יישום של מערכת לגילוי סיכונים בזמן אמת והתראות על בסיס רשומות בריאות אלקטרוניות באמצעות CogStack

ההשפעה של מניעת פסיכוזה מוגבלת על ידי כמה יעיל אנחנו יכולים לזהות אנשים בסיכון. פרוטוקול זה מציג גישה חדשה ליישום שירות זיהוי סיכונים פסיכוזה והתרעה במערכת שיא בריאות אלקטרונית בעולם האמיתי. היתרון העיקרי של מחשבון סיכונים אינדיבידואלי מבוסס קלינית זה הוא שהוא מאפשר זיהוי אוטומטי של אנשים בסיכון לפסיכוזה בקנה מידה גדול באמצעות רשומות בריאות אלקטרוניות על פני מצבים נפשיים שונים ובזמן אמת.

השיטות הנוכחיות לגילוי אנשים בסיכון לפסיכוזה אינן יעילות יחסית ורק 5-12% ממקרי הפסיכוזה של הפרק הראשון זוהו. מערכת זו מאפשרת זיהוי משופר של אנשים בסיכון, כמו גם תקשורת משופרת לרופאים. הפלטפורמה שפותחה יכולה להיות מותאמת אישית עבור מידול וזיהוי חיזוי סיכונים אחרים בפסיכיאטריה וזה יכול לתמוך ביישום של רפואה מדויקת בטיפול קליני עם תועלת של חולים.

אנו רוצים להפיץ שיטה חדשה זו לקהילה הרחבה יותר ולעסוק עם חוקרים, קלינאים, מטופלים, מטופלים ובעלי עניין אחרים כדי לקדם את הטמעת הרפואה המדויקת בפסיכיאטריה. אנו מקווים שהסרטון הזה יקל על ההישג של מטרה זו. למרות שהקובץ ה- Script, ששימש לפריסת מערכת זו ואת השיטה, מתוארים בפירוט במחקר.

צוות המחקר שלנו ישמח לסייע לחוקרים עתידיים שירצו ליישם גישה דומה על ההגדרות הקליניות שלהם. התחל על-ידי הורדה או שיבוט של מאגר הקוד מ- GitHub. כדי לקבוע את התצורה של צינור CogStack עבור בליעת נתונים, פתח את cogstack_deploy/קוגסטאק/ספריה ושנה פסיכוזה.

מאפיינים ושינוי הגדרות מקטע המקור:dbconfiguration בהתבסס על הגדרת מסד הנתונים של רשומת תקינות אלקטרונית, כולל ציון כתובת ה- IP של שרת מסד הנתונים, שם מסד הנתונים, שם המשתמש והסיסמה של מסד הנתונים. פתח דפדפן אינטרנט וגש לממשק המשתמש של Kibana. בפעם הראשונה בגישה לקיבנה, לחץ על הכרטיסיה תבניות ניהול ואינדקס כדי לציין אינדקס חיפוש אלסטי של עניין והזן psychosis_base השדה תבנית אינדקס.

לחץ על השלב הבא ובחר ETL_updated_dttm עבור שם שדה מסנן הזמן. לאחר מכן לחץ על צור תבנית אינדקס כדי להוסיף psychosis_base תבנית האינדקס עבור Kibana. לאחר ש- Kibana מחובר לאינדקס החיפוש האלסטי, חפש ועיין נתוני המקור באופן אינטראקטיבי דרך דף הגילוי.

כדי לגשת למחשבון הסיכון, פתח חלון מסוף חדש ופתח את ספריית הפסיכוזה. הזן את הפקודה המתאימה למסוף כדי להתקין את כל חבילות הפייתון הדרושות המשמשות במחשבון הסיכון ולהפעיל את מחשבון הסיכון לפסיכוזה. אם התהליך הושלם בהצלחה, יומנים של חישוב הסיכון יודפסו במסוף ותוצאות הסיכון יאוחסנו באינדקס חיפוש אלסטי חדש בשם psychosis_risk בפלטפורמת CogStack.

כדי לבדוק את תוצאות הסיכון בממשק Kibana, הוסף תבנית אינדקס psychosis_risk כדי לחבר את Kibana לאינדקס psychosis_risk ולחקור את תוצאות הסיכון דרך דף הגילוי. כדי לבנות פריטים חזותיים ו לוחות מחוונים כדי לקבל מבט כולל על מאפיינים עבור כלל האוכלוסייה של חולים בסיכון, לחץ על הצג פריטים חזותיים ולחץ על צור פריט חזותי חדש. בחר את סוג הפריט החזותי ובחר psychosis_risk את האינדקס לפריטים חזותיים.

לאחר יצירת פריטים חזותיים בודדים, לחץ על לוח מחוונים כדי ליצור לוח מחוונים המציג יחד ערכה של פריטים חזותיים קשורים. כדי ליצור התראה לרופאים כאשר חולים נמצאים בסיכון לפסיכוזה, לחץ על ניהול וצופה. כדי להגדיר צופה חדש, לחץ על צור שעון מתקדם והזן את המזהה והשם.

כדי לשלוח הודעת דוא"ל מתריעה לכתובת של קלינאי, מחק את תוכן סעיף הצפייה JSON והעתק את התוכן בשעון. json קובץ עם ספריית הפסיכוזה למדור JSON לצפות. לפני שמירת השעון, לחץ על הדמיה כדי לבדוק את ביצוע הצפייה.

אם השעון מוגדר בהצלחה, פלט הסימולציה יופיע. בנתון מייצג זה, ניתן לראות את מספר הרשומות שנבלעו ב- CogStack לאורך זמן בסדר כרונולוגי בהתבסס על תאריך העדכון האחרון של רשומה. לאחר השוואת המספרים והתוכן של הרשומות במסד הנתונים באינדקס החיפוש האלסטי, לא זוהו נתונים חסרים ולא ברורים המאשרים את המהימנות של צינור CogStack ואת בליעת הנתונים בסינכרון.

כפי שממחישים נתונים אלה, ניתן לדמיין את המאפיינים של חולים בסיכון לפסיכוזה, כולל מוצא אתני של מטופלים, מגדרים, גילאים וקטגוריות של אבחנות. כאן, ניתן לראות את הממשק להגדרת שירות התראת סיכונים באמצעות רכיב השעון בקיבנה כפי שהוכח. לאחר ששירות זה הוגדר בהצלחה, המשתמשים יקבלו הודעת דוא"ל אם יש מטופל אחד או יותר שהסיכון שלהם לפסיכוזה בשנתיים גבוה מ-5%, חשוב לבצע אימות צולב כדי להבטיח שמידע נכון יחולץ ממערכת רשומות הבריאות האלקטרונית המקומית.

אנו יכולים לשלב גרסה מעודנת של מחשבון סיכון זה ופרוטוקול זה כדי לשפר עוד יותר את חיזוי התוצאות. אנחנו יכולים גם לשלב גרסה דינמית של מחשבון סיכון זה אשר יאפשר עדכון בזמן אמת של התוצאות כמו הסימפטומים החולה לשנות, ולכן נותן תחזיות אמינות יותר המשקפות טוב יותר את המסלול הקליני של המטופל. ניתן לשנות את הפרוטוקול הזה כך שיאפשר ניטור והתראות מסירה למודלים אחרים של חיזוי סיכונים המאפשרים לרופאים לקבל החלטות בזמן כדי לשפר את הטיפול, הבטיחות והניסיון של המטופלים.