2025年3月21日
本文所述方法涉及对Drosophila melanogaster特定梳理行为所获视频资料进行人工标注。该方法可用于量化梳理行为的发作次数以及总体梳理时间,以评估是否存在非典型的自我梳理表型。
本研究通过RNAi介导的Atg8a基因敲降,模拟图雷特综合征患者中观察到的GABARAP功能缺陷,评估黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的理毛行为。我们旨在阐明aAtg8a在行为发育中的作用,从而深入理解其人类同源蛋白在神经行为过程中的调控功能。目前,采用人工注释方法存在若干实验挑战,包括复杂的分析流程(如视频注释与审阅)以及人工注释过程中固有的主观性。
自动化方法也面临一些挑战,包括需要具备较强的计算机科学专业知识才能有效实施和操作。我们发现,基因 Atg8a 在果蝇行为发育中所起的作用超出了此前已知的范围。更具体而言,我们发现该基因同时调控梳理行为和学习能力,提示 Atg8a 的同源基因可能在其他生物中也具有类似功能。
该技术可直接定量分析果蝇的梳理行为频率及分布情况。对于无法使用自动化方法的实验室而言,此方法尤为适用,且相较于基于染料的间接方法,可实现更详细的分析。总体而言,本研究推动了果蝇作为研究伴有强迫行为的神经发育障碍(如抽动秽语综合征)模型生物的应用。
此外,这还增加了自噬相关蛋白在行为发育中发挥作用的越来越多的证据。首先,将四个三孔培养皿并排置于白色表面上,每个培养皿上覆盖一块玻璃盖片。将相机置于培养皿上方。
确保载玻片上无反光,以免影响观察培养皿中果蝇的可见度;必要时调整培养皿位置或调暗灯光以消除反光。现在,在进行录像的实验台面上标记培养皿和相机的位置。将四至九日龄的果蝇置于覆盖有Parafilm和纸巾的冰块上,进行轻微麻醉。
麻醉后,应尽快使用画笔将果蝇转移至观察室。在三孔板的每个孔中各放置一只果蝇,操作时需尽量轻柔,以避免干扰果蝇,防止引发应激相关的行为改变。在麻醉后让果蝇适应环境30分钟,随后使用相机记录果蝇行为,然后打开终端并输入 cd PiSpy。
输入 python3 PiSpy.py,然后输入所需的录制时长和帧率。选择所需的分辨率,然后单击快速捕获。
现在使用 Pi Spy 中的预览相机功能,确保果蝇处于焦点且清晰可见。以推荐的每秒 24 帧的帧率录制果蝇活动 10 分钟,并保存文件。为分析视频,将文件导入 ELAN 6.8 软件,对梳理行为进行详细标注和深入分析。
选择层级,添加新层级,在层级名称中输入培养皿中的位置信息,并进行添加,以将每一行分配用于手动标注个体的行为片段。要标注行为,需双击待标注的层级,右键单击并沿该层级拖动光标,划定个体表现出单次理毛行为的时段。单击以选择新的标注区域,然后双击新高亮的时间段,输入在该时间点所观察到行为的缩写。
视频完成注释后,点击“查看”,然后选择“注释统计”,以获取每种行为的详细分类。将发生于果蝇身体前部区域的 grooming 行为识别为前部 grooming;将发生于果蝇身体前后端区域的 grooming 行为识别为后部 grooming。
与对照组相比,Atg8a RNAi 突变体的理毛行为持续时间显著增加。Atg8a RNAi 突变体用于理毛的时间也显著高于对照组。在前部与后部理毛行为的分布上未观察到显著差异。
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本研究通过RNAi介导的Atg8a基因敲低,探究模式生物Drosophila melanogaster的梳理行为,以理解Atg8a在神经行为过程中的作用,特别是与抽动秽语综合征(Tourette综合征)的相关性。该研究重点在于对梳理行为频率和分布进行直接定量分析,从而揭示Atg8a对行为发育的影响。
Drosophila melanogaster 是一种重要的模式生物,因其遗传背景清晰、生命周期短,且在神经发育行为和疾病研究中具有重要价值。
通过视频记录分析理毛行为,随后使用ELAN 6.8软件对行为进行人工标注,以实现精确的量化分析。
该分析可量化果蝇(Drosophila)的理毛频率和分布情况,从而揭示其行为模式及反应特征。
手动注释方法可能较为复杂,涉及主观判断和耗时费力的流程,这可能会导致结果的变异性。
研究结果表明,Atg8a 基因敲低显著影响梳理行为,提示其在行为发育中具有调控作用,并可能与自噬相关蛋白存在关联。
这些发现为探索Atg8a及其直系同源物如何参与人类神经发育障碍(特别是具有强迫症特征的疾病)提供了基础。
对黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)理毛行为的定量评估为研究与强迫症相关的神经行为表型提供了一个具有转化意义的模型。该检测方法能够直接测量行为输出,有助于神经发育疾病研究中的机制性风险排除和靶点验证。其操作简便且适应性强,适用于早期发现研究以及跨职能的研发团队。
这种行为量化方法适用于从早期发现到临床前验证的连续研究过程,可支持神经精神疾病项目中的假设检验和靶点优先排序。