$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
הנח שקופית זכוכית עם דגימת רקמה קבועה לתוך מאגר אחזור אנטיגן וחמם אותה.
הטמפרטורה הגבוהה וה-pH האלקליין של המאגר שוברים את קישורי החלבון המושרים על ידי קיבוע, וחושפים אפיטופים של אנטיגן.
יש לקרר את השקופית כדי למנוע נזק לרקמות הנגרם מחום, ולאחר מכן לשטוף כדי להסיר עודפי חיץ.
החל מחסום הידרופובי והנח את המגלשה בתא לחות.
הוסף מאגר חוסם חדירה. חומר הניקוי של המאגר מחלחל לממברנות התאים, וחלבונים חוסמים מסווים אתרי קשירה לא ספציפיים כדי להפחית את כתמי הרקע.
הסר עודף חיץ, הוסף קוקטייל נוגדנים מצומד מתכת ודגירה כדי לאפשר קשירת נוגדנים לאנטיגנים ספציפיים.
שטפו את השקופית, הסירו נוגדנים לא קשורים.
הוסף כתם גרעיני מצומד מתכת שנכנס לתאים ונקשר ל-DNA.
שוטפים את הכתם העודף ומייבשים את השקופית.
באמצעות סורק אופטי, השג תמונות ברזולוציה גבוהה של התכונות המבניות של הרקמה, המסייעות בפירוש נתונים מניתוח הדמיה של ציטומטריית מסה של הדגימה המוכתמת.
התחל עם קטע רקמה מטופל מראש של חמישה מיקרומטר המותקן על שקופית תואמת צביעה חיסונית. מקם את השקופיות בדואר שקופיות.
לאחזור אפיטופים המושרה על ידי חום או HIER, הוסף מאגר HIER בדואר השקופיות עד שהרקמה שקועה לחלוטין. הנח את דואר השקופיות בתא הסוואה, והתחל את תוכנית החימום.
לאחר סיום התוכנית, הנח את דואר השקופיות במגש מלא במים קרים, והניח לו להתקרר. שוטפים את השקופיות במים מזוקקים מספר פעמים על ידי הגדלת הנפח בהדרגה.
הסר את השקופיות מדואר השקופיות ונגב את המאגר העודף. כדי למנוע אובדן חיץ חוסם ונוגדנים, הקיפו את הרקמה באמצעות עט מחסום הידרופובי.
דגרו את המגלשות בתא לחות מותאם אישית למשך שעה. לחסימה לא ספציפית, הוסף מאגר חוסם למגלשות בתא הלחות. לאחר תקופת הדגירה, הסר את מאגר החסימה העודף, ותן למאגר הנותר להתייבש באוויר בטמפרטורת החדר.
הוסיפו בזהירות את תמיסת הנוגדנים על הרקמה ודגרו למשך הלילה בתא לחות בטמפרטורה של ארבע מעלות צלזיוס.
לאחר הדגירה יש לשטוף את השקופית עם PBS המכיל טריטון למשך 5 דקות. לבסוף, שטפו את השקופית פעמיים עם PBS למשך 5 דקות כל אחת. כעת, טפלו ברקמה בצבע האינטרקלטור ודגרו אותה בתא הלחות בטמפרטורת החדר למשך שלושים דקות.
לאחר הדגירה יש לשטוף את המגלשה במים בדרגת HPLC למשך חמש דקות, ולייבש אותה בחומר ייבוש למשך שלושים דקות.
לאחר שהשקף יבש, סרוק באמצעות סורק מסמכים שטוח ברזולוציה של לא פחות מ- 1200 נקודות לאינץ'.