2023年12月1日
本文介绍了一种基于聚二甲基硅氧烷(PDMS)的双层装置的制备方法,用于在油包水乳液(液滴)中生成组合文库。方案中详细描述了实现液滴自动化生成所需的硬件和软件,并展示了荧光液滴定量文库的制备过程。
我们肿瘤学系统生物学研究团队采用计算与实验相结合的方法,揭示塑造肿瘤微环境的复杂机制。我们基于临床数据和癌症生物学建立数学模型,以识别影响个体治疗反应的关键因素,最终目标是提升精准肿瘤学的水平。鉴于肿瘤对治疗反应具有异质性和动态性,扰动生物学已显示出克服基因组生物标志物局限性的潜力。
我们的方法是将具有接受能力的肿瘤细胞进行广泛的抗癌药物筛选,以鉴定肿瘤的表型特性,从而确定更有效的抗癌治疗方案。微流控技术是一种有价值的技术,可通过将少量样本(如肿瘤活检样本)分配到独立的区室(如液滴或塞段)中,实现对微量样本的分析。该技术还可控制每个塞段的化学成分,从而生成多种化学性质不同的塞段群体。
本文介绍了一种完全基于聚二甲基硅氧烷(PDMS)的装置,其中流体流动由压力驱动的Quake阀进行调控,从而实现对不同液滴群体的快速、可控且可编程的生成。此外,由于Quake阀本身也由PDMS制成,因此可无缝集成到装置的制备过程中。将从癌细胞高通量组合筛选中获得的数据与数学模型相结合,将有助于我们研究调控肿瘤微环境行为的信号通路。
这项研究将为精准肿瘤学的新策略铺平道路,为针对个体患者制定个性化治疗方案提供理论依据。首先,为微流控装置的每个控制通道截取一段PTFE管。在一端插入一根23号、0.5英寸鲁尔接头短针的针头。
将鲁尔接头连接至雄性鲁尔接头,然后将连接器插入一段聚氨酯管中。将聚氨酯管的另一端直接连接至电磁阀。
接下来,将一个23号、0.5英寸的鲁尔接头短管连接到注射器末端。用注射器吸取水。将聚四氟乙烯(PTFE)管的自由端连接到注射器上。
注入水,直至管路约一半位置。然后将管路从注射器上断开,并将游离端插入相应控制通道的打孔中。重复此操作,直至每个控制通道均连接至对应的电磁阀。
接下来,启动主界面程序。按下“Pressurize All Control Channels”选项以打开阀门。这将推动管路中的液体进入微流控装置的控制通道,从而将其充满。
对于每一种水相试剂,截取一段足够长的聚四氟乙烯(PTFE)管,以连接泵与微流控装置的入口。将一根23号、0.5英寸的鲁尔接头短管连接到注射器的一端。用所需的试剂填充注射器。
将试剂注入管路,直至管路充满。将管路的游离端插入微流控芯片上对应的试剂入口。通过软件,向每个入口的水相试剂施加400毫巴的压力。
使用主界面程序依次单独对控制通道进行减压。如有必要,可点击程序中“控制通道手动加压”标签框内的相应图标,以驱动各个阀门。在对油试剂重复加压操作后,点击“对所有控制通道减压”以同时对所有通道进行减压。
现在单击“Pressurize All Control Channels”以重新加压控制通道。通过在CSV文件中对每个液滴群的组成、序列和重复次数进行编码,并用“0”标记需要打开相应入口的控制通道,或用“1”标记需要关闭的控制通道。该文件将作为主界面程序中自动实验的输入文件。
接下来,单击“实验文件”选项卡中的文件夹图标以加载 CSV 文件。输入相关字段,例如实验重复次数、减压时间以及加压时间。然后在“条形码进样通道”部分选择对应条形码生成的进样通道,并设置其开启持续时间。
或者,可将条形码直接硬编码到输入的 CSV 文件中。现在将入口油相试剂的压力从 400 毫巴降低至 200 毫巴。接着,将一段 PTFE 管路连接至出口,用于收集液滴。
使用预填充的管路来平衡出口处的压力差。最后,按下“运行实验”以启动程序并开始生产。阀门能够在输入压力约为800毫巴时调节液体流动。
在 1200 毫巴时,输入压力过高,无法进行流量调节。当蒸馏水在恒定压力下注入时,流速降至零。减压后,流速恢复至驱动前的水平。
然而,在恒定流速下,阀门驱动未能实现入口的完全关闭。为了验证该装置的功能,生成了一个定量的组合液滴库。
本文介绍了一种基于聚二甲基硅氧烷(PDMS)的双层装置的制备方法,该装置用于在油包水乳液中生成组合文库。本方案详细说明了实现液滴自动生成所需的硬件与软件,并展示了构建定量荧光液滴文库的过程。
利用双层微流控装置进行高通量组合式微栓生产,可实现对有限患者来源样本中药物反应的快速、可编程筛选。该技术解决了在肿瘤学表型筛选和通路分析中生成定量且化学性质不同的反应区室的难题。其与计算建模的整合,可在关键的发现转折点提供预测可信度和机制层面的风险降低支持。
这种双层微流控平台适用于从早期发现到先导化合物筛选及临床前研究的全过程,尤其适用于专注于肿瘤学的研究流程。