2011年5月6日
在哺乳动物系统中常用的程序性细胞死亡检测方法,如DNA梯状条带分析或TUNEL检测,通常在植物中难以重复。结合GUS报告系统,我们提出一种快速的基于植物的瞬时检测方法,用于分析特定基因潜在的致死特性。
本实验的总体目标是利用 Gus 报告系统分析特定基因潜在的致死特性。将目标基因克隆至 Gus 表达盒中,并在 35S 启动子驱动下,通过相应的农杆菌载体在农杆菌菌株 LBA4404 中进行培养。随后,将这些载体与含有 Gus 表达盒的菌液混合,共同侵染尼克氏烟草(Nicotiana occidentalis)叶片。
可通过组织化学染色目视评估 Gus 活性,或通过荧光定量 mug 测定进行定量分析。与现有方法(如 DNA 梯状电泳或 TUNEL 测定)相比,该技术的主要优势在于,后者常用于哺乳动物系统,但在植物中难以重复;而本方法是一种灵敏、快速的基于植物的瞬时测定方法,其原理基于一个简单的事实:细胞存活是 Gus 表达发生的必要条件。今天演示该实验操作的是 Hua RAOs。
我们实验室的一名博士后研究助理指出,该侵染实验需要使用在25摄氏度下培养的三至六周龄烟草本氏烟(Nicotiana benthamiana)植株上充分展开的健康叶片。本实验计划在八天内完成。第一天,将含有细胞死亡检测载体的农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)甘油菌株以及含有Gus表达盒的载体菌株划线接种;当同时测试多个培养组合时,还需始终包含一个空载体作为阴性对照或填充对照。
将平板在28摄氏度下孵育两天。第三天,从每块平板上挑取单菌落接种至2毫升选择性LB培养基中。将每种培养物在28摄氏度、200转/分钟的振荡条件下孵育24小时,直至达到最大生长密度。
孵育24小时后,若出现菌体聚集,用移液器将培养物彻底重悬,并加入新鲜的选择性LB培养基,使每份培养物的总体积增至10毫升,以诱导农杆菌毒力基因的表达。加入丙酮至终浓度为25微摩尔,并在28摄氏度下振荡培养每份菌液16小时。下一步是将每份菌液在室温下以4,000 ×g离心10分钟,然后将沉淀重悬于10毫升浸润介质中。
不要添加丙酮,再次离心菌液,但此次用重悬缓冲液将每个沉淀重悬于5毫升含有100微摩尔丙酮的侵染培养基中。现在测量600纳米处的OD值。
浓度低至 0.1 是可接受的,但如果高于 0.9,则在浸润前用浸润介质和丙酮稀释至 0.9。在培养后,再次于 28 °C 条件下振荡培养三小时。将实验培养物与对照培养物按 1:1 比例与含有 Gus 盒的培养物混合。
对于每种培养物,使用一支1毫升无针注射器将ABA溶液注入密封处或新长出叶片的背面。渗透体积无需精确控制。当出现水浸状区域时,表明注入量已足够,此时在同一植株的相对两侧叶片上分别注入阴性对照和待检测基因,然后以相同方式再对另外两株植物进行渗透。
因此,每种培养条件对应三株植物。侵染后三天,即可采集叶片并检测GUS蛋白的表达。开始组织化学分析时,用X-Gluc底物对整片叶片进行真空浸润,直至叶片完全浸透。
现在,将叶片在室温下避光孵育过夜,或直至出现明显的蓝色染色。用蒸馏水冲洗叶片,然后将其置于70%乙醇中孵育过夜,直至叶绿素完全去除。第二天,用蒸馏水冲洗叶片,并检测GUS表达水平。
为了定量Gus表达,将底物mug转化为荧光产物mu,可通过以下步骤进行测定:首先在研钵中用液氮研磨浸润的叶片圆片。然后在保持样品处于冰上的条件下加入100 µL GUS提取缓冲液。接着在4°C下以14,000 ×g离心5分钟,收集含有总可溶性蛋白(包括Gus)的上清液。
使用NanoDrop测定总可溶性蛋白浓度,并用Gus提取缓冲液将每个样品的浓度调整至100微克总蛋白。然后,向每个样品中加入Gus提取缓冲液配制的mug底物,使终浓度为2毫摩尔mug。每个样品总体积为100微升,用移液器混匀后,在37摄氏度孵育反应1小时。
反应1小时后,加入800 µL GUS终止缓冲液以终止反应。为进行定量,将每份样品各100 µL加入微孔板中,在酶标仪中检测荧光,激发波长为365 nm,发射波长为455 nm,所得结果与标准曲线比较,GUS活性可表示为每分钟每微克总可溶性蛋白所对应的µmol产物量。根据所使用的构建体不同,可检测到不同的GUS表达水平;当GUS表达盒与细胞死亡负调控因子或抗凋亡基因共浸润时,GUS活性水平会发生相应变化。
相比之下,观察到较高的Gus表达水平。空载体对照组中的Gus水平则低得多。相反,当使用细胞死亡的正向调控因子或促死亡基因时,与空载体对照组相比,Gus表达显著降低。
一旦掌握,该技术可在大约一周内完成。在实施该操作时,需牢记此技术仅作为初步步骤,用于评估特定基因的潜在功能。后续还需开展进一步工作,以验证这些初步结果,并确定所涉及细胞的类型。
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本研究介绍了一种利用GUS报告系统的快速植物瞬时检测方法,用于分析特定基因的潜在致死特性。该方法解决了在植物系统中重现哺乳动物程序性细胞死亡检测所面临的挑战。
这种基于植物的GUS报告基因检测方法为细胞死亡通路中基因功能的初步筛选提供了一种快速且灵敏的技术,弥补了将哺乳动物凋亡机制转化为植物系统时的关键空白。该方法能够对促死亡和抗死亡调控因子进行早期功能分析,从而支持在发现生物学研究中进行靶点验证和机制层面的风险评估。其定量与可视化读数有助于在投入资源建立下游临床前模型之前,开展假设检验并优先筛选遗传靶标。
该检测方法适用于早期发现阶段,通过提供功能性读出结果,支持靶点验证和先导化合物的鉴定,从而在投入哺乳动物或复杂的临床前模型之前,为是否继续推进的决策提供依据。