2019年9月27日
本报告介绍了一种基于微流控芯片的方法,用于建立单细胞培养实验,可实现多个单细胞的高效配对及显微分析。
为了理解细胞间相互作用对细胞行为的影响,必须将捕获效率与活细胞动态成像观察有效结合。该微管可在较大的腔室内高效捕获多个单细胞,并提供充足的培养基础,用于动态追踪多个单细胞间的相互作用行为。首先准备PDMS装置。
将带有100微升三氯硅烷的晶圆模具放入称量皿中,置于干燥器内抽真空15分钟。停止抽真空后,在37摄氏度下于干燥器中对晶圆模具进行硅烷化处理,时间不少于1小时。按10:1的比例混合PDMS基础剂与PDMS固化剂,然后将总共20克的混合物倒入直径15厘米培养皿中的晶圆模具上。
将直径15厘米的培养皿放入干燥器中,抽真空1.5分钟。随后将培养皿从干燥器中取出,并用氮气去除PDMS中的残留气泡。将培养皿置于65 °C的烘箱中加热2至4小时,使PDMS固化。
完成后,将PDMS复制品从晶圆模具上取下,并在PDMS上打一个1.5毫米的入口和一个0.5毫米的出口。用可剥离胶带清洁PDMS复制品和载玻片表面,然后用氧气等离子体处理表面。
然后,手动将PDMS复制品与载玻片对齐,并使其相互接触。将PDMS载玻片置于65摄氏度的烘箱中放置一天。第二天,将PDMS装置浸入盛有PBS的容器中。
将其放入干燥器中,并抽真空15分钟。将装置转移至细胞培养超净台,用紫外光照射30分钟进行灭菌。用培养基替换PDMS装置中的缓冲液,并在4摄氏度下孵育一天。
当细胞达到70%至80%融合度时,移除培养基,并用5毫升PBS轻轻洗涤三次。向WNT5B sh4和pLKO-GFP细胞中加入含有1 µM荧光染料的1毫升DMEM/F-12培养基,在室温下孵育30分钟。孵育结束后,用5毫升无菌PBS轻轻洗涤细胞三次,移除PBS,然后加入2毫升0.25%胰蛋白酶-EDTA。
将细胞在室温下孵育 4 分钟,然后轻轻敲击培养皿以促进细胞脱落。加入 4 毫升 DMEM/F-12 培养基以分散 WNT5B sh4 和 pLKO-GFP 细胞,将细胞转移至 15 毫升离心管中,并在 300 ×g 下离心 3 分钟。弃去上清液,并将细胞沉淀物轻轻重悬于 1 毫升 DMEM/F-12 培养基中。
制备1毫升细胞悬液,浓度为每毫升3 × 10⁵个细胞,并置于冰上以防止细胞聚集。将聚四氟乙烯管连接至装置出口与注射泵之间。吸除培养基,然后向PDMS装置的入口加入1 µL已制备的细胞悬液。
接下来,使用注射泵以每分钟 0.3 微升的流速将细胞悬液加载到装置中。向装置的入口加入 1 微升 DMEM/F-12 培养基,然后使用注射泵将培养基加载到装置中。以每分钟 10 微升的流速,使用注射泵将 0.3 微升 DMEM/F12 培养基加载到装置中。
细胞加载完成后,取下管子,并用聚烯烃胶带密封入口和出口,以构建封闭的培养系统。将PDMS装置转移至直径10厘米的培养皿中,并在装置周围加入10毫升无菌PBS,以防止培养基蒸发。将培养皿放入培养箱中进行三重单细胞培养。
PDMS 装置具有三层结构,包含一个连接培养室和旁路通道的捕获位点。由于培养室与旁路通道之间的流动阻力不同,细胞可流入捕获位置,随后进入的细胞则通过旁路通道到达下一个捕获位点。回流步骤用于将细胞从捕获位点释放并送入培养室。
本方案的细胞捕获效率在三种不同细胞类型上进行了评估:人淋巴内皮细胞(LECs)、表达针对WNT5B的特异性短发夹RNA的人口腔鳞状细胞癌T2.6细胞,以及pLKO-GFP载体对照细胞。这三种细胞的单细胞捕获效率分别为:LECs约71%,WNT5B sh4细胞约74%,pLKO-GFP细胞约78%。
三重单细胞捕获效率为48%。该方法可用于淋巴管内皮细胞与鳞状癌细胞的多种单细胞共培养,可在显微镜下观察细胞的增殖情况和形态。需确保制备的细胞悬液中细胞聚集体尽可能少,因为细胞聚集体不仅会降低单细胞配对效率,还可能堵塞微通道。单个细胞之间的细胞间相互作用在调控细胞行为中起着重要作用。
我们的方法可为研究人员提供一种高效工具,用于在单细胞水平上研究细胞间的相互作用,这可能有助于发现那些通过基于群体的研究难以获得的新机制。
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本报告介绍了一种基于微流控芯片的方法,用于建立单细胞培养实验,可实现多个单细胞的高效配对及显微分析。该方法能够动态追踪细胞间的相互作用,从而更深入地理解细胞行为。
该微流控平台通过实现确定性的单细胞配对以及细胞间相互作用的实时追踪,克服了传统共培养系统中的一个关键局限。通过消除群体平均效应,该平台为癌症生物学及基质-肿瘤串扰相关的异质性细胞行为提供了机制层面的深入见解。该方法支持早期发现工作流程,其中精确的细胞分辨率有助于提高靶点验证的准确性,并降低转化假设的风险。
该方法通过提供可量化的单细胞分辨率数据,将相互作用驱动的表型进行直接观察,从而在早期发现流程中整合应用,为先导化合物的筛选和临床前决策提供依据。