2023年8月4日
本方案描述了利用组装的Cas9-sgRNA核糖核蛋白复合物对小鼠骨髓来源巨噬细胞进行基因组编辑的操作步骤 体外 并通过电穿孔递送。
本实验室研究结核分枝杆菌与宿主免疫系统之间的相互作用,重点关注细菌与巨噬细胞之间的初始相互作用。在巨噬细胞中已采用多种基因敲除技术,包括RNA干扰技术与CRISPR技术。其中主要挑战之一在于巨噬细胞中基因敲除效率较低。
本方案能够实现对原代巨噬细胞进行快速且高效的遗传操作,无需进行克隆和质粒构建。这些方法在免疫学研究中具有广泛适用性,可使研究人员在原代巨噬细胞中敲除基因,用于多种多样的研究。首先,将放置在超净工作台中的移液工作站参数设置为1,900伏、20毫秒,单次电脉冲。
小心地从包装中取出一支转染管,以保持其无菌状态,并加入 3 毫升 E 缓冲液。为准备电穿孔,从细胞中移除培养基,并用 PBS 洗涤细胞,以去除促进贴壁的血清和二价阳离子。随后,向细胞中加入 PBS 与 1 毫摩尔 EDTA 的混合液,在室温下孵育约 5 分钟,直至细胞开始脱落。
轻轻吹打混匀以悬浮细胞,并将细胞转移至一个低蛋白结合力的15毫升离心管中。在500 ×g下离心5分钟,使细胞沉淀。离心后迅速移除大部分上清液,保留约1毫升上清液在管中。
将细胞重悬于剩余的上清液中,并转移至低蛋白吸附的1.5毫升微量离心管中。取少量细胞样品用于计数,其余细胞在室温下以500×g离心5分钟,收集细胞沉淀。在离心过程中进行细胞计数。
取1× sgRNA和20毫摩尔的Cas9溶液,将管子 warming 至室温。离心后,移除细胞沉淀中的全部上清液,并用含有氯化钙和氯化镁的PBS重悬细胞,细胞浓度为每毫升4000万个。对于sgRNA-Cas9核糖核蛋白复合物的组装,将2.5微升sgRNA加入含1微升稀释Cas9的无菌PCR管中,边缓慢加入sgRNA边混匀约15秒,以防止沉淀产生。
室温孵育5分钟,以促进核糖核蛋白复合物的形成。通过电穿孔递送核糖核蛋白复合物时,先按下电穿孔枪头的推杆以伸出杆部,然后将杆部插入枪头中。
通过上下吹打重悬细胞。用细胞悬液充满电穿孔尖端,并吸取尖端全部10微升体积容量。从阴性对照sgRNA开始,将电穿孔尖端中的10微升细胞转移至含有3.5微升核糖核蛋白的样品管中。
上下吹打三次以充分混匀,并将10微升混合液重新吸入枪头中。将枪头放入电穿孔仪的电转站,插入缓冲液中,然后按下触摸屏显示器上的“开始”按钮。电转完成后,显示器将提示电击脉冲成功。
从仪器上取下移液器,将细胞放入未包被的12孔板的干燥孔中。用含有氯化钙和氯化镁的15毫升PBS溶液,上下吹打两次以冲洗枪头。将仍连接着枪头的移液器放置一旁备用。
立即将之前分装好的1毫升不含抗生素的培养基加入细胞中,并轻轻摇动培养板以混匀。此处展示的是用对照性非靶向sgRNA、Cas9核糖核蛋白复合物、靶向Rosa 26位点的sgRNA以及Src和Cblb基因进行电穿孔修饰后,从小鼠骨髓来源巨噬细胞中获得的Rosa 26位点的代表性Sanger测序色谱图。通过PCR和Sanger测序对靶基因进行分析,结果显示在Cas9切割位点下游的每个位置均出现多个核苷酸。
这些结果验证了多个靶向基因均达到了高编辑效率。
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本方案概述了一种利用Cas9-sgRNA核糖核蛋白复合物对小鼠骨髓来源巨噬细胞进行基因组编辑的方法。该方法可提高在原代巨噬细胞中进行遗传操作的效率。
在原代骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)中实现高效的基因敲除,可通过在与疾病相关的原代细胞中快速、高可信度地开展功能基因组学研究,解决免疫学导向药物发现中的关键瓶颈问题。本方案具有高编辑效率和简化的操作流程,可在早期发现的关键节点支持可靠的靶点验证和机制层面的风险排除。该方法可提高项目筛选的预测可信度,并加速将遗传学发现转化为可执行的治疗假设。
这种基于电穿孔的CRISPR工作流程整合了早期发现和靶点验证阶段,能够无缝推进至免疫学聚焦研发管线中的先导分子识别和临床前研究。