2011年12月2日
本文描述了一种利用固态纳米孔监测蛋白质在无机表面上非特异性吸附的方法。该方法基于电阻脉冲原理,可实现对吸附过程的实时、单分子水平检测。由于单个蛋白质吸附过程远未达到平衡状态,我们建议采用合成纳米孔的并行阵列,从而能够定量测定蛋白质吸附的表观一级反应速率常数以及朗缪尔吸附常数。
本实验的总体目标是制备用于蛋白质吸附研究的人工膜纳米孔。该过程通过使用扫描透射电子显微镜(STEM)在氮化物膜上钻取纳米孔来实现。随后将含有纳米孔的膜装入样品室,并用离子溶液润湿。
使液体在纳米孔的一侧与另一侧之间形成液桥,从而使纳米孔准备好进行实验。在两端施加电压后,可观察到离子电流通过纳米孔。最后一步是在纳米孔腔室中加入蛋白质。
最终观察到纳米孔道中离子电流的长寿命阻断现象,揭示了蛋白质吸附在纳米孔侧壁上的过程。大家好,我是 Dave Wicki,雪城大学物理系的一名研究生。
尽管该方法可用于研究蛋白质在无机表面的吸附行为,也可应用于其他体系,如蛋白质与核酸相互作用、单分子光谱学以及受限空间内分子的研究。首先将STEM调至加速电压。
接下来,将一块带有硅氮化物窗口的SPI网格装入透射电子显微镜(TEM)样品 holder 中。使用氧气等离子体对网格进行30秒的清洁,以去除表面污染物。在装入样品前,先将样品 holder 装入TEM中,并等待真空系统抽至工作真空度。
使用明场透射电子显微镜(TEM)模式,找到氮化物窗口,即原始图像上的一个明亮方形区域。确保透射电子显微镜已正确对中,然后对样品进行对中和聚焦。
现在将系统切换至STEM模式,并使用明场探测器对样品成像以检查其对中情况。如有单色器,将其设置为较低值,以获得更高的电子束电流用于钻孔。根据电子探针的直径选择合适的束斑尺寸,以进行纳米孔钻孔。
保持样品杆对齐。使用BROGRAM在所需放大倍数下精确聚焦氮化硅膜。若样品有任何移动,请消散电子束,等待样品稳定后再继续操作。
这可能需要长达一小时。一旦稳定,将电子探针置于样品上并开始钻制纳米孔。使用透射电镜(TM)钻制纳米孔需要极大的耐心。
这是一种氮化物在电子束探针作用下逐渐消散的过程。需保持电子探针始终位于钻孔位置正上方,并确认纳米孔已完全钻通。在将样品从透射电镜中取出之前,应使用高角度环形暗场探测器定期扫描检查样品。
如果样品发生轻微漂移,应调整电子探针的位置,使其对准纳米孔。当ROI图清晰聚焦时,氮化膜的闪烁现象将消失。当纳米孔形成且ROKY图失焦时,可观察到 fray nail 条纹。
关闭加热后对纳米孔成像,并对图像生成强度分布曲线。可通过该曲线中最暗区域估算纳米孔的直径。如有需要,可使用电子束扩大纳米孔。
当达到所需直径时,将单色器调至标准设置,切换至透射电子显微镜(TEM)模式。采用明场透射电子显微镜观察以确认孔径大小。
首先准备脱气的生理盐水。将溶液置于真空环境中,并在水浴中超声处理20分钟。小心地将含有氮化硅芯片的脆弱纳米孔放入一个10毫升的派热克斯烧杯中。然后在通风橱内,将烧杯放置在加热板上。
使用食人鱼溶液非常小心地清洗纳米孔芯片。首先,用玻璃移液管向容器中加入三毫升硫酸。其次,小心地向硫酸中加入一毫升高浓度过氧化氢。
请采取所有预防措施。让纳米孔芯片浸泡10分钟。然后使用玻璃移液管从烧杯中移除芬顿溶液,并妥善处理。
接下来,用脱气去离子水注满烧杯。使用一支洁净的玻璃移液管,将烧杯中的水排空,并重复此清洗步骤至少五次。用洁净的镊子取出纳米孔芯片,并通过轻微抽吸使其干燥。
干燥后,立即将纳米孔芯片密封到腔室中。可通过O型圈或硅胶密封剂将芯片固定在腔室内。向腔室中加入氯化钾溶液。
将银-氯化银电极连接到腔室。可通过将银丝浸泡在漂白剂中过夜来制备电极。在电极两端施加跨膜电位,并使用膜片钳放大器监测电流响应。
在电压钳模式下,根据测量结果绘制电流-电压曲线。该曲线应具有高度线性。当使用一摩尔氯化钾时,纳米孔的电导应与其直径相对应。
如果纳米孔未显示出线性IV曲线,电导过低或纳米孔的开放电流不稳定,则表明纳米孔未正确形成,应重复piha清洗步骤。确保液体存在于纳米孔内部至关重要。
如果此步骤操作不当,纳米孔中的离子电流将表现出极大的噪声,且蛋白质进入纳米孔的分配会显著减少。首先,将目标蛋白的纯化样品加入到腔室的接地浴液中,等待样品充分扩散。
施加一个跨膜电势偏压,其极性与所研究蛋白质的总电荷相反。施加200毫伏的电势应足以产生可观测信号。大多数蛋白质分析物事件将表现为相对于基线的瞬时电流偏转。
若未观察到信号,可增加样品室中蛋白质的浓度。较高的电压可改善信噪比和氮化层性能。纳米孔能够耐受数伏电压。
蛋白质的结合将表现为纳米孔基线电流的长时程变化。固态纳米孔的典型结果如下:开放孔道电流应具有高度稳定性。
纳米孔的电流-电压(IV)特性应具有高度线性。在1摩尔氯化钾、10摩尔磷酸钾(pH 7.4)溶液中,对IV曲线进行线性拟合所得的斜率即为纳米孔的单通道电导率。电导率与纳米孔直径呈直接关系,且应符合该方程。
该值应在30%以内相符。如果该值过小,则表明孔道可能未成功结合蛋白。快速事件应紧随蛋白吸附之后发生,表现为持续较长时间的电流下降。某些蛋白质具有高度不稳定性,会在孔道内部发生结构转变。
在这种情况下,长时间存在的电压降将伴随快速波动。观看本视频后,您应充分了解如何使用扫描透射电子显微镜制备固态纳米孔,并利用这些处于适当状态的SA蛋白进行吸附。请务必注意,使用piranha溶液具有极高危险性,在进行该操作时,必须采取预防措施,例如在通风橱中操作,并佩戴手套、实验服和化学防护围裙。
感谢观看,祝您的实验顺利。
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本文详细介绍了一种在氮化硅薄膜上制备固态纳米孔并利用其在单分子水平研究蛋白质吸附的实验方案。该方法采用电阻脉冲技术监测蛋白质与纳米孔表面的相互作用,可揭示蛋白质吸附动力学特性,并为单分子光谱学及限域空间内分子行为研究提供更广泛的应用前景。
固态纳米孔检测技术可实现对蛋白质吸附的直接、免标记单分子水平监测,有助于解决生物制药研发中蛋白质-表面相互作用研究的关键挑战&D. 随着器件微型化加剧了蛋白质吸附对微流控和分析平台的影响,这一能力正变得愈发重要。基于纳米孔的分析技术的整合有助于在早期发现和检测方法开发流程中实现可靠的预测和机制层面的风险降低。
这种基于纳米孔的检测方法适用于从早期发现到检测方法开发的整个流程,可为先导化合物的鉴定和临床前设备设计提供基础数据。