2011년 12월 22일
이러한 세포 마이 그 레이션으로 세포 프로세스 전통적으로 2 차원, 딱딱한 플라스틱 표면에 연구하고 있습니다. 이 보고서는 직접 단백질 지방화를 시각화하고보다 생리학 관련, 3 차원 매트릭스에서 마이 그 레이션 세포의 단백질 역학을 분석하는 기술을 설명합니다.
본 시연의 목적은 3D 매트릭스 내의 살아있는 세포에서 형광 표지된 단백질을 이미징하는 것입니다. 먼저, 형광 표지된 단백질을 발현하는 안정적 세포주를 생성합니다. 이 세포들을 3D 콜라겐 매트릭스에 파종한 다음, 공초점 현미경을 사용하여 이동하는 세포의 타임랩스 이미지를 획득합니다.
궁극적으로, 타임랩스 이미징과 형광 단백질(FP) 분석을 통해 이동하는 세포 내 단백질의 위치와 역동성을 규명함으로써, 3D 및 실시간으로 단백질의 역동성과 국소화를 관찰할 수 있습니다. 이는 세포 이동에 관한 근본적인 질문을 해결하는 하나의 방안을 제공합니다. 예를 들어, 세포질 단백질에 의해 접착 접점이 어떻게 조절되는가와 같은 질문이 이에 해당합니다.
또한, 이러한 접촉이 특정 억제제에 의해 어떻게 교란되는지도 확인합니다. P 35 디쉬에서 세포를 80~90% 밀도로 배양하고, 제조사의 지침에 따라 lipo 2000을 사용하여 목적 플라스미드를 세포에 형질전환합니다. 그런 다음 세포를 배양기에 넣습니다.
다음 날, 세포를 두 개의 P10 50 Petri dish에 나누어 담고 하룻밤 동안 배양합니다. G418 50 µg/mL을 추가하여 배지를 보충합니다. 2주 동안 항생제 선택 배양을 지속합니다.
배양물을 확인하여 G four 18 내성 콜로니를 검사합니다. 그다음, 도립 형광 현미경을 사용하여 GFP 양성 콜로니를 식별하고 표시합니다.
PBS로 세포를 두 번 세척합니다. 두 번째 세척 후, 표시된 각 콜로니가 건조되는 것을 방지하기 위해 얇은 액체 층을 남겨둡니다. 멸균된 면봉을 사용하여 가장자리 주변을 최대한 밀착하여 닦아내고, 콜로니 위에 trypsin 10 µL를 피펫으로 분주합니다.
모든 콜로니에 대해 신속하게 반복하십시오. 그 후, 세포 분리를 위해 플레이트를 37 °C에서 배양합니다. 현미경 하에서 둥근 외형을 확인하십시오.
각 콜로니에 10 µL의 trypsin을 가하고, 피펫팅하여 세포를 플레이트에서 완전히 분리하십시오. 그 다음, 안정적인 콜로니를 증식시키기 위해 각 세포 콜로니를 24-well dish 배양 접시의 개별 웰로 옮기십시오. 이어서, 표준 western blot 및 면역형광법을 사용하여 콜로니의 단백질 발현을 평가하십시오.
선택한 세포주를 배양하고 유리의 표면 개질을 수행합니다. 바닥 접시는 최적의 콜라겐 결합을 제공합니다. 10 millimeter 개구부가 있는 각 P 35 접시의 유리 부분에 300 µL의 실릴화 용액을 피펫으로 분주합니다.
실온에서 1시간 동안 배양합니다. 용액을 흡입하여 제거하고, 여과수로 10분씩 3회 세척합니다. 물을 제거하고 접시를 50 °C 핫플레이트 위에 1.5시간 동안 둡니다.
건조를 위해 디쉬 뚜껑을 약간 어긋나게 배치합니다. 건조된 디쉬가 식으면 각 디쉬의 유리 부분에 2% glutaraldehyde 용액 300 µL를 피펫으로 분주합니다. 1시간 동안 배양한 후, PBS로 10분씩 3회 세척합니다.
디쉬를 1시간 동안 UV 광선에 노출시켜 멸균합니다. 먼저 원심분리를 통해 100 µL의 형광 추적 입자를 펠렛화합니다. 상층액을 제거하고 입자를 500 µL의 배지에 재현탁합니다.
5회 세척한 후, 입자를 30 µL의 배지에 다시 현탁합니다. 다음으로, 트립신을 사용하여 GFP 발현 세포를 수확하고, 이노르 튜브(einor tube)에 mL당 200만 개의 세포 현탁액을 준비합니다. 성장 배지 240 µL를 피펫으로 취합니다. 여기에 1 M HEPES 12.6 µL, 여과수 20 µL, 세포 용액 50 µL, 그리고 형광 입자 10 µL를 추가합니다.
마지막으로, bovine dermis collagen 167 µL를 추가하고 솔루션 믹스를 충분히 혼합합니다. 이제 준비된 siloized dish의 유리 부분에 80 µL를 옮깁니다. 겔이 중합될 수 있도록 37 °C에서 50분 동안 배양합니다.
그런 다음 성장 배지 2 mL를 조심스럽게 추가합니다. 현미경 챔버를 37 °C의 안정된 상태 온도로 평형화하고 세포 배지를 보충합니다. DIC 이미징을 위해 중성 pH를 유지하려면, 파라폼 얇은 스트립이 부착된 유리 덮개로 디쉬의 상단을 교체하십시오.
오일 침전 렌즈를 사용할 때 증발을 방지하기 위해 디쉬의 측면을 덮습니다. 대물렌즈 위치에 침전액 한 방울을 떨어뜨립니다. 디쉬가 담긴 콜라겐 겔을 현미경 스테이지 위에 올려 디쉬가 침전액과 접촉하도록 합니다.
스테이지 드리프트를 최소화하기 위해 샘플의 초점을 맞추고 이미징할 관심 세포를 찾습니다. 디시가 안정될 때까지 약 45분 동안 둡니다. 장시간 캡처를 시작하기 전에 억제제 첨가 실험을 위한 이미지 획득 파라미터를 지정하십시오.
원하는 최종 농도로 약물이 첨가된 보충 배지를 준비합니다. 중성 pH를 유지하기 위해 세포 배지를 보충하되, 퍼필(perfil)로 밀봉하지 마십시오. 샘플을 현미경으로 옮기고 약물 처리 시점에 맞춰 이미징을 진행합니다.
이미지를 일시 정지하고, 디시를 건드리지 않은 상태에서 조심스럽게 디시 덮개를 캡처하여 제거합니다. 배지를 흡입하고 약물이 포함된 배지를 디시에 피펫으로 분주합니다. 그런 다음 조심스럽게 디시 덮개를 다시 닫습니다.
최적의 FRAP 설정은 시스템마다 다릅니다. 따라서 제조사의 지침서를 참조하십시오. 먼저 살아있는 세포 이미징을 위한 파라미터를 설정합니다.
광퇴색(photobleaching)을 위한 단계입니다. 연습 세포에서 이러한 파라미터를 테스트하여 세포를 손상시키지 않으면서 형광 신호를 광퇴색시킬 수 있는 충분한 레이저 강도를 확보하십시오. 그런 다음, 최소 5프레임을 획득하여 샘플의 이미지 캡처를 시작하십시오.
그런 다음 관심 영역을 광퇴색시킵니다. 회복 시간 동안 계속해서 캡처합니다. 통계 분석 소프트웨어를 사용하여 광퇴색 전후의 광퇴색 영역의 평균 형광 강도를 시간에 따라 측정합니다.
회복 곡선을 지수 방정식에 맞춥니다. 지수 피팅 곡선으로부터 반감기와 최종 강도에 대한 파라미터를 구합니다. 그런 다음 초기 형광 강도 대비 최종 형광 강도의 비율을 통해 이동 분율(mobile fraction)을 계산합니다.
이 3D 생세포 이미지들은 GFP actin을 발현하는 건강한 상피 세포들을 보여줍니다. 4일간의 배양 후, 이 세포들은 3D 콜라겐 매트릭스 내에서 낭종을 형성했습니다. 일부 세포는 낭종의 표면을 따라 이동했으며, 다른 일부 세포들은 낭종 내부에서 이동했습니다.
이동하는 세포가 가하는 견인력으로 인한 매트릭스 변형은 주변 매트릭스에 내장된 추적 입자의 변위 분석을 통해 측정됩니다. 여기에서는 RO kinase 억제가 견인력에 미치는 영향이 나타나 있습니다. 추적 입자의 움직임은 서로 다른 시점의 최대 투영 이미지로 표시되며, 각 시점은 유사 색상으로 구분되어 있습니다.
또는, 개별 추적 입자의 이미지를 몽타주 형태로 표시하여 추적 입자의 움직임을 보여줍니다. 시간이 지남에 따라, 이 추적 입자는 Y 2 7 6 3 2 첨가 전후로 각각 이동하는 세포의 후방 가장자리 쪽으로 가까워졌다가 멀어졌습니다. FRAP 분석은 3차원 매트릭스 내에서 이동하는 GFP actin 발현 세포를 추적하여 전형적인 형광 회복을 나타냅니다. 최적화된 레이저 설정으로 광퇴색 실험을 수행한 후, 세포의 건강과 손상 없는 상태를 유지하면서 관심 영역의 형광 강도가 배경 수준에 비해 눈에 띄게 감소합니다.
이 그래프는 지수 함수를 이용한 회복 곡선의 적합도를 보여줍니다. 숙련되면 매트릭스에 세포를 파종하는 데 한 시간이 소요될 수 있습니다. 3-아미노프로필 트리메틸실란(three amino propyl trimethyl)을 다루는 것은 매우 위험할 수 있다는 점을 잊지 마십시오.
따라서 화학 흄 후드 내에서 작업하는 것과 같은 예방 조치를 취하십시오. 또한 3D 매트릭스 내에서 세포를 다룰 때는 무균 상태를 유지해야 함을 기억하십시오.
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본 보고서는 3차원 콜라겐 매트릭스 내에서 이동하는 살아있는 세포의 형광 표지 단백질을 이미징하는 기술을 제시합니다. 이 방법은 전통적인 2차원 표면에 비해 생리학적으로 더 관련성이 높은 환경에서 단백질의 위치와 역동성을 시각화할 수 있게 해줍니다.
생리학적으로 유의미한 3D 환경에서 단백질 동역학을 연구하면 세포 이동 시 힘을 생성하는 단백질의 기계적 역할을 밝혀내어 표적 검증 능력을 향상시킬 수 있습니다. 이러한 접근 방식은 세포골격 동역학을 암 전이 및 상처 치유와 관련된 조직 침습 과정과 연결함으로써 전임상 모델의 예측 신뢰도를 높여줍니다. 이 방법은 단백질 위치와 매트릭스 변형을 실시간으로 직접 시각화함으로써 치료 가설의 기계적 리스크를 제거할 수 있게 합니다.
이 방법은 질병 관련 3D 환경에서 단백질 역학의 실시간 정량 분석을 가능하게 함으로써, 가설 검증부터 리드 물질 식별에 이르는 발견 연속체에 통합됩니다.