2020年7月3日
本文提供了标准化的实验方案,用于在分子水平上通过RT-qPCR检测秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)热休克反应(HSR)的诱导,在细胞水平上利用荧光报告系统进行检测,以及在个体水平上通过热恢复能力进行评估。
热激反应是一种重要的细胞应激反应通路,可维持秀丽隐杆线虫细胞质内的蛋白质稳态,并可在分子、细胞和个体水平上对其进行表征。本文介绍了一系列标准化的实验方案和最佳实践,可在线虫中 robust 地诱导热激反应,以促进该领域研究的可重复性。我们证明,常用于个体水平检测的耐热性实验并不依赖于热激反应。
相反,我们建议使用依赖于热休克反应的个体水平检测方法——热恢复实验。热休克反应会随着产卵开始而减弱。因此,在热休克反应实验中,发育时间是一个必须考虑的关键变量。
首先建立一个同步化的线虫群体。使用铂金丝挑取约10条带有卵的成虫转移至新鲜培养板中。确保去除随成虫一同转移的任何卵或幼虫。
让线虫产卵一小时,然后将成虫从培养皿中移除。将同步化的线虫在20摄氏度条件下培养至所需发育阶段,需注意发育时间因品系不同以及培养温度差异而有所变化。当线虫准备进行热激处理时,用石蜡膜包裹培养皿,并使用带有铅块的试管架将其完全浸入33摄氏度的循环水浴中,持续一小时。
从水浴中取出培养板,用纸巾擦干。移除石蜡膜,将线虫在20摄氏度下恢复6至24小时,此时间足以完成GFP的合成。为准备成像用的载玻片,将待用的载玻片置于另外两个载玻片之间,这两个载玻片上需贴有实验室胶带条。
在水中配制3%的琼脂糖溶液,放入微波炉加热至琼脂糖完全溶解。然后使用1 mL移液器吸取约150 µL琼脂糖溶液,置于载玻片中央。立即用一片空白载玻片覆盖,将其垂直放置,使其接触实验室胶带并平稳覆盖,然后小心取下。
为了固定线虫,先在琼脂糖垫的中央加入一滴1毫摩尔的左旋咪唑(levamisole)M9缓冲液,然后用铂金丝挑取10条线虫转移至液滴中。可选步骤:将左旋咪唑向琼脂糖垫外缘推开,并在线虫瘫痪后用铂金丝将其排列整齐。盖上盖玻片,并立即使用荧光显微镜进行成像。
进行热恢复实验时,先同步线虫,并在20摄氏度下培养至所需发育阶段。随后进行6小时的热激处理。将培养板从水浴中取出,在20摄氏度下恢复培养48小时。
恢复后,计数那些在机械刺激后能够立即爬行离开、且无抽搐或麻痹现象的线虫数量。为了在细胞水平上观察热激反应的诱导情况,分析了两种带有荧光报告基因的秀丽隐杆线虫品系。在未进行热激的阴性对照样品中,hsp-16.2 报告基因表现出正常的自发荧光,而 hsp-70 报告基因在肛门舒张肌中呈现组成型荧光。
热激一小时后,当使用RNAi在检测报告基因诱导之前敲低hsf-1时,两个报告基因均观察到强烈的荧光信号。两种菌株的荧光均显著减弱,表明这些报告基因的表达依赖于hsf-1。为了在分子水平上定量热激反应的诱导情况,采用rt key PCR检测了两种内源性热激蛋白。
研究发现,33摄氏度、持续一小时的热激可使两个热激基因的相对表达量增加2,000倍以上。热恢复实验表明,经历六小时热激后,在48小时恢复期结束时,正常运动的线虫比例下降了20%。hsf-1基因敲低导致线虫正常运动能力显著下降,超过95%的线虫在受到刺激后表现出抽搐性运动或瘫痪。
相比之下,hsf-1 的敲低对热耐受性实验的结果没有显著影响,在该实验中,线虫被暴露于持续的 35 摄氏度温度下,并在不同时间点测量存活线虫的百分比。首次进行该技术操作时,务必用石蜡膜将培养板包裹两层,以防止水分进入培养板而破坏实验。分子检测可进一步扩展为利用 RNA-seq 进行基因组分析。
其他受热激反应影响的生物体水平检测也可包括在内,例如寿命测定。在秀丽隐杆线虫中,能够关联分子、细胞和生物体水平的热激反应检测,已被证明对于理解该通路在发育和疾病中的作用具有重要价值。
本文介绍了在分子、细胞和个体水平上评估秀丽隐杆线虫热激反应(HSR)的标准化方案。研究强调了发育时期的重要性,并建议将热恢复作为检测HSR的可靠实验方法。
对秀丽隐杆线虫(C. elegans)热休克反应进行标准化测量,可对与神经退行性疾病及衰老研究相关的蛋白质稳态机制进行可重复的评估。该方法通过整合分子、细胞和个体水平的检测指标,支持在早期发现工作流程中进行靶点验证和机制层面的风险评估。发育时间控制的优化有助于在不同模式系统间转化研究结果时提高预测的可信度。
该方法适用于从早期发现到临床前研究的阶段,通过多层次热休克反应评估,支持基于假设的筛选及先导化合物优化。