2018年9月12日
本文介绍了一种对草莓植株在三维空间中结冰过程进行成像的实验方案。通过将两台红外相机以略微不同的角度放置,生成红蓝立体视频,以观察植株在三维空间中的结冰过程。
该方法可让您在三维空间中精确定位冰核形成及传播的位置,而使用某些红外相机可能难以实现这一点。该技术的优势在于能够提供深度信息,这是普通二维视频无法实现的。由于人类无法直接观察红外辐射,因此唯有通过能够探测红外辐射并将其转换为可见光谱的相机,才能可视化诸如冻结等产热过程。
尽管我们使用该系统来演示草莓植株的冰冻过程,但它也可用于任何在视觉图像中深度信息重要的项目中。该方案可能对某些人而言较为困难,因为它涉及使用一款学习曲线相对较陡的软件。首先,使用固定带和一小块木头,架设两台红外(IR)相机,以获得镜头之间合适的会聚角度。
两台摄像机必须对准同一物体,但角度略有不同,以对应人眼之间的距离。将两台摄像机安装在10厘米×10厘米的实验室升降架上。按照文本方案编程设置冷冻机后,将一株六周龄、带有两至五朵花的草莓植株放入一个一升的容器中,并置于冷冻机内。
使用千斤顶垂直调整两台相机的位置,使两个图像均包含整株植物及部分土壤。然后,通过 USB 连接线将两台相机连接到计算机,并将两台相机分别插入交流电源插座,以实现对植物的持续监测。要设置计算机和软件进行录制,请双击红外相机软件图标两次,打开两个软件窗口。
然后,按照帮助菜单中的说明,将左侧相机连接到左窗口,将右侧相机连接到右窗口。打开屏幕录制软件,通过点击并拖动来调整录制区域,使其包含两个相机的画面,从而实现对两个相机的同步屏幕录制。必须同时捕获两个相机的视频流,以确保左右图像精确同步。
屏幕录制软件将使您能够非常轻松地完成此操作。接下来,在控制器菜单中,通过选择“Run”启动冷冻程序,并开始屏幕录制。然后,单击窗口上的“Recording”按钮,确保显示正在录制区域的轮廓变为红色。
将草莓植株冷冻至零下八摄氏度,并将冰箱温度维持一小时。视频处理时,首先使用商用文件转换软件将屏幕录制软件生成的 MP4 文件转换为 mov 文件。然后,在项目面板内任意位置双击,将感兴趣的 mov 文件导入成像软件中,并将该文件拖动至项目面板底部的“合成”图标。
然后,将项目保存到包含原始视频的同一文件夹中。在预览窗口底部,单击“感兴趣区域”图标,并仅对左侧相机的录像部分进行勾画。将同一段 mov 视频拖动到“合成”图标,以创建该视频的第二个合成。
然后,使用右侧相机重复此步骤。接着,选择左侧视图的“合成”(Composition),将合成裁剪至感兴趣区域。之后,对右侧视图重复此步骤。
重命名每个合成文件,以标明左、右。通过单击选中左侧合成文件,然后在顶部主菜单中选择“合成”,“添加到渲染队列”。在渲染队列中,单击“输出模块”,并确保视频将被渲染为视频格式。
单击“输出到”,将视频命名为“Strawberry Left”,并将其保存到与原始录制文件和项目相同的文件夹中。单击“保存”,然后单击渲染面板右上角的“渲染”按钮。对“Strawberry Right”合成重复上述渲染操作。
接下来,双击项目面板,导入渲染好的 Strawberry Left 和 Strawberry Right 视频。同时选中这两个视频,将其拖动到项目面板底部的合成图标上。在弹出的对话框中要求输入静态图像持续时间时,输入数字三并添加五个零,以设置为三小时的持续时间。
在合成面板中选中顶层,然后从顶部菜单中选择“效果”、“透视”、“3D 眼镜”。在控制面板中,点击“左视图”右侧的方框,在合成面板的下拉菜单中列出两个视频,并在列表中选中用于左视图的视频。
然后,对右视图重复此步骤。在 3D 视图右侧的框中,选择红蓝左右模式。佩戴红蓝眼镜,在项目面板中检查该视图。如果 3D 视图显示不正确,单击“交换左右”。
调整场景汇聚和垂直对齐,以消除任何重影和视觉疲劳。当视频的 3D 效果达到可接受水平时,单击以选中该合成,并选择“合成”>“添加到渲染队列”,如本视频前面所示。最后,渲染视频。
该红外视频显示,尽管叶片上的结冰位置不一定相同,但叶片比花朵在更高的温度下结冰。叶片结冰后,冰冻现象沿叶柄向下延伸至植株的冠部。当温度再下降一到两度时,花朵开始结冰,首先从花萼开始,随后扩展到花瓣和花托。
将二维红外图像与三维佩戴眼镜图像进行比较时,三维图像更易于精确确定叶片和花朵结冰的顺序。这些小麦根系浸没在由泥炭组成的培养基中,并在冷冻前添加了冰屑,以确保根系能够冻结。冻核现象发生在约零下0.5摄氏度,在右侧根系的中段位置。
随后,冰冻从植株向上延伸至冠部,导致外层叶片基部结冰,再向下蔓延至植株后部的根部。需要注意的是,若缺乏三维视角,几乎无法判断特定根部结冰的顺序。应正确放置摄像机,确保每一台都对准被拍摄物体的同一位置。
使用本演示中所用的相机可确保生成红蓝立体视频的角度正确。该方法不仅可用于生成视频,还可通过从不同角度拍摄两张照片来生成任意物体的3D静态图像。
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本文介绍了一种利用红外相机对草莓植株冻结过程进行三维成像的实验方案。该技术能够可视化冰核形成与传播过程,提供标准二维视频无法实现的深度信息。
植物结冰事件的三维红外成像能够实现冰核形成与传播过程的精确空间定位,解决了生物系统中动态热过程定量分析的关键难题。该技术提升了表型筛选的预测可靠性,并为作物抗逆性转化研究提供支持。本方案提供的深度分辨输出结果,可直接服务于研发团队,有助于降低早期发现及临床前模型开发中的生物学变异性风险。
该三维红外成像方案可融入从发现到临床前研究的连续流程,为假设验证和模型确证提供关键的空间与时间数据。