TALEN介导的靶向基因整合:利用工程化序列特异性核酸酶将荧光蛋白基因精确插入hiPSCs

0 次观看4:24 分钟 • July 8th, 2025

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从含有培养基的人诱导性多能干细胞(hiPSC)悬液开始。加入一对编码转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN)的质粒。补充含有荧光蛋白基因的供体质粒,该基因与抗生素抗性基因相连,并带有相邻的同源臂,可特异性地与目标位点对齐。

通过电穿孔处理该混合物,使细胞膜形成瞬时孔隙,从而实现质粒的内化。质粒进入细胞后,编码TALEN的质粒被加工表达,产生TALEN蛋白——一类嵌合蛋白,由特异性的TALE DNA结合域与非特异性的FokI限制性内切酶切割域融合而成。

每条 TALEN 单体通过其 DNA 结合域——包含串联的氨基酸重复模块——识别并结合 DNA 双链上相反取向的靶位点,每个模块对应一个核苷酸,两结合位点之间由一段间隔序列分隔。随后,FokI 结构域发生二聚化,并在间隔序列内切割 DNA,产生带有突出末端的双链断裂。

当存在含有与切割位点侧翼区域互补的同源臂的供体质粒时,将利用同源序列作为DNA修复合成的模板,通过同源定向修复来连接双链断裂。在切口连接完成后,中间的荧光蛋白基因和抗生素抗性基因被整合到宿主基因组中。

将接种在饲养细胞层上以支持生长的hiPSCs用含抗生素的培养基处理。该无启动子的抗生素抗性基因由上游内源性启动子驱动,可实现对TALEN编辑细胞的筛选。

首先用 PBS 将 iPSC 培养物各洗涤一次,然后向每孔加入 1 毫升 37 摄氏度的温和细胞解离试剂,在 37 摄氏度下孵育约 5 分钟。当超过 50% 的细胞从培养容器上解离时,使用 P1000 移液器机械性地破坏任何残留的细胞团块或贴壁细胞。随后,向每孔加入 2 毫升 E8 培养基,并使用 10 毫升移液器进一步将细胞团解离为单细胞悬液。

现在,将收集的细胞倒入一个15毫升的锥形管中,离心沉淀。用少量E8培养基重悬细胞沉淀,进行细胞计数。然后,通过台盼蓝排斥法确认细胞培养物的活力及其充分解离后,将300万个细胞分别转移至两个15毫升的锥形管中。

在细胞离心的同时,将电穿孔系统设置为人胚胎干细胞系 H9 对应的细胞类型特异性程序。然后,向 1 个细胞沉淀中加入 10 微克同源重组供体质粒,作为对照样本;向另一个细胞沉淀中加入 10 微克同源重组供体质粒以及每种 TALEN 质粒各 5 微克,作为实验样本。

接下来,向每个对照组和实验组细胞沉淀中加入 100 µL 室温的完整 P3 原代细胞转染溶液,并重悬细胞。将样品转移至各自的电转杯中,然后进行电穿孔转染。转染后立即向每个电转杯中加入 500 µL 室温 E8 培养基,随后将转染后的 iPSC 样品逐滴转移至含有 DR4 小鼠胚胎成纤维细胞的各个 10 厘米培养皿中。

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最后更新:22 八月 2026