2023년 9월 8일
여기에서는 RT-LAMP(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification)를 통해 인간 샘플에서 SARS-CoV-2 바이러스를 검출하는 방법을 표준화하고 구현하기 위한 완전한 프로토콜을 제공합니다. 60분 이내에 완료되는 이 방법은 저렴한 비용과 저렴한 장비를 사용하여 모든 실험실이나 현장 진료에 적용할 수 있습니다.
우리의 연구는 LAMP를 고급 실험실 인프라가 부족한 현장 또는 1차 진료 환경에 적합한 사전 진단 테스트로 표준화하는 것을 목표로 합니다. 우리는 현지에서 생산할 수 있는 완충액과 대체 염료의 사용을 촉진하여 수입 상업용 키트에 대한 의존도를 줄이고자 합니다. 현재 CRISPR-Cas는 병원체에 대한 빠르고 구체적이며 민감한 진단 방법을 개발하는 데 사용되는 효율적인 시스템입니다.
이제 이 시스템에는 다양한 관심 샘플에서 RNA 또는 DNA 표적을 검출할 수 있는 광범위한 보충제가 있습니다. 현재의 실험적 과제는 앰플리콘 오염으로 인한 비표적 증폭을 방지하는 것과 관련이 있으며, 특히 이량체 형성이 발생하기 쉬운 긴 프라이머로 인한 일차 세포를 방지해야 합니다. 또한 염료에서 시각적으로 구별할 수 있는 색상 변화를 달성하기 위해 최적의 반응 조건을 결정하는 것을 목표로 합니다.
일단 표준화되고 완전히 검증되면 이 방법은 쉽게 구현할 수 있으며 저렴한 장비를 사용하여 저렴한 장비를 사용하여 60분 이내에 모든 실험실 또는 현장 진료에 적용할 수 있어 거의 모든 병원체를 검출할 수 있습니다. 따라서 1차 진료 센터에서 적시에 역학 감시를 수행하는 데 잠재적으로 사용할 수 있습니다. 우리의 다학제 그룹은 콜롬비아 토착 식물에서 분자를 발견하는 데 중점을 두고 있으며, 뎅기열, 지카 또는 SARS-COVID-2와 같은 바이러스의 복제를 억제할 수 있는 잠재력을 식별하기 위해 노력하고 있습니다.
또한 이러한 바이러스에 대한 분자 진단 방법을 개발하기 위한 연구를 진행하고 있습니다.
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본 연구는 역전사 루프 매개 등온 증폭법(RT-LAMP)을 이용하여 SARS-CoV-2 바이러스를 검출하는 표준화된 프로토콜을 제시합니다. 이 방법은 저자원 환경을 위해 설계되었으며, 저렴한 장비를 사용하여 60분 이내에 신속하게 검출할 수 있습니다.
RT-LAMP와 같은 신속하고 저렴한 분자 진단법은 중앙 집중식 및 분산형 환경 모두에서 신종 바이러스 위협의 조기 발견과 억제에 매우 중요합니다. 본 프로토콜은 SARS-CoV-2 및 기타 병원균의 확장 가능하고 현장 적용 가능한 검출을 가능하게 하여, 포트폴리오 전반의 리스크 완화와 적시의 역학 조사를 지원합니다. 또한, 뛰어난 적응성과 최소한의 인프라 요구 사항 덕분에 바이오 제약 R&D 및 공공 보건 대응 파이프라인의 전략적 자산으로 활용될 수 있습니다.
이 RT-LAMP 프로토콜은 초기 분석법 개발부터 현장 및 임상 환경에서의 중개적 배치에 이르기까지 진단 발견 연속체에 통합됩니다.