8 maggio 2020
Viene presentato un protocollo per eseguire il tracciamento del lignaggio e l'analisi genetica funzionale dei geni candidati a livello di singola cellula utilizzando l'analisi del mosaico con doppi marcatori (MADM). L'analisi clonale MADM fornisce un quadro quantitativo per misurare il comportamento proliferativo, l'output cellulare e la relazione di lignaggio dei singoli progenitori e delle loro cellule figlie.
L'analisi del mosaico con tecnologia Double Markers è un metodo potente in grado di fornire informazioni altamente quantitative sul comportamento di proliferazione e sui risultati delle cantine delle cellule staminali degli individui. Una caratteristica unica di questa tecnica, è che consente il tracciamento del lignaggio e l'analisi genetica funzionale dei geni candidati a livello di cellula singola.demontrating alla procedura sarà, Carmen Streicher, la tua tecnica, Nicole Amberge, post-doc, Gisselle Cheung, post-doc e Andy Hansen, una dottoranda del mio laboratorio. Per indurre eventi di ricombinazione MADM in topi sperimentali, utilizzare una siringa da 1 ml dotata di un ago calibro 25 per fornire una singola iniezione di Tamoxifen Intraperitoneal in una diga a tempo in gravidanza. Dall'analisi clonale MADM ai punti di tempo postnatali. Nei giorni embrionali da 18 a 19, mettere un topo incinta in posizione supina e disinfettare la pelliccia con il 70% di etanolo. Fai una piccola incisione nella pelle nell'addome inferiore sopra l'utero e fai una seconda incisione attraverso i muscoli e la parete muscolare addominale per rivelare il peritoneo. Utilizzare le forbici per separare l'utero dai tessuti circostanti e posizionare l'utero intatto in un guanto con acqua tiepida. Quindi utilizzare forbici e dita a punta fine per aprire attentamente le pareti uterine per rilasciare gli embrioni. Pulire i cuccioli premendo delicatamente i forzieri di tanto in tanto per iniziare a respirare prima di trasferire gli animali prenatali a una madre adottiva. Per raccogliere il tessuto clone MADM neurale posizionare un animale anestetizzato in posizione supina su un vassoio di chirurgia perfusione e disinfettare la pelliccia con il 70% di etanolo. Usa forbici e forcep per fare un'incisione attraverso la pelle e un'incisione attraverso lo strato muscolare. Quando la cavità toracica è visibile, annusare e sollevare il diaframma per rivelare il cuore e tagliare e fissare con cura la gabbia toracica al vassoio chirurgico.inserire un ago collegato a un tubo di pompazione peristaltico riempito con PBS nel ventricolo in basso a sinistra del cuore e utilizzare piccole forbici Iris per fare un'incisione nell'estremità posteriore dell'atrio destro. Perfondere il sistema cardiovascolare con il PBS seguito immediatamente da perfusione con ghiaccio freddo appena preparato 4% paraformaldeide in PBS. Quando la perfusione è completa, rimuovere il cervello attraverso un'attenta dissezione e posizionare l'organo raccolto in almeno cinque volte il volume cerebrale di paraformaldeide fresca al 4% durante la notte alle 4
Questo studio presenta un protocollo per il tracciamento della linea cellulare e l'analisi genetica funzionale di geni candidati a livello di singola cellula, utilizzando l'analisi mosaicale con doppi marcatori (MADM). L'analisi clonale MADM consente la misurazione quantitativa del comportamento proliferativo e dell'output cellulare di singoli progenitori e delle loro cellule discendenti.
L'analisi a mosaico con doppi marcatori (MADM) consente un tracciamento delle linee cellulari e un'analisi clonale con risoluzione a singola cellula senza precedenti nello sviluppo della corteccia cerebrale, affrontando direttamente la sfida della mappatura del destino e dei modelli di divisione delle cellule staminali neurali. Questa capacità aumenta la sicurezza predittiva nella validazione precoce di bersagli neurosviluppali e supporta la riduzione del rischio meccanicistica nelle decisioni relative al portafoglio del sistema nervoso centrale. Gli output quantitativi e qualitativi di MADM collocano questa tecnica come strumento fondamentale per l'interrogazione genetica funzionale nei flussi di R&S incentrati sulla neurobiologia.
Il tracciamento della linea cellulare basato su MADM integra le fasi dalla scoperta iniziale all'identificazione dei candidati e alla validazione preclinica nei percorsi mirati al sistema nervoso centrale.