2024年10月4日
现有的多能干细胞(PSC)向功能性细胞分化的体系目前受到严重的细胞系间和批次间变异性的阻碍。本文以心肌细胞分化为主要示例,介绍了一种基于图像的机器学习方法,用于智能监测和调控PSC分化过程的实验方案。
本研究基于活细胞明场图像,开发了一种利用多种机器学习模型的策略。该策略能够以非侵入方式识别细胞谱系,实时调控分化过程,并优化分化方案,从而提高多能干细胞向功能性细胞分化过程中的稳定性。多能干细胞具有在体外分化为多种细胞类型的潜力,可用于细胞治疗、疾病建模及药物开发。
在PSC分化细胞生产过程中,主要问题之一是细胞系和批次之间的不稳定性。这常常导致需要重复进行多次实验,耗费大量时间和劳动力。目前,最先进的显微成像技术能够支持对活细胞进行长期延时、高通量的图像采集。
与此同时,快速发展的机器学习方法正越来越多地应用于细胞图像分析,这为识别细胞培养过程中分化阶段的特定细胞组分或细胞图像提供了可能。该方法有望被应用于标准化其他细胞命运诱导系统,例如类器官分化、直接转分化或细胞重编程,特别是对于需要多步骤和复杂诱导因子的不稳定系统。此外,我们的策略可与其他技术兼容,有望整合为一个自适应闭环系统,实现体外PSC分化的全自动处理。
本研究利用机器学习技术,解决多能干细胞(PSC)分化过程中存在的变异性问题。以心肌分化为主要示例,该研究提出了一种非侵入性策略,用于实时监测和调控PSC分化过程,旨在优化实验方案并提高结果的一致性。
多能干细胞(PSC)分化过程中存在的细胞系间和批次间差异,对药物发现和细胞治疗流程中的可重复性与可扩展性构成了重大挑战。将活细胞成像与机器学习相结合,可实现对分化过程的实时、非侵入性监测与调控,有助于提高预测可靠性并推动标准化。该方法通过降低生物学风险、实现功能性细胞类型的稳定生产,直接促进了早期发现、检测方法开发及转化研究等工作的开展。
这种基于活细胞成像的机器学习策略贯穿从早期发现到先导物识别及临床前研究的全过程,既支持假设验证,也支持标准化细胞制造。