2012년 10월 31일
여러 후보 생체의 높은 처리량 검증은 동결 / 해동 사이클을 최소화하고 귀중한 플라즈마 샘플을 사용하기 위해 순차적 엘리사에 의해 수행 할 수 있습니다. 여기, 우리는 순차적으로 여섯 가지 검증 플라즈마 생체에 대한 ELISAs을 수행하는 방법을 보여줍니다 1-3 이식 - 대 - 호스트 질환 (GVHD)의 4 동일한 플라즈마 샘플 있습니다.
다음 실험의 전반적인 목적은 고처리량 순차적 ELISA를 사용하여 프로테오믹스로 발견된 수많은 새로운 바이오마커를 효율적으로 분석하는 것입니다. 먼저 소스 플레이트에 샘플을 첨가하여 각 바이오마커의 희석액을 생성하고 테스트 간에 회수된 혈장을 보관함으로써 이를 달성합니다. 그다음, 각 단백질에 대해 ELISA를 수행하여 환자 샘플 내의 농도를 결정합니다.
궁극적으로, 급성 이식편대숙주병의 임상 증상이 나타나는 시점에 이러한 바이오마커들의 단백질 수준 상승을 평가할 수 있습니다. 기존 방법들과 비교했을 때 이 기술의 주요 장점은 연속 분석기를 통해 다중 분석 플랫폼으로는 항상 가능하지 않은 여러 가지의 새로운 단백질을 분석할 수 있다는 점입니다. 이 기술의 응용 범위는 급성 이식편대숙주병의 진단까지 확장됩니다.
이 방법을 통해 검증된 바이오마커들은 현재 임상 진료를 위해 연구되고 있습니다. 이 방법은 외상 후 조혈모세포 이식의 합병증에 대한 통찰을 제공할 수 있을 뿐만 아니라, 폐 이식 합병증, 폐암 또는 진단용 혈액 검사가 유용한 잠재적 모든 질환의 바이오마커 발굴 및 검증에도 적용될 수 있습니다.
재현성을 확보하고 배치 간 변동성을 낮추기 위해서는 여러 단계를 일관되게 수행하는 것이 중요하므로, 이 방법의 시각적 시연이 매우 중요합니다. 실험 전날, 해동된 혈장 분주 시료를 15,300 RCF, 4°C에서 10분 동안 원심분리하여 하단의 응고물과 상단의 지질을 혈장에서 분리합니다. 그런 다음, 미리 정의된 맵에 따라 수동 피펫팅을 이용하여 각 시료의 희석되지 않은 혈장 150 µL를 96-well V-bottom 플레이트에 분주합니다. 플레이트를 파라필름(Parafilm)으로 감싸고 4°C의 습도 챔버에 최대 72시간 동안 보관합니다.
다음으로, 제조사의 지침에 따라 IL-2 수용체 알파 및 인간 성장 인자(HGF) 포획 항체를 재구성 및 희석한 후, 각 항체를 50 µL씩 각각의 96-well high binding half well plate의 각 well에 분주합니다. 그런 다음 plate sealer로 plate를 밀봉하고 4 °C에서 하룻밤 동안 배양합니다. 이제 제조사의 프로토콜에 따라 reg three alpha를 제조사 제공 코팅 버퍼로 희석하고, 이 용액 25 µL를 384-well no maxor plate의 각 well에 분주합니다.
그런 다음 실험 첫날에 이 플레이트를 밀봉하여 4 °C에 함께 보관하십시오. IL-2 receptor alpha 테스트 플레이트를 세척하고 TBS 내의 blotto로 블로킹하는 것으로 시작합니다. 표준품을 재구성한 후, 제조사의 프로토콜에 따라 8점 표준 곡선을 설정하십시오.
다음 플레이트에, 원본 플레이트로부터 희석하지 않은 혈장 50 µL와 각 표준 물질 50 µL를 ELISA 테스트 플레이트에 두 번씩 분주합니다. 그런 다음 밀봉된 플레이트를 300 RPM으로 설정된 플레이트 회전기에 넣고 상온에서 배양합니다. 2시간 후, IL-2 receptor alpha ELISA 테스트 플레이트에서 혈장을 회수하여 희석하지 않은 혈장 원본 플레이트로 다시 옮깁니다.
제조사의 프로토콜에 따라 EIA를 완료한 후, 450에서 570 nanometers로 설정된 플레이트 리더를 사용하여 각 웰의 광학 밀도를 측정하십시오. Reg III$\alpha$ ELISA의 경우, 먼저 10 $\mu$L의 희석하지 않은 혈장을 별도의 V-bottom 소스 플레이트로 옮긴 다음, 각 웰에 제조사에서 제공한 희석 버퍼 90 $\mu$L를 추가하여 1:10 희석 소스 플레이트를 만듭니다. 제조사의 프로토콜에 따라 Reg III$\alpha$ ELISA를 완료한 후, 384 웰 플레이트에 정지 용액을 추가하고 450에서 620 nanometers로 설정된 플레이트 리더를 사용하여 각 웰의 광학 밀도를 측정하십시오. 제조사 사양에 따라 IL-10 및 TNF-R1 캡처 항체를 재구성하고 희석한 후, 각각의 96 웰 하이 바인딩 하프 웰 플레이트의 각 웰에 캡처 항체 50 $\mu$L를 코팅하십시오.
그 후, 밀봉된 테스트 플레이트를 실온(elephant 플레이트용) 및 4 °C(TN FFR 플레이트용)에서 하룻밤 동안 배양하십시오. IL-2 수용체 alpha ELISA를 완료한 후, 희석하지 않은 플라스마 60 µL를 새로운 소스 플레이트로 옮깁니다. 그런 다음 각 웰에 PBS 내 1% BSA 60 µL를 첨가하여 1:2로 희석된 플라스마 소스 플레이트를 만듭니다.
다음으로 HGF 테스트 플레이트를 TBS 내의 BLOTTO로 세척 및 블로킹한 후, 8점 표준 곡선 희석액을 준비합니다. 플레이트 세척 및 블로킹 단계를 거친 후, 1~2배로 희석된 혈장과 각 표준물질의 50 µL 분주액을 EISA 테스트 플레이트에 중복으로 분주합니다. 그 다음, 밀봉된 플레이트를 300 RPM으로 설정된 플레이트 회전 장치 위에서 실온의 상태로 하룻밤 동안 배양합니다.
다음 날 아침, HGF ELISA 테스트 플레이트에서 1:2 희석 혈장을 회수하여 1:2 희석 혈장 소스 플레이트에 다시 넣습니다. 제조사의 프로토콜에 따라 EIA를 완료한 후, 실험 2일 차에 플레이트 리더를 450~570 nm로 설정하여 각 웰의 광학 밀도를 측정합니다. 먼저 10 µL의 희석하지 않은 혈장을 새 소스 플레이트로 옮긴 다음, PBS 내 1% BSA 190 µL를 추가하여 200 µL의 1:20 희석 혈장을 만듭니다.
그 후, 제조사의 프로토콜에 따라 ELISA를 완료한 다음, 450에서 570 nanometers로 설정된 플레이트 리더를 사용하여 흡광도를 측정하였습니다. TNF-α FFR의 경우, ELISA는 먼저 1% BSA 및 PBS 25 microliters를 1:20 희석 소스 플레이트에 추가하여 웰당 1:25로 희석된 혈장 125 microliters가 되도록 하였습니다. 그 후 제조사의 프로토콜에 따라 TNF-α FFR ELISA를 완료하고, 450에서 570 nanometers로 설정된 플레이트 리더를 사용하여 각 웰의 흡광도를 측정하였습니다. IL-8 EIA의 경우, 먼저 1:2로 희석된 혈장 60 microliters를 새로운 소스 플레이트로 옮긴 다음, 각 웰에 IL-8 희석액 180 microliters를 추가하여 1:6으로 희석된 혈장 소스 플레이트를 제조하였습니다.
제조사의 프로토콜에 따라 ILH Eliza를 완료한 후, 450에서 570 나노미터로 설정된 플레이트 리더를 사용하여 각 웰의 흡광도를 측정합니다. 마지막으로, 모든 Eliza가 완료되면 사용하지 않은 talk plasma를 thought Eloqua에 다시 넣고 향후 사용을 위해 냉동 보관합니다. 이 그래프에서는 초기 reg three alpha 위장관 이식편대숙주병 바이오마커 보고서를 위해 테스트된 1084명의 환자에 해당하는 reg three alpha 농도를 측정한 7개의 서로 다른 ELIZA 플레이트 표준 곡선의 흡광도가 표시되어 있습니다. 플레이트 간의 일관된 흡광도는 실험 간의 일관된 단백질 농도 측정을 보장합니다.
혈장 샘플 내 단백질 농도는 샘플의 광학 밀도를 표준 곡선 광학 밀도와 비교하여 계산하였습니다. 로봇 자동화 세척 핸들링 플랫폼을 사용하면 ELISA 및 크리에이티브 폼 웰 플레이트를 통해 사용하는 혈장의 부피를 줄이는 동시에 재현성을 더욱 높일 수 있습니다. 이 절차를 계획할 때, 희석하지 않은 혈장으로 EIS를 먼저 수행하여 이후 개발 단계의 실험에서 회수하여 사용할 수 있도록 하는 것이 중요합니다.
이 기술은 단백질체학 분야의 연구자들이 순차적 ELISA의 보편적 활용을 통해 관심 있는 모든 질병의 후보 바이오마커를 탐색할 수 있는 길을 열어주었습니다. 이 영상을 시청하고 나면, 적은 양의 혈장을 사용하고 비특이적 결합을 최소화하면서 순차적 ELISA를 통해 여러 바이오마커를 검증하는 방법에 대해 충분히 이해하게 될 것입니다.
이 연구는 이식 대 숙주 질환(GVHD)과 관련된 여러 혈장 바이오마커를 검증하기 위한 고처리량 순차적 ELISA 방법을 보여줍니다. 이 기술은 동결/해동 사이클을 최소화함으로써 귀중한 혈장 샘플의 효율적인 분석을 가능하게 합니다.
Validating multiple plasma biomarkers from limited, irreplaceable patient samples is a critical bottleneck in translational biomarker discovery for acute graft-versus-host disease (GVHD). A high throughput sequential ELISA approach enables efficient, reproducible quantification of candidate biomarkers while conserving precious plasma volume and minimizing pre-analytical variability. This supports early-phase target validation and mechanistic de-risking by providing reliable, multiplex-compatible data from clinically relevant sample types.
The sequential ELISA method fits within the biomarker validation continuum, moving from discovery proteomics through targeted verification to preclinical and clinical correlation, particularly when sample volume and stability are limiting factors.