2023年2月10日
本文介绍了一种基于免疫荧光的方法,用于定量细胞中单链DNA的水平。该方法高效且可重复,可用于检测复制应激,而复制应激是多种卵巢癌的常见特征。此外,该检测方法可与自动化分析流程兼容,进一步提高其检测效率。
本方案提供了一种高效且易于重复的方法,用于定量单链DNA,后者是多种细胞系中复制应激的标志物。此外,该方法操作简便,适用于高通量应用和筛选。特别是,该方法可实现对复制应激的快速定量,而复制应激是多种卵巢癌的显著特征之一。
该方法还适用于多种自动分析软件,可进一步提高效率。目前,单链DNA正被积极地视为针对DNA修复通路的化疗响应的一种生物标志物。因此,该方法在这一情境下具有很高的适用性。
复制应激不仅存在于卵巢癌或BRCA1、BRCA2缺陷型癌症中,因此该方法可广泛应用于其他多种细胞类型或疾病背景。首先,通过将经高压灭菌的直径12毫米的盖玻片和多聚赖氨酸溶液加入50毫升锥形管中,并在摇床中孵育15分钟,制备多聚赖氨酸包被的盖玻片。
在组织培养罩中吸除溶液。加入无菌水清洗盖玻片,然后将装有盖玻片的试管重新置于摇床中振荡五分钟。清洗盖玻片三次后,吸去试管中的水,并将盖玻片铺展于无菌培养皿中。
吸净残留水分,将样品置于超净工作台中晾干一小时,或直至无水滴残留。干燥后,用封口膜密封培养皿,并置于4摄氏度保存。为防止预提取步骤中细胞从盖玻片上脱落,将一片经多聚赖氨酸包被的盖玻片放入24孔板的每个孔中。
当OVCAR3细胞生长至70%至80%融合度时,吸去培养板中的培养基,并用5至7毫升PBS洗涤细胞。吸去PBS。吸净PBS后,加入1毫升0.25%胰蛋白酶,将培养皿置于37摄氏度培养箱中孵育8至10分钟,或直至细胞从培养板底部脱落。
用5到10毫升培养基收集细胞,并将细胞悬液加入锥形管中。按照标准操作流程,使用血细胞计数板手动计数细胞。接着,稀释细胞悬液,调整细胞数量,使其经过三次传代后达到70%至80%的融合度。
将1毫升细胞悬液加入置于24孔板孔中的多聚赖氨酸盖玻片上,在标准条件下于培养基中培养细胞。经过一个群体倍增后,吸去孔板中的原有培养基,并在接下来的两个群体倍增期间用10 µM IdU对细胞进行脉冲处理。收集细胞时,将培养基替换为预冷的含0.5% PBSTx的溶液,冰上作用5分钟。
细胞固定时,吸去 PBSTx,于室温下用 3% 多聚甲醛孵育细胞 15 分钟。用 PBS 洗涤三至四次后,将固定后的细胞置于 4 摄氏度保存,以备后续使用。固定完成后,在冰上用 0.5% PBSTx 对细胞进行透化处理,持续 5 分钟,确保完全覆盖整个盖玻片。
在室温下用1毫升0.2% PBST洗涤细胞三至四次后,吸去PBST,并用PBS配制的5% BSA在室温下封闭样本30分钟。进行免疫染色时,通过在平底塑料盒底部放置湿润的纸巾来制备统一的孵育环境。用Parafilm封住24孔板的盖子。
将其放入湿化孵育盒中,并将盖玻片平铺在培养板盖上。在盖玻片表面加入60微升稀释的抗BrdU小鼠一抗。或者,为减少抗体干燥并节省用量,可在Parafilm膜上滴加一滴稀释后的抗体,然后将盖玻片倒置贴附于液滴上。
然后在37摄氏度下孵育一小时。孵育结束后,吸除一抗。将盖玻片放回24孔板中,并用0.2% PBST洗涤四次。
按照之前的方法在盖玻片上加入稀释的二抗,室温避光孵育一小时。标记载玻片,并用含DAPI的封片剂将盖玻片封于载玻片上。若封片剂需要固化或硬化,则将载玻片置于室温避光处保存24小时。
未经处理和经0.5毫摩尔羟基脲处理的细胞来源的细胞核在DAPI和IdU通道中被染色并可识别。对这些图像的分析包括量化每个细胞核中的焦点数量。焦点数量与复制应激程度成正比。
在选择细胞系时,必须考虑其倍增时间,因为IdU脉冲标记的时间可能需要根据倍增时间的长短进行调整。此外,我们可以通过检测细胞中复制蛋白A来验证实验结果,并评估细胞内多种复制应激反应。该技术可与多种细胞系联合使用,并可结合任何诱导DNA损伤的试剂,用于检测单链DNA的积累情况。
因此,该方法具有广泛的可及性和适用性。
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本文介绍了一种高效且可重复的定量单链DNA的方法,该方法可用于检测多种细胞系中的复制应激。该方法在研究卵巢癌方面具有重要意义,并适用于高通量应用。
通过免疫荧光定量单链DNA(ssDNA)可提供一种稳健且可重复的复制应激读数,而复制应激是卵巢癌及其他癌症中的关键脆弱环节。该方法能够快速、高通量地评估DNA损伤反应,有助于在早期发现和转化研究中建立预测信心。其与自动化分析流程的兼容性使其成为全项目范围内靶点验证和机制去风险化的可扩展工具。
这种基于免疫荧光的单链DNA定量方法贯穿从早期发现到先导物筛选及临床前研究的全过程,支持假设验证和转化生物标志物的开发。