2020年6月24日
本文描述了从MCF7细胞融合单层的共聚焦图像中定量分析1)黏着斑的大小和数量,以及2)细胞形态指数及其分布。
本方案可实现从细胞内结构的二维图像中对其面积、周长和形态进行定量分析。该技术快速简便,仅需常规实验室设备和共聚焦显微镜,并使用开源软件。本实验操作由本实验室的博士研究生 Anna Balcerak 演示。
首先,在四孔胶原蛋白I型包被的腔室载玻片中,每孔加入5 × 10⁴个细胞和0.5毫升培养基,于37°C、5% CO₂培养箱中培养24小时。次日早晨,使用倒置光学显微镜确认细胞形成至少90%融合的单层,并使用共聚焦显微镜获取单个Z平面图像。进行黏着斑分析时,在ImageJ中打开图像,选择“分析”→“设置尺度”→“移除尺度”,并设为全局模式,以设定图像的像素尺度。
为了在测量选项中包含文件名和感兴趣区域的面积,请点击“analyze”(分析)并选择“set measurements”(设置测量),然后勾选“area”(面积)和“display label”(显示标签)选项。为了减去背景,请选择“process”(处理)中的“subtract background”(减去背景)。将滚动球半径设置为50像素,并勾选“sliding paraboloid”(滑动抛物面)。
为了确定最小感兴趣区域的面积,勾勒出最小的单个黏着斑,然后点击“分析”和“测量”以测定其面积。当至少选择并测量了20个感兴趣区域后,计算并保存所得结果的平均值。将上限设定为典型细胞面积的25%。
为将图像转换为二值图像,点击图像、调整、阈值,选择默认、黑白模式和暗背景。为测量感兴趣区域的数量和面积,选择分析和分析颗粒,并勾选像素单位、显示结果、清除结果和汇总。将汇总窗口中的切片、计数和总面积平均大小数据转移至所选的数据管理程序中。
进行黏着斑定量时,打开ImageJ中的黏着斑宏程序,并将最小感兴趣区域的面积作为“最小感兴趣区域面积”参数输入。将阈值类型设置为手动或自动,并保存更改。然后在ImageJ中调用该宏程序,并选择待处理的图像。
进行人工细胞形态分析时,在合适的图像处理软件中打开图像,并选择需要测量的参数。使用手绘选择工具,根据所选的连接蛋白标记的手动勾画细胞边界。每个细胞的各项选定参数将被自动计算。
当所有细胞均被勾画完毕后,选择“编辑”、“选择”和“添加到管理器”。仅应选择边界完整且完全可见的细胞。为进行测量,在兴趣区域管理器左侧框中选中所有出现的编号,然后点击“测量”。
结果将显示在结果框中,并可导入至选定的电子表格中。自动细胞分析有助于对大量细胞进行定量。针对每一种新的细胞类型,需首先运行宏程序以确定参数。
宏运行结束后,选择设置细胞大小边界。单击最小和最大细胞的标签,然后单击“测量”。设置最小细胞和最大细胞变量的数值,并保存更改。
关闭所有宏窗口,选择要以灰度处理的图像,然后再次运行宏。宏将生成一个结果表格,其中包含细胞形状指数、长宽比以及感兴趣区域选择列表的数据。
在此,可以观察到使用 ImageJ 计数的黏着斑的代表性图像,其中包括对照组和敲低细胞系的最终编号轮廓,以及黏着斑轮廓与原始图像的叠加结果。如本分析所示,与对照细胞系相比,敲低细胞每细胞的黏着施数量更多,且黏着斑尺寸更大。在这些图像中,展示了未经处理和经化学治疗处理的细胞单层的代表性区域。
根据细胞形状指数值对轮廓细胞进行表征,例如在本分析中显示,与未处理的对照细胞相比,药物处理细胞的最后一个区间值增加,主峰趋于平缓。随后可为每种细胞培养生成频率分布和累积分布。如图所示,对单层细胞进行灰度成像,实现了对来自12个视野的512个细胞的分析与定量,揭示了细胞形状指数的相对频率分布。
为了使本实验方案成功实施,使用尽可能高质量的图像至关重要。正确的细胞接种、染色和成像操作应确保获得足够实验质量的图像。
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本文详细介绍了一种利用共聚焦成像技术对MCF7细胞融合单层中的黏着斑和细胞形态指数进行定量分析的实验方案。该研究强调了如何通过常规的成像技术来分析黏着斑和细胞形态的变化。
定量分析黏着斑动态和细胞形态分布可为癌症细胞行为提供机制性见解,有助于肿瘤药物研发中的靶点验证。本方案可实现对黏附和形态的可重复、基于图像的评估,促进表型筛选和临床前模型的特征鉴定。该方法通过将分子扰动与治疗反应相关的功能性细胞输出相联系,支持基于数据的决策判断。
该方法适用于从靶点假设验证到先导物发现,再到临床前验证的整个发现流程,尤其适用于癌症力学生物学领域。