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— 微小RNA(miRNA)是一类参与基因调控的小分子非编码RNA。在癌症发生过程中,miRNA的表达水平会发生改变,因此具有作为癌症生物标志物的潜力。开始进行miRNA分离时,取新鲜采集的全血样本,在4摄氏度下离心,以分离血浆与血细胞。将上清液转移至新的离心管中,再次离心以获得更澄清的血浆上清液。吸取上清液后,加入预冷的匀浆液进行处理,随后加入裂解缓冲液以充分匀浆样本。加入蛋白酶K酶溶液以降解蛋白质,特别是那些在后续实验步骤中可能降解RNA的核酸酶。
— 接下来,将裂解液加入预组装的核酸提取仪专用 cartridge 的指定孔中。向相应孔中加入 DNase 1 溶液,以去除样品中的基因组 DNA。向 cartridge 上组装的洗脱管中加入无核酸酶水,用于 miRNA 分离前的预处理。将 cartridge 组件装入核酸提取仪中。选择并运行相应的 miRNA 纯化程序。完成后,取出含有 miRNA 的洗脱管,于 -80 摄氏度保存。
- 在以下实验方案中,我们展示了从肺癌筛查患者的血液样本中提取miRNA的方法。
— 开始本实验方案时,使用真空采血管采集10毫升全血样本,并在室温下保存。
– 避免在低温(如 4 摄氏度)下储存全血,以防热休克和细胞裂解导致非特异性微小 RNA 释放。
-在采血后一小时内离心血浆以进行分离。转移上清液时需避免接触淋巴细胞环,将上清液转移至15毫升离心管中。然后在相同条件下再次离心上清液。分装1毫升该血浆上清液至1.5毫升冻存管中,注意避免吸取管底的血浆组分。开始RNA提取时,每个样本向200微升血浆中加入200微升预冷的OMG溶液。为确保充分均质化,涡旋振荡15至30秒。为均质化样本,每个样本加入200微升裂解缓冲液和25微升蛋白酶K,涡旋振荡20秒。
— 然后将样品置于37°C的恒温混匀仪中孵育15分钟。接着,选择RSC miRNA组织方法,并为每个样品在核酸自动提取仪的载样盘上装载一个提取柱,正确安装活塞。将裂解液转移至仪器提取柱的指定位置,并加入5 µL DNase 1溶液。在每个洗脱管底部加入60 µL无核酸酶水。启动运行程序,开始自动化纯化过程。将获得的总RNA样品储存于-80°C。