$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
ה-modRNA d2EGFP-T2A-hTERT הונדס כמסגרת קריאה פתוחה היברידית, שבה רפורטר EGFP לא יציב (d2EGFP) קושר ל-TERT אנושי באמצעות פפטיד T2A בעל יכולת פיסול עצמי. הרצפים המלאים של הנוקלאוטידים והחלבונים עבור כל המבנים מופיעים ב-Supplementary File 1. רצף הקידוד הוקף על ידי אזור לא מתורגם (UTR) סינתטי ב-5′ ועל ידי ה-3′ UTR של β-globin אנושי, כדי להגביר את יעילות התרגום ואת יציבות ה-mRNA (איור 1A). קסטת הביטוי הכילה גם רצף מייצב אנזימים סינתטי (Es) ורצף מגביר שעתוק סינתטי (TEs), שנועדו לשפר את הפרוססיביות של T7 polymerase ולהפחית סיום שעתוק מוקדם. לאחר שיבוץ במורד ל-T7 promoter, בוצע שעתוק in vitro באמצעות anti-reverse cap analog (ARCA) ונוקלאוטידים משוערים (m5CTP ו-ΨUTP), ולאחריו הוספת זנב פולי(A) אנזימטי (בקירוב 120–200 nt) כדי לייצר d2EGFP-T2A-hTERT modRNA עם כובע, פוליאדנילציה ושלמות גבוהה (איור 1A).
ניתוח אלקטרופורטי אוטומטי של RNA אישש סינתזה יעילה של התעתק, תוך חשיפת סוג RNA דומיננטי בגודל המצופה עם מינימום של תוצרי פירוק בכמויות קלט שונות, מה שמתיישב עם יצירה מוצלחת של modRNA באורך מלא (איור 1B). בעקבות טרנספקציה של פיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנסנציה (senescence) עם 2 µg/mL d2EGFP-T2A-hTERT modRNA, חלבון hTERT הפך לניתן לזיהוי תוך 24 h ונשאר ברמה גבוהה למשך 48–96 h, מה שמעיד על תרגום מתמשך של התעתק הסינתטי (איור 1C). ניתוח של רפורטר d2EGFP המקושר הדגים פלורסצנציה חזקה בעקבות טרנספקציה הפוכה (reverse transfection), בעוד שפלורסצנציה נמוכה באופן משמעותי נצפתה בעקבות טרנספקציה ישירה (forward transfection) (איור 1D,E). ממצאים אלו מעידים על העברה ואקספרסיה משופרת של hTERT modRNA באמצעות גישת הטרנספקציה ההפוכה בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנסנציה.
טרנספקציה קדימה (FT) חוזרת של פיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה (הזדקנות תאית) עם modRNA של d2EGFP-T2A-hTERT במרווחי זמן של 5 ימים, הובילה לעלייה הדרגתית באורך הממוצע של הטלומרים (rT/S) ביחס לבקרים שעברו טרנספקציה דמה (mock-transfected), כפי שנמדד באמצעות PCR כמותי מולטיפלקס מונוכרומטי (MMqPCR) (איור 2A). יחס ה-rT/S עלה לאחר כל מחזור FT, כאשר המובהקות הסטטיסטית השתפרה מ-*P < 0.05 ל-**P < 0.01.
יישום של אותו לוח זמנים למינון באמצעות טרנספקציה הפוכה (RT) הוביל לעלייה בולטת יותר באורך הטלומרים. יחס ה-rT/S עלה לאחר כל מחזור RT והגיע להבדלים משמעותיים ביותר ביחס לבקרים שעברו טרנספקציה מדומה (*P < 0.05 עד ****P < 0.0001) (איור 2B). השוואה ישירה בין FT ל-RT לאחר שלושה מחזורי טיפול הדגימה ששתי הגישות העלו באופן משמעותי את ערכי ה-rT/S ביחס לבקרים שעברו טרנספקציה מדומה; עם זאת, RT הביא לעלייה גדולה יותר מאשר FT תחת תנאי מינון ותזמון זהים (*P < 0.05, ***P < 0.001, ****P < 0.0001) (איור 2C).
ניתוח צמיחה ארוך טווח הדגימה עוד כי מתן חוזר של hTERT modRNA האריך את תוחלת החיים השכפולית (איור 2D). תאים שקיבלו מחזור טיפולי אחד, שניים או שלושה הראו כמות מצטברת גדולה יותר של כפילויות אוכלוסייה באופן הדרגתי בהשוואה לבקרה שעברה טרנספקציה מדומה. תרביות שקיבלו שלושה סבבים של טיפול ב-hTERT modRNA, במיוחד באמצעות RT, הראו את הסטייה הגדולה ביותר מעקומות הצמיחה של הבקרה לאורך כ-250 ימים (עד ****P < 0.0001). חישובי כפילויות האוכלוסייה מוצגים ב-קובץ משלים 2.
פיברובלסטים מסוג LF1 בשלב מוקדם של דעיסה (senescence) שהועברו להם d2EGFP-T2A-hTERT modRNA הפגינו דפוס סולם TRAP חזק 48 שעות לאחר הטרנספקציה, בעוד שתאים שעברו טיפול ב-mock או ב-eGFP-modRNA הראו רק אות רקע, מה שמעיד על כך שפעילות הטלומראז נבעה מביטוי אקסוגני של hTERT (איור 3A). טיפול מקדים בחום ביטל את דפוס הסולם, מה שמאשר את סגוליות הבדיקה (איור 3B).
ניתוח של מהלך הזמן הראה כי פעילות הטלומראז הגיעה לשיאה בין 24 ל-48 שעות לאחר הטרנספקציה ולאחר מכן ירדה, וחזרה לרמות הקרובות לבסיס עד לשעה ה-72–96 (איור 3C). הגברת ריכוז ה-hTERT modRNA מ-50 ל-3,000 ng/mL הובילה לעלייה תואמת בעוצמת אות ה-TRAP, מה שמעיד על הפעלת טלומראז תלויה במינון (איור 3D).
ניתוח תפקודי באמצעות מבני hTERT מסוג פראי (wild-type), לא פעילים קטליתית (CI), וחסרי סיגנל למיקום גרעיני (ΔNLS) הדגים כי רק hTERT מסוג פראי יצר פעילות טלומראז חסונה. שני הגרסאות, CI ו-ΔNLS, נכשלו בהשראת פעילות דומה למרות תנאי העברה דומים (איור 3E). בהתאמה לממצאים אלו, ניתוח MMqPCR חשף עלייה ניכרת באורך הממוצע של הטלומרים (rT/S ≈ 1.4) רק בתאים שקיבלו modRNA של hTERT מסוג פראי. תאים שקיבלו CI-hTERT, ΔNLS-hTERT, או טיפול דמה (mock) נותרו קרובים לרמות הבסיס (rT/S ≈ 0.3; ****P < 0.0001) (איור 3F).
שלושה סבבים עוקבים של טרנספקציה הפוכה עם hTERT modRNA במרווחי זמן של 5 ימים הפחיתו באופן משמעותי את הפרופורציה של תאים חיוביים ל-β-galactosidase המשויך להזדקנות. אחוז התאים החיוביים ירד מכ-85% בתרביות שעברו טיפול דמה (mock) לכ-40% בתרביות שטופלו ב-hTERT, 15 ימים לאחר הטרנספקציה האחרונה (***P < 0.001) (איור 4A).
צביעה אימונוהיסטוכימית קונפוקליתית העלתה ביטוי מוגבר של Ki67 בתאים שעברו שלושה סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT בהשוואה לבקרה שעברה טיפול מדמה (mock), דבר המעיד על פעילות פרוליפרטיבית מוגברת (איור 4B). ניתוח RT-qPCR הדגים עוד ביטוי מופחת של סמני ההזדקנות p16 ו-p21 בעקבות טיפול ב-hTERT. ביחס לתאים בשלב הזדקנות מוקדם שקיבלו טיפול דמה (mock), ביטוי p16 ירד מכ-2.3-מכפלה ל-0.7-מכפלה, וביטוי p21 ירד מכ-11-מכפלה ל-6-מכפלה (**P < 0.01; ****P < 0.0001) (איור 4C,D). איור משלים 1 מדגימה עוד כי טיפול בכלורוקווין (CQ) או ב-Y-27632 לבדם לא שינה באופן משמעותי את הביטוי של p16 או p21 בתאים שעברו טרנספקציה מדומה (mock-transfected). לעומת זאת, השילוב של CQ ו-Y-27632 במהלך שלושה סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT הוביל להפחתה הגדולה ביותר בביטוי של p16 ו-p21, בהשוואה לטרנספקציה הפוכה של hTERT לבדה או לטיפול בכל אחד מהחומרים באופן בודד, בעוד שטיפול בחומר בודד הניב השפעות ביניים. ממצאים אלו מעידים כי שימוש משולב ב-CQ וב-Y-27632 הגביר את ההפחתה בביטוי של סמני התיישנות (senescence-associated markers) בעקבות טרנספקציה הפוכה של mRNA של hTERT. יחד, ממצאים אלו מדגימים כי טרנספקציה הפוכה חוזרת של mRNA של hTERT מקדמת הארכת טלומרים, מפחיתה סמני התיישנות ומשפרת מאפיינים פרוליפרטיביים בפיברובלסטים מסוג LF1 בשלב התיישנות מוקדם.

איור 1: תכנון, סינתזה ותיקוף פונקציונלי של mRNA מסוג d2EGFP‑T2A‑ hTERT בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של דעיכה (senescence). (A) תרשים של מבנה ה-mRNA ההיברידי של hTERT המכיל קסטה של d2EGFP המקושרת לפפטיד T2A, לצורך ביטוי סימולטני של hTERT ו-EGFP לא יציב. ה-ORF של d2EGFP-T2A-hTERT מוקף על ידי ה-3’ UTR של הגן β globin האנושי (HBB) ו-5’ UTR סינתטי. ה-mRNA סונתז באמצעות נוקלאוטידים שעברו מודיפיקציה, ובסיום נוסף זנב poly (A). (B) סינתזה יעילה של mRNA מסוג d2EGFP-T2A-hTERT בעל שלמות גבוהה באמצעות תמלול in vitro, כפי שנותח בבדיקה אלקטרופורטית אוטומטית של RNA. (C) ניתוח מהלך זמן של ביטוי חלבון hTERT באמצעות בדיקת אימונו-סיי (immunoassay) אוטומטית מבוססת קפילריות לאחר טרנספקציה של 2 µg/mL של mRNA מסוג d2EGFP-T2A-hTERT. (D) היעילות והביטוי של טרנספקציית mRNA מסוג d2EGFP-T2A-hTERT, כפי שנבחנו על ידי ביטוי EGFP בין טרנספקציה קדימה (FT) לטרנספקציה הפוכה (RT), נבדקו בפיברובלסטים דיפלואידיים ראשוניים בשלב דעיכה מוקדם (LF1). סרגל קנה מידה = 10 µm. (E) כימות עוצמת פלואורסצנציה ממוצעת (MFI) של אות eGFP לאחר טרנספקציה קדימה או הפוכה. סך של 20 תמונות בודדות נותחו עבור כל תנאי, הכוללות 4 אזורים נפרדים מ-5 חזרות ביולוגיות. הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. **P < 0.01; כפי שנוערך במבחן t לא מזווג עם תיקון של Welch. אנא לחצו כאן להצגת גרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 2: דינמיקת אורך הטלומרים ותוחלת חיים פרוליפרטיבית לאחר טרנספקציה חוזרת של mRNA של hTERT בכיוון קדימה לעומת כיוון אחורי בפיברובלסטים מסוג LF1 בשלב התחלה של סנסנציה. (A) אורכי הטלומרים הממוצעים (rT/S) נקבעו באמצעות Telomere MMqPCR. פיברובלסטים בשלב התחלה של סנסנציה עברו טרנספקציה קדימה (FT) עם mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT שלוש פעמים ברצף במרווחי 5 ימים, החל מהכפלת אוכלוסייה (PD) מספר 76. פס השגיאה מציין SEM; n = 5 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, **P < 0.01 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mock בלבד. (B) בדומה ל-(A), rT/S הוערכו כאשר תאים בשלב התחלה של סנסנציה עברו טרנספקציות חוזרות (RT) עם mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT שלוש פעמים ברצף במרווחי 5 ימים, החל מהכפלת אוכלוסייה (PD) מספר 76. פס השגיאה מייצג SEM; n = 7 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, ****P < 0.0001 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mock בלבד. (C) השוואת אורך הטלומרים הממוצע (rT/S) לאחר 3 טרנספקציות קדימה ואחורה ברצף במרווחי 5 ימים, או mock בלבד. פס השגיאה מייצג SEM; n = 10 חזרות ביולוגיות; *P < 0.05, ***P < 0.001, ****P < 0.0001. (D) עקומות גדילה של פיברובלסטים מסוג LF1 שעברו טרנספקציה עם 2 µg/ml mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT או mock בלבד, פעם אחת, פעמיים או שלוש פעמים ברצף במרווחי 5 ימים החל מ-PD# 76. חצים שחורים מציינים את מועדי הטיפולים. עקומות הגדילה חזרו שלוש פעמים, כאשר כל אוכלוסייה תורשבה בשלוש כפולות. 3 חזרות טכניות לכל דגימה ביולוגית, הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. *P < 0.05, **P < 0.01; ****P < 0.0001, כפי שהוערך באמצעות מבחני Brown-Forsythe ו-Welch’s ANOVA אנא לחץ כאן כדי לצפות בגרסה מורחבת של איור זה.

איור 3: mRNA של hTERT פעיל קטליטית, הממוקם בגרעין, מניע עלייה חולפת ותלוית-מינון בפעילות הטלומרז, אשר כשלעצמה מספיקה כדי לקדם הארכה מדידה של הטלומרים בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה. (A) תאים בשלב מוקדם של סנצנציה עברו טרנספקציה עם mock, eGFP, או mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT. 48 שעות לאחר הטרנספקציה, הוכן תמצית תאים מ-20,000 תאים והיא הוכפפה לבדיקת TRAP. תוצרי התגובה הריצו ב-PAGE נייטרלי ונצבעו ב-SYBR Green. (B) השבתה של טלומרז באמצעות חום כפי שנמדדה באמצעות בדיקת TRAP. (C) ניתוח של פעילות הטלומרז לאורך זמן בתאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה בעקבות טרנספקציה של mRNA של hTERT הראה כי הפעילות חזרה לרמת הבסיס בתוך 72 שעות, מה שמעיד על הפעלה זמנית של האנזים. (D) תאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה קיבלו כמויות משתנות של mRNA של d2EGFP-T2A-hTERT (0–3,000 ng/mL), והראו עלייה בפעילות הטלומרז באופן פרופורציונלי למינון. (E) הולכה של 2 µg/ml TERT הגבירה את פעילות הטלומרז בתאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה. ΔNLS הגביר חלקית את פעילות הטלומרז ללא השראה של הארכת טלומרים, מכיוון שהוא פועל בציטופלסמה אך אינו עובר לגרעין, בעוד ש-mRNA של CI TERT לא עורר אפקט זה, מה שמעיד על תוצאות תפקודיות שונות. (F) השפעת טרנספקציה הפוכה של TERT תפקודי, TERT חסר סיגנל למיקום גרעיני (ΔNLS), ו-TERT שאינו פעיל קטליטית (CI) על אורכי הטלומרים הממוצעים (rT/S) של תאי LF1 בשלב מוקדם של סנצנציה, המעידה על חשיבותו של TERT פעיל קטליטית הממוקם בגרעין להארכת הטלומרים. סרגל השגיאה מייצג SD; n = 7 חזרות ביולוגיות; ****P < 0.0001 בהשוואה לתאים שטופלו ב-mocks בלבד, כפי שהוערך באמצעות one-way ANOVA עם תיקון Welch. RTA%-פעילות טלומרז יחסית (% מהביקורת) מצוינת בתחתית כל נתיב. היחס בין רמות העוצמה של סולמי דגימות ה-TRAP לבין פס ה-ITAS (ביקורת פנימית- IC) חושב לפי הנוסחה הבאה עבור כל נתיב: Activity normalized = Ladder intensity/ IC intensity וכל דגימה נורמלה לביקורת החיובית כאחוז (ביקורת חיובית; 2,500 תאי H1299) באמצעות הנוסחה הבאה: Relative activity (%) =Activity normalized (sample)/ Activity normalized (reference). חיסור רקע הוחל בכל שלב. אנא לחצו כאן כדי לצפות בגרסה גדולה יותר של איור זה.

איור 4: טרנספקציה הפוכה אופטימלית של hTERT mRNA הופכת חלקית פנוטיפים הקשורים להזדקנות ומחדשת סממנים של פרוליפרציה בפיברובלסטים LF1 בשלב מוקדם של הזדקנות. (A) תמונות מייצגות של תאי LF1 בשלב מוקדם של הזדקנות המבטאים β-gal לאחר טרנספקציה של hTERT mRNA משוכלל 3 פעמים ברציפות במרווחי 5 ימים. סרגל קנה מידה = 100 µm. ביטוי β-gal נבדק 15 ימים לאחר הטרנספקציה האחרונה. הניסויים בוצעו שלוש פעמים עם >100 תאים לדגימה שנספרו ידנית. (B) תמונות קונפוקאליות מייצגות (הגדלה של 20x) של תאי LF1 בשלב מוקדם של הזדקנות, שצבעו סמן הפרוליפרציה Ki67. סרגל קנה מידה = 100 µm. עלייה משמעותית בביטוי Ki-67 לאחר 3 סבבים של טרנספקציה הפוכה של hTERT. אחוז הגרעינים החיוביים ל-Ki67 עולה באופן משמעותי לאחר 3× hTERT (RT). הגרף מייצג את הממוצע ± SD של ספירת הגרעינים החיוביים ל-Ki67, מנורמל למצב של טרנספקציית Mock. עבור כל תנאי, נבחנו בסך הכל 18 תמונות, כאשר 6 שדות נבחרים מכל אחד מהחזרים הביולוגיים, לסך של n = 3 חזרים ביולוגיים. ****P < 0.0001. (C) ביטוי סממני הזדקנות לאחר הצעירה חלקית בתיווך של 3× hTERT כפי שנמדד ב-RT-qPCR (n = 6). כל הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD. **P < 0.01; ****P < 0.0001, כפי שנמדד ב-t-test לא מזווג עם תיקון Welch. אנא לחץ כאן להצגת גרסה גדולה יותר של איור זה.
| רכיב | נפח/ריכוז סופי |
| DNA תבנית ל-PCR | 200 –1000 ng |
| 10× IVT Buffer | 2 μL |
| ATP (100 mM) | 2 μL (10 mM סופי) |
| GTP (100 mM) | 1.5 μL (7.5 mM סופי) |
| CTP (100 mM) | 2 μL (10 mM סופי) |
| m1Ψ-5′-TP (100 mM) | 2 μL (10 mM סופי) (ניתן להגדיל את שילוב ה-pseudo-UTP על ידי שילוב UTP רגיל ביחס של 1:4-2:2 (m1Ψ-5′-TP:UTP).) |
| ARCA (10 mM) | 4 μL (2 mM סופי) |
| מעכב RNase (40 U/μL) | 0.5 μL (20 U) |
| T7 RNA Polymerase (50 U/μL) | 2 μL (100 U) |
| H₂O נקי מנוקלאז | 20 μL |
טבלה 1: הרכב תגובת השעתוק במבחנה (IVT) לסנתזה של mRNA של hTERT עם מודיפיקציות של נוקלאוזידים. רכיבי התגובה והכמויות הסופיות ששימשה לסנתזה של IVT עם כיסוי ARCA מפורטים בטבלה.
| רכיב | נפח/ריכוז סופי |
| mRNA מטוהר עד 5 μg | ≤20 μL |
| 10× Poly(A) Tailing Buffer | 5 μL |
| ATP (10 mM | 5 μL (1 mM סופי) (למרות שזה כבר נמצא בבופר, התוספת הנוספת מסייעת לייצוב ה-poly A.) |
| Poly(A) Polymerase (5 U/μL) | 1 μL (5 U) |
| H₂O נטול נוקליאז | עד לנפח סופי של 50 μL |
טבלה 2: הרכב תגובת ה-poly(A)-tailing המשמשת למודיפיקציה פוסט-טרנסקריפציונית של hTERT mRNA. מוצגים נפחי הריאגנטים ותנאי התגובה ליצירת זנב poly(A) באורך 120–200 נוקלאוטידים.
| פרמטר | פורמט של 12 בארות | פורמט של 6 בארות |
| שטח פני גדילה | ~3.8 cm² | ~9.5 cm² |
| מדיה לכל בארה | 1.0 mL | 2.0 mL |
| מספר זריעת תאים | 5× 104–6.5× 104 Cells/ml | 2.0–2.5 × 10⁵ |
| מספר תאים ממוצע (ב-100% confluency) | 5.7× 104–7.2× 104 Cells/ml | 2.9–3 × 10⁵ |
| כמות mRNA לטרנספקציה | 750 –1000ng | 2000–3500 ng |
| חומר טרנספקציה ל-mRNA | 1.5 – 3.0 µL | 4.75 – 7 µL |
| נפח סופי של mRNA + חומר טרנספקציה ב-Opti-MEM | 50 µL | 200 µL |
טבלה 3: פרמטרי טרנספקציה מומלצים להעברת mRNA של hTERT בפורמטים של תרביות ב-6 בארות וב-12 בארות. מוצגים סיכומי צפיפויות זריעת תאים, כמויות mRNA, נפחי ריאגנט טרנספקציה ונפחי היווצרות קומפלקסים ששימשו בניסויי טרנספקציה ישירה (forward) והפוכה (reverse).
איור משלים 1: השפעת כלורוקווין ו-Y-27632 על ביטוי p16 ו-p21 הקשורים להזדקנות תאית בעקבות טרנספקציה הפוכה חוזרת של hTERT mRNA. (A) ניתוח Quantitative RT-PCR של ביטוי p16 mRNA בפיברובלסטים LF1 שעברו טיפול דמה (mock) או טרנספקציה הפוכה (RT) של 3× hTERT, לאחר טיפול בכלורוקווין (CQ), Y-27632, או שילוב של שניהם, כפי שצוין. (B) ניתוח Quantitative RT-PCR של ביטוי p21 mRNA תחת אותם תנאים ניסיוניים. רמות התמלול נורמלו ל-RpL13a והובאו ביחס לתאי בקרה צעירים (PD#12). נקודות נתונים בודדות מייצגות חזרות ביולוגיות. הנתונים מייצגים ממוצעים ± SD מ-n = 2 חזרות ביולוגיות, עם 5 חזרות טכניות לכל חזרה ביולוגית. מובהקות סטטיסטית מצוינת באיור; ns, לא מובהק. *P < 0.05, **P < 0.01, ****P < 0.0001, כפי שנקבע על ידי מבחני Brown–Forsythe ו-Welch's ANOVA. קיצורים: CQ, כלורוקווין; RT, טרנספקציה הפוכה; Y-27632, מעכב של Rho-associated protein kinase (ROCK).אנא לחץ כאן להורדת הקובץ.
קובץ משלים 1: רצפי DNA וחלבון של מבני ביטוי hTERT.אנא לחצו כאן להורדת הקובץ.
קובץ משלים 2: חישוב הכפלות אוכלוסייה (PD). הכפלות אוכלוסייה (PD) חושבו באמצעות הנוסחה PD = log₂ (Nf/N₀), כאשר N₀ הוא מספר התאים שנזרעו, ו-Nf הוא מספר התאים החיוניים שנאספו. PD מצטבר נקבע על ידי סכימת ערכי ה-PD לאורך המעברים.אנא לחצו כאן להורדת קובץ זה.