיס, דורש טכניקות אימונולוקליזציה אמינות מאוד. בניגוד לטכניקות ההתפשטות והדחיסה המסורתיות שמדכאות כל מידע תת-תאי ותת-גרעיני, הליך השימור התלת-ממדי המתואר כאן מאפשר שימור חלבונים מיוטיים מרכזיים באתרי התת-תאים הטבעיים שלהם (ציטופלזמה, גרעינית ותת-גרעינית: אאוכרומטין, הטרוכרומטין ונוקלאולר). לכן, פרוטוקול זה מתאר כיצד לקבע ביעילות אנתרים מיוטיים, לנתח ולשחרר מיוציטים מאנתרות, ולבצע אימולוקליזציה סימולטנית של שלושה חלבונים מרכזיים במיוציטים זכריים בתירס.
מיוזה היא תהליך מרכזי המווסת את העברת התכונות בצמחים ובגידולים מודליים; לכן, שיטות מיקרוסקופיה פשוטות שמאפשרות הדמיה עקבית ונאמנה של מיקום החלבונים מקלות על הבנת האופן שבו תכונות אלו יכולות להיות מועברות ביעילות רבה יותר. למרבה הצער, ההדמיה של מיקום החלבונים בתוך מיוציטים השתנתה מאוד בהתאם לטכניקה שבה נעשה שימוש 1,2. לכן, מטרת הפרוטוקול היא לספק שיטה פשוטה וניתנת לשחזור שמבטלת ארטיפקטים במהלך התצפית על מיוציטים. לדוגמה, מוכר זה זמן רב כי תצפית על כרומוזומים מיוטיים היא תהליך עדין שמתבצע על ידי ריסוק התאים באמצעות דחיסה פשוטה או טכניקות התפשטות מפריעות אף יותר. ב-Arabidopsis thaliana, חוקרים משתמשים לעיתים קרובות בשיטות הפצה המשתמשות בתערובת של קרנוי (תערובת 3:1 של אתנול וחומצה אצטית) יחד עם חומרי ניקוי שונים כמו ליפסול, טווין-20 וטריטון X-100, וכן תערובות אנזימים המכילות צלולאז, פקטינאז וציטוהליקאזים, כדי לפרק תאים ולאפשר אימונולוקליזציה יעילה על הכרומוזומים הקטנים 1,2. טכניקות אלו משנות קונפורמציה של כרומוזום תלת-ממדי לדו-ממדית, ומאפשרות תצפית מהירה על כל הכרומוזומים המפוזרים מלאכותית בתמונה אחת. תכונות מסוימות של כרומוזומים העוברים טיפולים קשים אלו עשויות להיות ברורות; עם זאת, לעיתים קרובות הם אינם מייצגים את ההתנהגות הטיפוסית של תאים וכרומוזומים ב-vivo6. זיהוי מהיר ורחב מאוד של עד שני נוגדנים אפשרי באמצעות טכניקות הפצה דו-ממדיות במגוון מיני צמחים, כולל תירס 7,8,9,10,11.
עם זאת, למרות הנוחות של טכניקות דו-ממדיות ישנות, כיום מוכר שתופעות מסוימות רגישות לשיטות מפריעות ולא ניתן לראות אותן אם התא, הגרעין או הכרומוזומים ניזוקים במהלך התפשטות או דחיסה. לדוגמה, תנועת חלבון RAD50 מהציטופלזמה לגרעין במהלך שלב הלפטוטן, או במהלך קישור צנטרומר (לפטונמה/זיגונמה), זוהתה רק במיוציטים תלת-ממדייםשלמים 12. כאן מוצע לקוראים פרוטוקול תלת-ממדי מפורט בן 4 ימים המשתמש באנתרים מקובעים ב-4% פאראפורמלדהיד כדי לאימונולוקליזציה של שלושה חלבונים מרכזיים במיוציטים זכריים של תירס, ובכך לשמור על שלמותם המבנית. בהשוואה למתודולוגיית אימונולוקליזציה תלת-ממדית של תירסדומה 8, הוספנו הערות מעשיות וטיפים לפתרון תקלות לחוקרים. פרוטוקול זה יועיל לעבודתם של ביולוגים של צמחים ומגדלי צמחים המעוניינים לחקור תהליכים מיוטיים שונים, כגון שליטה ברקומבינציה המיוטית על ידי הקומפלקס הסינפטונמי.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
זהירות: לטפל בפורמלדהיד ואקרילאמיד באמצעות ציוד מגן אישי מתאים ומכסה כימיקלים; שניהם רעילים (אקרילאמיד גם נוירוטוקסי לפני הפולימריזציה). כל החומרים בהם השתמשו במחקר מופיעים בטבלת החומרים.
1. קיבוע אנתרים של תירס לשימור המבנה השלם של מיוציטים
2. הטמעת מיוציטים של תירס בתוך כריכות כריך פוליאקרילאמיד
יום 1: הכנת שקופיות תלת-ממדיות
3. אימונולוקליזציות
יום 2: כביסה
יום 3: נוגדנים משניים, שטיפות והתקנת שקופיות
יום 4: תצפיות מיקרוסקופיות
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
באמצעות פרוטוקול זה, ניתן לצפות בו-זמנית בדפוסי המיקום של שלושת החלבונים המיוטיים המרכזיים בתירס (איור 1). החלבון המיוטי ABSENCE OF FIRST DIVISION 1 (AFD1) הוא הומולוג של תת-היחידה אלפא-קלייזין REC8 של קומפלקס הקוהזין המיאוטי. ה-ASYNAPTIC 1 (ASY1) הוא אלמנט אקסיאלי קריטי, בעוד שה-ZYPPER1 (ZYP1) הוא האלמנט הטרנסוורסלי של הקומפלקס הסינפטונלי15. צביעת DAPI מראה גרעין ברור וצביעת כרומטין, המאפשרת זיהוי של תת-השלבים המיוטיים, אך גם מראה צב...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
פרוטוקול זה מציע יתרון מרכזי על פני אחרים בכך שהוא שומר על נתונים תלת-ממדיים חיוניים על טעינת חלבונים כרומוזומליים מיוטיים. תכונות אלו אינן ניתנות לשימור באמצעות טכניקות התפשטות רגילות 1,2. עם זאת, לפרוטוקול זה יש שתי מגבלות: הוא איטי ודורש טכנית בהשוואה לטכניקות הפצה רגילות שמבוצעות בתוך יום אחד. לעומת זאת, הפרוטוקול שלנו דורש ארבעה ימי עבודה, בעיקר בשל שלבי שטיפה נרחבים ודגירה לילית של נוגדנים ראשוניים ומשניים, שלא ניתן לקצר או...
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
המחברים מצהירים שאין להם אינטרסים מתחרים.
המחברים מודים לאדריאנה מונסראט על ניהול מנהלי ורכש. א. רונסרט מודה במענקים מ-UNAM-PAPIIT ו-SECIHTI, ומודה למכון לביוטכנולוגיה (IBt-UNAM) על המימון הראשוני והשנתי. פ. בולאנוס מודה לסגן הרקטור למחקר באוניברסיטת קוסטה ריקה על התמיכה המתמשכת.
הגישה מוגבלת. התחברו או התחילו תקופת ניסיון כדי לצפות בתוכן זה.
| שם | חברה | מספר קטלוג | הערות |
|---|---|---|---|
| 1.5 mL microtubes Axygen | Corning | MCT-150-C | |
| 15 mL Falcon tubes | Thermo Fisher Scientific | 339651 | |
| 50 mL Falcon tubes | Thermo Fisher Scientific | 339652 | |
| 6 well plate Falcon polystyrene microplate | Thermo Fisher Scientific | 08-772-1B | |
| Acetic acid, 60% | Thermo Fisher Scientific | A38-212 | |
| Acrylamide 30% and bis-acrylamide solution, 29:1 | Biorad | 1610157 | |
| Aluminum fold | Reynolds | U07211R0 | |
| Amonium Persulfate (APS) | Merck | A3678 | |
| Binocular stereomicroscope | NA | NA | |
| Bovine Serum Albumin (BSA) | Merck | A9418 | |
| DAPI | Merck | D9542 | |
| DelltaVision microscope | Olympus | NA | |
| Distilled H2O | NA | NA | |
| Disposable Filter Units with PES filters of 0.45 μm pore | Thermo Fisher Scientific/Nalgene | 09-740-63B | |
| Fine forceps FST Dumont SS | Fine Science Tools | 11200-33 | |
| goat (IgG H+L) highly cross-adsorbed anti-rat labelled by AlexaFluor647 | Invitrogen | A-21247 | |
| goat (IgG H+L) highly cross-adsorbed anti-rabbit labelled by AlexaFluor568 | Invitrogen | A-21428 | |
| goat (IgG H+L) highly cross-adsorbed anti-guinea pig labelled by AlexaFluor488 | Invitrogen | A-11073 | |
| Gloves | Merck | Z412392 | |
| Growing chambers / greenhouse / or field | NA | NA | |
| DTT | Merck | D0632 | |
| EDTA | Sigma-Aldrich | E6758 | |
| EGTA | Sigma-Aldrich | E3889 | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| Masking tape 3M | Fisher Scientific | 19-047-259 | |
| Maize seeds | NA | ||
| Microscope 22 x 22 mm-1,5 glass coverslips | Fisher Scientific | 12-542-B | |
| Microscope 22 x 22 mm-H coverslips | Deckgläser, Zeiss | 474030-9020-000 | |
| Microscopic glass slides | Fisher Scientific | 22-230-900 | |
| Microscope slide box | Fisher Scientific, | 03-448-9 | |
| Micropipets P20, P200, P1000 | Merck | CLS4069 | |
| NaCl | Merck | S7653 | |
| Nail polish | Electron Microscopy Science | 72180 | |
| Paper towels | Merck | Z188956 | |
| Parafilm | Merck | P7668 | |
| Paraformaldehyde 16% solution | Electron Microscopy Grade | 15710 | |
| PBS | Merck | P4474 | |
| Plastic box with lid | Tupperware | NA | |
| Poly-L-Lysine | Merck | P4707 | |
| Primary antibodies (rat anti-ZmAFD1, rabbit anti-ZmASY1, guinea-pig anti ZmZYP1) | NA | ||
| Prolong Antifading | Molecular Probes | P36934 | |
| Petri dish (D x H: 35 mm x 10 mm | Corning | 351008 | |
| Petri dish regular size | Merck | P5731 | |
| PIPES | Merck | P1851 | |
| Pipet tips (0.5-10 uL) sterile | Merck/Corning | AXYT300 | |
| Pipet tips (200 uL) sterile | Merck/Corning | AXYT200Y | |
| Pipet tips (1000 uL) sterile | Merck/Corning | AXYT1000BRS | |
| Razor blade - single edged | Fisher Scientific | 12-640 | |
| Rocking platform shaker | NA | NA | |
| Spermine | Merck | 85590 | |
| Spermidine | Merck | S2626 | |
| Sorbitol | Merck | S8143 | |
| Tween-20 | Merck | P9416 | |
| Triton X-100 | Fisher Scientific | 9002-93-1 | |
| Ultra pure Acrylamide | Invitrogen | 15512023 | |
| Vacuum |
בקש הרשאה לשימוש חוזר בטקסט או באיורים של מאמר JoVE זה
בקש הרשאה