2017年6月19日
本文描述了三维荧光漂白后恢复技术(3D-FRAP)在分析依赖间隙连接的miRNA转运中的应用。与常用方法相比,3D-FRAP能够以高时空分辨率实时定量小RNA的细胞间转移。
本实验的总体目标是研究活体心肌细胞中缝隙连接依赖性的微小RNA转移。该方法有助于阐明微小RNA在细胞间信号传递系统中的作用。该技术的主要优势在于,能够在活细胞中以高时空分辨率对微小RNA的缝隙连接交换进行可视化和定量分析。
根据文本方案分离心肌细胞后,将细胞以每平方厘米3 × 10⁵个细胞的密度接种于6孔板中。于37°C及5% CO₂条件下培养过夜。次日,向细胞中加入0.5 trypzine,孵育5分钟以使细胞脱落。
通过加入细胞培养基终止胰蛋白酶的活性。计数细胞后,在300 × g条件下离心10分钟。然后用电穿孔缓冲液重悬细胞,使细胞浓度为每100 µL含4 × 10⁵个细胞。
接下来,将100 µL细胞悬液与荧光标记的micro RNA在离心管中混合,并将混合液加入电穿孔比色皿中。然后使用电穿孔仪上的G009程序进行电穿孔。加入500 µL预热的细胞培养基,将全部细胞悬液转移至四孔玻璃底培养板的一个孔中。
将细胞在37摄氏度、5%二氧化碳的培养箱中培养一天。预热显微镜培养箱并开启共聚焦系统后,将培养皿载玻片插入载物台样品架中。使用1.4数值孔径的油镜,以561纳米激光作为激发光源(低激光功率),检测范围设为570至680纳米,以定位转染的心肌细胞簇。
接下来,在设置管理器中,激活z轴扫描、时间序列、漂白和区域按钮。然后,在采集模式菜单中设置FRAP参数,将帧尺寸设为512×512,线步进设为1,扫描时间设为小于1秒。在通道菜单中,调节激光功率、偏移量和增益设置,以在最低激光激发条件下获得最大荧光信号,避免信号强度饱和。
然后,将针孔大小设置为两微米。接下来,在区域菜单中选择自由绘制工具,使用光标标记目标细胞、参考细胞和背景区域。如有需要,可选择多个目标细胞进行光漂白。
在漂白菜单中,调整光漂白设置。然后,在 z-层叠菜单中,根据细胞的厚度定义 z-层叠采集的范围。将 z 层的数量调整为 12 到 15 层,随后启动 FRAP 实验并记录荧光恢复过程。
为分析数据,使用显微镜专用软件对采集的z轴层扫图像创建最大强度投影:点击“处理”(processing),选择“最大强度投影”(maximum intensity projection),选定文件后应用。最后,将目标区域、背景及参照细胞在所有时间点的荧光强度数据复制到电子表格中,并根据文本方案进行数据分析。图中所示为分离的心肌细胞,具有典型的条纹状α-辅肌动蛋白(alpha actinin)分布,以及沿细胞间边界分布的大片连接蛋白43(connexin43)斑块。
培养物中存在一些非心肌细胞。如流式细胞术结果所示,转染效率达到了45%。此外,活/死细胞染色实验表明,大多数细胞具有较高的存活率,这在分析缝隙连接通讯时非常重要。
进行荧光漂白恢复(FRAP)分析时,在细胞簇中选择目标细胞,并使用100%激光功率进行光漂白,导致所选细胞中的微小RNA荧光减弱。对获取的数据进行定量分析和归一化处理后显示,平均恢复率为20%。在本实验中,通过siRNA介导的connexin43基因敲低导致蛋白表达减少,并抑制了间隙连接通讯。荧光恢复率降低超过50%,表明微小RNA转移效率在很大程度上依赖于细胞间的间隙连接耦合。
该图展示了荧光漂白恢复(frap)实验的三维表面渲染图像。与最大强度投影相比,通过采集z轴层扫数据(z-stacks)可构建三维重建图像,用于研究微小RNA(micro RNA)在细胞内的定位与移动性。一旦掌握实验技术,若操作得当,frap测量可在两到三小时内完成。
在进行该实验操作时,重要的是选择具有相似数量邻近细胞的靶细胞。此外,应选择合适的漂白参数和图像采集条件,以避免光毒性效应。观看本视频后,您应能够充分理解如何使用FRAP显微技术,对微小RNA在细胞簇内的运动进行定量分析和可视化观察。
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本文介绍了使用三维光漂白后荧光恢复技术(3D-FRAP)来研究活体心肌细胞中依赖间隙连接的微小RNA转移。这一创新方法能够以高时空分辨率实时定量小RNA的细胞间转移。
对缝隙连接介导的miRNA转移进行高分辨率分析,有助于解决理解与疾病调控及治疗靶向相关的细胞间信号传导机制中的关键挑战。3D-FRAP显微成像工作流程可实现对小RNA运动的实时定量,从而提高RNA靶点验证的预测可信度,并降低基于RNA的治疗策略在机制层面的风险。该能力增强了早期发现阶段的决策依据,并为RNA治疗药物的研发组合优先级确定提供信息支持。
这种3D-FRAP显微技术可融入RNA治疗药物从早期机制研究到检测方法开发及临床前验证的整个发现流程。