2013年10月15日
本文介绍了一种用于单细胞分析的微流控芯片。该芯片可通过荧光检测或免疫检测方法,对细胞内蛋白质、酶、辅因子和第二信使进行定量分析。
以下实验的总体目标是利用荧光或免疫分析方法分析单细胞裂解物。首先构建微流控装置,并将抗体包被于内腔表面;随后在第二步中将单个细胞固定在捕获结构中,并暴露于多种试剂以刺激细胞产生响应。
环形阀门迅速关闭,裂解缓冲液流经装置。环形阀门短暂打开,细胞在微腔室内裂解,由于体积微小,释放的蛋白质得以在高浓度下与抗体结合。随后,环形阀门再次打开。
对反应室进行清洗后,将检测试剂引入封闭的微反应室中。使用荧光显微镜随时间监测荧光强度的增加,结果表明该系统能够定量且可靠地检测来自单个细胞的目标分析物。该方法有助于回答单细胞分析领域中的关键科学问题。
特别是,它对细胞在化学环境变化下的响应进行了系统性研究。我们可以观察到,由于化学刺激导致细胞内分子的上调或下调。该技术具有两个主要优势。
第一,我们可以使固定化的细胞暴露于一个确定的化学环境中,该环境可以是恒定的或周期性变化的。第二,我们可以在没有交叉污染或分析物因运输而损失的情况下,对分析物进行高灵敏度和高特异性的重新分析。首先,按照随附的文字方案制备三种不同的SU8母体晶圆。
其中一个用于制作流体层,一个用于控制层,第三个用于微接触印章。然后开始制备微流控芯片,首先准备10:1的PDMS与固化剂混合物。充分混合两部分,并将溶液脱气30分钟,直至混合物中无气泡。
接下来,将晶圆置于培养皿内的控制层中,并用胶带固定在底部。倒入约50克PDMS,形成厚度为4至5毫米的层,然后将晶圆置于80摄氏度的烘箱中至少2小时,以确保PDMS完全固化。对微接触印刷用晶圆重复相同操作,但使用约20克PDMS而非50克,从而形成厚度为4至5毫米的PDMS层。
制备底层时,将一层40微米高的PDMS以2000 RPM的转速旋涂60秒至带有微流控层的晶圆上。当所有部件均完成固化后,在80摄氏度的烘箱中加热固化PDMS层一小时。
从晶圆上取下控制层,并用剃刀辅助将其切成小片。然后使用1毫米的活检穿孔器打孔以制备压力连接孔,并用胶带覆盖通道用于储存。接着,从微接触印刷晶圆上方取下PDMS,并制备与腔室区域大小相同的印章。
将它们存放在无尘抽屉中,直至使用。然后将旋涂晶圆和四到五毫米厚的控制层放入等离子清洗仪中。在0.75毫巴的氧气等离子体条件下,以18瓦功率处理45秒。
等离子处理后,在具有较大工作距离的显微镜下迅速对齐两层。在已放置的上层部件周围添加一些多余的PDMS,以方便后续从晶圆上剥离PDMS。然后将晶圆置于80摄氏度的烘箱中至少一小时。
固化后,使用解剖刀小心地将PDMS从晶圆上剥离,并用1.5毫米活检穿刺针在微芯片上打孔,以留出用于流体连接的穿孔。此外,通过切割200微升移液器吸头的上部,并使用一些备用的半固化PDMS,在微芯片上制作一个储液池,然后将其粘接在顶部。
然后将芯片在 80 摄氏度的烘箱中固化至少一小时。首先清洁载玻片和 PDMS 部件。用肥皂清洗载玻片。
用蒸馏水冲洗,然后再用乙醇冲洗。使用氮气流干燥载玻片。用胶带去除PDMS上的任何碎屑和灰尘颗粒。
然后将PDMS部件和清洗后的玻璃片放入等离子清洗仪中,在18瓦功率下处理45秒,以确保牢固键合。等离子处理后,将芯片置于加热板上加热5分钟。键合完成后,剪去几个200微升移液器吸头的下端,用含有4% BSA的过滤PBS溶液填充10至15微升,并插入装置的进样口。
然后使用剪去尖端的吸头,加入10至15微升PBS,将其放入对照通道中。接着将芯片放入离心机,以800 × g离心5分钟,使液体充满通道。如果任何通道中仍有气泡残留,请重复此步骤,直至通道完全充满液体。
将封闭液在室温下孵育至少30分钟。然后以每分钟10 µL的流速用PBS冲洗流体层中的溶液。使用注射泵,该装置现在已准备好进行细胞实验。为免疫测定预印玻片,将PDMS微接触打印印章与0.5%生物素化BSA在洁净的培养皿中孵育。
半小时后,用蒸馏水彻底且快速地清洗印章,并用氮气流吹干印章。干燥后,迅速将印章放置在已清洁的玻璃载片上,以转移图案化的生物素化BSA。放置后不要移动印章,并检查印章是否与玻璃载片完全接触。
如果未完全贴合,可轻敲印章,但不要用力按压。然后将印章连同微流控芯片的上部一起放入等离子体腔室中,在18瓦功率下暴露于氧气等离子体中45秒。等离子体处理后,将印章从玻璃载片上取下。
在表面呼吸会使图案显现。将微型腔室对齐放置在打印好的表面上。对齐后,将芯片置于50摄氏度的加热板上30分钟,以封闭剩余表面;随后用离心机将4%经无菌过滤的PBS BSA溶液注入芯片(操作如前所示),孵育微芯片至少30分钟,然后以每分钟10微升的流速用PBS冲洗流体层中的溶液。
使用注射泵,可直接使用该芯片,或在4°C的湿盒中保存长达两周。接下来,将PBS中的avadon引入储液池,以形成完全功能化的结合表面。随后使溶液流动,将avadon通过流体通道输送。
用 PBS 充分冲洗储液池,并冲洗通道。然后向储液池中加入蛋白 G,并使其流经通道。用 PBS 冲洗储液池和芯片,以洗去多余的蛋白 G。
接下来,将目标抗体加入储液池,并使其流经微通道。然后停止流动,孵育以促进结合,再用 PBS 洗涤通道。在引入细胞前,可使用荧光标记的类似物检测打印过程的质量。使用无酶解离缓冲液收获贴壁细胞(如此处所示的 HEK 293 细胞),随后过滤以减少细胞团簇数量;过滤完成后,将细胞悬液装入注射器中。
每毫升300,000个细胞,使用注射泵以正向流体将细胞加载到芯片上,流速为每分钟10至20微升,持续约三分钟,适用于此类贴壁细胞,以防止细胞在捕获结构填满后非特异性地附着。当捕获结构充满细胞后,通过向顶层施加三巴压力来封闭腔室。然后使用显微镜观察腔室。若发现大量细胞非特异性地黏附在腔室内表面,应迅速打开腔室,并以每分钟10至30微升的流速用细胞解离缓冲液尝试将其冲洗掉。
对于葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)检测,向裂解缓冲液中加入 2 毫摩尔葡萄糖-6-磷酸、0.5 毫摩尔 NADP⁺、0.5 单位/毫升 DIA 阵列以及 0.3 毫摩尔 RIN,并确保充分混匀。通道清空后,以 30 微升/分钟的流速将 G6PDH 裂解缓冲液通过芯片。在裂解缓冲液流动过程中,迅速打开并关闭各个腔室,保持开启 500 毫秒,以便裂解液进入腔室,并在裂解开始后立即监测动力学反应。
在此示例中,可随时间监测荧光产物。图中显示的是一组腔室阵列,这些腔室先填充了橙色食用染料,然后通过加压微腔上方的控制层将其封闭。腔室封闭后,用绿色食用染料冲洗通道,以显示腔室的密封性。
每个腔室仅含有625皮升的液体体积,可使裂解细胞释放的分子浓度保持在足以进行分析的高水平。此外,可通过控制阀门的开关方式,有效避免腔室之间的交叉污染。在这些腔室中,可检测诸如单个PMA激活的U 937细胞所释放的溶酶体数量等分析物,该细胞可在腔室内通过酶促反应催化生成荧光分子。
绿色线条代表单个细胞所在腔室的荧光强度随时间的变化。黑色虚线表示无细胞腔室的荧光强度。作为对比,本实验通过检测细胞内酶G六PDH来显示有毒分子对膜完整性的效应。
黑线代表无毒性影响的对照样本,而橙线代表受所示毒素影响的细胞。这是一个针对细胞内蛋白的免疫测定示例。将GFP抗GFP抗体固定在表面,细胞裂解后,利用turf显微镜观察GFP蛋白的结合动力学。
时间点0.1表示在该时刻加入了裂解缓冲液;在时间点0.2,绿色荧光蛋白(GFP)开始在表面积累,表明细胞裂解已经发生,GFP已扩散至表面。在时间点0.3,GFP与抗体的结合完成。在此最后一个示例中,释放的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)与表面的捕获抗体结合,随后加入辣根过氧化物酶(HRP)标记的检测抗体。
一旦所有未结合的检测抗体被洗去,便加入检测试剂,并让反应进行一段时间。以下是使用该方法测得的U 937细胞和HEC 293细胞中先前存在于细胞内的GA DH含量在动物数量间的比较。观看本视频后,您应充分了解如何制备微流控芯片、如何修饰表面以实现免疫分析,以及最终如何利用该装置进行单细胞分析。
该方法可用于帮助回答单细胞生物学领域的许多引发性问题。
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本文介绍了一种用于单细胞分析的微流控芯片,可实现细胞内蛋白质及其他生物分子的定量检测。该方法利用荧光分析或免疫分析进行详细的细胞分析。
单细胞化学分析对于解析细胞异质性以及理解早期药物发现中细胞对化学刺激的功能性响应至关重要。该微流控芯片平台可实现对单个细胞内生物分子的定量、高灵敏度检测,有助于机制性风险排除和靶点验证。其并行化、可重复的实验格式可在药物发现流程的关键转折点提升预测的可信度。
这款微流控芯片可融入从早期假设验证到先导化合物鉴定及临床前研究的整个发现流程,为定量单细胞分析提供了一个可重复使用的平台。