이 프로토콜은 인간 대장 오가노이드를 확립하고, 카드뮴 유발 독성을 감지하기 위한 루시페라제 기반 ATP 생물발광 분석법을 평가하는 것을 목표로 합니다. 이 검사는 오가노이드 생존성의 용량 및 시간 의존적 변화를 정량화하여 검사의 실현 가능성과 민감도를 평가합니다.
방법 논문
* These authors contributed equally
이 프로토콜은 인간 대장 오가노이드를 확립하고, 카드뮴 유발 독성을 감지하기 위한 루시페라제 기반 ATP 생물발광 분석법을 평가하는 것을 목표로 합니다. 이 검사는 오가노이드 생존성의 용량 및 시간 의존적 변화를 정량화하여 검사의 실현 가능성과 민감도를 평가합니다.
카드뮴(Cd)은 1그룹 발암물질로 분류되며 심각한 전 지구적 환경 문제를 이루고 있습니다. 본 연구는 인간 대장항장 오가노이드 모델을 구축하고, 루시페라제 기반 ATP 생물발광 분석법이 대장 오가노이드(CO)의 Cd 노출에 대한 독성 반응을 감지하는 타당성과 민감도를 평가하는 것을 목표로 했습니다. 줄기세포는 인간 대장 조직에서 분리되어 3차원 저저막 기질 내에서 배양하여 CO를 생성했습니다. 오르가노이드는 다양한 노출 시간에 따라 단계별 Cd 농도로 처리되었습니다. 발광성 시약을 같은 부피 비율로 첨가하고, 상온에서 부드럽게 흔들어 용해와 시약 침투를 촉진한 후, 생물발광 반응이 진행되도록 배양했다. 루미네센스는 다중 모드 마이크로플레이트 리더기에 발광 모드로 기록되었습니다. 용량-반응 곡선 적합을 사용하여 최대 억제 농도의 절반 크기 계산과 생존 가능성 또는 상대적 생존력 변화를 평가하였습니다. 1차 줄기세포는 인간 대장 조직에서 성공적으로 분리되어 CO를 생성하는 데 사용되었습니다. Cd 노출은 용량 의존적 및 시간 의존적 오가노이드 대사 활동 감소를 일으켰습니다; 선량-반응 분석을 통해 오가노이드의 생존 곡선과 IC50 값을 산출하였습니다. 이 연구는 환경 중금속 독성학 연구에서 인간 CO를 활용하는 방법론적 지침과 실질적 통찰을 제공합니다.
CD는 자연적으로 존재하는 중금속으로, 1그룹 발암물질로 분류되며 전 세계적인 환경 문제로 자리 잡았습니다. 인간의 CD 노출은 주로 흡입과 식이 섭취를 통해 이루어집니다. 만성 저용량 노출은 다양한 건강 부작용과 연관되어 있지만, 사용과 환경 방출을 크게 줄이는 것은 여전히 어려운 과제입니다 2,3. 전통적인 2차원 배양은 평평한 기질 위에서 자라며 조직 구조, 세포 극성, 종양 미세환경이 부족합니다. 따라서 이들은 체내에서 이질성과 카드뮴 노출에 대한 진정한 독성학적 반응을 재현하는 능력이 제한적입니다. 이러한 시스템은 세포 간 상호작용, 기질 의존적 성장, 또는 약물 내성 발달의 생물학적 과정을 충분히 모델링할 수 없습니다. 환자 조직에서 유래한 3차원 오가노이드 시스템은 기존의 2차원 세포주에 비해 생리학적으로 더 중요한 플랫폼을 제공합니다. 오가노이드는 1차 조직의 유전체 특징, 조직학적 조직, 기능 상태를 유지합니다. 이로 인해 종양 성장, 진화, 카드뮴 독성에 대한 민감도를 보다 정확하게 모델링할 수 있게 되어 질병 모델링 및 독성학 연구에 명확한 이점을 제공합니다7. CO는 복잡한 3차원 구조, 세포 이질성, 그리고 자기 갱신과 자기 조직화를 위한 내재적 능력을 가지고 있습니다 8,9. CO를 수혜자 쥐에 이식하면 장 내 줄기세포 자기갱신을 촉진하고 숙주 면역 미세환경을 조절하여 보호 효과를 낼 수 있습니다. 2009년 Sato 등은 단일 성체 Lgr5⁺ 장 줄기세포가 자발적으로 자기조직화하고 분화하여 모든 장 세포 계통을 아우르는 crypt-villus 구조를 형성할 수 있음을 처음으로 입증했다10.
장 상피는 섭취 후 CD 독성에 대한 첫 번째 방어선을 형성합니다. 실제로 Cd의 경구 생체이용률은 일반적으로 5% 미만입니다. CD 유발 장 독성은 세포 간 접합부의 붕괴, 세포 간 투과성 증가, 염증 반응 유도로 특징지어집니다. 더 나아가, Cd는 장 내 면역 기능을 교란시키고 장내 미생물군의 구성과 항상성을 변화시킵니다. 노출 용량과 지속 기간에 따라 Cd는 세포 주기 조절 이상을 일으켜 일부 상황에서는 암성 표현형을 촉진하고 다른 경우에는 세포자멸사를 유도할 수 있습니다. CD는 간접적으로 ROS(활성산소종) 생성을 자극하여 산화 스트레스와 산화환원 불균형을 유발할 수 있습니다. 수용체, 키나아제, 인산분해효소, 프로테아제, 접착 분자, 전사 인자의 기능은 산화환원 신호를 통해 조절될 수 있습니다. Cd는 또한 신호 전달 연쇄 반응을 교란하여 ERK1/2, JNK(c-Jun N-말단 키나아제), p38 MAPK(p38 미토겐 활성화 단백질 키나아제)의 활성화 상태를 여러 세포 유형에 걸쳐 변화시킵니다12. MAPK 계단에서 ERK1/2를 활성화함으로써 Cd는 세포 증식과 생존을 촉진하고, 프로그램된 세포 사멸을 억제하며, 비정상적인 과증식에 기여할 수 있습니다13. CD는 주요 효과 단백질의 발현과 활성을 직접적이든 간접적으로 조절할 수 있습니다. 예를 들어, 종양 억제 단백질인 p53을 하향 조절하고 Bcl-2, Bcl-xL과 같은 항세포자멸성 단백질을 상향 조절하여 궁극적으로 세포자멸사와 세포주기 항상성을 방해합니다.
Cd의 세포독성 효과를 평가하는 데 사용되는 CO 모델에서는 ATP 함량 측정이 오가노이드 생존 가능성을 평가하는 데 널리 사용됩니다. 에너지 대사의 중심 분자인 ATP는 오가노이드의 전반적인 대사 상태와 생존 가능성을 직접 반영합니다. CO에 카드뮴이 노출되면 Cd는 주로 미토콘드리아 기능 장애를 유발하고, 산화 스트레스를 악화시키며, 오가노이드 에너지 항상성을 방해합니다. 이러한 사건들은 ATP 생산을 저해하고 궁극적으로 오가노이드 생존력을 저하시킵니다. 따라서 ATP 수치 변화는 카드뮴 유발 세포독성에 대한 강력한 기능적 판독 신호가 됩니다. 기존의 세포독성 분석법에는 비도 MTT/CCK-8 분석, 생사염색, 유세포분석 기반 분석이 포함됩니다. 이러한 방법들과 비교할 때, ATP 기반 분석법은 3차원 오가노이드 시스템에서 뚜렷한 이점을 제공합니다. 오가노이드의 구조적 복잡성과 뚜렷한 공간적 이질성 때문에, 전통적인 염색 및 영상 방법은 조직 침투 부족과 정량적 정확도 저하로 인해 종종 제한됩니다. 반면, ATP 분석은 루시퍼레이스 매개 생물발광 반응에 의존하여 오가노이드 구조를 파괴하지 않고 직접 정량화할 수 있습니다. ATP 측정은 높은 감도와 넓은 동적 범위를 보입니다. 이를 통해 초기 대사 억제부터 오가노이드 사살에 이르기까지 연속적인 생물학적 반응을 감지할 수 있어, 다양한 카드뮴 농도에서 정확한 용량-반응 분석을 가능하게 합니다. ATP 수치는 오가노이드의 전반적인 기능 상태를 포괄적으로 반영하며, 형태학적 평가나 단일 분자 표지자에 의존하는 접근법보다 우수한 성능을 보입니다. 따라서 이 분석법은 고처리량 독성 스크리닝에 특히 적합하여 안정성과 재현성을 향상시킵니다.
ATP 생물발광을 이용해 CO의 Cd 노출 민감도를 평가하는 핵심 원리는 반딧불이 루시페라제가 ATP, Mg2⁺, O₂가 존재하는 상태에서 D-루시페린을 산화시켜 옥시루시페린을 생성하고 광자를 방출한다는 점입니다. 방출되는 빛의 세기는 정의된 선형 범위 내에서 샘플 내 측정 가능한 ATP 함량에 비례합니다. 따라서 발광은 세포 대사 활동이나 생존 가능성에 대한 간접적인 정량적 대체물 역할을 합니다. 오가노이드는 세포외 기질 내에 내재되어 있으며 다층 3차원 구조를 가지고 있습니다. 이를 수용하기 위해 ATP 분석제 시약은 최적화된 용해 완충 조성과 절차를 특징으로 합니다. 이러한 최적화는 내부 오가노이드 세포의 교란을 개선하고, ATP 방출을 촉진하며, 생물발광 신호를 안정화합니다. 중요한 점은 ATP 생물발광이 정확한 세포 수가 아니라 대사 활동을 보고한다는 것입니다. 예를 들어, 미토콘드리아 억제제는 세포가 생존하는 동안에도 짧은 기간 동안 세포 내 ATP 수치를 현저히 감소시킬 수 있습니다. 반대로, 일부 초기 세포 사살 형태는 일시적으로 비교적 높은 ATP 수치를 보존할 수 있습니다.
카드뮴(Cd) 독성 평가에서 생리학적 관련성이 우수함을 입증함에도 불구하고, 대장직장 오가노이드 모델은 몇 가지 실질적 한계를 제시합니다. 전통적인 2차원(2D) 세포주와 비교할 때, 오르가노이드 배양은 더 많은 시간과 비용이 많이 듭니다. 더불어, 동물 유래 행렬에 의존하기 때문에 배치별 변동성이 발생하여 대규모 고처리량 독성 스크리닝에서의 활용도를 제한합니다. 이 모델들은 중금속이 장 상피에 미치는 직접적인 독성학적 영향을 평가하는 데 매우 적합하지만, 전신 독성이나 복잡한 독성 작용을 평가하는 생체 내 모델을 완전히 대체할 수는 없습니다.
이 연구에서는 인간 대장 조직을 원료로 사용하여 대장암 줄기세포를 분리하고 시험관 내에서 CO를 확립하였습니다. 오가노이드는 다양한 농도와 다양한 노출 시간 동안 Cd에 노출되었습니다. 그 후 발광 감지 모드의 다중 모드 마이크로플레이트 리더기를 사용해 발광을 측정했습니다. 특정 마이크로플레이트 리더의 운영 소프트웨어를 사용하여 세포 생존성 또는 IC50 값을 계산하고 시각화하였습니다.
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이 실험은 쑤저우 직업보건대학 윤리위원회(승인 번호)의 승인을 받았습니다. SWYXLL202516) 그리고 의료 윤리 기준에 따라 진행되었습니다. 본 연구의 모든 대상자는 서면 동의서를 제공하였습니다.
1. 인간 대장 조직 분리 및 COs 형성
2. Cd에 노출된 CO의 민감도 분석법
3. 발광 생존 시약 첨가
4. 발광 생존 시약 측정
5. 데이터 처리 및 분석
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인간 CO의 설립
우리는 조직 샘플에서 대장 납골당 구조를 성공적으로 분리했으며, 저배율 및 고배율 현미경 모두에서 전형적인 납골 지하 형태를 명확히 관찰하였습니다. 시험관 내 배양 과정에서 분리된 납골당은 점차 확장되어 질서 있는 형태학적 성숙 과정을 보였다(그림 1A,B). 배양 3일차와 6일차에는 구조적으로 온전한 대장항문 유기체가 형성되었으며, 주로 구형 또는 초기 출아 형태의 구조를 보였다(그림 1C,D).
CO의 CD 노출에 대한 민감성
CO는 96 웰 플레이트에 시딩되어 추가로 5일간 배양한 후, 0, 5, 10, 20, 40 μM 농도의 카드뮴 처리가 이루어졌습니다. 7...
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본 연구는 CO를 이용한 카드뮴 노출 및 ATP 생존성 분석에 대한 표준화된 프로토콜을 수립하여 카드뮴이 오가노이드 생존력에 미치는 영향을 평가합니다. 이 프로토콜은 오가노이드 해리 및 96웰 플레이트 단계를 최적화하여 실험적 재현성과 이후 ATP 분석의 안정성을 향상시킵니다. 현재 실험 프로토콜은 주로 Cd 독성 평가를 위한 3D 대장암 오가노이드 모델 구축에 초점을 맞추고 있지만, 광범위한 연구를 통해 전통적인 2D 세포 배양과 3D 오르가노이드 모델이 약물 반응, 세포 간 상호작용, 조직 구조, 독성학 프로필 면에서 크게 다르다는 것이 입증되었습니다. 2차원 단일층과 비교할 때, 오르가노이드는 종양의 공간 구조, 세포 이질성, 생체 내 미세환경을 더 충실히 재현하여 생리학적 관련성이 뛰어납니다. 복잡한 세포-세포 및 세포-세포외기질(ECM) 상호작용이 없기 때문에, 2D 배양이 중금속 노출에 반응할 때 실제 생체 내 독성학적 과정을 정확히 포착하지...
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저자들은 이해 충돌이 없음을 선언한다.
모든 저자들은 작업에 충분히 기여했으며, 모든 측면에 대해 책임을 질 것에 동의했습니다. 장쑤 고등교육기관 과학기술 혁신연구팀(2021), 장쑤 직업대학 공학기술연구센터 프로그램(2023), 장쑤성 만성질환 예방 및 통제 핵심기술 개발 및 전환 공학연구센터(2024), 장쑤성 종양학 분자 표적 치료 및 동반 진단 공학연구센터 프로젝트(SGK2202506), 쑤저우 시민 생계 기술 프로젝트 프로그램(보조금 번호 SYWD2024099), 중국 장쑤 고등교육기관 자연과학 핵심재단(보조금 번호 24KJA310008), 쑤저우 직업보건대학 프로그램(보조금 번호 szwzy202406, 보조금 번호 szwzy202304, 보조금 번호 szwzy202320, 보조금 번호 szwzy202308)에 대해 연구합니다. 중국 장쑤성 청란 프로젝트 (2025). 쑤저우 응용기초연구(의학 및 보건) 과학기술 혁신 프로젝트 / 쑤저우 응용기초연구(의학 및 보건) 청년 프로젝트(SYW2024185)
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| 100 μm cell strainer | BIOLOGIX | 15-1100 | |
| 15 mL 원심분리기 튜브 | BIOFIL | CFT011150 | |
| 1mL 피펫 팁 | Zhejiang Baidi Biotechnology Co., LTD | H808633 | |
| 200 μL 피펫 팁 | Zhejiang Baidi Biotechnology Co., LTD | H808214 | |
| 24웰 플레이트 | Corning Incorporated | 3524 | |
| 50 mL 원심분리기 튜브 | CLUXCELL | 321050 | |
| 96웰 플레이트 | Corning Incorporated | 220400 | |
| BioTek Cytation 5 | BioTek Co., LTD | 16280004 | 특정 마이크로플레이트 리더용 운영 소프트웨어. |
| Cadmium chloride,10g | Sigma | 202908-10G | |
| Cell Counting-Lite 3D Luminescent Cell Viability Assay | Vazyme | DD1102-01/02/03 | 1:1 부피 비율의 발광 생존성 시약. |
| Human Colonic organoid Kit Plus(Expansion) | Mogenel Biotechnology | MA-0817HOO1HLP | |
| Dulbecco’s Modified Eagle Medium | thermo fisher | 6125552 | |
| 포스핀 | Beyotime | FS019 | |
| 아이스 박스 | Beyotime | FBX078 | |
| 저온 고속 원심분리기 | Anhui Zhongke Zhongjia Scientific Instrument Co., LTD | KDC-40 | |
| Matrigel | Mogenel Biotechnology | 82755 | 베이스먼트 멤브레인 매트릭스 |
| 오가노이드 분리 용액 | Mogenel Biotechnology | MB-0818L01L | 오가노이드 분리 용액 |
| 페니실린-스트렙토마이신 | Beyotime | C0222 | |
| 인산염 완충 식염수(1XPBS) | Fdbio Science Biotech Co.,Ltd | FD7032 | |
| 피펫 | RUINING | Pipet-Lite XLS | |
| GraphPad Prism 8.0 | GraphPad Software | 특정 마이크로플레이트 리더용 운영 소프트웨어. | |
| 가위 | Beyotime | FS001 | |
| 조직 소화 용액 | Mogenel Biotechnology | MB-0818L06L/MB-0818L06S |
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