2024年2月23日
本方案描述了一种用于定量检测的实验方法 秀丽隐杆线虫 基于液体培养物中细菌清除率测定的摄食速率
我的研究重点是解析药物诱导摄食行为变化背后的转录与代谢通路。我致力于鉴定能够减少摄食量并延长寿命的药物,这表明其可能激活了有益的禁食相关通路。通过我们建立的细菌清除实验,我们鉴定了两种不同的通路,分别调控5-羟色胺诱导的摄食行为和抗精神病药物诱导的摄食行为。
我目前正在研究这些通路如何与摄食行为及长寿突变体相关联。本实验方案使研究人员能够探究摄食与寿命之间的关系。摄食速率通常通过咽部泵动来表征。
然而,秀丽隐杆线虫(C. elegans)的泵动速率并不一定与摄食量成正比。将本方案与之前的检测方法结合使用,可提供每单位线虫群体摄食量的定量数据。我们的检测方法使我们能够利用小分子对摄食进行定量调控,并同时确定所诱导的摄食变化如何影响寿命。
首先,将一个OP50菌落接种到含有氨苄青霉素和两性霉素B的5毫升LB培养基中,在37摄氏度的细菌摇床中培养约6小时。当培养物变浑浊后,将OP50预接种培养物按1:2,000的比例稀释至含有氨苄青霉素和甘油的250毫升TB培养基中。然后将OP50液体培养物转移至无菌离心管中。
在4°C条件下,将离心管于台式离心机中以3,100 ×g离心15分钟。弃去上清液,将OP50菌体沉淀重悬于无菌水中,随后再次离心。第二次洗涤后,弃去上清液,将OP50菌体沉淀重悬于50毫升无菌水中。
将其转移至已预称重的50毫升锥形离心管中,离心20分钟以沉淀OP50。离心结束后,小心移除所有上清液,确保管内无残留水分。通过从含有沉淀的离心管重量中减去空离心管的重量,计算沉淀物的重量。
将OP50菌体沉淀物充分重悬于S-Complete缓冲液中,使其浓度达到100毫克/毫升。将OP50悬液涂布于琼脂平板上,检测是否存在污染。将OP50悬液溶于S-Complete缓冲液中,于4°C保存。
首先,选择一个含有饥饿状态L1期秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)幼虫的线虫生长培养基(NGM)平板。用1毫升无菌水轻轻冲洗平板上的线虫。将约300微升的线虫悬液分装到接种了浓缩OP50大肠杆菌的NGM平板上。
使用平板干燥器或本生灯将平板晾干,随后在20摄氏度下培养,直至大量个体发育为怀卵成虫。收集线虫时,用最多10毫升无菌水冲洗平板表面,将线虫与水的混合液转移至15毫升锥形管中。静置约四分钟,依靠重力使线虫沉降至管底。
使用小型移液器吸头,小心吸出上清液并弃去。然后加入最多15毫升无菌水。最后一次洗涤后,移除上清液,并加入5毫升 freshly prepared 的次氯酸钠和氢氧化钠溶液。
将线虫在室温下孵育5分钟,每隔1分钟涡旋振荡至少10秒。使用解剖显微镜监测反应进程。当所有成虫完全裂解或溶解后,加入M9缓冲液以中和反应,最终体积调至15毫升。
然后在1,300 × g条件下离心试管2分钟。通过离心,用13毫升M9缓冲液再洗涤卵子两次,随后用15毫升S-Complete缓冲液洗涤一次。然后在1,300 × g条件下离心卵子2分钟。
离心后,吸除上清液,并加入10毫升S-Complete缓冲液。使用摇床或类似装置,在室温下轻轻旋转过夜。利用解剖显微镜观察,判断线虫是否已孵化。
在显微镜下计数 S 缓冲液中 10 微升液滴内的线虫。用含有羧苄青霉素、两性霉素 B 和 OP50 的 S-Complete 培养基制备液体线虫混合液,浓度为每毫升 60 条线虫。将含线虫的培养基 120 微升加入 A 至 G 行,不含线虫的培养基加入 H 行。然后用封板膜密封培养板,防止污染和蒸发。
将密封的培养板在20摄氏度下孵育约65小时,直至动物发育为L4期幼虫。向每孔加入30微升0.6毫摩尔的氟代脱氧尿苷储备液,以在L4阶段使动物绝育。使用封板膜重新密封培养板,并在微孔板振荡器上以800转/分钟振荡20分钟。
将培养皿放回20 °C的培养箱中。次日,向第1天的线虫培养物中加入目标药物。用封口膜重新密封培养皿,并在板式摇床中以800 ×g振荡20分钟。
然后,打开盖子和密封膜后,使用酶标仪测量第1天的OD600。重新密封后,将培养板放回20摄氏度的培养箱中。使用倒置显微镜(最好配备2倍物镜),对每个孔中的线虫数量进行计数,并将数据记录在电子表格中。
计数后,将培养皿放回 20 摄氏度的培养箱中。摄食量变化倍数随血清素浓度变化的剂量反应曲线显示,N2 品系能够以剂量依赖的方式过度进食。daf-16 mu86 突变体的基础摄食量高于 N2,但其无法像 N2 品系一样以剂量依赖的方式对血清素产生反应。
在用洛沙平处理但分别喂食经X射线、γ射线或甲醛固定杀死的细菌的线虫中,其摄食量存在显著差异。一系列遗传品系的摄食量比较显示,exc-4和cgr-1突变体摄食较少,而srp-6突变体摄食较多。
本方案描述了一种通过测量液体培养中细菌清除率来定量秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)摄食速率的实验方法。该方法可帮助研究人员探究摄食行为与寿命之间的关系。
利用细菌清除法对秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)的食物摄入量进行定量测量,可实现对代谢和寿命相关通路的高通量研究。该检测方法有助于提高早期靶点验证和调控摄食行为化合物的机制去风险化预测的可信度。其可扩展性和直接定量能力有助于在代谢与衰老研究流程中实现可靠的项目筛选。
该细菌清除实验贯穿早期发现、先导物鉴定及临床前研究,支持代谢与衰老研究流程中的假设验证和定量表型分析。