2024年1月12日
我们描述了一种基于斑马鱼胚胎振动惊吓反应的化学化合物毒性评估筛选系统的工作流程和数据分析方法。该系统记录斑马鱼胚胎在受到振动刺激时的运动反应,可对总体毒性/致死性以及神经肌肉毒性进行综合评估。
在筛选化学物质的毒性时,当前实验面临的一个挑战是如何在考虑到完整生物体复杂性的同时,快速、高通量地确定其在体内的毒性效应。通过采用一种行为读出方法,监测斑马鱼胚胎对振动刺激的逃避反应,我们的系统能够识别出干扰神经或肌肉功能的化合物。由于死亡的胚胎不会运动,因此我们也能检测到因非特异性毒性导致胚胎死亡的化合物。
我们所介绍的系统构建成本较低,且具有可定制性。该系统易于维护,所有部件均可更换。目前,我们正在PrecisionTox联盟中使用该惊跳反应检测系统,以确定用于组学数据采集的化学化合物剂量。
数据来自五种模式生物及人类细胞系,将用于推导毒性通路和生物标志物,以预测人类毒性。首先,在10厘米的培养皿中,通过自然产卵收集处于卵裂期的胚胎,具体为从二细胞期至八细胞期的胚胎。
从培养皿中移除未受精的卵、碎屑和鳞片以清洁培养皿。每个含有15毫升E3培养基的培养皿中放置60个胚胎。将所有盛有胚胎的培养皿置于已用湿纸巾准备好的加湿环境中。
然后在受精后72小时,于设定为28.5摄氏度的培养箱中孵育。接下来,从-20摄氏度冰箱中取出所需的化学储备溶液,并使其解冻。在玻璃瓶中用E3培养基对每种化学物质进行系列稀释。
观察溶液是否有沉淀产生,如有,则记录,并进一步稀释以达到下一个较高浓度。重复检查并稀释,直至无沉淀产生。然后检测并记录暴露溶液的 pH 值。
如果pH值超出7.0至8.5范围,用盐酸或氢氧化钠调节至7.4。未使用的暴露培养基应按照当地法规进行处理。首先,收集斑马鱼胚胎,并在28.5摄氏度的培养箱中培养至受精后72小时。
同时配制待测化学品至所需浓度。检查受精后72小时的胚胎,移除死亡或未孵化的胚胎。
将10个胚胎放入每个六厘米的组织培养皿中,每个培养皿加入九毫升E3培养基。这些培养皿称为暴露板。用化合物名称、暴露浓度和重复编号标记每个暴露板。
从最低浓度开始,向每块培养板中加入一毫升暴露溶液,并轻轻摇晃培养板。对于溶解度较低的化合物,用暴露溶液完全替换培养基中的10毫升。记录化合物溶液添加到胚胎中的顺序。
然后将培养板置于湿润的孵育盒中,在28.5摄氏度的培养箱内孵育48小时。开始振动惊吓实验时,打开计算机和振动装置。创建一个配置文件的电子表格。
记录每个培养板五个位置的处理信息,包括化合物、浓度和重复次数。打开振动惊跳反应检测套件的通用用户界面(GUI)程序。在GUI程序中选择不同位置,以检查摄像头的移动并观察其响应情况。
从培养箱中取出样品板,将其放入五个指定位置,并让胚胎静置数分钟。在图形用户界面程序中,点击“Record”,新窗口将出现。
在此窗口中,选择先前准备好的配置文件。确认样品描述与每个位置上的样品相符。观察程序激活声脉冲时LED灯亮起的情况。
记录完成后,相机会返回至位置一,软件开始压缩文件。将已测量的样品替换为下一组样品,并按演示进行下一次运行。然后使用筛网从所有已测量的培养板中收集曝光溶液,同时保留胚胎。
开始数据分析时,使用 VirtualDub 或其他视频查看软件打开视频数据。通过视觉观察并记录对声音脉冲产生反应的胚胎数量。在电子表格中记录化合物名称、重复次数、化合物浓度以及不动胚胎的百分比。
使用嵌入 R 脚本的 KNIME 工作流进行基准浓度分析。对未经处理的野生型胚胎在振动刺激下的不活动性进行评估,结果显示其平均不活动性为 14.33%,且在不同产卵批次间存在差异。三卡因对运动能力影响的基准浓度计算表明,在 1% 浓度下运动能力下降,浓度高于 2.5% 时活动完全停止,基准浓度 50 为 164.9 微摩尔。
一个次优的实验示例显示出胚胎反应不一致,提示发育问题可能影响惊吓反应的稳健性。
本研究利用斑马鱼胚胎振动惊吓反应评估化学化合物的毒性。通过监测胚胎对振动刺激的运动反应,该系统可评估多种化合物的神经肌肉毒性和总体致死性。
高通量体内毒性筛选在早期药物发现和化学品安全性评估中仍然是一个关键瓶颈。斑马鱼振动惊跳反应系统能够快速、定量地评估神经肌肉毒性和一般毒性,有助于在靶点验证和先导化合物筛选阶段提高预测的可信度。该系统具有模块化、可扩展的设计,符合企业在不同化合物库中对可重复性、成本效益和转化相关性的需求。
这种基于斑马鱼的检测方法连接了早期发现与临床前安全性研究流程,在开展哺乳动物研究之前提供可操作的毒性数据。