2022年8月18日
本方案描述了在微流控装置中结晶微观冰晶和笼形水合物的方法,可实现晶体形成后周围液体的交换。这为研究抑制剂的结晶过程及其结合机制提供了前所未有的可能性。
该方案的独特之处在于,它使用户能够研究、观察并测量可溶性分子与晶体表面之间的相互作用。利用此方法已获得抗冻蛋白与冰不可逆结合的有力证据。该技术的主要优势在于能够控制微米尺度冰晶和水合物晶体的生长,并以可控方式更换其周围的溶液。
首先,将预先制备好的模具放入一个用铝箔覆盖的玻璃培养皿中。然后,通过称量固化剂与弹性体按1:10比例混合,持续搅拌约五分钟,制备30至40毫升的PDMS混合物,直至混合物呈现白色且几乎不透明。接下来,将PDMS混合物倒入装有模具的培养皿中,并在真空干燥器中脱气,直至无气泡残留。
将含有液态PDMS的模具在70摄氏度的烘箱或加热板上加热,直至形成类似橡胶的质地。然后用手术刀沿器件轮廓切割,注意推动手术刀时应向前推进而非向下按压,因为模具较为脆弱。取出切割好的PDMS器件后,将其倒置放入一个新的培养皿中。
使用钝头注射器和20号针头,根据印制的图案在装置上打孔。然后将清洗后的PDMS和盖玻片放入等离子清洗仪中。关闭阀门,打开电源、真空泵和抽气泵。
让等离子清洗机运行约一分钟。将射频(RF)调至高功率,并通过微调阀门让少量空气进入等离子清洗机。当观察窗颜色由紫色变为粉红色时,继续让等离子清洗机工作50秒,然后关闭射频。
保持泵运行一分钟,关闭后逐渐打开主阀,使空气进入等离子清洗仪。然后将PDMS表面按压到已清洁的盖玻片上,并通过轻轻上提盖玻片观察是否发生分离,以确认两者已牢固键合。用镊子固定90度钝头针的针头后,将针的一端插入Tygon管,另一端插入装置中打好的一个孔中,并对其他孔重复此操作。
在铜制冷台表面滴加少量浸油,使用无绒布擦拭,形成一层薄油膜。接着,将洁净的蓝宝石圆片放置在油膜上。然后,在蓝宝石圆片中心滴加一滴浸油,将PDMS装置置于液滴上,使装置的结构特征对准冷台观察孔的位置。
固定装置位置后,将管路固定在容纳胶带的铝盒外壁上。使用玻璃注射器向入口通道注入四到五微升的抗冻蛋白溶液,并关闭冷台盖子。启动温度控制程序,将温度设定为零下25摄氏度。
然后以大约每五秒升高1°C的速度缓慢升温。接近样品的熔点,该熔点范围可能在-1至-0.2°C之间,具体取决于抗冻蛋白溶液中所用的缓冲液。为了更好地观察单个晶体,切换至10倍或20倍物镜。
在目标位置获得单晶后,通过略微降低温度使晶体生长,直至晶体两端接触到微流控通道的壁。切换至50倍物镜后,将抗冻蛋白溶液注入通道,观察荧光强度的增加,表明蛋白溶液已成功注入通道。为记录溶液交换过程,使用NIS-Elements成像程序,确保施加的压力不过高,并缓慢将缓冲液注入微流控装置的第二个入口。
观察荧光信号的下降,其下降速率取决于施加在注射器上的压力。在制备摩尔比为1:15的四氢呋喃(THF)水溶液后,将该溶液注入微流控装置中。待THF水溶液冻结后,缓慢升高温度,直至除水合物外的所有冰完全融化,并在1°C下保持三分钟。
将温度设定为零下二摄氏度,观察在无抑制剂条件下微流控通道中形成的水合物数量。然后使用玻璃注射器将抗冻蛋白或抑制剂注入微流控通道,同时调节温度以确保已形成的晶体不会熔化或继续生长,并静置数分钟,使抑制剂分子吸附至晶体表面。通过向通道内注入不含抑制剂的溶液,进行溶液置换。
在溶液交换前后拍摄晶体的图像,并使用成像程序分析晶体及溶液中的荧光强度。已成功完成围绕冰晶的溶液交换,表明溶液交换速度相对较快。然而,较慢的交换也是可行的。
在交换完成后,可清晰观察到冰上吸附的抗冻糖蛋白分子发出的荧光强度。通过定量分析监测了抗冻蛋白的浓度,并测定了溶液和冰上的荧光强度,结果表明溶液中的荧光信号在溶液交换过程中降低了100倍,而冰表面计算得到的荧光信号则保持不变。还进行了四氢呋喃(THF)水合物的微流控实验,在允许水合物晶体吸附抑制剂分子后,将不含抑制剂的溶液注入通道中。
在使用两种抑制剂(包括用异硫氰酸荧光素标记的抗冻糖蛋白和荧光染料藏红O)进行溶液置换后,观察到了四氢呋喃水合物。该方法的关键步骤是在微流控通道中形成并分离单个晶体,以及对晶体周围的溶液进行置换。此方法也可用于其他对温度高度敏感的晶体材料,以期阐明抑制剂与这些晶体相互作用的机制。
在晶体周围进行溶液交换的能力,使研究人员得以揭示抗冻蛋白结合机制的关键信息,并发现同位素效应对冰晶生长的新现象。
本方案描述了在微流控装置中微小冰晶和笼形水合物的结晶过程,可实现对已形成晶体周围液体的可控交换。这一创新方法能够对结晶过程及抑制剂的结合机制进行详细研究。
在微米尺度上精确控制冰和笼形水合物的结晶过程,能够对抑制剂结合及晶体生长动力学进行机理研究,这对于生物制药早期发现至关重要。该微流控平台支持对晶体表面分子相互作用进行定量、实时分析,直接为靶点验证和机制层面的风险评估提供依据。该方法可提高药物研发管线中抑制剂开发及项目筛选的预测可靠性。
这种微流控结晶方法通过实现对抑制剂与冰和水合物晶体相互作用的假设驱动型定量分析,连接了早期发现、先导物识别和临床前研究。