2012년 8월 18일
전자 상자 성체의 공명 (EPR) 분광학은 철 (II)-N-메틸-D-glucamine dithiocarbamate, 철 (MGD)를 사용하여 인간 neutrophils에서 소 대동맥 내피 세포와 초과 산화물 라디칼 음이온에서 질소 산화물을 감지하기 위해 고용되었다 2와 5,5 - 디메틸-1-pyroroline-N-산화물 각각 DMPO.
저는 오하이오 주립대학교 약리학 부교수인 Frederick Dina입니다. 본 시연에서는 EPR 스핀 트래핑(Spin Trapping)을 이용하여 세포로부터 일산화질소와 초과산화물을 검출하는 방법을 보여드리겠습니다.
활성 산소 및 질소종은 다양한 질병의 발생과 연관되어 있으며, 따라서 생물학적 시스템 내에서의 검출이 매우 중요합니다. 활성종 검출을 위해 생물학적 시스템에 적용된 신뢰할 수 있는 방법은 소수에 불과하며, 이들은 특이성과 민감도 면에서 한계가 있습니다. 반면, 스핀 드롭핑(Spin dropping)은 활성 산소종(ROS)의 식별에 흔히 사용되며, 이는 라디칼이 니트로 스핀 트랩이나 금속 복합체에 첨가 반응을 일으켜 지속적인 스핀 부가물을 형성하는 원리를 이용합니다. 이렇게 형성된 부가물은 전자 상자성 공명 분광법(electron paramagnetic resonance spectroscopy) 또는 EPR로 검출할 수 있으며, 다양한 라디칼 부가물은 각각 고유한 스펙트럼을 나타내므로 이를 통해 생성된 라디칼을 식별하고 라디칼 생성의 성질과 역학에 관한 풍부한 정보를 얻을 수 있습니다.
산화질소 합성효소(Nitric oxide Syntase)는 N-A-D-P-H를 사용하여 L-arginine을 L citruline으로 전환하여 산화질소를 생성하는 반응을 촉매합니다. 산화적 스트레스 조건 하에서, 이 효소는 언커플링(uncoupling)이라고 불리는 과정을 통해 산화질소 대신 초과산화물을 생성하는 상태로 전환될 수 있으며, 이는 헴(heme)의 산화나 산화질소 조절을 방해하는 보조 인자로 인해 발생하는 것으로 알려져 있습니다. 생물학적 시스템에서 산화질소 조절은 혈관 확장과 같은 유익한 생리적 기능을 유도하는 세포 신호 전달에서 결정적인 역할을 하기 때문에 매우 중요하지만, 과잉 생성은 종종 염증성 질환과 연관됩니다. 따라서 생물학적 시스템 내에서 산화질소를 검출하는 것은 매우 중요합니다.
생물학적 시스템에서 또 다른 중요한 신호 전달 분자 군은 일산화질소와 같은 활성 산소종입니다. 낮은 농도의 활성 산소종은 세포 기능, 신호 전달 및 면역 반응을 조절하는 데 중요한 역할을 하지만, 조절되지 않은 농도에서는 세포 산화 손상을 일으켜 산화 스트레스로 이어질 수 있습니다. 초과산화물 라디칼 음이온은 가장 중요한 활성 산소종 중 하나이며, 초과산화물 아질산염 및 하이드록실 라디칼과 같이 생물학적 시스템에 존재하는 것으로 알려진 가장 강력한 산화제들의 주요 전구체입니다. 따라서 생물학적 시스템에서 초과산화물을 검출하거나 격리하는 것은 매우 중요한데, 이는 초과산화물의 생성이 산화적 폭발의 첫 번째 징후를 나타내기 때문입니다.
본 프로토콜에서는 서술된 절차에 따라 배양된 소 대동맥 내피세포를 트립신 처리합니다. 배양 후, 세포를 라벨이 부착된 6-well 플레이트로 옮겨 37 °C, 5% CO2 조건에서 하룻밤 동안 배양합니다.
인큐베이터에서 6-웰 플레이트를 꺼내고 첫 번째 웰의 배지를 흡입하여 제거합니다. 1 mL의 인산완충식염수(DPBS)로 세포를 두 번 세척합니다. 0.8 mg의 황산철을 염화칼슘과 염화마그네슘이 포함된 1 mL DPBS에 첨가하여 1.9 mM 황산철 7수화물 용액을 준비합니다.
염화칼슘과 염화마그네슘이 포함된 500 µL DPBS에 2.7 mg의 암모늄 MGD를 첨가하여 MGD 용액을 준비합니다. 새로 조제한 1.9 mM 황산철 헵타수화물 210 µL와, 1:7 몰비를 사용하여 새로 조제한 MGD 210 µL를 첨가하고 결과물인 현탁액을 혼합합니다. 4.6 µL의 칼슘 이온 4를 첨가하고 피펫팅을 통해 용액을 다시 혼합합니다.
그 다음 샘플을 37 °C에서 36분 동안 배양하십시오. 에펜도르프 튜브에 가라앉은 상층액을 수집하십시오. EPR 획득 파라미터를 중심 자기장 3427 gauss, 변조 진폭 6 gauss, 주파수 9.8 GHz로 설정하십시오.
기기 및 실험 조건에 따라 파라미터가 달라질 수 있으므로, 해당 장비에서 사용된 다른 파라미터는 본문을 참조하십시오. 상층액을 EPR 평면 셀로 옮기고 파라핀으로 밀봉한 후 EPR 공동(cavity)에 넣습니다. 실험이 수행된 후, 121회 스캔, 스캔당 10.4초 조건으로 약 21분 동안 스펙트럼을 기록합니다.
Brucker WIN EPR 프로세싱을 사용하여 베이스라인을 보정하고 2D 스펙트럼을 적분하면 배경 노이즈를 줄일 수 있습니다. 스캔 시간과 스캔 횟수는 실험마다 다를 수 있다는 점에 유의해야 합니다. 또한, 베이스라인 보정 방법 역시 소프트웨어마다 다를 수 있습니다.
eNOS 언커플링을 시작하려면, 6-웰 플레이트의 두 번째 웰에서 배지를 제거하고 1 mL의 DPBS로 세포를 두 번 세척합니다. 그다음 준비된 0.5 mM Syn 1 용액 100 µL를 첨가하고, 10% FBS가 포함된 DPBS로 최종 부피를 2 mL로 맞춘 후, 37 °C 및 5% CO2 조건에서 2시간 동안 세포를 배양합니다.
세포를 DPBS로 두 번 세척합니다. 그런 다음 갓 조제한 2.8 millimolar 황산철 칠수화물 210 microliters와 이전 절차에 따라 갓 조제한 19.6 millimolar MGD 210 microliters를 첨가합니다. 이어서 1.9 millimolar calcium ion four 4.6 microliters를 첨가하고 용액을 다시 혼합합니다.
이전과 동일하게, 세포를 37 °C에서 36분 동안 배양합니다. 36분 후, 에펜도르프 튜브에 가라앉은 상층액을 수집하여 EPR 플랫 셀로 옮깁니다. 이전과 동일한 수집 파라미터를 사용하여 EPR 스펙트럼을 기록합니다.
본 프로토콜을 시작하기 전, 동일한 방식으로 데이터를 처리하십시오. 1 M DMPO 표준 용액과 0.1 mM DTPA가 포함된 PBS를 준비합니다. 그다음, 4-by-12의 1 mg/mL 용액을 만듭니다.
DMSO에 용해된 Myra State 13 acetate 또는 PMA를 사용하여, 1 mg/mL D-glucose와 1 mg/mL albumin이 포함된 einor tube의 PBS로 PMA 스톡 솔루션을 10 µg/mL로 희석하여 1 mL씩 분주합니다. 1.5 mL einor tube에서 피펫팅을 통해 PMN 세포를 5~6 × 10⁶ cells/mL 농도로 조절합니다. 약 1.6 × 10⁶ cells의 PMN, 10 mM DMPO 및 0.2 µg/mL PMA를 포함하며 최종 부피가 60 µL가 되도록 혼합물을 준비합니다.
본 실험에서는 Bruker ESP 300 X 밴드 분광계를 사용합니다. 용액을 EPR 플랫 셀에 옮긴 후, 플랫 셀을 EPR 공동(cavity)에 넣습니다. EPR 획득 파라미터로 중심 자기장 3, 486 goss, 변조 진폭 0.5 goss, 주파수 9.8 gigahertz를 입력합니다.
기기 및 실험 조건에 따라 매개변수가 달라질 수 있으므로, 스펙트럼 획득에 사용된 다른 매개변수들은 본문을 참조하시기 바랍니다. 본 시연에서는 두 가지 서로 다른 스핀 트랩인 iron MGD와 DNPO를 사용하여 일산화질소와 초과산화물 라디칼의 검출 과정을 보여줍니다.
우리는 칼슘 이온 4(calcium ion four)로 혈관 내피세포를 자극하면 일산화질소가 생성되며, seen one으로 처리할 때의 결과도 보여줍니다. perine nitrite 공여체는 일산화질소 생성을 감소시킬 수 있으나, 니트로 스핀 트랩(nitro spin trap) 존재 하에 PMA로 호중구를 자극하면 초기 형성된 초과산화물 adda의 불안정성으로 인해 S 산화물 대신 하이드록실 라디칼 ADDA가 생성됩니다. iron mg d nitros에 의한 스핀 트랩 메커니즘은 기본적으로 동일하지만, iron MGD에 일산화질소가 결합하는 과정은 반응 속도가 매우 빠르며, 형성된 iron MGD 일산화질소 결합 형태는 매우 안정적입니다.
실제로 EPR 신호 강도의 유의미한 감소 없이 EPR 스펙트럼을 나중에 얻기 위해 용액을 -80 °C에서 냉동 보관할 수 있습니다. 반면, 니트로 스핀 트랩을 이용한 산화물 검출 속도는 느립니다. 이로 인해 일산화질소 검출을 위한 상대적인 철 MGD 4에 비해 더 높은 농도의 스핀 트랩이 필요합니다.
초과산화물 부가물 형태를 성공적으로 검출하기 위해 여러 가지 접근 방식이 사용되어 왔으며, 본 영상에서는 더 이상 시연하지 않았습니다. 예를 들어, 평면 셀(flat cell)을 사용하면 세포 밀도가 더 높아지기 때문에 초과산화물 부가물 신호 강도를 더 높일 수 있습니다. 이 문제에 대해서는 관련 텍스트를 참고하시기 바랍니다.
또한, DMPO 대신 BMPO 및 VMP와 같은 인증된 스핀 트랩이나, 더 지속적인 SU 과산화물 부가물을 생성할 수 있는 인산화된 Nitro DAP MPO를 사용할 수 있습니다. US 검출을 위해 스핀 트래핑을 적용할 때 SU 과산화물 부가물을 안정화하기 위해 시클로덱스트린을 사용하기도 했습니다. SU 슈퍼옥사이드 생성 직후에 EP 스펙트럼을 즉시 획득하는 것을 강력히 권장합니다.
따라서, 철 MGD를 이용한 일산화질소 검출은 훨씬 더 효율적이며, 현재 초과산화물의 PR 스핀 트래핑이 직면한 주요 과제는 철 MGD 일산화질소 가첨물 형성에서 관찰된 특성들을 확보하는 것입니다. 즉, 빠른 초과산화물 반응성과 안정적인 가첨물 형성입니다. 초과산화물에 대해 빠른 반응성을 보이며 안정적인 스핀 가첨물을 형성하는 스핀 트랩을 개발하기 위한 노력이 현재 본 연구실과 다른 연구 그룹들에 의해 진행되고 있습니다.
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본 연구에서는 전자 상자성 공명(EPR) 분광법을 사용하여 생물학적 세포로부터 일산화질소 및 초과산화물 라디칼을 검출하는 방법을 시연합니다. 이 방법은 스핀 트래핑(spin trapping) 기술을 포함하며, 이를 통해 다양한 질병과 연관된 반응성 종을 식별할 수 있습니다.
산화 스트레스 및 염증 경로를 표적으로 하는 초기 단계 신약 개발에서 리스크를 줄이기 위해서는 일산화질소와 초과산화물 라디칼의 정확한 검출이 매우 중요합니다. 스핀 트래핑을 이용한 전자 상자성 공명(EPR) 분광법은 세포 시스템 내에서 이러한 반응성 종을 직접적으로 정량 측정할 수 있게 하여, 기전 검증과 예측 신뢰도를 뒷받침합니다. 이러한 역량은 표적 검증 및 리드 화합물 도출의 전환점에서 포트폴리오 결정 과정을 강화합니다.
EPR 기반 스핀 트래핑은 초기 표적 검증부터 리드 화합물 발굴 및 전임상 기전 연구에 이르기까지 신약 개발의 연속적인 과정에 통합되어 활용됩니다.