26. Juni 2010
Dieses Protokoll beschreibt einen allgemeinen Ansatz zur Photokonversion von fluoreszierenden Proteinen auf einem konfokalen Laser-Scanning-Mikroskop durchgeführt. Wir beschreiben Verfahren für die Photokonversion puried Protein-Proben, sowie für Dual-Sonde optische Hervorhebung in lebende Zellen mit mOrange2 und Dronpa.
Das übergeordnete Ziel des folgenden Experiments besteht darin, die fluoreszierenden Proteine M orange zwei undron für eine doppelte optische Markierung zu verwenden, um vier einzelne Zellpopulationen oder zelluläre Kompartimente selektiv zu markieren. Dies wird erreicht, indem die Zellen zunächst mit schwachem 488-Nanometer-Anregungslicht bestrahlt werden, wodurch die gesamte grüne gezogene Fluoreszenz ausgeschaltet wird. Als zweiter Schritt werden die Zellen einem intensiven 488-Nanometer-Anregungslicht ausgesetzt, das die M-orange-Fluoreszenz in rote Fluoreszenz photochemisch umwandelt.
Anschließend werden die Zellen einer zweiphotonischen Anregung bei 800 Nanometer ausgesetzt, um die Dral-Fluoreszenz einzuschalten. Auch hier liefern die Ergebnisse den Nachweis, dass eine Markierung von Zellen in vier unterschiedlichen Kombinationen auf der Grundlage einer optischen Hervorhebung mit zwei Sonden mittels M Orange zwei und gezogenem ppa möglich ist. Der Hauptvorteil dieses Verfahrens im Vergleich zu bestehenden Experimenten wie der subzellulären Fraktionierung besteht darin, dass es an lebenden Zellen durchgeführt wird.
Dieses Verfahren kann helfen, zentrale Fragen in der Biologie der Beta-Zellen zu beantworten, beispielsweise warum nur ein kleiner Bruchteil der Insulinvesikel ausgeschüttet wird. Obwohl dieses Verfahren Einblicke in die Funktion der Beta-Zellen liefert, kann es auch auf andere Systeme angewendet werden. Zum Beispiel die Verfolgung von Krebszellen in vivo. Eine Probe mit fluoreszierenden Proteintropfen besteht aus einer oktalen Wasseremulsion, in deren wässriger Phase sich ein fluoreszierendes Protein befindet.
Diese Emulsion wird für mikroskopische Anwendungen zwischen einer Objektträgerplatte und einer 22 Millimeter großen quadratischen Deckglasplatte eingeschlossen. Zu Beginn dieses Verfahrens müssen die Objektträger und Deckgläser gereinigt und mit einem hydrophoben Mittel beschichtet werden. Reinigen Sie die Glaswaren, indem Sie sie fünf Minuten lang mit Aceton waschen.
Nach dem Spülen lassen Sie das Glasgerät an der Luft trocknen. Bereiten Sie anschließend eine 2%-ige Methyltrimethoxysilanslösung in Aceton vor und beschichten Sie das Glasgerät zwei Minuten lang mit dieser Lösung. Nach der Beschichtung nehmen Sie das Glasgerät aus der Lösung und lassen es trocknen.
Anschließend spülen Sie das Glasgerät mit 70 % Ethanol aus einer Sprühflasche ab. Nach dem Spülen lassen Sie das Glasgerät erneut an der Luft trocknen und entfernen jegliche restliche Flüssigkeit. Unter Verwendung von Druckluft kann das beschichtete Glasgerät mindestens einen Monat lang aufbewahrt werden.
Nachdem das Glaswerk vorbereitet wurde, beschaffen Sie fluoreszierende Proteine, die zuvor als His-markierte Proteine aus E. coli gereinigt wurden. Messen Sie das Absorptionsspektrum des gereinigten Proteins. Bereiten Sie eine Stammlösung mit einer optischen Dichte von etwa 0,1 in Tris-gepufferter Salzlösung mit einem pH-Wert von acht, die 0,1 % Rinderserumalbumin enthält, vor.
Bereiten Sie außerdem 10 Milliliter einer 1:1-Mischung aus einem Octal und einer Tris-gepufferten Salzlösung in einem 15-Milliliter-Kegelrohr vor und mischen Sie diese gründlich. Lassen Sie die Mischung nach dem Mischen stehen, bis die Phasentrennung vollständig ist. Die obere Phase ist das Octal. Geben Sie zur Herstellung der Emulsion 45 Mikroliter eines Octals und 5 Mikroliter fluoreszierendes Protein in ein Epi- oder Orph-Röhrchen.
Tippen Sie einige Male auf das Röhrchen, um die Bildung der Emulsion einzuleiten, und behandeln Sie das Röhrchen anschließend 30 Sekunden lang in einem Ultraschallbad mit Ultraschall. In der Zwischenzeit bereiten Sie einen beschichteten Objektträger und eine Deckglas vor, die nach der Beschallung verwendet werden. Die Emulsion sollte vollständig trüb sein.
Pipettieren Sie sofort vier Mikroliter der Emulsion aus der Mitte des Reaktionsgefäßes auf einen beschichteten Objektträger und decken Sie sie mit einem beschichteten Deckglas ab. Die Emulsion sollte sich gleichmäßig zwischen Objektträger und Deckglas verteilen. Innerhalb weniger Minuten sollte die Probe stabil sein.
Das folgende Verfahren stellt eine allgemeine Strategie zur Durchführung eines Photo-Konversions-Experiments mit einem fluoreszierenden Protein an einem konfokalen Laser-Scanning-Mikroskop dar. Dieses Verfahren kann sowohl für gereinigte Proteine als auch für lebende Zellen angewendet werden. In diesem Experiment dient eine Tropfenprobe, die das gereinigte m orange two Protein enthält, als allgemeiner Ausgangspunkt für die Photo-Konversion.
Richten Sie das konfokale Laserscanning-Mikroskop wie folgt ein. Verwenden Sie ein 40x-Ölimmersionsobjektiv mit einer numerischen Apertur von 1,3 und eine Bildgröße von 512 mal 512 Pixeln. Stellen Sie die Pixelverweilzeit auf sechs Mikrosekunden ein, den Scan-Zoom auf vier und vergrößern Sie die Lochblende, um eine Z-Auflösung von drei Mikrometern zu erreichen.
Konfigurieren Sie zwei Detektionskanäle für die anfängliche und die photochemisch umgewandelte Fluoreszenz sowie einen Kanal für die photochemische Umwandlung. Beobachten Sie die orange emittierende Spezies mit Anregungslicht von 561 Nanometern und sammeln Sie die Fluoreszenz zwischen 570 und 630 Nanometern. Detektieren Sie die photochemisch umgewandelte rot emittierende Spezies mit Anregungslicht von 633 Nanometern und sammeln Sie die Fluoreszenz zwischen 640 und 700 Nanometern.
Für den Photo-Konversionskanal wählen Sie die 488-Nanometer-Laserlinie aus und erfassen Sie die Fluoreszenz zwischen 490 und 540 Nanometern. Die Aufnahme des Photo-Konversionskanals ist nicht zwingend erforderlich, kann aber hilfreich sein. Beginnen Sie das Experiment, indem Sie mit dem Detektorkanal die anfängliche Fluoreszenz unter Verwendung des kontinuierlichen Abtastmodus abbilden, um die Laserleistung und den Detektorgewinn für eine optimale Bildqualität einzustellen.
Aktivieren Sie dann den Photo-Konvertierungs-Kanal und wählen Sie eine niedrige Laserleistung. Beginnen Sie mit der Aufnahme einer Zeitrafferserie und erhöhen Sie schrittweise die Leistung des Photo-Konvertierungs-Lasers, bis eine signifikante Bleiche der ursprünglichen Fluoreszenz beobachtet wird. Setzen Sie das Scannen fort, bis die ursprüngliche Fluoreszenz etwa 75 % ausgebleicht ist.
Als Nächstes deaktivieren Sie den Photo-Konvertierungs-Kanal und aktivieren den Detektionskanal für die photo-konvertierte Fluoreszenz. Beginnen Sie die Aufnahme mit einer hohen Detektorverstärkung und geringer Laserleistung. Erhöhen Sie dann schrittweise die Laserleistung, bis die photo-konvertierte Fluoreszenz detektiert wird.
Stellen Sie nach dem Erkennen die Laserleistung sowie die Detektion oder den Verstärkungsfaktor (Gain) für eine optimale Bildqualität ein. Optimieren Sie abschließend die für die photochemische Umwandlung verwendete Laserleistung sowie deren Dauer. Eine Erhöhung der Laserleistung beschleunigt die Rate der photochemischen Umwandlung.
Jedoch führt zu viel Laserleistung zur Photobleiche des Proteins. Sobald die optimale photochemische Umwandlung, Laserleistung und Dauer bestimmt wurden, können diese Parameter verwendet werden, um ein Standard-Photobleich-Modul oder ein Fluoreszenz-Wiederherstellungs-Modul nach Photobleiche zu konfigurieren. Danach wird der Kanal für die photochemische Umwandlung aufgrund der Redshift-Spektraleigenschaften von M orange zwei nicht mehr benötigt.
Es kann in Kombination mit dem grünen, lichtschaltbaren fluoreszierenden Protein dPUPA für eine optische Markierung mit zwei Sonden verwendet werden. Beginnen Sie mit der optischen Markierung mittels zweier Sonden, indem Sie Hela-Zellen in Glasboden-Mat-Tech-Schalen kultivieren und die Zellen 24 Stunden vor der Bildaufnahme mithilfe einer Standard-LIPECTOMY-2000-Transfektion mit Plasmiden transfectieren, die die fluoreszierenden Proteine kodieren.
Platzieren Sie die lebenden Zellen auf einem konfokalen Laser-Scanning-Mikroskop und richten Sie das Mikroskop wie zuvor beschrieben für die M-Orange-Zwei-Photonen-Umwandlung ein. Konfigurieren Sie anschließend das Mikroskop für die DPA-Photoschaltung. DPA wird mit 488 Nanometer Licht angeregt und seine Fluoreszenz kann unter Verwendung des M-Orange-Zwei-Photonen-Umwandlungs-Kanals abgebildet werden.
Stellen Sie sicher, dass die zum Abbilden von MPA verwendete Laserleistung minimiert wird, da eine zu hohe Laserleistung die Inaktivierung von mpa verursacht. Fügen Sie einen Kanal für die MPA-Photoaktivierung unter Verwendung einer Zwei-Photonen-Anregung bei 800 Nanometern hinzu und bestimmen Sie anschließend die für die Bildgebung erforderliche Laserleistung für Photoaktivierung und Photoinaktivierung der OFA-Fluoreszenz.
Einer der schwierigsten Aspekte dieses Verfahrens besteht darin, RPA zu inaktivieren, ohne M Orange photochemisch umzuwandeln, da beide Ereignisse bei derselben Wellenlänge stattfinden. Um dies zu verhindern, ist es äußerst wichtig, die photochemische Umwandlung sorgfältig zu optimieren.
Laserleistung und -dauer: Vorsicht walten lassen, da eine Photoumwandlung von M Orange zwei stattfinden kann. Eine Inaktivierung von PU tritt bei Anregung mit 488 Nanometer Licht zur Inaktivierung von PU ohne signifikante Photoumwandlung von M Orange zwei auf. Verwenden Sie eine niedrigere Laserleistung, sobald die Parameter für die Photoumwandlung von M Orange zwei und den DPA-Photoschaltvorgang eingestellt sind.
Durch eine Doppelsonden-Optik kann eine optische Hervorhebung erzielt werden. Zunächst wird die DPA-Fluoreszenz im gesamten Sichtfeld durch schwache 488-Nanometer-Anregung deaktiviert. Anschließend wird ein interessierender Bereich ausgewählt und mOrange2 durch intensive 488-Nanometer-Anregung umgewandelt.
Schließlich einen interessierenden Bereich auswählen und die DPA-Fluoreszenz mittels 800 Nanometer Zwei-Photonen-Anregung aktivieren. Proben mit fluoreszierenden Proteintropfen eignen sich ideal für die Einrichtung von Photo-Konvertierungsanwendungen an konfokalen Mikroskopen. Wenn die Tropfenprobe korrekt hergestellt wurde, erscheinen die Tropfen sehr homogen.
Wenn die Probe jedoch ohne Beschichtung des Mikroskopobjektträgers mit einem Deckglas präpariert wird, neigen die Tropfen in den präparierten Proben dazu, gegen eine der Glasoberflächen gequetscht zu werden. In Abwesenheit von 0,1 % BSA neigt das fluoreszierende Protein dazu, sich an der oktalen Wasser-Grenzfläche anzusammeln. Die Erzeugung eines fluoreszenten Halo-Effekts durch photochemische Umwandlung hängt entscheidend von der Laserleistung und der Belichtungsdauer ab.
Zu hohe Laserleistung oder zu lange Belichtung führt zu Photobleichen und bewirkt eine Verringerung der photochemisch umgewandelten roten Fluoreszenz. Die unterschiedlichen spektralen Eigenschaften von M orange zwei und PHO erlauben eine optische Markierung mit zwei Sonden vor der photochemischen Umwandlung. Zellen, die M orange zwei, Histon H zwei B und DPA mito exprimieren, zeigen orange Fluoreszenz im Zellkern und grüne Fluoreszenz in den Mitochondrien. Wenn die gesamte Fluoreszenz mit niederenergetischer 488-Nanometer-Anregung ausgeschaltet wird, tritt eine minimale photochemische Umwandlung von M orange auf.
Zwei M Orange zwei können anschließend mit intensiver 488-Nanometer-Anregung in Rot photokonvertiert werden. Sobald M Orange zwei photokonvertiert wurde, kann die Fluoreszenz des gezeichneten Puffs mit 800-Nanometer-Zwei-Photonen-Anregung wieder eingeschaltet werden. Mit der dualen Sonde zur optischen Markierung können Zellen auf vier verschiedene Arten markiert werden.
Mit dieser Technik ist es möglich, vier verschiedene Zellpopulationen gezielt zu markieren. Wie Sie gesehen haben, gehört die Inaktivierung von MPA, ohne mOrange photochemisch umzuwandeln, zu den schwierigsten Aspekten dieses Verfahrens. Sobald diese Beherrschung erreicht ist, können mit diesem System weitere Experimente durchgeführt werden, beispielsweise die Verfolgung mehrerer Populationen in pankreatischen Beta-Zellen.
Das war's. Ich hoffe, diese Präsentation war für Sie hilfreich, und viel Erfolg bei Ihren Experimenten.
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Dieses Protokoll beschreibt eine Methode zur Photoumwandlung fluoreszierender Proteine mithilfe eines konfokalen Laser-Scanning-Mikroskops. Es erläutert die Verfahrensschritte zur Photoumwandlung gereinigter Proteinproben sowie zur optischen Markierung mit zwei Sonden in lebenden Zellen unter Verwendung von mOrange2 und Dronpa.
Mit der dualen optischen Markierung können zelluläre Kompartimente in lebenden Zellen präzise räumlich und zeitlich markiert werden, was die mechanistische Risikominderung bei der Target-Validierung unterstützt, indem Protein-Dynamik und subzelluläre Transportvorgänge direkt beobachtet werden können. Dieser Ansatz erhöht die Vorhersagesicherheit in der frühen Entdeckungsphase, da quantitative Echtzeit-Auslesungen des Proteinverhaltens unter physiologischen Bedingungen bereitgestellt werden und somit die Abhängigkeit von Artefakten fixierter Zellen verringert wird. Die Methode eignet sich für Screening-Workflows, bei denen die subzelluläre Lokalisation Aufschluss über Target-Bindung und Signalwegsmodulation gibt.
Die Methode integriert sich in frühe Entdeckungsworkflows, indem sie Live-Cell-Bildgebungsfähigkeiten bereitstellt, die mittels räumlich aufgelöster Proteindynamik die Zielvalidierung und die Identifizierung von Leitstrukturen unterstützen.