2014年11月28日
ヒト、マウス、またはラットのグランザイムB(GzmB)のタンパク質分解活性を特異的に測定する、単純で定量的な比色分析法について説明します。このプロトコールは、適切な認識配列を持つ他の合成ペプチド基質の加水分解により、他の顆粒セリンプロテアーゼのプロテアーゼ活性を測定するために容易に適合させることができます。
次の実験の全体的な目標は、ineプロテアーゼグランザイムB.Thisのタンパク質分解活性を測定することです.これは、最初に目的の細胞の溶解物を調製し、次にサンプルに基質を迅速に添加することによって達成されます。次に、グランザイムB活性を比色反応によって測定します。最終的に、グランザイムBによるalla alla as sベンゾの高度に特異的な切断は、α spart酸残基に対するその特異性に基づいて評価することができます。
PCRやウェスタンブロットを用いたグランドゾーンBの発現検出など、既存の方法と比較したこの手法の主な利点は、ベンジルの加水分解がグランドゾーンBに特異的であり、プロテアーゼが活性であることを示していることです。細胞を調製するために、ライセートはまず、野生型C57ブラックシックス由来の脾臓の単一細胞懸濁液から初代NK細胞を単離するか、または細胞が活性化された後に製造元の指示に従って市販のキットを使用してネガティブセレクションによりグランザイムB遺伝子ヌルマウスを制御します。培養物をPBSで最高速度で2〜3秒間3回洗浄した後、最低500万個のNK細胞を含むペレットを100マイクロリットルのNont P 40溶解バッファーに氷上に20分間再懸濁します。
次に、マイクロ遠心分離機でライセートを15, 000Gで10分間スピンダウンし、仰臥位剤を新しいチューブに移します。タンパク質濃度を決定した後、適切な市販のプロトコルに従って、セイトを最低でも約2ミリグラム/ミリグラムの濃度で、マイナス20°Cで保存し、グランドザイムB活性アッセイを行う。次に、調製したばかりのヒープバッファー中のサンプルあたり最低100マイクログラムのタンパク質溶解物を最終容量160マイクロリットルに希釈します。
次に、マルチチャンネルピペットを使用して、ウェルあたり50マイクロリットルのサンプルを96ウェルのビニールUボトムプレートに三重にロードします。3つのバッファーのみのコントロールウェルを含めるように注意しながら、それぞれに100マイクロリットルの希釈DTNBを追加します。その後、50マイクロリットルの新たに希釈したアララは、ベンゾイル基質をヒープバッファー単独のウェルのそれぞれに追加し、その後、任意のネガティブコントロールが続き、予想されるポジティブサンプルで終了します。
マイクロプレートリーダーでアララをベンジルとして加水分解することにより、15秒ごとに25回の読み取りを行う速度論的アッセイプロトコルを使用して、405ナノメートルの光学密度でaase活性を測定します。最後に、プレートリーダーソフトウェアを使用して、各ウェルの基質切断の最大速度を計算し、グランザイム遺伝子ノックアウトマウスを使用して生データを適切な統計解析ソフトウェアに転送します。合成ペプチド基質アララは、ベンジルとして、グランザイムBによって特異的に加水分解されることが発見されました.さらに、合成基質の強固な切断は、野生型初代NK細胞の細胞溶解物では測定できますが、対照としてグランザイムBノックアウト動物のNK細胞では測定できません。
この実験では、トリプシン様基質特異性を持ち、両タイプの細胞由来の溶解物に存在するグランザイムAのタンパク質分解活性は、BLTベンジルの加水分解によって測定されたものと同等であり、I-E-P-D-P-N-Aは、種間でグランザイムB活性を試験するために一般的に使用されています。この代表的な実験では、テトラペプチド配列の解析により、マウスではなくヒトのグランザイムBがIEPD配列後に効率的に切断できることが明らかになりました。これは、ヒトとマウスの両方のビッドの認識配列と一致します。対照的に、ヒトNK白血病細胞ライセートの量を30マイクログラムから10マイクログラムに減らしても、I-E-P-D-P-N-A基質を加水分解するのに十分なグラム酵素Bが得られます。
このビデオを見れば、ヒトおよびマウスの赤酵素Bのin vitro分析に適した基質と実験コントロールの選び方について十分に理解できるはずです。
完全なトランスクリプトを表示し、数千本の科学動画にアクセス
本記事では、ヒト、マウス、またはラットのサンプルにおけるグランザイムB (GzmB) の蛋白分解活性を測定するための定量的な比色アッセイについて解説します。この手法は、異なる合成ペプチド基質を用いることで、他の顆粒セリンプロテアーゼにも適応させることが可能です。
グランザイムBのプロテアーゼ活性を正確に測定することは、免疫療法の開発において細胞傷害性リンパ球の機能を検証するために不可欠です。この比色アッセイは、プロテアーゼ活性を直接的かつ特異的に読み取ることができ、前臨床モデルにおけるターゲットへの結合(target engagement)およびプロアポトーシス能のメカニズム的なリスク低減を可能にします。また、種間互換性を備えているため、げっ歯類を用いた研究からヒトへの応用まで、トランスレーショナルな連続性をサポートします。
このアッセイは、ターゲットバリデーションからリード最適化に至る創薬の連続的なプロセスに適合しており、プロテアーゼの機能的な活性が生物学的有効性および作用機序の根拠となります。