Deparaffinization ו rehydration של קטעי רקמות: הליך דו-שלבי להסרת שעוות פרפין משקופיות רקמת FFPE ואחריו התייבשות רקמות

רלוונטיות תעשייתית למסמך סיכום

עיבוד רקמות בשיטת FFPE מאפשר ארכוב לטווח ארוך של דגימות קליניות תוך שימור השלמות המולקולרית לצורך אנליזות המשך. דה-פראפיניזציה ורהידרטציה הם שלבי הכנה חיוניים המחזירים את הנגישות לרקמה לצורך הערכת ביומרקרים ומחקרים מכניסטיים. תהליך עבודה זה תומך בתיקוף מטרות ובפיתוח בדיקות בתחום גילוי תרופות לאונקולוגיה, על ידי הבטחת הכנת דגימות הדירה מאוספים מאורכבים.

יישומים אסטרטגיים במו"פ בביופארמה

גילוי מוקדם ותיקוף מטרה

• ערך מדעי: מאפשר חקירה של מטרות טיפוליות במודלים של רקמות אנושיות בעלות רלוונטיות קלינית.
• ערך תפעולי: מספק גישה למאגרי FFPE מאורכבים לצורך ניתוח רטרוספקטיבי של ביטוי מטרות.
• ערך ניבוי: תומך במתאם בין סמנים ביולוגיים לתוצאות קליניות כדי להפחית סיכונים בבחירת המטרה.

סריקה ופיתוח בדיקה

• מוכנות הבדיקה: מייצר נתחי רקמה שהורטבו מחדש, התואמים לתהליכי עבודה של אימונוהיסטוכימיה והיברידיזציה in situ.
• פלט כמותי: שומר על האנטיגניות ועל שלמות החומצות הגרעיניות לקבלת אותות מדידים בשלבים הבאים.
• שחזור: זמני אינקובציה סטנדרטיים בממס מבטיחים הכנה עקבית של הרקמה בין סדרות שונות.

מחקר תרגומי ופרה-קליני

• רלוונטיות למחלה: שימוש בחתכים של FFPE מגידולי מערכת העיכול למידול ביולוגיה של סרטן בבני אדם.
• המשכיות תרגומית: גישור בין ממצאי גילוי לתיקוף של דגימות קליניות.
• הפחתת סיכונים מכניסטיים: אישור נוכחות המטרה ברקמה אנושית לפני השקעה במערכות מידול.

אינטגרציה של תהליכי עבודה וצינורות עיבוד

נוהל זה משתלב ברצף הגילוי על ידי מתן אפשרות לניתוח של רקמות אנושיות מאובסרליות לפני זיהוי המולקולה המובילה (lead) ותיקוף פרה-קליני.

• ביולוגיה של גילוי: מאפשרת בדיקת השערות לגבי הפעלת מסלולים בדגימות גידולים אנושיות ראשוניות.
• סריקה: מכינה רקמות עבור פלטפורמות לסריקת סמנים ביולוגיים הדורשות מורפולוגיה שלמה ושימור אנטיגנים.
• אנליטיקה: מפיקה חתכים המתאימים לדימות כמותי ולקריאות של פתולוגיה דיגיטלית.
• מחקר תרגומי: תומכת ברצף מגילוי מטרה ועד למתאם עם דגימות קליניות.
• שימוש חוזר ארגוני: קובעת פרוטוקול הכנה ניתן לשימוש חוזר עבור מספר נקודות קצה אנליטיות בפרויקטים שונים.

השפעה תפעולית וארגונית

• ערך מדעי: מגביר את הביטחון ברלוונטיות של המטרה באמצעות בדיקה ישירה של רקמות אנושיות.
• ערך תפעולי: מאפשר עיבוד סטנדרטי של בלוקי FFPE עבור היסטולוגיה בתפוקה גבוהה.
• ערך אסטרטגי: מפחית את ההסתמכות על מודלים חלופיים על ידי ניצול דגימות עם אנוטציה קלינית.
• השפעה על הפורטפוליו: מספק בסיס להחלטות go/no-go המבוססות על ביטוי המטרה ברקמות המופקות ממטופלים.

שיקולי יישום

• דורש כוח אדם המוכשר בהיסטולוגיה לטיפול בחתכים רגישים של רקמה.
• תלוי בגישה לפתרונות xylene ו-ethanol עם אוורור נאות ופינוי פסולת תקין.
• מצריך פרוטוקולי תזמון סטנדרטיים למניעת עיבוד יתר או עיבוד חסר.
• חובה להתחשב בשונות בעובי הרקמה בעת אופטימיזציה של משכי האינקובציה.
• מוגבל על ידי דגרדציה של חומצות גרעיניות וחלבונים בבלוקי FFPE ישנים, דבר המצריך הערכת QC.

שאלות נפוצות בביופארמה