2018年11月11日
本文介绍了一种研究Rho GTP酶法呢基化及鸟苷-5'-三磷酸(GTP)负载的实验方案。该方案包含两种详细方法,即膜组分分离和GTP酶联免疫吸附测定。本方案可用于检测其他多种小GTP酶的法呢基化状态及GTP结合情况。
小Rho GTP酶是一类具有多种细胞功能的超家族蛋白。例如,这些蛋白参与调控细胞命运、细胞对压力的响应、细胞运动性以及细胞周期。小Rho GTP酶蛋白的活性受翻译后修饰的调控。
这些修饰参与对其活性的严格调控。例如,蛋白质预酰化和GTP结合是这类蛋白最重要的翻译后修饰。我实验室近期改进并建立了一种简单的方法,用于研究该蛋白超家族的翻译后修饰。
为此,我们使用了251种胶质母细胞瘤细胞系,用辛伐他汀进行靶向处理,并检测了这些蛋白质的翻译后修饰。该方法包括亚细胞分级分离以及检测与该蛋白质超家族结合的GTP结合蛋白。为此,我们通过检测RhoA的定位及其与GTP的结合情况,来评估该蛋白的翻译后修饰水平。
从37摄氏度的培养箱中取出细胞。在显微镜下观察细胞以确认汇合度。细胞汇合度应达到70%至80%。
用预冷的PBS洗涤细胞一次。加入5 mL EDTA,将细胞放回37摄氏度培养箱中孵育5分钟。孵育5分钟后,将含细胞的EDTA收集至15 mL离心管中。
将试管放入冰盒中,然后进行离心。将离心机设置为4°C、1500g,离心5分钟。离心结束后,弃去上清液,加入1毫升冷的PBS。
充分吹打混匀细胞。将细胞混合液转移至一个新的已标记的1.5毫升离心管中。转移后,立即进行离心处理。
将离心机设置为4°C、1500g,离心细胞5分钟。检查沉淀大小。将样品置于冰上。
彻底弃去上清液,切勿扰动沉淀。加入缓冲液一,通过反复吹打充分混匀。
进行超声处理。将超声仪设置为五个循环,每个循环5秒,重复三次。超声处理应在冰上进行,但为便于说明,视频中未展示此步骤。
将样品转移至超速离心机。使用超速离心机将细胞匀浆分离为胞质和膜组分。设置离心机在4°C条件下以100,000 ×g离心35分钟。
检查沉淀物的大小。分离上清液。完全收集上清液,注意不要扰动沉淀物。
上清液为胞质组分。将上清液转移至新标记的离心管中。向沉淀中加入缓冲液二。
此为膜组分。用移液器上下吹打充分混匀。随后进行蛋白质定量及Western blot样品制备。
使用15%凝胶进行SDS-PAGE电泳上样。通过观察分子量标记物或使用Ponceau染色来确认蛋白质转膜效果。加入一抗进行免疫印迹分析。
我们使用 Rac1/2/3、Cdc42 和 RhoA。将培养板从培养箱中取出,在显微镜下观察细胞以确认汇合度。
细胞应达到70%至80%的融合度。将培养板置于冰上,吸除培养基,并用预冷至4 °C、pH值调至7.2的磷酸盐缓冲液(PBS)洗涤细胞。
吸除 PBS。将培养板在冰上倾斜放置额外 1 分钟,以彻底去除残留的 PBS。残留的 PBS 会对本实验产生不利影响。
在含有蛋白酶和磷酸酶抑制剂的适量预冷裂解缓冲液中裂解细胞。用细胞刮收集细胞裂解液。进行此操作时,将培养板倾斜。
将裂解液转移至预冷的、已标记的冻存管中,并置于冰上。使用涡旋振荡器充分混匀。保留10 µL裂解液用于蛋白质定量分析。
将剩余的细胞裂解液在液氮中快速冷冻。将速冻后的冻存管转移至-80 °C冰箱中。保存这些样品。
注意,样品保存时间不应超过14天。按照步骤一至八,逐一从其他培养板中制备细胞裂解液。操作需迅速,切勿将样品在冰上放置超过10分钟。
切勿同时操作所有培养皿。测定蛋白质浓度。计算裂解缓冲液体积,以使各样品间的蛋白质浓度归一化。
注意:通常每毫升一毫克为最佳浓度,但每毫升0.3至2毫克也可被检测到。通过向一个微量离心管中加入60微升裂解缓冲液和60微升结合缓冲液,制备空白对照。通过向一个微量离心管中加入12微升Rho对照蛋白、48微升裂解缓冲液和60微升结合缓冲液,制备阳性对照。
将 Rho 亲和板从袋中取出并置于冰上。用 100 微升冰冻蒸馏水溶解各孔中的粉末。保持该板置于冰上。
将速冻的细胞裂解液在25摄氏度的水浴中解冻。向每个样品中加入计算好的冰上预冷的裂解缓冲液体积,以标准化蛋白浓度。将60微升标准化的冰上预冷样品转移至微量离心管中,并加入60微升结合缓冲液。
充分混匀后置于冰上。用力甩动微孔板以彻底去除孔中液体,随后在实验台垫上用力敲击5至7次。每孔加入50 µL标准化样品、空白对照和阳性对照,均设复孔。
将培养板置于4°C的轨道摇床上震荡30分钟。注意:摇床速度应设置为300 rpm。通过轻弹去除板中的样品,并用200 µL室温洗涤缓冲液洗涤两次。
每次洗涤后,通过轻弹并随后轻拍的方式彻底去除孔中的洗涤缓冲液,并将板置于室温下的实验台上。向每孔中加入200 µL室温抗原呈递缓冲液,在室温下孵育2分钟。将孔中的溶液轻弹弃去,再用200 µL室温洗涤缓冲液洗涤3次。
向每个孔中加入 50 微升新鲜配制的 1:250 稀释的抗 RhoA 一抗。将酶标板置于摇床上,25 摄氏度、300 转/分钟孵育 45 分钟。弃去孔中溶液,用 200 微升洗涤缓冲液在室温下洗涤三次。
向每个孔中加入 50 微升新鲜配制的 1:250 稀释的抗 RhoA 二抗。将板置于摇床上,25 摄氏度、300 转/分钟振荡孵育 45 分钟。通过混合等体积的试剂 A 和试剂 B 配制 HRP 检测试剂。弃去每孔中的溶液,用 200 微升室温洗涤缓冲液洗涤三次。
每孔加入 50 µL 新鲜配制的 HRP 检测试剂。在 3 至 5 分钟内读取化学发光信号,以获得最大信号值。使用适当的软件分析结果。
我们的结果表明,辛伐他汀减少了 RhoA 在膜组分中的定位,而增加了其在胞质组分中的积累。有趣的是,辛伐他汀增加了与 RhoA 结合的 GTP。为什么?
我们预期辛伐他汀会降低该活性。他们必须同时检测该蛋白的亚细胞定位以及该蛋白的GTP结合能力,以对小Rho GTP酶的活性做出最终评估。
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本文介绍了一种研究Rho GTP酶蛋白预nylation修饰及GTP负载的实验方案。所述方法包括膜组分分离和GTP酶联免疫吸附测定,可适用于多种小GTP酶。
准确检测Rho GTP酶的异戊二烯化及GTP结合状态,对于降低靶向细胞信号转导和细胞骨架调控的早期发现项目的研发风险至关重要。本方案可实现对翻译后修饰的定量评估,从而直接影响疾病相关模型中的靶点验证和作用机制的可信度。整合这些检测方法有助于对研发项目进行可靠筛选,并为肿瘤学和神经生物学研发管线中的立项或终止决策提供依据。
该方法通过实现对Rho GTPase活性的定量、机制性检测,架起了早期发现与临床前研究之间的桥梁。该方法适用于从靶点验证到先导化合物筛选及转化研究的各个环节。