2009年6月25日
本文介绍了一种测定酵母母细胞复制寿命的通用实验方案。
芽殖酵母 Croce Visi 已被广泛用于研究衰老生物学。在本文中,我们介绍了一种测定酵母母细胞复制寿命的通用实验方案。大家好,我是来自华盛顿大学生物化学系 Brian Kennedy 实验室的 Kristen Steffen。
今天我们将向您展示一种测量酵母母细胞复制寿命的实验方法。我们在实验室中使用该方法来研究影响酵母细胞寿命的基因。现在,让我们开始吧。
对于复制性寿命实验以及寿命分析用酵母细胞的制备,需要制备固体YEPD平板。请使用适当的无菌技术制备这些YEPD琼脂平板。每个寿命实验中待分析的四到五个菌株,至少需准备两个平板。
这些平板至少应在寿命实验开始前两天制备,并在开始寿命测定前使其干燥。如果实验无法在倒板后四到五天内进行,则应使用封口膜或塑料膜包裹,并置于冷藏培养箱中,以防止干燥。从冷冻保藏菌种中取出酵母菌株,划线分离单菌落。
接种到 YEPD 琼脂平板上。通过将平板均分为若干等大的扇形区域,同一块 YEPD 平板上可轻松划线接种多达六种菌株。将细胞在 30 摄氏度下培养两天。
孵育结束后,从培养箱中取出细胞,并将单个菌落的细胞转接到新鲜的 YEPD 平板上。此时应对待分析的菌株进行标记,以确保复制性寿命实验的盲法操作,即解剖人员不知道各个菌株的身份。链状结构。
接下来,将已划线的包被细胞在30摄氏度下孵育至次日晚上。取出细胞后,将每种包被菌株的细胞轻轻划线转接到新鲜的YEPD平板上。这些平板将作为用于复制性寿命实验的实验平板。
应在YEPD平板左侧沿一条垂直线进行点种分析细胞。不要将过多细胞转移到单个新鲜YEPD平板上,因为这会导致细胞在过夜培养期间生长过密,从而影响其复制寿命,每块平板上点种约三至五个区域为宜。
假设将对每个菌 patch 中的 20 个细胞进行复制性寿命分析,目前寿命实验已全部准备就绪,接下来只需在实验台面上过夜培养即可。明天我们便可开始显微解剖操作,将酵母细胞定位在培养皿上,并获取新生的女儿细胞,用于复制性寿命分析。
使用配备有适用于酵母的显微解剖装置的显微镜。从第一个菌株斑块中转移约50个细胞至培养皿上距离原有斑块较远的位置。如果显微镜载物台带有刻度,可利用这些刻度确保在后续操作中易于找到细胞。
有时细胞可能会卡在针头中,如果在错误的时间释放出来,可能会造成问题。为确保针头清洁且无细胞残留,请反复将针头接触琼脂表面。然后通过用力将针头穿过琼脂表面来在琼脂中打孔。
此孔将作为标记,用于在后续解剖和点样细胞去除过程中确定培养板上的方位。注意避免将酵母细胞落入孔中,否则它们会生长并在孔正上方形成菌落。用一根细针将单个酵母细胞垂直排列成20个等距位置,每个细胞位置之间间隔一到三个针的直径。
每隔几个细胞,在同一条线的相同位置并排放置两个细胞,而不是一个细胞。这样可以在挑选未交配子代细胞时提供冗余性。如果其中一个被转移的细胞在第10和第11个位置之间未能分裂,则在琼脂上创建一排由7到8个孔组成的水平序列。
这将作为后续解剖和去除子细胞过程中在平板上定位的标记。再次注意,避免将酵母细胞落入孔中,否则它们会生长并形成菌落。对平板上的每个菌斑重复此操作,继续沿同一轴线垂直排列细胞。
需要注意的是,在AER上打孔时,所打孔的数量应与补片编号相对应,即第一个补片对应一个孔,第二个补片对应两个孔。每个补片的细胞排列完成后,用封口膜密封培养板,并在30摄氏度下孵育约两小时。请记住,从此时起,所有培养板均应使用封口膜密封,仅在进行解剖操作时方可打开。
为防止干燥,需对每块培养板重复此操作步骤。在实验中,进行寿命分析时,必须确保每个细胞均起始于一个未交配的子代细胞。
首先,将培养板从培养箱中取出,并确认大部分阵列细胞已完成细胞分裂。此处展示的是先前已排列好的细胞,可以看出,在培养箱中培养两小时后,它们已经开始分裂。现在我们得到了一个母细胞(即较大的细胞)及其附着在其上的新生子代细胞(即处女子细胞),该处女子细胞将用于起始寿命分析。
如果需要额外时间以完成细胞分裂,请将培养板放回培养箱。从第一个阵列细胞开始,用针轻轻压在贴壁细胞上方,将子细胞从母细胞上分离。
当针头接触细胞时,轻敲显微镜底座侧面有时会有所帮助。接下来,将分离的子细胞放置到细胞垂直排列的位置,替换母细胞及任何其他子细胞,并暂时将其余细胞移至一旁。对每个阵列细胞重复上述步骤。
如果某个细胞未能分裂,则从位于待测细胞旁边的冗余细胞中取一个子代细胞。完成操作后,每个区域应垂直排列有20个子代细胞。将所有母细胞和多余的子代细胞收集到一堆中,并转移回靠近区域附近的一个称为“墓地”(graveyard)的区域。
为防止形成微菌落和局部营养耗尽,必须将不需要的细胞与正在进行寿命分析的细胞保持较远距离。细胞分离后,从平板上移除并置于30摄氏度下孵育约两小时。对实验中的每一块平板重复上述步骤。
为了测量单个细胞的复制能力,您需要准备寿命数据表。寿命数据表可以是一个简单的网格,其中每一行对应一个单独的母细胞,每一列对应一个年龄时间点。请根据待分析菌株的数量对每张数据表进行标注。
首先,从培养箱中取出培养板,检查大部分阵列细胞是否已完成至少一次细胞分裂。若需更多时间以完成细胞分裂,应将培养板重新放回培养箱中。从第一块板上的第一个阵列细胞开始,通过显微观察母细胞和子细胞,判断已发生的细胞分裂次数。
通常,根据细胞排列的特征性模式,可以很容易地确定一个母细胞产生了多少个子代细胞。这个例子中很容易看出母细胞产生了多少个子代细胞,因为这里有两个细胞,它们大小相同,且都比母细胞小。在寿命评分表的相应位置记录母细胞产生的子代细胞数量。
接下来,使用针头将子代细胞从母细胞上分离,具体操作方法如下:将针头轻轻置于附着的细胞上方,同时轻敲显微镜底座侧面,使针头在细胞上产生轻微震动。保持母细胞在垂直线上位置不变,将子代细胞暂时移开。对阵列中的每个细胞重复上述步骤。
最后收集所有弃去的子代细胞,并将其转移至靠近原始菌落的墓地区域。用封口膜封住培养板,于30摄氏度孵育2至3小时。重复弃去子代细胞及孵育步骤。
对实验中的每一块平板执行此步骤。重复整个操作过程,直至所有母细胞停止分裂。需要注意的是,随着母细胞老化,细胞周期进程会变慢,因此在后续的不同年龄时间点之间,建议将平板孵育更长时间。之后,可将平板在4°C下过夜保存。
复制性寿命实验产生的原始数据是一组数字列表,对应每个母细胞在各个年龄时间点所产生的子代细胞数量,如此处所示。通过将记分表中每一行的数值相加,即可得到每个母细胞的复制性寿命。
可将同一实验组中其他细胞的数据合并,以生成生存曲线并进行统计学计算。该曲线应大致符合Gompertz-Makeham动力学特征,呈现为具有较低早期死亡率、随后生存率相对较快下降、并在较晚年龄时曲线趋于平缓的S形曲线。我们刚刚向您展示了如何开展酵母复制性寿命实验。
进行此操作时,重要的是要记住,细胞在非低温环境下会持续分裂。因此,请记得将培养板在4°C下过夜放置,以免第二天早晨出现过多子代细胞而难以计数。就是这样。
感谢观看,祝您的实验顺利。
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本文介绍了一种测量酵母母细胞复制寿命的通用实验方案,该模型是研究衰老过程的关键。该方法在科研中用于探究影响酵母细胞寿命的基因。
通过测量芽殖酵母的复制寿命,可建立一个在遗传上易于操作的系统,用于研究与高等真核生物有丝分裂活跃细胞相关的保守衰老机制。该检测方法能够通过将基因扰动与可量化的细胞衰老表型相联系,实现靶点验证和机制层面的风险评估。该方法通过生成可重复的定量数据,支持早期发现阶段的工作流程,用于衰老相关治疗领域的通路分析和先导靶点的筛选。
复制性寿命测定法适用于从靶点假设验证到先导物发现的整个研究连续过程,尤其适用于具有跨物种保守性的衰老通路研究。