14 ביוני 2024
אנו מציגים פרוטוקולים להערכת מיומנות מסלול תיקון שבר גדיל כפול בתאים באמצעות חבילה של מצעי כתב חוץ-כרומוזומליים מבוססי לומינסנציה.
ארטיוס מפתחת תרופות אנטי-סרטניות חדשניות המכוונות לתגובת הנזק לדנ"א. כדי לאפשר זאת, פיתחנו מגוון של בדיקות חדשניות למדידת פעילות תיקון הדנ"א התאי. לבדיקות אלה הייתה השפעה גדולה על התוכניות שלנו, מה שהוביל לכך שנכסים בשלב הקליני נבדקו בחולים עם צרכים רפואיים גבוהים שלא נענו.
מדידה מדויקת של הפעילות התאית על המטרה חיונית לקידום טיפולים ממוקדים חדשים. יצירת בדיקות עבור גורמי תיקון דנ"א עם התכונות הנדרשות לתדלוק קמפיין גילוי תרופות יעיל הייתה מאתגרת, בין אם מדובר בצורך בתפוקה גבוהה, אות לרעש חזק, תפנית מהירה, ובאופן אידיאלי, ניידות למערכות ביולוגיות שונות. פיתחנו חבילה של מבחני כתב חזקים, כמותיים ומבוססי הארה כדי למדוד את המיומנות של ארבעה מסלולי תיקון שברים דו-גדיליים עיקריים, רקומבינציה הומולוגית, חיבור קצה לא הומולוגי, חיבור קצה בתיווך מיקרוהומולוגיה וחישול גדיל יחיד.
מבחני כתב אלה מאומתים כקריאת תיקון תלוי מסלול, רגישים לאפנון פרמקולוגי ויש להם זמן תפנית מהיר. מצעי התיקון שפיתחנו הם חוץ-כרומוזומליים, כך שניתן להדביק אותם באופן ארעי למודלים מעניינים ולהתאים אותם בקלות לפורמט בעל תפוקה גבוהה. אנו מאמינים שלמערכות הבדיקה שלנו יש מקום חשוב במתן אפשרות לגילוי תרופות DDR, אך גם בקידום הבנתנו את הביולוגיה של DDR באופן רחב יותר.
מבחינה זו, אנו מקווים שהשיטות יסייעו להאיץ את הזיהוי וההעמדה לדין של מטרות תרופתיות חדשות, שיובילו לתרופות למחלות כגון סרטן שבהן יש צורך רפואי גבוה שלא נענה.
מאמר זה מציג פרוטוקולים להערכת היעילות של מסלולי תיקון שברים דו-גדיליים בתאים, באמצעות סובסטרטים של רב-דיווח חוץ-כרומוזומליים המבוססים על לומנסנס. הבדיקות שפותחו חיוניות להבנת התגובה לנזקי DNA ולסיוע בגילוי תרופות בתחום האונקולוגיה.
בדיקות דגיאה (reporter assays) כמותיות המבוססות על לומניסנציה לתיקון שברים דו-גדיליים ב-DNA מאפשרות מדידה רב-מסלולית וספציפית למסלול של פעילות תיקון DNA תאית, ובכך תומכות ישירות בתיקוף מטרות (target validation) ובצמצום סיכונים מכניסטיים בגילוי תרופות לאונקולוגיה. בדיקות אלו מספקות תוצאות מהירות, הדירות וניתנות להרחבה, החיוניות לקידום טיפולים המכוונים לתגובת נזקי DNA (DDR). שילובן בתהליכי הגילוי מגביר את הביטחון החזוי ואת תעדוף תיקי הפיתוח עבור נכסים המכוונים ל-DDR.
בדיעות אלו ממוקמות בתוך רצף הגילוי, החל מאישוש מוקדם של מטרה, דרך זיהוי מובילים ועד להערכה פרה-קלינית של תרופיות המכוונות למסלולי ה-DDR.