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以表达荧光标记的分泌系统组分的呼吸系统病原体 Legionella pneumophila 开始,该组分是感染宿主所必需的。
为了量化这些组分的极性,获取荧光图像,并调整对比度以区分单个细胞。
从细胞极向细胞质方向放置矩形区域,以测量荧光梯度。
对这些区域进行掩膜处理,提取平均强度和方差,然后计算极性评分为方差与平均强度的比值。
高极性分数表明细菌极区发生了组分的靶向募集。
进行动态测量时,采集两幅时间序列图像,并调整对比度以清晰显示细胞。
在细胞中心放置方形区域以测量胞质荧光。
遮蔽整个细胞以校正光漂白,并在细胞间定义背景区域以扣除噪声。
导出所有强度数据,并计算随时间变化的荧光强度变化。
强度增加表明分泌成分在细菌内聚集,而强度降低则反映分泌成分在细菌内的动态再分布。
为了量化极性,调整图像对比度,使细菌清晰可见。
然后放大目标区域,使用区域工具在极点处开始绘制一个0.25 × 1.3微米的矩形,并延伸至细胞质内,确保该矩形始终位于细菌边界之内。
标记至少 200 个细菌,并通过分析菜单中的“区域转掩膜”按钮创建掩膜。点击“掩膜统计”,在掩膜范围内选择“对象”。然后在特征和强度中勾选平均强度和方差。
将数据导出为文本文件,并使用电子表格应用程序计算每种细菌的极性评分,即方差与平均荧光强度的比值。
为了定量分析融合蛋白的动力学,打开图像采集窗口并标记时间序列。
在时间点数量框中输入 2。连续采集两幅表达目标荧光蛋白的 Legionella pneumophila 图像。
调整图像对比度,直至细胞清晰可见。然后使用区域工具,在至少400个细胞的中央放置一个0.25 × 0.25 微米的正方形区域。
接下来,使用分析菜单中的“使用区域创建掩膜”按钮,对目标方格创建掩膜。新建一个空白掩膜,使用像素工具标记至少25个随机细胞的整个细胞区域。再创建另一个掩膜,使用大号画笔工具标记细胞之间的区域。
最后,选择掩膜统计,并确保在掩膜一的掩膜范围下选择了“对象”。在特征与强度中,选择平均强度。导出数据,并对掩膜2重复此过程。对于掩膜3,选择整个掩膜并导出平均强度。