יישומים ללוחות תאורה בקוד פתוח מיקרופלייט

שיטות מסורתיות להעברת ידיים של רייגנטים בתפזורת לתוך צלחות microtiter הם איטיים נוטים לטעות אנוש. טכנולוגיה זו יותר מהכפילה את יעילות התהליך ומסייעת לחסל שגיאה זו. טכניקה זו יכולה לסייע למשתמשים להבין פעולות המבוצעות במיקרו-פלטות, לצמצם את ההזדמנות לשגיאות ולהגדיל את יעילות המשתמש במהלך פעולות pipetting ידניות.

טכניקה זו תשפיע באופן חיובי על התוצאות במסגרות פרה-קליניות וקליניות על ידי הסרה והפחתה של טעויות שיכולות להיות יקרות ואפילו מסכנות חיים אם לא יתוקנו. מערכת קוד פתוח זו יכולה להיות מותאמת בקלות עבור יישומים אחרים, כגון בדיקות העתקת מיקרופלסטיק, כדי למנוע חוסר עקביות במיקום מורכב או bioassay, עבור כימיה וצרכים ביולוגיים. הפגנת הליך העברת הדגימה תהיה לינה דלוקה, מנהלת מתחם ממעבדת זיהוי העופרת.

כדי להגדיר העברה לדוגמה אוטומטית למחצה של לוח-לצלחת, השתמש ביישום עריכת גיליון אלקטרוני כדי ליצור קובץ CSV המכיל לוחות מקור ויעד, תיוג ברקוד המקור של העמודות, ברקוד היעד, באר המקור, באר היעד והעברת אמצעי האחסון. תחת העמודות, כלול שורה אחת בקובץ עבור כל פעולת pipetting רצויה המציינת את הברקוד האלפא-מספרי של mircoplate המקור, אם יש כזה, את הברקוד האלפא-מספרי של המיקרו-פלאט המשמש כיעד, אם יש כזה, את השורה האלפא-נומרית ואת מזהה העמודה של הבאר שיש לצנרת ממנה בטבלת המקור, את השורה האלפא-נומרית ואת מזהה העמודה עבור הבאר שיש לצנרת מצלחת היעד ואמצעי האחסון שיש להעביר מ בבאר המקור בעמודת ברקוד המקור, ליעד גם בברקוד היעד. פתח את תוכנית מדריך אור כדי לפתוח את מיקרופלסטיק מסייע צינורות פולט אור צלחת לצלחת יישום ממשק משתמש גרפי ולחץ על בחר קובץ דובדבן.

בחלון דפדפן הקבצים, פתח את קובץ ה- CSV. היישום יהיה לנתח את השורה הראשונה של קובץ CSV ולהאיר את הבארים המתאימים במקור לוחות היעד. השתמש בלחצנים הבא וה הבא כדי לחצות את קובץ ה- CSV כרצונך.

ממשק המשתמש הגרפי יסמן באפור את כל השורות שהודראו בעבר ויסמן, בחום, את השורות הפעילות כעת. בצע את פעולות הצינור לפי הצורך כדי להעביר דגימות בין באר המקור של צלחת המקור, ל הבאר היעד של צלחת היעד. בנוסף לממשק המשתמש, ניתן לאמת את ברקודי הלוח באמצעות צגי ה- LCD המחוברים ללוחות התאורה.

לאחר מכן לחץ על הבא היטב" כדי להמשיך עד לסוף קובץ ה- CSV. כדי לטעון קובץ CSV חדש, לחץ על בחר קובץ דו-פיפיק"בכל עת. כדי לצאת מהתוכנית, לחץ על X האדום בפינה השמאלית העליונה של הממשק.

עבור תאורות מרובות בארות, פתח את יישום ההטנה הטורית של פולטי האור המסייעים במיקרופלאטים וציין את מצב ההטרדה הרצוי, צפיפות הלוחות והתחל שורות או עמודות. השתמש בלחצנים הבא" ו"הקודם" כדי לנווט בין השורות או העמודות ברצף משורת ההתחלה או העמודה ההתחלתית, לשורה או לעמודה האחרונה בטבלה. בכל פעם שלחצים על הכפתור הבא או הקודם, לוח האור יאיר את ה-LED המתאים מעל המיקרו-לוח.

המשך עד לסיום רצף ההקצבות לפני היציאה מהתוכנית. כדי לדמות חזותית בדיקה, הנח מיקרופלסטיק במדריך האור הנייד. מדריך האורות מכיל סוללה ואת כל האלקטרוניקה הדרושה לשימוש ללא תלות במחשב כדי לאפשר שימוש במדריך במצב כף יד שניתן לשלוט בו באמצעות לחצני דחיפה מובנים כדי לעבור בין מצבי הדגמה.

השתמש במתג דו-מצבי צריכת החשמל במארז מדריך האור הנייד כדי להפעיל את המערכת ולבחור את מצב מדריך האור הנייד המתאים לניסוי. במצב הדגמת סינון בתפוקה גבוהה, השתמש במתג הלחצן הימני בחלק העליון של מדריך התאורה הנייד כדי לעבור בין תבניות התאורה לדוגמה. בארות מוארות בצבע אדום מדמות את לוותר reagent של חקירה, למשל, תאים תלויים במדיה.

בארות מואר עם צבע צהוב לדמות זיהוי reagent תוספת. לאחר מכן, מקור אור גירוי מדומה עם כל הבארים הופכים כחולים, ואחריו סימולציה של אור נפלט. העמודה הראשונה והאחרונה של בארות מוארת בירוק, ועמודי השדה לדוגמה האמצעית מוארים בכחול כדי לציין את הצלחת שנקראת על קורא מיקרופלסטיק.

בארות אקראיות בשדה המדגם יהיה גם צבע ירוק בעוצמה משתנה כדי לייצג להיטים. כדי להחליף את קו יישור האור בין מצב ההדגמה של סינון תפוקה גבוהה למצב הדגמת titration, לחץ על מתג הלחצן השמאלי. כאשר מדריך האור נכנס למצב הדגמת טיטריות, כל בארות בעמודות שלוש ו -13 יהיה מואר עם הצבע הצהוב.

לחיצה על מתג הלחיצה הימני ביותר תאיר את העמודות הבאות ברצף. כאשר לוחצים על לחצן העכבר לאחר שהטורים 12 ו- 22 מגיעים, הבארות בעמודות 4 עד 12 ו- 13 עד 22 יהיו מוארות בעוצמה הולכת ופוחתת של צהוב כדי לייצג את התיחום. לתאורת חפץ, הנח את המיקרופלאט במדריך האור הנייד ולחץ פעמיים על מתג הלחיצה השמאלי ביותר כדי להעביר את מדריך האור למצב תאורה.

השתמש בלחצן הימני כדי לעבור בין קבוצה של צבעים מוגדרים מראש לפי הצורך עבור היישום. לוח האור יפעיל את כל ה-LEDs באדום, כחול, ירוק, כתום, לבן, סגול, צהוב ואינדיגו ברצף עם כל לחיצה על הכפתור הימני. באופן אופציונלי, ניתן להשתמש במצלמה או בטלפון חכם כדי לצלם את הלוח המואר לצורך תיעוד או תיעוד של העבודה.

העברת דגימות בין צלחות והכנת דילול סדרתי ניתן לבצע ללא חשש של הסחת דעת או לאבד את המסלול של מה פעולות pipetting להישאר. פלטפורמת MAPLE יכולה לשמש כדי לעזור להאיר את המיקרופלט כדי לזהות ממצאים פוטנציאליים, כגון משקעים, בארות ריקות, בארות מלאות חלקית או בועות אוויר. לאחר מכן משתמשים יכולים לנקוט צעדים כדי ameliorate דגימות לפני מתן אותם לתהליכי מעבדה במורד הזרם.

בניסוי מייצג זה, רשימת העבודה כללה 49 פעולות pipetting משני מיקרופלסטיק מקור 384 באר המכיל מבחר אקראי של צבעים צבעוניים לאיית Jove ב microplate יעד יחיד 384-well. פריסת הבארות בצלחת היעד מאשרת שהמשתמש נכנס לתוך הבאר הנכונה. תבנית הצבע של הבארים בצלחת היעד ניתן להשתמש כדי לזהות שגיאות שעבורן המשתמש לא צינור מן הבאר הנכונה של לוחות המקור.

תוצאות מבדיקה זו ראש בראש מראות חיסכון ממוצע בזמן של 50%כאשר משתמשים ביצעו בדיקה זו באמצעות MAPLE לעומת רשימת עבודה מודפסת לא מקוונת. יתר על כן, שיעור השגיאה של הלוחות שנוצרו באמצעות MAPLE היה 0%עבור כל המשתמשים, בעוד שיעור שגיאה של 6%נצפתה עבור משתמש טירון אחד באמצעות רשימת עבודה עבור משימת ההכנה לדוגמה. ניסוחים סינרגיה סמים דורשים הכנת מטריצה 2D מבוסס על דילול סדרתי לפי עמודה עבור התרופה הראשונה דילול סדרתי בשורה עבור התרופה השנייה.

אנו חוקרים את השימוש בלוחות תאורת LED להארת חלוקת מיקרודרופת. על ידי strobing אור LED, אנחנו יכולים ללכוד תמונות של דגימות נוזליות לבקרת איכות וניתוח. מכשיר זה יכול להפחית את החשיפה של המשתמש לחומרים מסוכנים וסוכנים על ידי הגבלת זמן האינטראקציה שלהם והקלה על שימוש מתאים בריג'נט.