ניתוח מתמיד של האביב המולקולרי על ידי ספקטרוסקופיית בדיקה כוח Biomembrane

וידאו זה מתאר נהלים שלב אחר שלב על שימוש בדיקה כוח Biomembrane, או BFP כדי למדוד קבוע קפיץ מולקולרי. בגשושית כוח, BFP הופיע לאחרונה על פני השטח של התא המקורי או בניתוח ספקטרוסקופיית כוח דינמי SITU. המטרה העיקרית של טכניקה זו היא למדוד גנטיקה מחייבת מולקולה אחת.

הליך ניתוח נתונים זה הוא מסר פשוט אך רב עוצמה ומספק מידע מכני, במיוחד הכוח הדינמי ודלקת של קרום התא המבטאים מולקולות. במהלך מחזור הניסויים של BFP, המיקרוביום של הגשושית הימר עם תא הדם האדום וצוואה, תא היעד וקשר מולקולרי קולטן ליגנד בין הגשוש לבין היעד יכול להיחשב כמערכת מוח מחוברת סדרה. בהתבסס על החוק של הוק, ההדדיות של קבוע האביב הכולל של מערכת קפיצים מחוברת סדרה שווה לסכום של קבוע האביב ההופכי של כל רכיב בודד, כפי שהמשוואה מראה.

קבוע האביב של תא הדם האדום מחושב על סמך תנועת האירועים, התלויה לרדיאלי של מיקרופייט הגשושית בחליפה. תא הדם האדום, אזור המגע המעגלי בין תא הדם האדום לצוואה והמיקרו-פיפטה השואפת ללחץ. נתוני הכביש BFP מתקבלים על ידי מכשיר וירטואלי תוצרת בית של תצוגה שמאלית, השולט בתנועה של מיקרו-פיפט היעד על ידי מתרגם PAs.

מחזור מגע מלא של PFP מורכב מחמישה שלבים. גישה. פגיעה. קשר, לסגת ולנתק. בהתחלה, מדגיש את עמדת רובוסטו APICS מסומן כמו X שווה 0 ב deshine שחור.

המטרה מונעת לאחר מכן על ידי יצירה או מתרגם כדי לפגוע ולדחוס את רובוסטו כדי לגרום לתנועת צוואות שלילית. שים לב לזה כ- X קטן מאפס בקו המקף האדום. בשלב הניתון לאחור, פסגת busto האדומה נעה ממיקום X הקטן מאפס בחזרה למיקום X השווה למיקום אפס המכונה שלב הדחיסה.

אם נוצר קשר בין קומפלקס מולקולת קולטן ליגנד, תא הדם האדום יהיה שונה עוד יותר לכיוון חיובי אחר. X זה, הגדול מאפס, מכונה שלב המתיחה של שלב הניתון החוזר. שלב הה לסגת הוא החלק הקריטי ביותר כדי לקבוע את קבוע האביב של המולקולה של מליטה.

איסוף נתוני כוח לעומת כביש זמן באמצעות פלטפורמת רכישת הנתונים של BSP. כל ניסוי בדרך כלל להקליט 50 עד 200 מחזורי מגע, פתח את תוכנת ניתוח הנתונים PFP. לחץ על סמל התיקיה הצהובה ובחר את קובץ נתוני השורה המתאים על-ידי לחיצה כפולה עליהם.

אנחנו בתוכנית. לאחר מכן לחץ על לחצני החצים למעלה ולמטה כדי לעבור בין אירועים. שימוש בקריטריוני אי-הכללה חריגים כדי לסנן אירועים לא חוקיים.

בחר את סוג הנתונים המייצא שנכפה על תבנית זמן ובחר את טווח הזמן המתאים למצב. לחץ על לחצן נתוני התוויית ייצוא. הנתונים המיוצאים נשמרים כקובץ טקסט כברירת מחדל.

קובץ טקסט זה מכיל שתי עמודות נתונים. זוהי העמודה הראשונה המייצגת את אבות הזמן ואת העמודה השנייה המייצגת את הכוח המתאים בכל נקודת זמן. התווה את עקומת הכוח לעומת הזמן באמצעות תוכנת גליונות אלקטרוניים כדי להשיג את עקומת ההעתקה הכפויה לעומת עקומת ההעתקה.

הכפל את ערך הזמן של כל נקודת נתונים על-ידי תנועת PSO של חברת ווילו סטיל. אפס את נקודת הנתונים הראשונה על-ידי חיסור ערך ההעתקה הקטן ביותר מכל נקודת נתונים. המרה אופקית זו אינה משפיעה על חישוב קבוע האביב הבא.

בעקומת הכוח לעומת העקירה, שתי קבוצות שחקנים נפרדות היו שונות אם ניתן לזהות את שיפוע הכוח החדש. כל אחד מייצג את שלב הדחיסה ואת שלב 10 הסגנונות. התאם שורת רגרסיה לכל קבוצת נתונים.

הקו עם שיפוע תלול יותר מייצג את קבוע האביב הכולל בשלב מדחס מסומן K1. והקו שהיה הקטן ביותר מייצג את הקו בשלב 10 הסגנונות הזה שצוין כ K2.As שציינתי, קבוע האביב הכולל הוא ההדדי של הבן של קבוע האביב של הסדרה של כל רכיב. במהלך שלב הדחיסה של הקצב למצב התא, הקשר המולקולרי אינו נמתח, ולכן קבוע קפיץ מליטה מולקולרית אינו נלקח בחשבון. קבוע הקפיצה של תא היעד מתואר כמשוואה המוצגת כאשר K1 מייצג את קבוע הקפיצה הכולל במהלך שלב המדחס.

בשלב 10 הסגנון של הקצב למכור מצב, קבוע האביב הכולל הוא השמש של קבוע האביב uverse של הקשר המולקולרי של תא הדם האדום. ותא היעד, השתמש במשוואה המוצגת כדי לחשב את קבוע קפיץ מליטה מולקולה, אשר K2 מייצג את קבוע האביב הכולל. קראת את שלב 10 העצירה.

במצב פעימה כדי לנצח, שכן עיוות B הוא זניח, המונח המתאר את ההופכי של התא היעד קפיץ קבוע גישה אפס, ולכן קבוע האביב הכולל בשלב המדחס שווה ערך קבוע האביב תא הדם האדום מראה כמו המשוואה הבאה. בשלב המתיחה, ניתן לחשב את קבוע הקפיץ של הקשר המולקולרי על ידי חיסור ההשפעה של תא הדם האדום המוצג כמשוואה הבאה. לאסוף קבועי האביב של יחס שילוב רוח צד B, בטא 3 קומפלקס, תא K562 ואת גישת שילוב Febrifugine B בטא שלוש מורכב, לחשב את הממוצע ואת סטיית התקן של קבועי האביב נגזר בבחירת סולם ניוטון או ננומטר.

עכשיו אתה צריך להבין טוב יותר מהן הדרישות למדידה וקפיץ קבוע מתוך נתוני VFD. יש להבחין בהבדלים בין הקצב למצב התא לבין מצב הקצב לביט. לשירות הצגת מולקולות שונות יהיו הגנות שונות למדידת קבוע האביב.

לסיכום, הליך זה צעד אחר צעד מתאר כיצד לבצע ניתוח קבוע האביב המולקולרי באמצעות BFP. אנו צופים שמאמצים עתידיים ייעשו כדי להפוך את רכישת הנתונים של BFP לאוטומטית ולשלב את רכישת הנתונים BFP וניתוח DFS בתוכנית מנוחה אחת למחשב. מה שהופך את כל ניתוח נתוני הפעולה של BFP לידידותי יותר למשתמש וגבוה לאורך כל הדרך.