2025年6月27日
本方案描述了一种凝胶迁移生化实验,用于检测FEN1(瓣状内切酶1)的活性及抑制剂的开发。
我们开发了一种基于荧光的方法来检测FEN1核酸酶活性并筛选小分子抑制剂,从而推动了诊断技术和靶向治疗研究的发展。
目前的表达检测面临诸多挑战,包括传统方法的复杂性和安全性问题,以及现有基于荧光技术所需的高成本和专用设备。
本方案解决了传统放射学方法和高成本荧光技术的不足,提供了一种更安全、高效且易于使用的检测方案。
我们的实验室将致力于优化高通量筛选平台,以探索FEN1抑制剂在癌症治疗中的体内应用及其作用机制。
[指导教师] 首先,根据FEN1的特异性切割活性设计DNA寡核苷酸链。将单链DNA寡核苷酸加入退火缓冲液中混合。加入10微升退火缓冲液和去离子水,使总体积达到50微升。随后,将反应混合物置于金属浴中,100摄氏度加热1分钟。立即转移至72摄氏度,孵育10分钟。然后关闭热源,使溶液逐渐冷却至室温,以形成完整的双链DNA底物。进行FEN1核酸酶活性检测时,首先将2微升DNA底物与FEN1核酸酶在反应缓冲液中混合。将反应混合物置于37摄氏度金属浴中孵育15分钟。加入20微升2X终止缓冲液以终止反应。随后,将20微升终止后的样品上样至预置的12%变性聚丙烯酰胺凝胶。以100伏电压电泳60分钟。完成后,在荧光成像系统下观察电泳结果。用移液器将2微升二甲基亚砜转移至1.5毫升微量离心管中。向管中加入2微升FEN1核酸酶和10微升2X反应缓冲液,以及6微升去离子水。充分混匀后,冰上孵育10分钟。孵育结束后,加入2微升DNA底物,使最终反应体积为20微升。接下来,通过将1摩尔储备液(溶于二甲基亚砜)进行两倍系列稀释,制备FEN1核酸酶抑制剂FEN1-IN-4的工作稀释液。向新的1.5毫升微量离心管中分别加入2微升FEN1核酸酶和2微升稀释后的FEN1-IN-4抑制剂。然后加入10微升2X反应缓冲液和4微升去离子水。轻轻混匀后,冰上孵育10分钟。随后向管中加入2微升DNA底物,使最终体积达到20微升。将反应混合物置于37摄氏度金属浴中孵育15分钟。然后加入20微升终止缓冲液终止反应。在约45千道尔顿处出现清晰的蛋白条带,表明从诱导表达中成功纯化了FEN1核酸酶。荧光素标记的双链DNA底物出现在80千道尔顿位置,与59千道尔顿的单链底物相比,证实了其成功合成。FEN1核酸酶以剂量依赖方式切割80个核苷酸的双链DNA底物,在0.5微克/微升浓度下观察到完全切割。FEN1-IN-4化合物显著抑制了FEN1对双链DNA底物的切割,表现为80个核苷酸条带的保留。FEN1-IN-4以浓度依赖方式降低FEN1核酸酶活性,其半数最大抑制浓度为14.03微摩尔。
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本研究介绍了一种基于荧光的生化检测方法,用于评估FEN1(Flap Endonuclease 1)的活性,并促进小分子抑制剂的开发。该工作旨在克服传统方法的相关局限性,为与癌症治疗相关的FEN1活性提供一种更安全、更高效的检测方案。
基于荧光的FEN1核酸酶活性检测方法满足了肿瘤药物发现领域对更安全、可扩展且定量检测手段的关键需求。该方法可快速评估FEN1作为与癌症相关靶点的可行性,并支持对小分子抑制剂进行高通量筛选,直接影响早期项目组合的筛选决策和作用机制层面的风险评估。该技术的应用有助于加速以DNA修复为靶向的治疗研发管线从靶点验证到先导化合物发现的转化进程。
这种基于荧光的检测方法将FEN1靶点验证和抑制剂筛选置于早期发现与先导化合物识别的交汇点,可支持其无缝整合到以肿瘤学为重点的研发管线中。