2019年1月7日
我们展示了利用不连续密度梯度根据细菌荚膜产生情况分离细菌群体的方法。该方法可用于比较不同培养物之间的荚膜含量、分离具有特定荚膜表型的突变株,或鉴定荚膜调控因子。本文描述了该检测方法的优化及操作流程。
该方法有助于解答肺炎克雷伯菌研究领域中的关键问题,例如哪些基因参与调控荚膜及其相关毒力因子。该技术的主要优势在于能够将产荚膜菌株与非产荚膜菌株进行物理分离,同时可用于快速比较不同菌株的荚膜生成能力。尽管该方法最初是为研究肺炎克雷伯菌中的荚膜调控而开发,但也可应用于其他细菌种类。
通常,初次接触该方法的人员会遇到困难,因为倾注梯度液以及将细胞加入梯度液的过程可能较为复杂。本方法的可视化演示至关重要,我们将展示这些难以掌握的技术,并提供相应的建议和技巧以帮助使用者。首先,用无菌接种环从保存平板上挑选单个菌落,接种于10毫升合适的液体培养基中。
将培养物在培养箱中孵育过夜。然后将培养物转移至15毫升离心管中,进行离心。接着弃去上清液,并将沉淀重悬于2毫升磷酸盐缓冲液(PBS)中。
重复离心操作,并弃去上清液。然后将沉淀重悬于 2 mL 磷酸盐缓冲液(PBS)中。为制备密度梯度稀释液,将密度梯度介质与 PBS 混合。
然后将每种梯度稀释液各取 600 微升,分装至各自的 2 毫升离心管中。用 200 微升移液器吸取 100 微升细胞,将移液器吸头置于多个梯度中某一管的管壁侧边,位置刚好位于弯月面下方。极其缓慢地将细菌细胞吸入梯度中,注意避免混合界面。
将制备好的离心管在 8,000 g 条件下离心 10 分钟。随后,将离心管转移至试管架中,观察保留细胞刚好位于密度梯度层上方所需的最小梯度稀释度。首先,取 1 毫升最稀释的密度梯度液加入到一个 5 毫升圆底试管中。
使用带有1.5英寸针头的注射器,吸取1毫升下一个浓度更高的密度梯度溶液。将针头置于试管底部,缓慢注入注射器中的液体。每一步密度梯度均必须形成清晰的界面。
如果各层混合,将无法实现细菌的清晰分离。轻轻取出梯度层中的针头,以免扰动梯度稀释液之间的界面。然后将试管放入试管架中。
将 600 微升制备好的细胞小心地加至离心管中梯度液的上层。然后将离心管放入试管适配器中,并连同适配器一起称重以确保平衡。随后,将装有离心管的适配器放入台式离心机的固定角转子中,在 3,000 ×g 条件下离心 30 分钟。
最后,离心结束后小心取出离心管,放入试管架中,并拍摄结果照片。在本实验方案中,采用密度梯度离心法,根据细菌菌株产生荚膜的多少对其进行分离。尽管具体结果取决于细菌种类,但大多数菌株会在梯度中迁移至单一位置。
将该方法应用于细菌突变体文库时,应在梯度上方产生一条主要条带,上层梯度中出现一条密度较低的条带,以及在底部出现少量无荚膜组分。在进行该操作时,需注意梯度界面不得混匀,且梯度中不应含有气泡。操作完成后,应采用验证方法(如尿糖醛酸测定或显微镜观察)来检测荚膜含量。
在将该技术用于新菌株时,这一点尤为重要。切记,操作危险等级2类病原体可能存在危险。进行此操作时,应始终采取预防措施,例如佩戴个人防护装备、遵守风险评估要求以及正确处理和处置培养物。
本文展示了利用不连续密度梯度根据荚膜产生情况分离细菌群体的方法。该方法可用于比较不同培养物之间的荚膜含量、分离具有特定荚膜表型的突变株,以及鉴定荚膜调控因子。
该方法可使生物制药研发团队根据荚膜表达情况对细菌亚群进行物理分离,荚膜是影响免疫逃逸和治疗耐药性的关键毒力因子。通过提供一种半定量分离工具,该方法有助于抗菌药物和疫苗研发项目中的靶点验证和机制去风险化。在评估菌株文库或突变体集合中与荚膜相关的表型时,该方法可提高预测的可信度。
该方法适用于早期发现的连续过程,能够推动从表型筛选到靶点鉴定及临床前验证的进展,尤其适用于荚膜作为致病性决定因素的抗感染研究项目。